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1983年，甘(gan)肅省人民政府批準(zhun)成立了甘(gan)肅省蓮花山自然保護(hu)區。
2003年(nian)6月經國辦發[2003]54號(hao)文批準晉升為甘(gan)肅蓮花山國家級自然保護區。
甘肅蓮花山國(guo)家級自然保護區屬秦(qin)嶺(ling)東西復雜構(gou)(gou)造帶，由于(yu)洽(qia)置兩(liang)個構(gou)(gou)造體系(xi)相(xiang)毗(pi)鄰地段，不同構(gou)(gou)造體系(xi)間的干擾，反映在構(gou)(gou)造形跡上也較為(wei)復雜，同時在巨型構(gou)(gou)造體系(xi)的基礎上，局(ju)部發育著次(ci)級或更次(ci)一級的構(gou)(gou)造。
（1）秦(qin)嶺東西復雜構造帶
該構造帶由新堡—力士山為復背斜軸的復式背斜所組成，軸部為下石炭統砂巖，粉砂巖、頁巖等，向兩翼漸新由中、上石炭統、二疊系，中、下三疊統灰巖、砂巖、頁巖，板巖、礫巖等組成。復背斜軸(zhou)在(zai)紅崖(ya)魯—尖山一(yi)帶(dai)基本上呈(cheng)東西(xi)向展(zhan)布(bu)，僅局部偏(pian)轉(zhuan)呈(cheng)孤形(xing)，由尖山往西(xi)則呈(cheng)北西(xi)向展(zhan)布(bu)，總體方(fang)向為315°。展(zhan)布(bu)方(fang)向的(de)改變系由于秦嶺帶(dai)經歷了長期的(de)、復雜的(de)歷史演變，多次的(de)運動和康藏(zang)體系，祁呂弧形(xing)擠(ji)壓帶(dai)多字形(xing)體系相毗(pi)鄰而產生的(de)嚴重(zhong)干擾所致，但從山脈的(de)走向，巖層的(de)產狀，地層的(de)分(fen)布(bu)，次級褶皺的(de)軸(zhou)向，壓性(xing)斷(duan)裂等大(da)部分(fen)都近(jin)于東西(xi)，足(zu)以反映(ying)秦嶺構(gou)造帶(dai)的(de)面貌，從較大(da)的(de)區域(yu)來看則是(shi)清楚的(de)，蓮花山自然保護區屬于新堡地區。
褶(zhe)(zhe)皺：在(zai)新(xin)堡地區(qu)的(de)褶(zhe)(zhe)皺有8條，其(qi)中與蓮(lian)花(hua)山(shan)自然(ran)保護(hu)區(qu)有影(ying)響的(de)為母太子山(shan)—扎那山(shan)復向(xiang)斜(xie)，由二疊系地層所(suo)組成，長67km，兩翼傾(qing)角45°～50°。兩段次級(ji)褶(zhe)(zhe)皺發(fa)育(yu)，受平山(shan)巖(yan)體(ti)破壞，由平山(shan)巖(yan)體(ti)向(xiang)西(xi)，軸向(xiang)近東西(xi)向(xiang)展布(bu)后，受母太子山(shan)橫斷層破壞向(xiang)北挪動，在(zai)橫斷層以(yi)西(xi)軸向(xiang)又(you)呈(cheng)近東西(xi)向(xiang)。
斷層：太子山—前東灣(wan)沖斷層，展(zhan)(zhan)布到蓮(lian)花(hua)山保(bao)護區，斷層南傾(qing)，為中三疊(die)統(tong)砂巖(yan)(yan)，灰巖(yan)(yan)、頁(ye)巖(yan)(yan)逆覆于上(shang)新統(tong)磚(zhuan)紅色(se)砂巖(yan)(yan)，礫巖(yan)(yan)之上(shang)。長達64km，傾(qing)角40°，其展(zhan)(zhan)布方向(xiang)由290°～270°結構面本身呈(cheng)彎曲的不規則波狀。
（2）河西構造體系
這一構(gou)造(zao)(zao)體(ti)系僅發現了沿洮(tao)河(he)的(de)橫(heng)斷層，其總體(ti)方(fang)向(xiang)330°。如(ru)峽城(cheng)橫(heng)斷層展布(bu)方(fang)向(xiang)為(wei)(wei)330°，傾角80°，在宗石至九甸峽一帶可見被壓(ya)碎巖(yan)石所構(gou)成(cheng)(cheng)(cheng)的(de)破碎帶及(ji)陡(dou)立的(de)磨(mo)光(guang)面和(he)近水平(ping)的(de)擦痕，這些表(biao)明(ming)其屬于壓(ya)扭性質。該(gai)(gai)橫(heng)斷層造(zao)(zao)成(cheng)(cheng)(cheng)東(dong)盤向(xiang)南(nan)推移，斷距(ju)達2km，沿洮(tao)河(he)往南(nan)由于斷距(ju)變小(xiao)而(er)反映的(de)不(bu)十分(fen)清楚，但拖拉褶皺說(shuo)(shuo)明(ming)了該(gai)(gai)斷裂(lie)的(de)存在，這在娃(wa)兒(er)溝南(nan)一帶反映尤為(wei)(wei)明(ming)顯。就洮(tao)河(he)在區范圍內(nei)來(lai)說(shuo)(shuo)它是受北(bei)西向(xiang)橫(heng)斷裂(lie)和(he)派生的(de)北(bei)東(dong)向(xiang)橫(heng)斷裂(lie)控制，僅局部地段沿襲了東(dong)西向(xiang)構(gou)造(zao)(zao)的(de)結構(gou)面從(cong)而(er)構(gou)成(cheng)(cheng)(cheng)了河(he)道(dao)彎(wan)曲。
甘肅蓮(lian)花山(shan)國家級自然保護區主要地貌類型(xing)有(you)：
（1）構(gou)造侵蝕地貌
①構(gou)造侵蝕深切割亞(ya)高(gao)山
組(zu)成物質：花崗石(shi)麻巖、石(shi)灰砂巖。
主要特(te)征(zheng)：絕對高度(du)(du)和(he)相對高度(du)(du)都在1000米以上，除山(shan)頂面積和(he)山(shan)間平臺外，山(shan)坡坡度(du)(du)多>35°，山(shan)體為溝谷(gu)深切，形成(cheng)“U”谷(gu)套(tao)“V”谷(gu)的特(te)征(zheng)，主要分布蓮(lian)花(hua)山(shan)西北(bei)段和(he)中段一帶。
現代地貌作用(yong)：外力(li)(li)作用(yong)具分(fen)帶現象，海(hai)拔(ba)3000米以上地區(qu)，寒(han)凍(dong)風化作用(yong)強烈，重力(li)(li)崩(beng)塌和滑(hua)坡屢有發生(sheng)。海(hai)拔(ba)3000米以下地區(qu)，則以暴流(liu)沖(chong)刷(shua)作用(yong)為主。
②構造侵蝕淺切割(ge)中(zhong)山(shan)
組成物質：砂礫(li)巖(yan)、頁巖(yan)、石英砂巖(yan)等(deng)。
主要特征：絕對(dui)高(gao)度(du)1000米(mi)，相對(dui)高(gao)度(du)500～1000米(mi)，山(shan)坡坡度(du)以25°～35°為主，位(wei)于山(shan)頂和(he)現(xian)代河(he)流裂點(dian)的上溯帶，切(qie)斷(duan)密度(du)甚大，山(shan)體為縱橫溝谷切(qie)割。
現代地(di)貌(mao)作用：以強烈的(de)流水(shui)沖刷(shua)為(wei)主，尤(you)其在(zai)汛期，有(you)小型水(shui)石流的(de)形成，加劇了(le)地(di)面的(de)侵蝕作用。
③黃土侵蝕溝壑
組成(cheng)物質(zhi)：第四系(xi)的黃土。
主要特征：絕對高度<1000米，相對高度<500米，切割深度小于250米，由于人為活動強烈，林木破壞嚴重，多呈稀疏的灌木林或灌草叢狀態，黃土坡面（陽坡）開墾為梯田。山間廣布較寬的谷地，多是農田和經濟林。
現代地貌作(zuo)用：山體(ti)顯得(de)低小(xiao)和(he)單薄，呈崗丘狀或渾(hun)圓，徑流更為分散，故(gu)山坡的線狀沖刷作(zuo)用占(zhan)次要(yao)地位，而面(mian)蝕作(zuo)用顯得(de)占(zhan)主導地位。
（2）河谷階地(di)地(di)貌
組成物(wu)質：細沙、砂粘(zhan)土，盆地底部邊緣分布砂礫質扇形地。
主要特征：絕對高度<1000米，相對高度10～50米，地勢平坦，分布于山間地帶，但山溪流到寬谷時流速減緩，多彎曲，對階地有切割作用。
現(xian)代地貌作用：沉(chen)積作用為主，在洪水泛濫(lan)時期沖刷側蝕較(jiao)嚴(yan)重(zhong)，甚至又出(chu)現(xian)新的沉(chen)積。
甘肅蓮花山保護區地處于內陸中緯地帶，西秦嶺西端，黃土高原向青藏高原過渡地帶。地勢較高，峰巒疊嶂，海拔3000米以上，阻擋冷空氣入侵，形成氣候較溫暖而降(jiang)(jiang)水(shui)(shui)(shui)較多(duo)(duo)，而多(duo)(duo)災害性天(tian)氣(qi)；冶力關、八角等地植被較好(hao)，天(tian)氣(qi)溫和而多(duo)(duo)雨；但(dan)雨水(shui)(shui)(shui)較廣而不(bu)均(jun)勻。形成復雜的氣(qi)候特征。寒冷(leng)(leng)、陰濕、四季(ji)(ji)不(bu)分明(ming)，降(jiang)(jiang)水(shui)(shui)(shui)東北多(duo)(duo)西南少，旱澇(lao)雹(bao)凍頻繁，具有長冬(dong)(dong)無夏(xia)、春秋相(xiang)連(lian)、冬(dong)(dong)長冬(dong)(dong)冷(leng)(leng)而不(bu)寒、春季(ji)(ji)回暖慢(man)、秋季(ji)(ji)降(jiang)(jiang)溫快、冬(dong)(dong)干秋濕的高原氣(qi)候特色。
按(an)照常規的(de)四季劃分標準，蓮花山保護區沒有夏季，春秋相連，平(ping)均初(chu)霜(shuang)期9月28日，平(ping)均終霜(shuang)期5月23日，無霜(shuang)期133天。
保護區的冬(dong)(dong)季(ji)，受季(ji)風(feng)的影響和陸地(di)冷氣(qi)(qi)(qi)團的控(kong)制，盛行(xing)偏北風(feng)，平均氣(qi)(qi)(qi)溫(wen)-5.6℃～-0.6℃，最(zui)(zui)冷月（1月）平均氣(qi)(qi)(qi)溫(wen)為-8.3℃，極端最(zui)(zui)低溫(wen)達-29℃，冬(dong)(dong)冷冬(dong)(dong)長(chang)，雨雪少。寒冷干(gan)燥，冬(dong)(dong)季(ji)降(jiang)雪量大部(bu)分地(di)區7至15mm，約占年(nian)降(jiang)水量的2%，降(jiang)水后冬(dong)(dong)多，前冬(dong)(dong)少，是全年(nian)降(jiang)水量最(zui)(zui)少的季(ji)節。
保護區在(zai)(zai)全國降(jiang)(jiang)水(shui)(shui)量(liang)地帶分布(bu)上(shang)除400mm降(jiang)(jiang)水(shui)(shui)等值線南(nan)側。多年(nian)平(ping)均(jun)降(jiang)(jiang)水(shui)(shui)量(liang)548.4mm。受(shou)季風(feng)和地形的(de)影響(xiang)，降(jiang)(jiang)雨(yu)時空分布(bu)不均(jun)。全年(nian)降(jiang)(jiang)水(shui)(shui)量(liang)多集中在(zai)(zai)7、8、9三個月，年(nian)平(ping)均(jun)降(jiang)(jiang)水(shui)(shui)量(liang)317.2mm，占全年(nian)降(jiang)(jiang)水(shui)(shui)量(liang)的(de)57.8%。降(jiang)(jiang)水(shui)(shui)量(liang)也隨海(hai)拔增高(gao)而遞增，海(hai)拔2100米(mi)左右(you)的(de)東(dong)北部(bu)，降(jiang)(jiang)水(shui)(shui)量(liang)500mm以上(shang)，海(hai)拔2500米(mi)以上(shang)的(de)西南(nan)部(bu)，降(jiang)(jiang)水(shui)(shui)量(liang)800mm。
干(gan)旱、冰雹、大雨、暴雨、連陰雨及霜凍是保護區(qu)的主要災害，嚴重危害著農牧業生產和人民生命財產的安(an)全。
保護區月(yue)(yue)平均(jun)氣溫(wen)以7月(yue)(yue)為最高，達21.1℃。6、8月(yue)(yue)略低(di)，分別(bie)是19.7℃和(he)(he)20.8℃。月(yue)(yue)平均(jun)最低(di)氣溫(wen)是1月(yue)(yue)份，為-15.6℃，12月(yue)(yue)和(he)(he)2月(yue)(yue)略低(di)，分別(bie)為-12.9℃和(he)(he)-11.9℃。
據1968～1982年資料記載，保護區年蒸(zheng)發(fa)量平均為(wei)1266.8mm，是(shi)全年降水量的2.3倍。春末(mo)夏初地溫急劇回升，蒸(zheng)發(fa)量大(da)于降水量。5～7月蒸(zheng)發(fa)量最大(da)，為(wei)525.4mm，會因(yin)水分入不敷出，發(fa)生干旱。
保護區內全(quan)年多(duo)為東(dong)(dong)(dong)南風(feng)，頻率6%；其次是(shi)東(dong)(dong)(dong)北風(feng)，頻率5%。冬季為東(dong)(dong)(dong)北風(feng)，最(zui)多(duo)頻率5%，靜風(feng)頻率63%。全(quan)年最(zui)多(duo)東(dong)(dong)(dong)北——東(dong)(dong)(dong)南風(feng)，最(zui)大頻率4%，靜風(feng)頻率59%。年平均風(feng)速14m/s。
甘肅蓮花山國家級自然(ran)保護區(qu)分布的土(tu)(tu)(tu)壤為地帶性土(tu)(tu)(tu)壤，主要分為亞高山草甸土(tu)(tu)(tu)、暗棕土(tu)(tu)(tu)、黑土(tu)(tu)(tu)、栗鈣土(tu)(tu)(tu)和紅粘土(tu)(tu)(tu)。
其中(zhong)，亞(ya)高山草(cao)甸土(tu)：包括2個(ge)土(tu)屬(shu)，2個(ge)土(tu)種，即(ji)：亞(ya)高山草(cao)甸土(tu)和亞(ya)高山灌叢草(cao)甸土(tu)。
暗(an)棕壤(rang)(rang)：包括2個(ge)土(tu)屬，2個(ge)土(tu)種，即：暗(an)棕壤(rang)(rang)和(he)草甸(dian)暗(an)棕壤(rang)(rang)。
黑土(tu)：包括2個土(tu)屬，2個土(tu)種(zhong)，即：灌叢(cong)黑土(tu)和(he)生草黑土(tu)。
栗鈣土：包(bao)括1個土屬，1個土種，即：疏林栗鈣土。
紅粘(zhan)土(tu)：包(bao)括2個(ge)土(tu)屬，2個(ge)土(tu)種，即：灌叢(cong)紅土(tu)和生(sheng)草紅土(tu)。
區內土壤垂直分布狀況為：
海拔3300～3500米(mi)為亞高(gao)山(shan)草(cao)甸土帶；海拔2600～3300米(mi)為暗棕壤帶；海拔2200～2600米(mi)為黑土帶；海拔2000～2500米(mi)為栗鈣土和紅粘土帶。
保護區內的土壤以(yi)暗棕壤為主，其次為黑(hei)土帶，再次為亞高山草甸土帶。
甘肅(su)蓮花山國家級自然保(bao)護(hu)區內(nei)地(di)(di)表(biao)水(shui)和地(di)(di)下水(shui)豐(feng)富。保(bao)護(hu)區地(di)(di)處洮河(he)、冶木河(he)匯流(liu)的三(san)角(jiao)地(di)(di)帶，是黃(huang)河(he)與長江兩大水(shui)系(xi)的分水(shui)嶺和一些支流(liu)的發源(yuan)地(di)(di)。蓮花山保(bao)護(hu)區的水(shui)系(xi)屬(shu)于黃(huang)河(he)水(shui)系(xi)，主要支流(liu)為洮河(he)。
1、地表水
（1）洮河
洮(tao)河是黃(huang)河上(shang)游(you)的一支(zhi)較大支(zhi)流(liu)(liu)，發源(yuan)于甘肅(su)、青海兩省交界(jie)處的西傾山(shan)北麓、由西向(xiang)東流(liu)(liu)經岷縣(xian)(xian)折向(xiang)北流(liu)(liu)，流(liu)(liu)經蓮花山(shan)保護(hu)區東北邊緣，至(zhi)永靖縣(xian)(xian)境內匯入黃(huang)河劉家(jia)峽水庫。
蓮(lian)花山保護區以上流(liu)域植被良好，水土流(liu)失較輕，河流(liu)含沙量(liang)較小。
（2）冶木河
冶木河發源于(yu)太子山(shan)南麓，源地(di)海拔(ba)高程3920米，河流(liu)自西向東流(liu)經夏(xia)河、卓尼、臨潭、康樂等(deng)縣(xian)，于(yu)康樂縣(xian)蓮麓鄉(xiang)注入洮河，是洮河一大(da)(da)支流(liu)，干流(liu)平均坡降(jiang)26.5‰，流(liu)域為(wei)橢圓形(xing)，地(di)表起伏較大(da)(da)，山(shan)大(da)(da)溝(gou)深(shen)，氣候(hou)高寒濕(shi)潤，山(shan)地(di)陰坡森林茂密，植被良好。
2、地下水
保護區地表水(shui)和地下(xia)水(shui)相(xiang)當豐富、水(shui)流量(liang)較大(da)的有(you)(you)洮河(he)(he)、冶木河(he)(he)，還有(you)(you)磨溝(gou)(gou)河(he)(he)、八(ba)度河(he)(he)、黑牛河(he)(he)、蛇(she)路溝(gou)(gou)、安藏溝(gou)(gou)、冰扎溝(gou)(gou)等(deng)大(da)小(xiao)河(he)(he)流30余處，大(da)大(da)小(xiao)小(xiao)的溝(gou)(gou)岔均(jun)有(you)(you)泉水(shui)涌出。
甘(gan)肅蓮花山國(guo)家(jia)級自然保護(hu)區位于臨夏、甘(gan)南、定西三州(zhou)市的康(kang)
樂(le)、臨(lin)潭、卓尼(ni)、渭源、臨(lin)洮(tao)(tao)五縣交(jiao)界處，地理(li)(li)位(wei)置(zhi)在東(dong)經103°39′59″～103°50′26″，北緯(wei)34°54′17″～35°01′43″，總面積11691公頃。保(bao)(bao)護(hu)區(qu)(qu)東(dong)至(zhi)洮(tao)(tao)河，西(xi)臨(lin)洮(tao)(tao)河林(lin)(lin)業局的(de)(de)冶(ye)力關(guan)林(lin)(lin)場，南(nan)靠洮(tao)(tao)河林(lin)(lin)業局的(de)(de)羊沙林(lin)(lin)場，北沿冶(ye)木河為(wei)界，為(wei)洮(tao)(tao)河林(lin)(lin)區(qu)(qu)的(de)(de)東(dong)北邊(bian)緣。 [3] ?保(bao)(bao)護(hu)區(qu)(qu)內(nei)涉及(ji)蓮蘆、冶(ye)力關(guan)、八角、藏巴(ba)哇4個鄉的(de)(de)蓮花山、足(zu)古川、地寺坪、寺址(zhi)、蛇路、八度、牙布山、上東(dong)山、柳林(lin)(lin)9個行政村。保(bao)(bao)護(hu)區(qu)(qu)的(de)(de)核(he)心區(qu)(qu)、緩沖區(qu)(qu)、實(shi)驗區(qu)(qu)，由保(bao)(bao)護(hu)區(qu)(qu)管理(li)(li)機構設置(zhi)界標，予(yu)以公告。
甘肅蓮花山國家級自(zi)然(ran)保(bao)(bao)護(hu)區(qu)內森林是中國西(xi)部黃土高原向青藏高原過渡地帶(dai)亞高山針葉(xie)林的重要(yao)組成部分，保(bao)(bao)存(cun)了干旱地區(qu)典(dian)型的森林生(sheng)態系統。保(bao)(bao)護(hu)區(qu)內具有明顯的森林植被(bei)垂直帶(dai)譜(pu)，包羅了從溫帶(dai)到(dao)寒溫帶(dai)的典(dian)型自(zi)然(ran)景觀，是歐亞大陸從溫帶(dai)到(dao)寒溫帶(dai)主要(yao)植被(bei)類型的縮(suo)影，具有很高的科研價值。
保護區生物(wu)資源(yuan)豐(feng)富(fu)，組成(cheng)成(cheng)分(fen)和(he)結構極為復(fu)雜，物(wu)種(zhong)多樣性程(cheng)度和(he)物(wu)種(zhong)總數豐(feng)度高(gao)，截至(zhi)2012年(nian)，保護區有種(zhong)子(zi)植(zhi)物(wu)90科346屬745種(zhong)，列(lie)為國(guo)家保護的植(zhi)物(wu)有星葉草、紅花綠絨蒿(hao)、胡桃、垂枝云(yun)杉(shan)、野大豆、黃蓍、木姜子(zi)、桃兒(er)七、紫斑牡丹(dan)等(deng)11種(zhong)和(he)蘭(lan)科植(zhi)物(wu)毛杓蘭(lan)、紫點杓蘭(lan)等(deng)15種(zhong)。其中(zhong)(zhong)木本植(zhi)物(wu)123種(zhong)、草本和(he)藤本167種(zhong)。木本植(zhi)物(wu)中(zhong)(zhong)，優勢(shi)種(zhong)是冷(leng)杉(shan)、云(yun)杉(shan)、黃尖柳、華山(shan)(shan)松、油松、山(shan)(shan)楊、白(bai)樺等(deng)。另外，還有藥用植(zhi)物(wu)100多種(zhong)。
保護(hu)區內草(cao)藥不少(shao)。“桃兒七”產(chan)地(di)(di)在中國(guo)西部地(di)(di)區，它(ta)是(shi)小染料的植物鬼日的根(gen)和莖，臨床實踐表明，它(ta)對一些癌癥有較好的醫(yi)效。
保護(hu)區內有天目瓊花，它們生活在海拔2400米(mi)上(shang)下(xia)的治木林中，三、四米(mi)高，開著白色的傘狀大(da)花。
甘肅(su)蓮(lian)花(hua)山國(guo)家級(ji)自(zi)然保(bao)護(hu)區(qu)作為中(zhong)國(guo)重要的自(zi)然地(di)理分
界線和候(hou)鳥(niao)遷徙通道，其特殊的地理位置和豐富的生(sheng)物(wu)資(zi)源成為青藏高原向黃土(tu)高原過渡地帶的基因庫(ku)，在拯(zheng)救(jiu)珍稀瀕危野生(sheng)動植物(wu)、生(sheng)物(wu)多樣性研究、維護地區生(sheng)態安(an)全、促進社區發(fa)(fa)展方面發(fa)(fa)揮著重要的作用。
保護區動(dong)(dong)(dong)物(wu)資(zi)源豐富。截(jie)至2012年，有(you)野生動(dong)(dong)(dong)物(wu)749種(zhong)(zhong)，其(qi)中獸類(lei)45種(zhong)(zhong)，隸(li)(li)(li)(li)屬(shu)(shu)于6目(mu)、17科、35屬(shu)(shu)。鳥類(lei)133種(zhong)(zhong)，隸(li)(li)(li)(li)屬(shu)(shu)14目(mu)33科89屬(shu)(shu)。兩(liang)棲動(dong)(dong)(dong)物(wu)有(you)4種(zhong)(zhong)，隸(li)(li)(li)(li)屬(shu)(shu)于2目(mu)、4科、4屬(shu)(shu)，爬行動(dong)(dong)(dong)物(wu)2種(zhong)(zhong)，隸(li)(li)(li)(li)屬(shu)(shu)于1目(mu)、2科、2屬(shu)(shu)；魚類(lei)5種(zhong)(zhong)，隸(li)(li)(li)(li)屬(shu)(shu)于1目(mu)、2科，森林(lin)(lin)昆(kun)蟲560余種(zhong)(zhong)。列入國家重(zhong)點保護的(de)野生動(dong)(dong)(dong)物(wu)有(you)38種(zhong)(zhong)。其(qi)中有(you)一級(ji)保護動(dong)(dong)(dong)物(wu)斑尾榛(zhen)雞(ji)、雉(zhi)鶉、胡兀鷲、林(lin)(lin)麝、馬(ma)麝等(deng)9種(zhong)(zhong)；有(you)二級(ji)保護動(dong)(dong)(dong)物(wu)蘇門羚、斑羚、巖(yan)羊(yang)、藍馬(ma)雞(ji)、血雉(zhi)等(deng)31種(zhong)(zhong)。
甘肅蓮花山國(guo)家級自然保護區總面(mian)積(ji)11691公(gong)(gong)(gong)(gong)頃，其中林業用地(di)面(mian)積(ji)9240公(gong)(gong)(gong)(gong)頃，非(fei)林業用地(di)2451公(gong)(gong)(gong)(gong)頃。全區森林覆蓋率69.3%。在(zai)林業用地(di)中，有林地(di)面(mian)積(ji)4073公(gong)(gong)(gong)(gong)頃，宜林地(di)面(mian)積(ji)788公(gong)(gong)(gong)(gong)頃，灌木林面(mian)積(ji)4034公(gong)(gong)(gong)(gong)頃，疏(shu)林地(di)面(mian)積(ji)108公(gong)(gong)(gong)(gong)頃，未成林造林地(di)面(mian)積(ji)223公(gong)(gong)(gong)(gong)頃，苗圃地(di)面(mian)積(ji)14公(gong)(gong)(gong)(gong)頃。
全林(lin)區(qu)天然(ran)林(lin)面(mian)(mian)(mian)積(ji)(ji)(ji)3322公頃(qing)，人工林(lin)面(mian)(mian)(mian)積(ji)(ji)(ji)751公頃(qing)。全區(qu)活立木(mu)總(zong)蓄(xu)積(ji)(ji)(ji)224853m3，其中，天然(ran)林(lin)蓄(xu)積(ji)(ji)(ji)224406m3，人工林(lin)蓄(xu)積(ji)(ji)(ji)447m3。森林(lin)按林(lin)分類型劃分，樺木(mu)林(lin)面(mian)(mian)(mian)積(ji)(ji)(ji)1764公頃(qing)，蓄(xu)積(ji)(ji)(ji)98567m3，冷杉林(lin)面(mian)(mian)(mian)積(ji)(ji)(ji)607公頃(qing)，蓄(xu)積(ji)(ji)(ji)73216m3，云杉林(lin)面(mian)(mian)(mian)積(ji)(ji)(ji)1132公頃(qing)，蓄(xu)積(ji)(ji)(ji)42045m3，楊樹林(lin)面(mian)(mian)(mian)積(ji)(ji)(ji)147公頃(qing)，蓄(xu)積(ji)(ji)(ji)5068m3，華山松面(mian)(mian)(mian)積(ji)(ji)(ji)130公頃(qing)，蓄(xu)積(ji)(ji)(ji)4549m3，櫟林(lin)面(mian)(mian)(mian)積(ji)(ji)(ji)33公頃(qing)，蓄(xu)積(ji)(ji)(ji)1193m3，落葉松面(mian)(mian)(mian)積(ji)(ji)(ji)106公頃(qing)，油松面(mian)(mian)(mian)積(ji)(ji)(ji)154公頃(qing)，蓄(xu)積(ji)(ji)(ji)215m3。
辦公室：負責(ze)政務工(gong)作，組織(zhi)擬訂工(gong)作計劃；組織(zhi)執(zhi)行(xing)各項工(gong)作制度(du)；負責(ze)文秘(mi)、機要、宣傳(chuan)、檔案、信訪、信息、接待、后勤保(bao)障、基(ji)本建(jian)設、車輛調配、保(bao)密(mi)、外事等工(gong)作。
組織人事(shi)科(ke)（工(gong)(gong)會、團委）：負責(ze)(ze)黨(dang)(dang)務(wu)工(gong)(gong)作，貫徹落實黨(dang)(dang)和(he)(he)國家有關組織、人事(shi)、勞動、統(tong)戰、僑務(wu)、老干(gan)部(bu)、紀(ji)(ji)檢等方面的(de)方針政策，并監督執行；負責(ze)(ze)基層管(guan)(guan)理(li)站領(ling)導班子建(jian)設(she)(she)、干(gan)部(bu)和(he)(he)人才隊伍管(guan)(guan)理(li)；負責(ze)(ze)機構、職能(neng)配置、人員(yuan)編(bian)制、調(diao)配、職稱評(ping)聘(pin)、干(gan)部(bu)和(he)(he)技術工(gong)(gong)人考核培訓；負責(ze)(ze)勞動工(gong)(gong)資、福利(li)、津貼、社會統(tong)籌保險(xian)等工(gong)(gong)作；負責(ze)(ze)紀(ji)(ji)檢、監察、內部(bu)審計、黨(dang)(dang)風廉(lian)政建(jian)設(she)(she)工(gong)(gong)作；協(xie)調(diao)工(gong)(gong)、青、婦(fu)工(gong)(gong)作。
計劃(hua)財(cai)務(wu)科（項目辦）：負(fu)(fu)責經費預（決）算，資金籌措、使用和(he)管理(li)工(gong)作；負(fu)(fu)責年度計劃(hua)的制定(ding)，并組織實施；負(fu)(fu)責國(guo)有資產管理(li)、統計、財(cai)務(wu)及專控商品購(gou)置申報(bao)等工(gong)作；負(fu)(fu)責項目的篩(shai)選、論(lun)證(zheng)、申報(bao)、儲(chu)備等工(gong)作。
科(ke)(ke)研(yan)管理科(ke)(ke)（森(sen)防(fang)站）：負(fu)(fu)(fu)(fu)(fu)責(ze)動植物棲(qi)息地及森(sen)林(lin)(lin)(lin)生態系統的定位觀(guan)測和環境監測；負(fu)(fu)(fu)(fu)(fu)責(ze)新(xin)技術(shu)開發、引進(jin)與(yu)推廣；負(fu)(fu)(fu)(fu)(fu)責(ze)編制研(yan)究報告、確定科(ke)(ke)研(yan)課題，并組織(zhi)實(shi)施(shi)；負(fu)(fu)(fu)(fu)(fu)責(ze)配合國內外專家進(jin)行(xing)科(ke)(ke)研(yan)、考察及學術(shu)交流(liu)活動；負(fu)(fu)(fu)(fu)(fu)責(ze)向社區群眾進(jin)行(xing)科(ke)(ke)普宣傳教育；負(fu)(fu)(fu)(fu)(fu)責(ze)貫(guan)徹執行(xing)森(sen)林(lin)(lin)(lin)病(bing)蟲害防(fang)治的政策、法(fa)規；負(fu)(fu)(fu)(fu)(fu)責(ze)森(sen)林(lin)(lin)(lin)病(bing)蟲害的調查、監測、預報、防(fang)治、檢疫等工作；負(fu)(fu)(fu)(fu)(fu)責(ze)森(sen)林(lin)(lin)(lin)病(bing)蟲害項目的篩(shai)選、論證(zheng)、申(shen)報。
資(zi)源(yuan)(yuan)管理(li)科（退耕辦、天保辦）：負(fu)(fu)責(ze)監督執行國家有關保護(hu)森林(lin)(lin)資(zi)源(yuan)(yuan)的(de)法律法規(gui)；負(fu)(fu)責(ze)保護(hu)區內造林(lin)(lin)綠化、森林(lin)(lin)經(jing)營、種苗及(ji)天保工程的(de)管理(li)；負(fu)(fu)責(ze)組織(zhi)森林(lin)(lin)資(zi)源(yuan)(yuan)調查規(gui)劃及(ji)資(zi)源(yuan)(yuan)動態監測；負(fu)(fu)責(ze)作業設計、檢查驗收(shou)、票(piao)證管理(li)、林(lin)(lin)地管理(li)、林(lin)(lin)政稽查等工作。
產業開發科（森(sen)林公園(yuan)）：負(fu)責森(sen)林生態旅游(you)、林下資源開發等多種經營項目的管理；負(fu)責組(zu)織社區群眾參(can)與保護區建設和旅游(you)服務；負(fu)責對(dui)社區扶持項目進行技術指導。
護(hu)林(lin)防(fang)(fang)(fang)火辦公室(shi)：負(fu)責貫徹執(zhi)行國家(jia)護(hu)林(lin)防(fang)(fang)(fang)火的(de)法律法規(gui)；負(fu)責制(zhi)定護(hu)林(lin)防(fang)(fang)(fang)火預案；負(fu)責護(hu)林(lin)防(fang)(fang)(fang)火工程項目(mu)的(de)編制(zhi)、申報，并組織實施(shi)；負(fu)責防(fang)(fang)(fang)火期(qi)的(de)值班、檢(jian)查(cha)、指導、統計、火險等(deng)級預報等(deng)工作；負(fu)責防(fang)(fang)(fang)火物(wu)資(zi)、通(tong)訊設施(shi)的(de)貯備和管理使用；負(fu)責護(hu)林(lin)防(fang)(fang)(fang)火宣傳。
基層(ceng)保(bao)(bao)護(hu)(hu)站：負責(ze)監(jian)督執行(xing)國家有關保(bao)(bao)護(hu)(hu)森林(lin)資(zi)源的(de)法律(lv)法規(gui)；負責(ze)組(zu)織轄區內造林(lin)綠(lv)化、資(zi)源調查(cha)、育苗及森林(lin)經營等工作；組(zu)織森林(lin)資(zi)源巡護(hu)(hu)與(yu)監(jian)測；負責(ze)轄區內新成林(lin)驗(yan)收、票證管(guan)理、林(lin)地管(guan)理、林(lin)政稽(ji)查(cha)工作；負責(ze)向轄區內群眾(zhong)宣傳林(lin)業法律(lv)法規(gui)。
甘肅蓮花(hua)山(shan)國家級(ji)自然(ran)保護區內(nei)的護林(lin)防火(huo)、森林(lin)病蟲害防治(zhi)、資源保護、禁種罌粟等工作(zuo)。
宣傳、貫徹執行國家有(you)關自然保護區的法律(lv)、法規(gui)和方(fang)針、政策；
負責實施保(bao)護區總體規劃(hua)和年度計劃(hua)，制定和實施各項管(guan)理制度；
負責保護區野生動(dong)植物資源(yuan)調查和(he)環境監測(ce)，建(jian)立資源(yuan)檔(dang)案；
負責保護、拯(zheng)救、增殖珍貴稀有生(sheng)物(wu)物(wu)種；
組織在保護區(qu)內進行森林撫育和(he)植樹造林；
組織在保(bao)護(hu)區內(nei)開展科(ke)研、參觀、考察、旅游等活動；
負責保(bao)護區內自然(ran)資源、生態(tai)環境的保(bao)護管理工作，組織開展森(sen)林(lin)防火及(ji)森(sen)林(lin)病蟲(chong)害防治；
依法查處破壞(huai)保護區(qu)自然資源和(he)生態環(huan)境的違法行為。
蓮花山，主峰(feng)海拔3578米，呈(cheng)磷(lin)形(xing)斷層，矗(chu)立云端(duan)，
酷(ku)似一(yi)(yi)朵初綻的蓮花盛開在(zai)綠波翠色之(zhi)(zhi)(zhi)中(zhong)，故(gu)名(ming)——蓮花山(shan)(shan)(shan)。蓮花山(shan)(shan)(shan)古(gu)稱西崆峒，據(ju)考證(zheng)廣成(cheng)之(zhi)(zhi)(zhi)子(zi)曾(ceng)在(zai)此修成(cheng)正果。早在(zai)明初，蓮花山(shan)(shan)(shan)就被(bei)辟為佛、道教名(ming)山(shan)(shan)(shan)，有(you)古(gu)建筑上(shang)千間，能食宿上(shang)萬(wan)(wan)人。這(zhe)里林木蔥郁，茂密無(wu)限，奇(qi)峰屹立，碧波萬(wan)(wan)頃，鳥語(yu)花香(xiang)，山(shan)(shan)(shan)清水秀，不是江(jiang)南勝(sheng)于江(jiang)南，有(you)泰山(shan)(shan)(shan)之(zhi)(zhi)(zhi)雄，華(hua)山(shan)(shan)(shan)之(zhi)(zhi)(zhi)險(xian)，廬山(shan)(shan)(shan)之(zhi)(zhi)(zhi)美，青城之(zhi)(zhi)(zhi)幽，峨眉之(zhi)(zhi)(zhi)秀的美贊。是一(yi)(yi)座集(ji)自然風光，人文(wen)景觀，民俗(su)風情(qing)于一(yi)(yi)體的旅(lv)游名(ming)山(shan)(shan)(shan)。
蓮(lian)花(hua)山(shan)(shan)景(jing)點有：蓮(lian)花(hua)山(shan)(shan)山(shan)(shan)門(men)，三仙女(nv)，黑虎臥石，碑林（112塊），蓮(lian)花(hua)寶殿(dian)(dian)(dian)(dian)(dian)(dian)，菩薩(sa)殿(dian)(dian)(dian)(dian)(dian)(dian)，頭(tou)天(tian)(tian)門(men)，二天(tian)(tian)門(men)，三天(tian)(tian)門(men)，四天(tian)(tian)門(men)，娘(niang)(niang)娘(niang)(niang)殿(dian)(dian)(dian)(dian)(dian)(dian)，獨(du)木橋，巨(ju)龍橋，轉(zhuan)閣(ge)樓，紫宵宮，靈(ling)宮殿(dian)(dian)(dian)(dian)(dian)(dian)，舍身崖，娘(niang)(niang)娘(niang)(niang)殿(dian)(dian)(dian)(dian)(dian)(dian)，磨(mo)針殿(dian)(dian)(dian)(dian)(dian)(dian)，藥王殿(dian)(dian)(dian)(dian)(dian)(dian)殿(dian)(dian)(dian)(dian)(dian)(dian)，夫子殿(dian)(dian)(dian)(dian)(dian)(dian)，吳家庵，神仙洞，金頂，八仙臺(tai)，水(shui)簾洞，太白殿(dian)(dian)(dian)(dian)(dian)(dian)，白鸚閣(ge)，文(wen)昌閣(ge)，魁星閣(ge)，夾人巷，王母殿(dian)(dian)(dian)(dian)(dian)(dian)，玉皇(huang)閣(ge)，了望臺(tai)，雷祖(zu)殿(dian)(dian)(dian)(dian)(dian)(dian)，觀音殿(dian)(dian)(dian)(dian)(dian)(dian)，老(lao)君殿(dian)(dian)(dian)(dian)(dian)(dian)，七真殿(dian)(dian)(dian)(dian)(dian)(dian)，三皇(huang)洞，送子殿(dian)(dian)(dian)(dian)(dian)(dian)。
甘(gan)肅蓮花山(shan)國家級(ji)自(zi)然保(bao)護(hu)區西側有省道S311線通過，使保(bao)護(hu)區通往蘭州和(he)(he)周邊各縣的交通條件(jian)便利。保(bao)護(hu)區內道路暢通，總計(ji)通車里(li)程約46km，足（足古川）蓮（蓮花山(shan)）公(gong)路和(he)(he)林區便道是(shi)連接(jie)保(bao)護(hu)區管(guan)理局(ju)至各保(bao)護(hu)管(guan)理站(zhan)的主要交通線。
2008～2009年，甘肅(su)蓮(lian)花(hua)山國家(jia)(jia)級(ji)自然(ran)保(bao)護區(qu)(qu)與(yu)甘肅(su)農業大(da)學林(lin)學院(yuan)聯(lian)合(he)開展《蓮(lian)花(hua)山國家(jia)(jia)級(ji)自然(ran)保(bao)護區(qu)(qu)森林(lin)植被恢復(fu)效果(guo)評(ping)價研(yan)(yan)究(jiu)》、《蓮(lian)花(hua)山森林(lin)群落(luo)(luo)物種(zhong)多樣性和空間格局的分形研(yan)(yan)究(jiu)》、《蓮(lian)花(hua)山國家(jia)(jia)級(ji)自然(ran)保(bao)護區(qu)(qu)森林(lin)群落(luo)(luo)物種(zhong)多樣性測度及(ji)次級(ji)自然(ran)單元優先保(bao)護評(ping)價》、《蓮(lian)花(hua)山國家(jia)(jia)級(ji)自然(ran)保(bao)護區(qu)(qu)真菌物種(zhong)多樣性、群落(luo)(luo)結構及(ji)其與(yu)植物群落(luo)(luo)之關系(xi)研(yan)(yan)究(jiu)》等科(ke)(ke)研(yan)(yan)項目。在合(he)作(zuo)方式上，保(bao)護區(qu)(qu)科(ke)(ke)研(yan)(yan)人員將直(zhi)接(jie)參與(yu)科(ke)(ke)研(yan)(yan)項目的研(yan)(yan)究(jiu)，對(dui)帶動和培養保(bao)護區(qu)(qu)科(ke)(ke)研(yan)(yan)人才，提高保(bao)護區(qu)(qu)科(ke)(ke)研(yan)(yan)水平(ping)起到積極作(zuo)用(yong)。
科研項目以(yi)蓮花山林(lin)區(qu)森林(lin)恢復(fu)現狀為(wei)依(yi)據(ju)，構建(jian)植被(bei)恢復(fu)測(ce)度指標體(ti)系(xi)及(ji)其評價方法，探討其退化生態系(xi)統(tong)的植被(bei)恢復(fu)措(cuo)施(shi)以(yi)及(ji)植被(bei)在(zai)不同的恢復(fu)途徑(jing)下與物(wu)種多(duo)樣性的關(guan)系(xi)，為(wei)蓮花山山地林(lin)區(qu)植被(bei)乃至整個西北、全國林(lin)區(qu)次生植被(bei)生態系(xi)統(tong)恢復(fu)測(ce)度指標及(ji)恢復(fu)重建(jian)途徑(jing)提(ti)(ti)供理論依(yi)據(ju)和決策參考(kao)，并將(jiang)為(wei)開展(zhan)和堅(jian)持長期的生態系(xi)統(tong)定位(wei)研究提(ti)(ti)供重要依(yi)據(ju)。
