臺北醫學大學原名臺北醫學院，創立于1960年6月1日，是醫學專家暨熱心醫藥教育人士胡水旺先生與徐千田先生等所捐資創設。創校之初，校地盡是一片荒蕪水田，教學與研究資源匱乏，四十八年來，在歷屆校長的(de)努(nu)力(li)下，從(cong)創校之三(san)學系二專科，擴展為現有(you)醫(yi)學院(yuan)(yuan)、口腔醫(yi)學院(yuan)(yuan)、藥學院(yuan)(yuan)、護(hu)理學院(yuan)(yuan)、公共(gong)衛生暨營養學院(yuan)(yuan)五(wu)個學院(yuan)(yuan)，十三(san)學系及十三(san)研究所之規模。自從(cong)2000年改名臺北(bei)醫(yi)學大學以來，便一(yi)直(zhi)以成為國際(ji)一(yi)流醫(yi)學大學為目標，持續努(nu)力(li)。
在教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)學(xue)方面(mian)，作(zuo)為一(yi)所都會型醫學(xue)專(zhuan)業(ye)大(da)學(xue)，臺北醫學(xue)大(da)學(xue)的(de)(de)教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)育理(li)念，在于教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)導學(xue)生醫學(xue)專(zhuan)業(ye)知識之外，同時重(zhong)視博(bo)雅教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)育，回歸以(yi)人(ren)為本的(de)(de)教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)學(xue)。在這(zhe)樣的(de)(de)理(li)念上(shang)，自2006年起，連續三年獲(huo)得教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)育部教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)學(xue)卓越計劃補助，獲(huo)得肯定(ding)。為落實該(gai)校結合(he)醫學(xue)科技與人(ren)文(wen)教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)育的(de)(de)理(li)想，深化人(ren)文(wen)與通識教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)育，學(xue)校以(yi)專(zhuan)業(ye)教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)育通識化、通識教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)育專(zhuan)業(ye)化為兩大(da)主軸，持續貫徹(che)教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)學(xue)品質與績(ji)效(xiao)的(de)(de)目標。
在研(yan)(yan)(yan)究(jiu)方面，頂(ding)尖研(yan)(yan)(yan)究(jiu)是國際(ji)一(yi)流大(da)學(xue)不可或缺之一(yi)環，臺北醫(yi)學(xue)大(da)學(xue)過去幾(ji)年(nian)來，研(yan)(yan)(yan)究(jiu)水(shui)準已有長足的進步。為持(chi)續朝向世界前五百大(da)頂(ding)尖大(da)學(xue)，學(xue)校順應(ying)國際(ji)趨(qu)勢，極力(li)爭取大(da)型及整合(he)型研(yan)(yan)(yan)究(jiu)計劃，延攬(lan)國內外杰(jie)出(chu)人才及其團(tuan)隊，提高(gao)研(yan)(yan)(yan)究(jiu)獎(jiang)勵，并建(jian)立與國際(ji)一(yi)流研(yan)(yan)(yan)究(jiu)單位(wei)合(he)作關系。
在醫(yi)(yi)療(liao)方(fang)面，隨著教學研究的成(cheng)長，該(gai)校醫(yi)(yi)療(liao)體(ti)系也日漸茁壯。臺北(bei)(bei)醫(yi)(yi)學大學擁(yong)有附設醫(yi)(yi)院(yuan)(yuan)、萬(wan)芳(fang)醫(yi)(yi)院(yuan)(yuan)、雙(shuang)和醫(yi)(yi)院(yuan)(yuan)，三(san)所附屬醫(yi)(yi)院(yuan)(yuan)，近三(san)千床(chuang)之規模，是為(wei)臺北(bei)(bei)地區(qu)(qu)醫(yi)(yi)學院(yuan)(yuan)校最大之醫(yi)(yi)療(liao)體(ti)系。臺北(bei)(bei)醫(yi)(yi)學大學統合學校及(ji)三(san)附屬醫(yi)(yi)院(yuan)(yuan)的資源，在見、實(shi)習與臨床(chuang)技能(neng)訓練上(shang)，具有完整的設備與空間，更以服務鄰近社區(qu)(qu)，保障國人健康為(wei)職志。
洪奇昌：民主進(jin)步黨立(li)法委員
林益世：國民黨立法委(wei)員(yuan)
侯文詠(yong)：麻醉醫師(shi)、知名作家
張洪量：牙醫系畢業，流行音樂歌手(shou)、制(zhi)作人
隆(long)中(zhong)隱：知名(ming)中(zhong)國音樂教育者(zhe)
陳以生：牙醫系學(xue)士(shi)、口研所碩士(shi)，流行音樂歌手
陳子忠：醫(yi)(yi)技(ji)系學(xue)士、中港臺醫(yi)(yi)療管理人員
李良雄：臺北榮(rong)民總(zong)醫(yi)院(yuan)院(yuan)長
1958年，創(chuang)辦人(ren)胡水旺先生、徐千田先生籌設北醫。
1960年，北醫(yi)創立，當時有醫(yi)學系、牙(ya)醫(yi)學系及藥(yao)學系三系。
1963年，成立護理(li)助產專修(xiu)科，招收五專生。
1965年(nian)，成立醫事技術專修科，招收五專生。
1975年(nian)，醫(yi)(yi)事技術(shu)專修(xiu)科改制為醫(yi)(yi)事技術(shu)學系。
1976年，設立臺北醫學大(da)學附設醫院。
1977年(nian)，護(hu)理助產專修科(ke)改制為護(hu)理學(xue)系。
1979年，成立保健營養(yang)學系(xi)。
1989年，成立公共衛生(sheng)學系。
1989年，成立天然物(wu)醫(yi)學研究(jiu)所。
1990年，胡(hu)俊(jun)弘先生接(jie)任校長，成(cheng)立(li)醫學研究所。
1992年，成立口腔復健醫學研究所。
1993年，口腔(qiang)復健醫(yi)(yi)學(xue)研究所(suo)改名為(wei)牙(ya)醫(yi)(yi)學(xue)研究所(suo)。天然物(wu)醫(yi)(yi)學(xue)研究所(suo)改名為(wei)醫(yi)(yi)學(xue)研究所(suo)。
1994年，成(cheng)立(li)細胞及(ji)分子(zi)生物研究(jiu)所。領先全國各(ge)校(xiao)成(cheng)立(li)「醫學(xue)資訊暨(ji)電子(zi)計算(suan)機中心」。
1995年，成立保健營養學(xue)研(yan)究(jiu)所(suo)碩士班。護理學(xue)研(yan)究(jiu)所(suo)碩士班。
1996年，接收臺北市(shi)政府委托經(jing)營市(shi)立萬芳醫院(yuan)。
1997年，成立醫務管理(li)學系。
1998年，成立生物(wu)醫學技術研(yan)究(jiu)所(suo)、醫學資訊研(yan)究(jiu)所(suo)。
1999年，成(cheng)立生藥(yao)技(ji)術(shu)學(xue)(xue)系(xi)，是(shi)臺灣第一(yi)個中藥(yao)相關學(xue)(xue)系(xi)。由當時藥(yao)學(xue)(xue)院(yuan)院(yuan)長楊玲(ling)玲(ling)教授所(suo)創立,但由於藥(yao)師全聯會的反對(dui),迫使2007年停止招(zhao)生。
2000年，改名(ming)「臺(tai)北(bei)醫學大學」，成(cheng)立醫務管理研究所、生物醫學材料研究所。
2001年，成立呼(hu)吸治(zhi)療學系(xi)、口腔衛生學系(xi)。
2002年，成立藥理學(xue)研(yan)究(jiu)所(suo)、口腔科學(xue)研(yan)究(jiu)所(suo)、保健營養(yang)研(yan)究(jiu)所(suo)博士班(ban)。
2003年，通過衛(wei)生署甄選，籌建雙(shuang)和醫(yi)院，并(bing)成(cheng)立(li)醫(yi)學人文研(yan)究(jiu)所。
2004年，成立神經科學(xue)研究所(suo)。
2006年，口腔科學研(yan)(yan)(yan)究(jiu)(jiu)所與生(sheng)醫(yi)材(cai)料研(yan)(yan)(yan)究(jiu)(jiu)所合并，改(gai)名為(wei)生(sheng)醫(yi)材(cai)料暨(ji)工程研(yan)(yan)(yan)究(jiu)(jiu)所。護理學研(yan)(yan)(yan)究(jiu)(jiu)所博士班成立、醫(yi)事技術學系改(gai)名為(wei)醫(yi)學檢驗暨(ji)生(sheng)物技術學系。
2007年，成立牙體技(ji)術(shu)學系、老人護理暨管理學系。由(you)原先(xian)的醫(yi)(yi)學研(yan)究(jiu)所(suo)(suo)基礎組、細胞(bao)及分子生物研(yan)究(jiu)所(suo)(suo)、醫(yi)(yi)學檢驗暨生物技(ji)術(shu)學系碩士班、藥(yao)理學研(yan)究(jiu)所(suo)(suo)及神經(jing)科(ke)學研(yan)究(jiu)所(suo)(suo)五所(suo)(suo)整合為(wei)醫(yi)(yi)學科(ke)學研(yan)究(jiu)所(suo)(suo)。
2008年，附(fu)屬醫院-雙和醫院於7月1日開始(shi)營運、邱文達教授(shou)接任校長
2009年，醫務管理學系并入公共衛生暨(ji)營養(yang)學院，開(kai)始招收碩士班國際(ji)學生。
2010年(nian)，成立醫(yi)學(xue)科技學(xue)院、人文暨社會科學(xue)院。
2011年(nian)，榮獲QS亞洲(zhou)頂(ding)尖大(da)學前百大(da)。連續六年(nian)獲教育部補(bu)助近4億元(yuan)。
2011年，邱文達校(xiao)長榮(rong)陞(sheng)衛生署署長，閻云教授(shou)接任北醫第九任校(xiao)長。
2013年，老人護理(li)暨管(guan)(guan)理(li)學(xue)系(xi)更名為高齡健康管(guan)(guan)理(li)學(xue)系(xi)。
2014年，藥學(xue)系分設藥學(xue)組、臨床(chuang)藥學(xue)組。
2015年(nian)，成立管(guan)理(li)學(xue)院，并將公共衛(wei)生暨(ji)營(ying)養(yang)學(xue)院中的「醫(yi)務管(guan)理(li)學(xue)系（學(xue)士班、碩士班、碩士在(zai)職專(zhuan)班）」整并至管(guan)理(li)學(xue)院。
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