臺北醫學大學原名臺北醫學院，創立于1960年6月1日，是醫學專家暨熱心醫藥教育人士胡水旺先生與徐千田先生等所捐資創設。創校之初，校地盡是一片荒蕪水田，教學與研究資源匱乏，四十八年來，在(zai)歷屆校長的努力下(xia)，從創校之三學(xue)(xue)(xue)(xue)系(xi)二專科(ke)，擴展為(wei)現有醫(yi)學(xue)(xue)(xue)(xue)院、口(kou)腔(qiang)醫(yi)學(xue)(xue)(xue)(xue)院、藥學(xue)(xue)(xue)(xue)院、護理(li)學(xue)(xue)(xue)(xue)院、公共衛生暨營養學(xue)(xue)(xue)(xue)院五個學(xue)(xue)(xue)(xue)院，十三學(xue)(xue)(xue)(xue)系(xi)及十三研究(jiu)所(suo)之規(gui)模。自從2000年改名臺(tai)北(bei)醫(yi)學(xue)(xue)(xue)(xue)大學(xue)(xue)(xue)(xue)以來，便(bian)一直(zhi)以成為(wei)國際(ji)一流醫(yi)學(xue)(xue)(xue)(xue)大學(xue)(xue)(xue)(xue)為(wei)目標，持續努力。
在教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)方面，作為一所都會型醫(yi)學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)專業大(da)學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)，臺(tai)北醫(yi)學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)大(da)學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)的教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)育(yu)理念，在于教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)導學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)生醫(yi)學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)專業知識之外，同時重視博雅教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)育(yu)，回歸以(yi)人(ren)為本的教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)。在這樣的理念上，自2006年起，連(lian)續三年獲得教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)育(yu)部教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)卓越計劃補助，獲得肯(ken)定。為落(luo)實該校結合(he)醫(yi)學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)科技與(yu)人(ren)文教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)育(yu)的理想，深化(hua)人(ren)文與(yu)通(tong)識教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)育(yu)，學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)校以(yi)專業教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)育(yu)通(tong)識化(hua)、通(tong)識教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)育(yu)專業化(hua)為兩大(da)主軸，持續貫徹教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)品質與(yu)績效的目標。
在研(yan)究(jiu)(jiu)(jiu)方面，頂尖研(yan)究(jiu)(jiu)(jiu)是國際(ji)(ji)一(yi)流大(da)(da)學不可(ke)或缺之一(yi)環，臺(tai)北醫(yi)學大(da)(da)學過去幾年來(lai)，研(yan)究(jiu)(jiu)(jiu)水準已有(you)長(chang)足的進步(bu)。為持續朝向(xiang)世界前五百大(da)(da)頂尖大(da)(da)學，學校順應國際(ji)(ji)趨勢，極力(li)爭(zheng)取(qu)大(da)(da)型(xing)及整合(he)型(xing)研(yan)究(jiu)(jiu)(jiu)計劃(hua)，延攬(lan)國內外杰出人才及其團隊，提高研(yan)究(jiu)(jiu)(jiu)獎(jiang)勵(li)，并建立與國際(ji)(ji)一(yi)流研(yan)究(jiu)(jiu)(jiu)單位合(he)作關(guan)系。
在醫(yi)(yi)(yi)(yi)療(liao)方面，隨著教(jiao)學(xue)(xue)研(yan)究的成長，該校醫(yi)(yi)(yi)(yi)療(liao)體系也(ye)日(ri)漸茁壯。臺北醫(yi)(yi)(yi)(yi)學(xue)(xue)大(da)學(xue)(xue)擁有附(fu)設醫(yi)(yi)(yi)(yi)院(yuan)(yuan)、萬芳醫(yi)(yi)(yi)(yi)院(yuan)(yuan)、雙和醫(yi)(yi)(yi)(yi)院(yuan)(yuan)，三(san)所附(fu)屬(shu)醫(yi)(yi)(yi)(yi)院(yuan)(yuan)，近三(san)千床之(zhi)規模，是為臺北地(di)區醫(yi)(yi)(yi)(yi)學(xue)(xue)院(yuan)(yuan)校最大(da)之(zhi)醫(yi)(yi)(yi)(yi)療(liao)體系。臺北醫(yi)(yi)(yi)(yi)學(xue)(xue)大(da)學(xue)(xue)統合學(xue)(xue)校及(ji)三(san)附(fu)屬(shu)醫(yi)(yi)(yi)(yi)院(yuan)(yuan)的資源，在見、實(shi)習與臨(lin)床技(ji)能訓練上，具有完整的設備(bei)與空間，更以服務鄰近社區，保障國人健康為職志。
洪(hong)奇昌：民主進步黨立法委員
林益世(shi)：國民黨(dang)立法委員
侯文詠(yong)：麻醉醫師、知(zhi)名作家
張洪量：牙醫系畢業，流行音(yin)樂歌(ge)手、制(zhi)作人(ren)
隆中隱(yin)：知名中國音樂教育(yu)者
陳以(yi)生(sheng)：牙醫系學士、口研所碩士，流行音樂(le)歌手
陳子(zi)忠：醫技系(xi)學士、中(zhong)港臺(tai)醫療管理人員
李(li)良雄：臺(tai)北榮民總醫院院長
1958年，創(chuang)辦人(ren)胡(hu)水旺先生、徐(xu)千田先生籌設(she)北(bei)醫(yi)。
1960年(nian)，北醫創(chuang)立，當時有醫學系(xi)、牙醫學系(xi)及(ji)藥學系(xi)三系(xi)。
1963年(nian)，成(cheng)立護理助產專修科，招收五專生。
1965年，成(cheng)立醫事(shi)技術專(zhuan)修科，招收(shou)五專(zhuan)生。
1975年，醫事技(ji)術(shu)專(zhuan)修科改制為醫事技(ji)術(shu)學(xue)系。
1976年，設立臺北醫學大學附設醫院(yuan)。
1977年，護理助(zhu)產專修科(ke)改制(zhi)為護理學系。
1979年，成(cheng)立(li)保健營(ying)養學系。
1989年，成立公(gong)共衛生學(xue)系。
1989年，成(cheng)立天(tian)然物醫學研究所。
1990年，胡俊弘先生接任校(xiao)長，成立(li)醫學(xue)研究所。
1992年，成立(li)口腔復健(jian)醫學研究所。
1993年，口腔復健醫學(xue)(xue)研(yan)究所(suo)(suo)(suo)改(gai)(gai)名為(wei)牙(ya)醫學(xue)(xue)研(yan)究所(suo)(suo)(suo)。天然物醫學(xue)(xue)研(yan)究所(suo)(suo)(suo)改(gai)(gai)名為(wei)醫學(xue)(xue)研(yan)究所(suo)(suo)(suo)。
1994年(nian)，成(cheng)(cheng)立(li)(li)細胞及分子生(sheng)物研究所(suo)。領先全國各校成(cheng)(cheng)立(li)(li)「醫(yi)學資訊暨(ji)電子計算機(ji)中心(xin)」。
1995年(nian)，成立保(bao)健營(ying)養學研(yan)究所(suo)碩士班。護(hu)理學研(yan)究所(suo)碩士班。
1996年，接收(shou)臺北市政(zheng)府委(wei)托經(jing)營(ying)市立萬芳醫院(yuan)。
1997年，成立醫務管理學系。
1998年(nian)，成立生物醫(yi)學(xue)技術研(yan)究所、醫(yi)學(xue)資訊研(yan)究所。
1999年(nian)，成立生藥(yao)(yao)技(ji)術學(xue)系，是(shi)臺灣第一個(ge)中(zhong)藥(yao)(yao)相關學(xue)系。由(you)當時藥(yao)(yao)學(xue)院院長楊玲玲教授所創立,但由(you)於藥(yao)(yao)師(shi)全聯會的(de)反(fan)對,迫使(shi)2007年(nian)停止招生。
2000年，改名「臺北(bei)醫(yi)(yi)學大學」，成立(li)醫(yi)(yi)務(wu)管理研(yan)究(jiu)(jiu)所、生物醫(yi)(yi)學材(cai)料研(yan)究(jiu)(jiu)所。
2001年，成立呼(hu)吸治療學系、口(kou)腔衛生學系。
2002年，成立藥理(li)學研究所、口腔科學研究所、保健營養研究所博士班。
2003年，通過(guo)衛生(sheng)署甄(zhen)選(xuan)，籌建雙(shuang)和(he)醫(yi)院，并成立醫(yi)學人文研究(jiu)所。
2004年(nian)，成立神經科學研究(jiu)所。
2006年(nian)，口腔科學(xue)研(yan)究所與(yu)生(sheng)醫材料研(yan)究所合(he)并，改(gai)名(ming)為(wei)生(sheng)醫材料暨(ji)工程(cheng)研(yan)究所。護理(li)學(xue)研(yan)究所博士班成(cheng)立、醫事(shi)技術學(xue)系改(gai)名(ming)為(wei)醫學(xue)檢(jian)驗暨(ji)生(sheng)物技術學(xue)系。
2007年，成立牙體技術學(xue)(xue)(xue)系(xi)、老人護理(li)暨管(guan)理(li)學(xue)(xue)(xue)系(xi)。由(you)原先的醫(yi)學(xue)(xue)(xue)研究(jiu)所(suo)基(ji)礎組、細胞及(ji)(ji)分子生物(wu)研究(jiu)所(suo)、醫(yi)學(xue)(xue)(xue)檢驗暨生物(wu)技術學(xue)(xue)(xue)系(xi)碩(shuo)士班、藥理(li)學(xue)(xue)(xue)研究(jiu)所(suo)及(ji)(ji)神經(jing)科學(xue)(xue)(xue)研究(jiu)所(suo)五所(suo)整合為(wei)醫(yi)學(xue)(xue)(xue)科學(xue)(xue)(xue)研究(jiu)所(suo)。
2008年，附屬醫(yi)(yi)院(yuan)-雙和醫(yi)(yi)院(yuan)於7月1日開始營運、邱文達教授接任校長
2009年，醫(yi)務管理學(xue)系并入公共衛生暨營(ying)養(yang)學(xue)院，開始招收碩士班(ban)國際學(xue)生。
2010年(nian)，成立醫學科技(ji)學院、人(ren)文暨社會科學院。
2011年(nian)，榮獲QS亞洲頂尖大學前百大。連(lian)續六年(nian)獲教育部補助(zhu)近4億元(yuan)。
2011年，邱(qiu)文達校(xiao)(xiao)長(chang)榮陞衛生署署長(chang)，閻(yan)云教(jiao)授接任北醫(yi)第九任校(xiao)(xiao)長(chang)。
2013年，老人護(hu)理暨管(guan)理學系更名為高齡健康管(guan)理學系。
2014年，藥(yao)學系(xi)分設藥(yao)學組、臨床藥(yao)學組。
2015年，成立(li)管(guan)理(li)學院(yuan)，并將公共衛(wei)生暨(ji)營養學院(yuan)中的「醫(yi)務(wu)管(guan)理(li)學系（學士班、碩士班、碩士在職(zhi)專班）」整并至管(guan)理(li)學院(yuan)。
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