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基本介紹

2003年完成的(de)(de)人(ren)類基(ji)(ji)因組計劃成功地對所有20,000個蛋(dan)白質(zhi)(zhi)編碼基(ji)(ji)因（蛋(dan)白質(zhi)(zhi)組）進行了測序，這是一(yi)項巨大(da)的(de)(de)科學成就，但這實際上只是一(yi)個開始。下一(yi)步是檢查蛋(dan)白質(zhi)(zhi)組以開始了解所有這些蛋(dan)白質(zhi)(zhi)的(de)(de)功能。

人(ren)類蛋白(bai)質(zhi)圖譜(HPA)項(xiang)目(mu)于(yu)2003年啟動，目(mu)標(biao)是使用基(ji)于(yu)抗(kang)體的(de)蛋白(bai)質(zhi)組學系統地繪制(zhi)這些蛋白(bai)質(zhi)的(de)表(biao)達。該計劃主(zhu)要設在瑞典，由非營(ying)利組織(zhi)Knut和(he)Alice Wallenberg基(ji)金會(KAW)資助。內部生產(chan)和(he)商業購買(mai)的(de)抗(kang)體首先由研(yan)究人(ren)員(yuan)驗證(zheng)，然后用于(yu)表(biao)征每(mei)種蛋白(bai)質(zhi)。

數據可(ke)通過開(kai)放式交互(hu)式數據庫(ku)獲(huo)取：www.proteinatlas.org.

它包(bao)含數百萬張高分(fen)辨(bian)率圖像，顯示44種(zhong)不(bu)同正(zheng)常人體組織(Tissue Atlas)和20種(zhong)不(bu)同癌(ai)癥(zheng)類型(xing)(Cancer Atlas)中76 種(zhong)不(bu)同細胞類型(xing)的(de)蛋白質(zhi)表達的(de)空間(jian)定(ding)位。

在美(mei)國細胞(bao)生物學學會（ASCB，2016年12月(yue)）上(shang)，一個新(xin)(xin)的Cell Atlas在HPA的更新(xin)(xin)版本（第16版）中(zhong)發布(bu)，參加人數眾(zhong)多(duo)。

特色功能

它的特點：

l 免疫熒光染色(se)細胞(bao)的高分辨率、多色(se)圖(tu)像

l 代表人體不(bu)同(tong)器官(guan)細(xi)胞群的(de)56種細(xi)胞系(xi)中蛋白質(zhi)的(de)亞(ya)細(xi)胞空間定位

l 使用深度RNA測(ce)序表征的所有人(ren)類基因(yin)的mRNA表達(da)

l > 12,000個基因和可用抗體(ti)映射到30種(zhong)不同(tong)的細(xi)胞結構（即細(xi)胞核、胞質溶膠、線粒體(ti)等）

精(jing)確定(ding)位(wei)蛋(dan)白質(zhi)的(de)(de)(de)亞細胞定(ding)位(wei)對于(yu)理解其(qi)(qi)功(gong)能(neng)(neng)至關重要(yao)。當它們定(ding)位(wei)到預期的(de)(de)(de)微環境（即細胞器、囊泡或大分(fen)子(zi)復(fu)合物）時，它們將在合適的(de)(de)(de)生化條件下遇(yu)到其(qi)(qi)他蛋(dan)白質(zhi)或RNA以實現其(qi)(qi)分(fen)子(zi)功(gong)能(neng)(neng)（Breckles，2016）。這份(fen)全面(mian)的(de)(de)(de)圖(tu)譜為世界各(ge)地的(de)(de)(de)研(yan)究(jiu)(jiu)人員對蛋(dan)白質(zhi)功(gong)能(neng)(neng)進行(xing)更復(fu)雜(za)的(de)(de)(de)研(yan)究(jiu)(jiu)提供了急需的(de)(de)(de)工具。

以下是Cell Atlas中(zhong)的(de)一些示(shi)例圖像：

CCNB1：細(xi)(xi)胞周期(qi)蛋(dan)白(bai)B1是(shi)一種(zhong)調節(jie)蛋(dan)白(bai)，位于細(xi)(xi)胞質中(zhong)(zhong)，參與人(ren)和(he)小鼠細(xi)(xi)胞的有絲(si)分裂。它主(zhu)要在(zai)細(xi)(xi)胞周期(qi)的G2/M 期(qi)以細(xi)(xi)胞周期(qi)依賴性(xing)的方(fang)式表(biao)達。在(zai)圖中(zhong)(zhong)，U-2 OS人(ren)細(xi)(xi)胞系中(zhong)(zhong)的細(xi)(xi)胞周期(qi)蛋(dan)白(bai)B1蛋(dan)白(bai)表(biao)達（抗體HPA030741）以綠色(se)(se)顯示，而細(xi)(xi)胞核為藍色(se)(se)，微管為紅色(se)(se)。

蛋白質圖譜

DAXX：死亡(wang)(wang)域相(xiang)關蛋白(bai)(bai)6是一(yi)種(zhong)多功(gong)能蛋白(bai)(bai)，主要(yao)定位于(yu)人和小鼠細(xi)(xi)胞(bao)的(de)(de)細(xi)(xi)胞(bao)核(he)(he)和核(he)(he)體，但也在細(xi)(xi)胞(bao)質(zhi)中(zhong)表達。DAXX 與有絲分裂G2期的(de)(de)著絲粒相(xiang)關。在細(xi)(xi)胞(bao)質(zhi)中(zhong)，它(ta)通過與細(xi)(xi)胞(bao)凋亡(wang)(wang)抗原Fas相(xiang)互作用來(lai)調節細(xi)(xi)胞(bao)凋亡(wang)(wang)。該圖(tu)顯示了細(xi)(xi)胞(bao)系A-431中(zhong)細(xi)(xi)胞(bao)核(he)(he)內的(de)(de)核(he)(he)體（GFP標(biao)記的(de)(de)抗體HPA008797）中(zhong)的(de)(de)表達。