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保護區(qu)位于(yu)甘肅(su)省西(xi)端的(de)敦(dun)煌市(shi)南湖鄉(xiang)境內，總面(mian)積(ji)8.81777萬(wan)公頃，東(dong)為黨河水庫，西(xi)隔甘肅(su)敦(dun)煌西(xi)湖國家級自然保護區(qu)而見(jian)一望(wang)無際(ji)的(de)庫姆塔格沙漠，南接阿克(ke)賽哈(ha)薩克(ke)族自治縣，北面(mian)則是大面(mian)積(ji)的(de)戈(ge)壁(bi)荒漠。
全區年降水量平均值(zhi)為36.8--153.8毫米,年日照時(shi)數3033.4--3316.5小(xiao)時(shi)，具有(you)典型(xing)的大陸性荒漠氣(qi)候特點。
敦(dun)煌(huang)陽關自然保護區始建于1992年，地處(chu)河西走廊坳陷之西端(duan)，祁連山褶皺帶，位于瓜州—敦(dun)煌(huang)盆(pen)(pen)地西南邊緣的陽關小盆(pen)(pen)地。
1994年經省政府(fu)批準(zhun)晉升為省級自然保護(hu)區。
2006年(nian)，為了(le)認真貫徹(che)落實溫家寶總理關(guan)于“敦(dun)(dun)煌生態保(bao)護工(gong)作，必須高度重(zhong)視，科學規劃(hua)，綜合治理，加快進行。“絕不能(neng)讓敦(dun)(dun)煌變成第二個樓蘭(lan)”的重(zhong)要批示精神，敦(dun)(dun)煌市政府在國家環保(bao)部的指導下，正式啟動了(le)敦(dun)(dun)煌陽關(guan)省級(ji)自(zi)然保(bao)護區(qu)晉升國家級(ji)自(zi)然保(bao)護區(qu)的申報工(gong)作。
2009年9月正式獲得了國(guo)務院的審批命名，晉升為國(guo)家(jia)級(ji)自然(ran)保護區。
敦煌陽關國家級自(zi)然保護(hu)區(qu)總面(mian)(mian)積(ji)為8.81777萬(wan)公(gong)頃，其(qi)中(zhong)核心區(qu)面(mian)(mian)積(ji)為2.7322萬(wan)公(gong)頃，緩沖區(qu)面(mian)(mian)積(ji)為2.80826萬(wan)公(gong)頃，實(shi)驗區(qu)面(mian)(mian)積(ji)為3.27731萬(wan)公(gong)頃。
敦煌市氣(qi)象(xiang)局為(wei)陽關自然(ran)保(bao)護區和(he)西(xi)湖(hu)自然(ran)保(bao)護區建(jian)立(li)了無人區域自動站以及敦煌市建(jian)成的西(xi)北地區戈壁荒(huang)漠生態(tai)與環境研究(jiu)站，為(wei)自然(ran)保(bao)護區的保(bao)護和(he)發展提供了科學依據和(he)氣(qi)象(xiang)保(bao)障。
保護(hu)(hu)區是(shi)中(zhong)(zhong)國西部干旱荒(huang)漠區中(zhong)(zhong)較為罕見的(de)(de)特殊成因內陸河流生(sheng)態系統，保護(hu)(hu)區的(de)(de)濕地是(shi)中(zhong)(zhong)國西部荒(huang)漠區重要的(de)(de)候(hou)鳥棲息地和遷(qian)徙驛站，生(sheng)存著(zhu)各種(zhong)(zhong)(zhong)(zhong)鳥類87種(zhong)(zhong)(zhong)(zhong)，其中(zhong)(zhong)候(hou)鳥50種(zhong)(zhong)(zhong)(zhong)，列入(ru)(ru)(ru)國家一、二級保護(hu)(hu)鳥類有(you)(you)16種(zhong)(zhong)(zhong)(zhong)，列入(ru)(ru)(ru)IUCN保護(hu)(hu)名錄(lu)的(de)(de)有(you)(you)2種(zhong)(zhong)(zhong)(zhong)，列入(ru)(ru)(ru)《瀕危野生(sheng)動物(wu)(wu)國際貿易公約》的(de)(de)有(you)(you)8種(zhong)(zhong)(zhong)(zhong)，列入(ru)(ru)(ru)《中(zhong)(zhong)國瀕危動物(wu)(wu)紅皮書》的(de)(de)有(you)(you)3種(zhong)(zhong)(zhong)(zhong)。
白尾海雕是大型猛(meng)禽，被(bei)列(lie)入《世界自然保護聯盟》（IUCN） 2012年瀕危物(wu)種紅色名錄(lu)，屬于國(guo)家一級保護動(dong)物(wu)。
保護(hu)區還生長著各類(lei)種(zhong)子植物141種(zhong)，其中(zhong)國家(jia)重點保護(hu)珍(zhen)稀瀕危植物4種(zhong)。
敦煌陽(yang)關國家(jia)級自然保(bao)(bao)(bao)護區(qu)的建立，對(dui)(dui)積極探索極端干旱(han)區(qu)荒漠(mo)濕地的治(zhi)理、水環境改(gai)善和(he)(he)(he)生物(wu)多(duo)樣性(xing)保(bao)(bao)(bao)護，實現濕地生態(tai)環境的重建，對(dui)(dui)研究我國西部荒漠(mo)區(qu)濕地與荒漠(mo)復合生態(tai)系(xi)統(tong)的變遷和(he)(he)(he)演替，保(bao)(bao)(bao)存野生動(dong)植物(wu)種(zhong)質(zhi)的遺傳多(duo)樣性(xing)和(he)(he)(he)棲(qi)息地，保(bao)(bao)(bao)護和(he)(he)(he)拯救瀕(bin)(bin)危物(wu)種(zhong)，開展生態(tai)學研究具有獨(du)特(te)的價(jia)值，對(dui)(dui)甘(gan)肅河西走廊乃至中國西部的生態(tai)安全，莫高窟、月牙泉、陽(yang)關遺址等著(zhu)名文化古(gu)跡(ji)和(he)(he)(he)自然景觀的保(bao)(bao)(bao)護，以及甘(gan)、青、新(xin)三省(sheng)區(qu)交界(jie)處生物(wu)多(duo)樣性(xing)保(bao)(bao)(bao)護都有著(zhu)重大意義。保(bao)(bao)(bao)護區(qu)濕地良好(hao)的荒漠(mo)植被、濕地中充足的水源和(he)(he)(he)飼料(liao)為黑鸛(guan)和(he)(he)(he)鵝喉(hou)羚等珍(zhen)稀瀕(bin)(bin)危動(dong)物(wu)的生存和(he)(he)(he)繁衍(yan)提供了保(bao)(bao)(bao)障。
