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保護區(qu)位于甘肅(su)省(sheng)西(xi)(xi)端(duan)的敦煌市南湖鄉境內，總面(mian)積(ji)8.81777萬(wan)公頃，東(dong)為(wei)黨(dang)河水庫(ku)，西(xi)(xi)隔甘肅(su)敦煌西(xi)(xi)湖國家級自然保護區(qu)而見一望無際的庫(ku)姆塔格沙漠(mo)，南接阿(a)克賽哈薩克族自治縣，北面(mian)則是大面(mian)積(ji)的戈壁荒漠(mo)。
全區年降水量平均值(zhi)為36.8--153.8毫米,年日照時數3033.4--3316.5小時，具有典型的大(da)陸性荒漠(mo)氣候特點。
敦煌(huang)陽關自然保護區始建(jian)于(yu)1992年，地(di)處河西走廊坳陷之西端，祁連山褶皺帶，位于(yu)瓜州—敦煌(huang)盆地(di)西南邊緣的陽關小盆地(di)。
1994年(nian)經省政府批準(zhun)晉升為省級自然(ran)保護區。
2006年，為了(le)認真貫(guan)徹落(luo)實溫家(jia)寶總理關(guan)于“敦(dun)(dun)煌生態保(bao)護工作(zuo)，必須(xu)高度重(zhong)視，科學規(gui)劃，綜合治理，加快(kuai)進(jin)行。“絕不(bu)能讓敦(dun)(dun)煌變成第二個樓蘭”的重(zhong)要批示精神(shen)，敦(dun)(dun)煌市(shi)政府(fu)在(zai)國(guo)家(jia)環(huan)保(bao)部的指導下，正式啟動了(le)敦(dun)(dun)煌陽關(guan)省級(ji)自然保(bao)護區晉升(sheng)國(guo)家(jia)級(ji)自然保(bao)護區的申報工作(zuo)。
2009年(nian)9月正式獲得(de)了國務(wu)院的(de)審(shen)批命名，晉升為(wei)國家(jia)級(ji)自然保護區(qu)。
敦煌陽關國家級自然(ran)保護區(qu)總面積為8.81777萬(wan)公(gong)頃，其中核心區(qu)面積為2.7322萬(wan)公(gong)頃，緩沖區(qu)面積為2.80826萬(wan)公(gong)頃，實驗區(qu)面積為3.27731萬(wan)公(gong)頃。
敦煌市(shi)氣象局為陽關自然(ran)保護(hu)(hu)區(qu)和(he)西湖自然(ran)保護(hu)(hu)區(qu)建立了無人區(qu)域自動站以(yi)及敦煌市(shi)建成(cheng)的西北地區(qu)戈壁荒漠(mo)生(sheng)態與環境研究站，為自然(ran)保護(hu)(hu)區(qu)的保護(hu)(hu)和(he)發展提供了科學依據和(he)氣象保障。
保護區是中(zhong)國西(xi)(xi)部(bu)干旱荒漠(mo)區中(zhong)較為罕見的(de)(de)(de)特殊(shu)成因內陸河流生(sheng)態系統，保護區的(de)(de)(de)濕地是中(zhong)國西(xi)(xi)部(bu)荒漠(mo)區重要的(de)(de)(de)候鳥棲息(xi)地和(he)遷徙(xi)驛站(zhan)，生(sheng)存(cun)著各種(zhong)鳥類(lei)87種(zhong)，其中(zhong)候鳥50種(zhong)，列(lie)入國家一、二級保護鳥類(lei)有16種(zhong)，列(lie)入IUCN保護名錄的(de)(de)(de)有2種(zhong)，列(lie)入《瀕危野生(sheng)動物國際(ji)貿易公(gong)約》的(de)(de)(de)有8種(zhong)，列(lie)入《中(zhong)國瀕危動物紅皮書》的(de)(de)(de)有3種(zhong)。
白尾海雕是大型猛禽，被列入《世界自然保護(hu)聯盟(meng)》（IUCN） 2012年(nian)瀕危(wei)物(wu)種紅(hong)色(se)名錄，屬于國家(jia)一級保護(hu)動物(wu)。
保護區還生長著(zhu)各類種(zhong)子(zi)植物(wu)141種(zhong)，其(qi)中(zhong)國家重點保護珍稀瀕危植物(wu)4種(zhong)。
敦煌陽(yang)關國家(jia)級自(zi)然(ran)保(bao)護區(qu)的(de)(de)建立(li)，對(dui)積極探索(suo)極端干旱區(qu)荒(huang)漠(mo)濕地(di)的(de)(de)治理、水環(huan)境(jing)改善和(he)(he)(he)生(sheng)物多樣性保(bao)護，實現(xian)濕地(di)生(sheng)態(tai)(tai)環(huan)境(jing)的(de)(de)重建，對(dui)研究(jiu)我國西(xi)(xi)部(bu)(bu)荒(huang)漠(mo)區(qu)濕地(di)與荒(huang)漠(mo)復合生(sheng)態(tai)(tai)系統的(de)(de)變遷和(he)(he)(he)演替，保(bao)存野生(sheng)動植(zhi)物種(zhong)質的(de)(de)遺傳(chuan)多樣性和(he)(he)(he)棲息地(di)，保(bao)護和(he)(he)(he)拯救(jiu)瀕危(wei)物種(zhong)，開展生(sheng)態(tai)(tai)學研究(jiu)具有獨特的(de)(de)價值(zhi)，對(dui)甘肅(su)河西(xi)(xi)走(zou)廊乃至中(zhong)國西(xi)(xi)部(bu)(bu)的(de)(de)生(sheng)態(tai)(tai)安(an)全，莫高窟、月牙(ya)泉、陽(yang)關遺址等(deng)著名文化古跡和(he)(he)(he)自(zi)然(ran)景觀的(de)(de)保(bao)護，以(yi)及甘、青、新(xin)三省區(qu)交界處生(sheng)物多樣性保(bao)護都有著重大(da)意(yi)義。保(bao)護區(qu)濕地(di)良好的(de)(de)荒(huang)漠(mo)植(zhi)被、濕地(di)中(zhong)充足的(de)(de)水源和(he)(he)(he)飼料為黑鸛(guan)和(he)(he)(he)鵝喉羚等(deng)珍稀瀕危(wei)動物的(de)(de)生(sheng)存和(he)(he)(he)繁衍提供了保(bao)障。
