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保護(hu)區位于(yu)甘肅(su)省西(xi)端的(de)敦煌市南(nan)湖(hu)(hu)鄉境(jing)內，總面積8.81777萬公(gong)頃(qing)，東為黨河水庫，西(xi)隔甘肅(su)敦煌西(xi)湖(hu)(hu)國家級(ji)自(zi)(zi)然保護(hu)區而見(jian)一望無際(ji)的(de)庫姆(mu)塔格沙漠，南(nan)接阿克(ke)賽哈薩(sa)克(ke)族(zu)自(zi)(zi)治(zhi)縣，北(bei)面則是大面積的(de)戈(ge)壁(bi)荒漠。
全區(qu)年降水量平均值為36.8--153.8毫米,年日照時(shi)數(shu)3033.4--3316.5小時(shi)，具(ju)有典型的大陸性荒(huang)漠氣候(hou)特(te)點。
敦煌(huang)陽(yang)(yang)關(guan)(guan)自然保護區始建于(yu)1992年，地(di)處河西(xi)走廊坳陷之西(xi)端，祁連(lian)山褶皺帶，位于(yu)瓜州—敦煌(huang)盆(pen)地(di)西(xi)南(nan)邊緣的陽(yang)(yang)關(guan)(guan)小盆(pen)地(di)。
1994年經省(sheng)政府批準(zhun)晉升為省(sheng)級自(zi)然保(bao)護區。
2006年，為了(le)認(ren)真貫(guan)徹(che)落實溫(wen)家(jia)寶總理關于“敦煌生(sheng)態(tai)保(bao)護(hu)工作，必(bi)須高度重視(shi)，科學規(gui)劃，綜合(he)治理，加(jia)快進行。“絕不能讓敦煌變成第二個(ge)樓蘭(lan)”的(de)重要批(pi)示精神，敦煌市政府在國家(jia)環保(bao)部的(de)指導(dao)下，正(zheng)式啟動了(le)敦煌陽關省(sheng)級自(zi)然保(bao)護(hu)區晉升國家(jia)級自(zi)然保(bao)護(hu)區的(de)申報工作。
2009年(nian)9月(yue)正(zheng)式獲得了國務院的審批命名，晉(jin)升為國家(jia)級(ji)自然(ran)保護區。
敦(dun)煌(huang)陽關國家級自然保護區總面積(ji)(ji)為8.81777萬公(gong)頃(qing)，其中(zhong)核心區面積(ji)(ji)為2.7322萬公(gong)頃(qing)，緩(huan)沖區面積(ji)(ji)為2.80826萬公(gong)頃(qing)，實(shi)驗區面積(ji)(ji)為3.27731萬公(gong)頃(qing)。
敦煌市氣象(xiang)局為(wei)陽關自然保護(hu)(hu)區和西湖自然保護(hu)(hu)區建立了無人區域自動站(zhan)以及敦煌市建成的西北地(di)區戈壁荒漠生(sheng)態(tai)與環(huan)境研究站(zhan)，為(wei)自然保護(hu)(hu)區的保護(hu)(hu)和發展提供了科學依據和氣象(xiang)保障。
保(bao)護(hu)區是(shi)中國西部干旱荒漠(mo)區中較為罕(han)見的特殊成因(yin)內陸河流生(sheng)態(tai)系統，保(bao)護(hu)區的濕地是(shi)中國西部荒漠(mo)區重要的候鳥棲息地和遷(qian)徙驛站(zhan)，生(sheng)存(cun)著各種(zhong)鳥類87種(zhong)，其中候鳥50種(zhong)，列入國家一、二級保(bao)護(hu)鳥類有(you)(you)(you)16種(zhong)，列入IUCN保(bao)護(hu)名錄的有(you)(you)(you)2種(zhong)，列入《瀕危野生(sheng)動物國際(ji)貿易公(gong)約》的有(you)(you)(you)8種(zhong)，列入《中國瀕危動物紅皮書》的有(you)(you)(you)3種(zhong)。
白尾(wei)海雕(diao)是大型(xing)猛禽，被列入《世界自然保(bao)護(hu)聯盟》（IUCN） 2012年(nian)瀕(bin)危物種紅色名錄，屬于(yu)國家一級保(bao)護(hu)動物。
保(bao)護(hu)區(qu)還生長著各類種子植物(wu)141種，其中國家重點保(bao)護(hu)珍稀瀕危植物(wu)4種。
敦煌陽關國(guo)家級自然保(bao)護(hu)(hu)區的(de)(de)建立，對(dui)(dui)積極探索極端干旱區荒(huang)(huang)漠(mo)濕(shi)地的(de)(de)治(zhi)理、水環境(jing)改善(shan)和(he)生物多樣性(xing)保(bao)護(hu)(hu)，實現濕(shi)地生態(tai)環境(jing)的(de)(de)重建，對(dui)(dui)研(yan)究(jiu)我(wo)國(guo)西(xi)部荒(huang)(huang)漠(mo)區濕(shi)地與(yu)荒(huang)(huang)漠(mo)復合生態(tai)系統的(de)(de)變遷和(he)演替，保(bao)存野生動植物種質(zhi)的(de)(de)遺傳多樣性(xing)和(he)棲息(xi)地，保(bao)護(hu)(hu)和(he)拯救瀕危物種，開展生態(tai)學研(yan)究(jiu)具有獨特的(de)(de)價值(zhi)，對(dui)(dui)甘(gan)肅河西(xi)走廊(lang)乃至中國(guo)西(xi)部的(de)(de)生態(tai)安全(quan)，莫(mo)高窟、月牙泉、陽關遺址(zhi)等著名(ming)文化古跡和(he)自然景觀的(de)(de)保(bao)護(hu)(hu)，以及甘(gan)、青、新三省(sheng)區交界(jie)處生物多樣性(xing)保(bao)護(hu)(hu)都(dou)有著重大(da)意義。保(bao)護(hu)(hu)區濕(shi)地良好的(de)(de)荒(huang)(huang)漠(mo)植被、濕(shi)地中充足的(de)(de)水源(yuan)和(he)飼(si)料為黑鸛和(he)鵝喉羚等珍稀瀕危動物的(de)(de)生存和(he)繁衍提供(gong)了保(bao)障(zhang)。
