臺北醫學大學原名臺北醫學院，創立于1960年6月1日，是醫學專家暨熱心醫藥教育人士胡水旺先生與徐千田先生等所捐資創設。創校之初，校地盡是一片荒蕪水田，教學與研究資源匱乏，四十八年來，在歷屆校長的努(nu)力下，從創校之三學(xue)(xue)系二專科，擴展為(wei)現有醫學(xue)(xue)院、口腔醫學(xue)(xue)院、藥學(xue)(xue)院、護理學(xue)(xue)院、公(gong)共(gong)衛生暨營養學(xue)(xue)院五個學(xue)(xue)院，十三學(xue)(xue)系及十三研究所之規(gui)模。自從2000年改名臺北醫學(xue)(xue)大學(xue)(xue)以(yi)來，便一直以(yi)成為(wei)國際一流醫學(xue)(xue)大學(xue)(xue)為(wei)目標，持續努(nu)力。
在教(jiao)學(xue)(xue)(xue)方面，作(zuo)為(wei)一所都會型(xing)醫學(xue)(xue)(xue)專業大(da)學(xue)(xue)(xue)，臺北(bei)醫學(xue)(xue)(xue)大(da)學(xue)(xue)(xue)的(de)(de)教(jiao)育(yu)(yu)理念(nian)，在于教(jiao)導學(xue)(xue)(xue)生醫學(xue)(xue)(xue)專業知識之(zhi)外，同時重視博雅教(jiao)育(yu)(yu)，回歸以人(ren)為(wei)本的(de)(de)教(jiao)學(xue)(xue)(xue)。在這樣的(de)(de)理念(nian)上，自2006年起(qi)，連續(xu)三(san)年獲得教(jiao)育(yu)(yu)部教(jiao)學(xue)(xue)(xue)卓越(yue)計劃補助(zhu)，獲得肯(ken)定。為(wei)落實該校結合(he)醫學(xue)(xue)(xue)科技與(yu)人(ren)文教(jiao)育(yu)(yu)的(de)(de)理想，深化(hua)人(ren)文與(yu)通識教(jiao)育(yu)(yu)，學(xue)(xue)(xue)校以專業教(jiao)育(yu)(yu)通識化(hua)、通識教(jiao)育(yu)(yu)專業化(hua)為(wei)兩大(da)主軸，持續(xu)貫(guan)徹(che)教(jiao)學(xue)(xue)(xue)品質與(yu)績效的(de)(de)目(mu)標。
在研(yan)究(jiu)方面(mian)，頂(ding)尖研(yan)究(jiu)是國際(ji)一(yi)流大學(xue)(xue)(xue)不可(ke)或(huo)缺(que)之一(yi)環，臺北(bei)醫學(xue)(xue)(xue)大學(xue)(xue)(xue)過去幾年(nian)來，研(yan)究(jiu)水準已(yi)有長足的進步。為持續朝(chao)向世界前五百大頂(ding)尖大學(xue)(xue)(xue)，學(xue)(xue)(xue)校(xiao)順應國際(ji)趨(qu)勢，極力爭取大型(xing)及整(zheng)合型(xing)研(yan)究(jiu)計劃，延攬(lan)國內外杰(jie)出人才及其團隊，提高研(yan)究(jiu)獎(jiang)勵(li)，并建立與國際(ji)一(yi)流研(yan)究(jiu)單(dan)位(wei)合作關系。
在醫(yi)(yi)(yi)療方(fang)面(mian)，隨(sui)著教學(xue)研究(jiu)的(de)(de)成長(chang)，該校(xiao)醫(yi)(yi)(yi)療體(ti)系也日漸茁壯。臺(tai)北(bei)醫(yi)(yi)(yi)學(xue)大(da)學(xue)擁有(you)附(fu)設醫(yi)(yi)(yi)院(yuan)(yuan)、萬芳(fang)醫(yi)(yi)(yi)院(yuan)(yuan)、雙和(he)醫(yi)(yi)(yi)院(yuan)(yuan)，三(san)(san)所附(fu)屬醫(yi)(yi)(yi)院(yuan)(yuan)，近三(san)(san)千床之(zhi)規(gui)模，是為臺(tai)北(bei)地區(qu)醫(yi)(yi)(yi)學(xue)院(yuan)(yuan)校(xiao)最大(da)之(zhi)醫(yi)(yi)(yi)療體(ti)系。臺(tai)北(bei)醫(yi)(yi)(yi)學(xue)大(da)學(xue)統合(he)學(xue)校(xiao)及三(san)(san)附(fu)屬醫(yi)(yi)(yi)院(yuan)(yuan)的(de)(de)資源，在見、實(shi)習(xi)與(yu)(yu)臨床技能訓練上(shang)，具有(you)完整的(de)(de)設備(bei)與(yu)(yu)空間(jian)，更以服務鄰近社區(qu)，保(bao)障(zhang)國(guo)人健康為職志。
洪奇昌：民主進步黨立法(fa)委員
林益世：國民黨(dang)立法委員
侯文詠：麻醉醫(yi)師、知名作家
張洪量：牙醫系畢業，流行音樂歌手、制(zhi)作人
隆中隱：知名中國音樂教育者
陳以生：牙醫系學士(shi)(shi)、口研所(suo)碩(shuo)士(shi)(shi)，流行音(yin)樂歌(ge)手
陳(chen)子(zi)忠：醫(yi)技系學士、中港臺醫(yi)療管(guan)理(li)人員(yuan)
李(li)良(liang)雄(xiong)：臺北榮民(min)總醫院院長
1958年，創(chuang)辦(ban)人胡水旺(wang)先生(sheng)、徐千田先生(sheng)籌(chou)設北醫。
1960年，北醫創立(li)，當時有(you)醫學系、牙醫學系及(ji)藥(yao)學系三系。
1963年，成立護(hu)理助產專修科，招收五專生。
1965年，成立醫事技術(shu)專修科，招(zhao)收五專生。
1975年(nian)，醫事(shi)技(ji)術專修(xiu)科改制為醫事(shi)技(ji)術學(xue)系。
1976年，設立臺(tai)北醫學大學附(fu)設醫院。
1977年，護理助產專修(xiu)科改制為護理學(xue)系。
1979年，成立保(bao)健(jian)營養(yang)學系。
1989年(nian)，成立(li)公共(gong)衛生學系。
1989年，成立天(tian)然物醫學(xue)研究(jiu)所。
1990年，胡俊弘(hong)先生接任校長，成立醫學研究所。
1992年(nian)，成立口腔復健醫學研(yan)究所。
1993年，口腔復(fu)健醫(yi)學研(yan)究(jiu)(jiu)所(suo)改名為牙醫(yi)學研(yan)究(jiu)(jiu)所(suo)。天然物醫(yi)學研(yan)究(jiu)(jiu)所(suo)改名為醫(yi)學研(yan)究(jiu)(jiu)所(suo)。
1994年，成立細(xi)胞及分子(zi)生物(wu)研(yan)究所。領(ling)先全國各校(xiao)成立「醫學資訊暨電子(zi)計算機(ji)中心」。
1995年，成立保健營養學(xue)研究(jiu)所(suo)碩士班。護理(li)學(xue)研究(jiu)所(suo)碩士班。
1996年，接(jie)收臺北市政府委(wei)托經營市立萬芳(fang)醫(yi)院(yuan)。
1997年，成立醫(yi)務管理學系(xi)。
1998年(nian)，成立(li)生物醫學(xue)技術研(yan)究(jiu)(jiu)所、醫學(xue)資(zi)訊研(yan)究(jiu)(jiu)所。
1999年，成立(li)(li)生(sheng)藥(yao)技術學(xue)(xue)系，是臺灣第一個中藥(yao)相關學(xue)(xue)系。由當時(shi)藥(yao)學(xue)(xue)院(yuan)院(yuan)長楊玲玲教授所創立(li)(li),但由於藥(yao)師(shi)全聯(lian)會的(de)反(fan)對,迫(po)使(shi)2007年停止(zhi)招生(sheng)。
2000年(nian)，改名「臺北醫(yi)(yi)學(xue)大學(xue)」，成立(li)醫(yi)(yi)務(wu)管理研究所(suo)、生物(wu)醫(yi)(yi)學(xue)材料研究所(suo)。
2001年，成立(li)呼吸治療學系(xi)、口(kou)腔衛生學系(xi)。
2002年，成立藥(yao)理(li)學(xue)(xue)研(yan)(yan)究(jiu)所(suo)、口腔科學(xue)(xue)研(yan)(yan)究(jiu)所(suo)、保健營養研(yan)(yan)究(jiu)所(suo)博士班。
2003年，通過衛生署甄(zhen)選，籌(chou)建雙和醫(yi)院(yuan)，并成立醫(yi)學人(ren)文研究所。
2004年，成立神經科(ke)學研(yan)究所。
2006年，口腔科學(xue)(xue)(xue)研究(jiu)所(suo)與生(sheng)醫(yi)(yi)材(cai)料研究(jiu)所(suo)合并，改名為生(sheng)醫(yi)(yi)材(cai)料暨工程研究(jiu)所(suo)。護理學(xue)(xue)(xue)研究(jiu)所(suo)博士(shi)班成立、醫(yi)(yi)事技術(shu)學(xue)(xue)(xue)系(xi)改名為醫(yi)(yi)學(xue)(xue)(xue)檢驗(yan)暨生(sheng)物技術(shu)學(xue)(xue)(xue)系(xi)。
2007年(nian)，成立牙體技術(shu)學(xue)(xue)系、老人護理暨管理學(xue)(xue)系。由原先的醫(yi)(yi)學(xue)(xue)研(yan)(yan)(yan)究(jiu)(jiu)所(suo)(suo)基礎組、細胞及分(fen)子(zi)生物研(yan)(yan)(yan)究(jiu)(jiu)所(suo)(suo)、醫(yi)(yi)學(xue)(xue)檢驗(yan)暨生物技術(shu)學(xue)(xue)系碩士班、藥理學(xue)(xue)研(yan)(yan)(yan)究(jiu)(jiu)所(suo)(suo)及神經科學(xue)(xue)研(yan)(yan)(yan)究(jiu)(jiu)所(suo)(suo)五所(suo)(suo)整合為醫(yi)(yi)學(xue)(xue)科學(xue)(xue)研(yan)(yan)(yan)究(jiu)(jiu)所(suo)(suo)。
2008年，附屬醫(yi)院-雙和醫(yi)院於(wu)7月1日開始(shi)營(ying)運、邱文達教授接任校長(chang)
2009年，醫務管(guan)理學系并入(ru)公共衛生(sheng)暨營(ying)養學院(yuan)，開始(shi)招(zhao)收碩(shuo)士(shi)班國際(ji)學生(sheng)。
2010年，成立(li)醫學(xue)科技學(xue)院(yuan)、人文暨社會科學(xue)院(yuan)。
2011年，榮獲(huo)QS亞洲頂尖(jian)大(da)學(xue)前(qian)百大(da)。連續(xu)六年獲(huo)教育部補助近4億元。
2011年，邱文達校(xiao)長(chang)榮陞衛生(sheng)署署長(chang)，閻(yan)云教(jiao)授接任北醫(yi)第九任校(xiao)長(chang)。
2013年(nian)，老人(ren)護理(li)暨管理(li)學系更(geng)名(ming)為高齡健康管理(li)學系。
2014年，藥學系分設藥學組(zu)、臨床藥學組(zu)。
2015年，成立管(guan)(guan)理學(xue)院(yuan)，并(bing)將公共衛生暨(ji)營養學(xue)院(yuan)中的「醫務管(guan)(guan)理學(xue)系（學(xue)士班(ban)、碩(shuo)士班(ban)、碩(shuo)士在職(zhi)專班(ban)）」整并(bing)至(zhi)管(guan)(guan)理學(xue)院(yuan)。
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