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1991年11月18日，保護區(qu)湖北省人(ren)民政府批準建(jian)立。
1998年8月18日，國(guo)務院批升(sheng)保護(hu)區為國(guo)家級自然保護(hu)區。
保護區(qu)位(wei)于(yu)湖北省石(shi)首市天鵝洲長江故道(dao)區(qu)，地理(li)坐標(biao)為東經112°33′，北緯29°49′。
天鵝洲故道(dao)是1972年長江自(zi)然裁彎形成(cheng)，由遺留的(de)長江故道(dao)、故道(dao)圍繞的(de)小島和故道(dao)外的(de)邊灘(tan)(tan)組成(cheng)。麋鹿自(zi)然保(bao)護(hu)區位于其邊灘(tan)(tan)中，屬(shu)典型(xing)的(de)近代河流沖積(ji)物沉積(ji)而成(cheng)的(de)洲灘(tan)(tan)平原。該(gai)地海(hai)拔在31~36m。
保護區屬中亞熱(re)帶濕(shi)潤季風氣候。年均氣溫16.5℃，極(ji)端(duan)高(gao)溫38.6℃，極(ji)端(duan)低溫-14.9℃。年平均降(jiang)雨量1200mm以上，相對濕(shi)度82%，年均無霜期261天。
保(bao)護(hu)區內土(tu)(tu)壤形成歷(li)史(shi)不(bu)長，成土(tu)(tu)母質單一(yi)，主要土(tu)(tu)類為草(cao)甸土(tu)(tu)及潮(chao)土(tu)(tu)，質地(di)為輕壤和沙壤，有機質含量(liang)高，潛在營養豐富。
保(bao)護區南面(mian)緊接長(chang)江，北面(mian)和東面(mian)為(wei)長(chang)江故道環繞，西(xi)面(mian)是防洪民堤，堤內為(wei)農業(ye)區。面(mian)積(ji)1567公頃。
保護(hu)(hu)區屬野生(sheng)生(sheng)物類(lei)中的野生(sheng)動物類(lei)型自(zi)然保護(hu)(hu)區，主(zhu)要(yao)保護(hu)(hu)對象是野化麋鹿及其棲息(xi)的淡水沼澤(ze)生(sheng)態系統(tong)。
截至(zhi)2011年，保護區(qu)初步(bu)統計(ji)共有(you)植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)64科168屬238種(zhong)。從故道淺(qian)水(shui)區(qu)到沿(yan)岸洲灘逐漸(jian)向高處分布，有(you)湖(hu)泊植(zhi)(zhi)(zhi)被的沉水(shui)植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)，如眼子菜、苦草(cao)(cao)(cao)等(deng)；浮水(shui)植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)如菱、芡實、浮萍等(deng)；挺水(shui)植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)如茭白、荻、蘆葦(wei)等(deng)及沼澤植(zhi)(zhi)(zhi)被的豐富草(cao)(cao)(cao)類，如苔草(cao)(cao)(cao)、蓼、水(shui)燈心、稗草(cao)(cao)(cao)、蒿(hao)類和多種(zhong)豆科植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)，其(qi)中以蘆葦(wei)和荻群(qun)落為主，也有(you)比較開闊的淺(qian)灘草(cao)(cao)(cao)地和成片(pian)的旱柳灌叢。
截至2011年，保(bao)護(hu)區內的脊椎動物以鳥(niao)(niao)(niao)類(lei)(lei)最為豐(feng)(feng)富(fu)，共有鳥(niao)(niao)(niao)類(lei)(lei)14目28科45屬60種。鳥(niao)(niao)(niao)類(lei)(lei)中(zhong)有國(guo)家重點保(bao)護(hu)鳥(niao)(niao)(niao)類(lei)(lei)11種，其中(zhong)一級保(bao)護(hu)3種（白鸛(guan)、黑鸛(guan)、大鴇(bao)），二(er)級保(bao)護(hu)8種。此外，還有分布有豐(feng)(feng)富(fu)的兩(liang)棲爬行類(lei)(lei)動物和魚類(lei)(lei)。
保(bao)(bao)(bao)護(hu)(hu)(hu)(hu)區(qu)(qu)將根據自(zi)然保(bao)(bao)(bao)護(hu)(hu)(hu)(hu)區(qu)(qu)管(guan)(guan)理(li)的(de)(de)有(you)關(guan)法律、法規的(de)(de)要求，以野生(sheng)麋鹿種(zhong)群及其自(zi)然環(huan)境(jing)就地(di)保(bao)(bao)(bao)護(hu)(hu)(hu)(hu)為核(he)心(xin)，實現保(bao)(bao)(bao)護(hu)(hu)(hu)(hu)區(qu)(qu)資(zi)(zi)(zi)源管(guan)(guan)護(hu)(hu)(hu)(hu)、科(ke)學(xue)研究(jiu)(jiu)和科(ke)普宣教相結合(he)，積極開(kai)展國內(nei)外合(he)作(zuo)與交(jiao)流，合(he)理(li)開(kai)發利(li)用自(zi)然資(zi)(zi)(zi)源，有(you)限度地(di)開(kai)展生(sheng)態旅(lv)游和多種(zhong)經營，提高(gao)保(bao)(bao)(bao)護(hu)(hu)(hu)(hu)區(qu)(qu)的(de)(de)自(zi)我發展能力，將保(bao)(bao)(bao)護(hu)(hu)(hu)(hu)區(qu)(qu)建成融科(ke)學(xue)研究(jiu)(jiu)、環(huan)境(jing)教育、生(sheng)態旅(lv)游、自(zi)然資(zi)(zi)(zi)源有(you)效保(bao)(bao)(bao)護(hu)(hu)(hu)(hu)為一體，管(guan)(guan)理(li)水平(ping)達國內(nei)領先水平(ping)并在(zai)國際上具有(you)較高(gao)知(zhi)名度的(de)(de)示范(fan)自(zi)然保(bao)(bao)(bao)護(hu)(hu)(hu)(hu)區(qu)(qu)。
保護(hu)區先后與(yu)北(bei)京麋鹿(lu)生態試驗中心、國家環保總局南京環科所、中科院(yuan)(yuan)動物所、中科院(yuan)(yuan)武漢(han)植物所、武漢(han)大(da)學(xue)環境資(zi)源學(xue)院(yuan)(yuan)建(jian)立了科研合(he)作關(guan)系，取得了豐富的研究資(zi)料(liao)和(he)數據(ju)，為保護(hu)區規范化建(jian)設提供(gong)了強有力(li)的保障(zhang)。
保護區具(ju)有五大(da)生態特色，《湖(hu)北(bei)省(sheng)旅(lv)游(you)總體規劃》已將天鵝洲列為(wei)湖(hu)北(bei)省(sheng)十二大(da)特色精品旅(lv)游(you)區之一，2006年(nian)又被中(zhong)(zhong)國(guo)旅(lv)游(you)營銷年(nian)會(hui)授予為(wei)“中(zhong)(zhong)國(guo)優秀(xiu)旅(lv)游(you)目的地”。
石首麋鹿自然保護區保護區以其良好的濕地生態環境、豐富的生物多樣性、成功的麋鹿野生(sheng)繁育實(shi)踐(jian)贏得了國內外專家學者的(de)廣泛(fan)贊(zan)譽和社(she)會各(ge)界的(de)高度關(guan)注(zhu)。
2004年，北京(jing)市科委(wei)組(zu)織召開的(de)“麋(mi)鹿(lu)重(zhong)引(yin)進(jin)項(xiang)目”科技(ji)成(cheng)(cheng)果鑒定(ding)(ding)會(hui)上(shang)，專家們(men)一致認定(ding)(ding)石首麋(mi)鹿(lu)保護區率先建立了(le)世界上(shang)完全擺脫對人類依賴、可自我維持的(de)野生種群，結束了(le)數百年來無野生麋(mi)鹿(lu)的(de)歷史，是中國(guo)物種重(zhong)引(yin)進(jin)的(de)成(cheng)(cheng)功典范。
保護區既是黑鸛、東方大白(bai)鸛、天鵝(e)、大鴇等(deng)國家(jia)一級(ji)保護動物(wu)(wu)的(de)(de)主要棲息地，也是瀕危水生(sheng)動物(wu)(wu)“長江女(nv)神(shen)”白(bai)鰭豚遷地之處。保護區的(de)(de)生(sheng)物(wu)(wu)多樣(yang)性被生(sheng)物(wu)(wu)學家(jia)稱為“濕地基因(yin)庫(ku)”。
2005年，保護區(qu)內麋鹿保護項(xiang)目分(fen)別獲得北京科技進步獎和中(zhong)華環保基(ji)金會(hui)、國(guo)際野生救援(yuan)會(hui)頒發的首屆“中(zhong)國(guo)野生資源(yuan)保護金獎”，石(shi)首市也因此被中(zhong)國(guo)野生動(dong)物保護協(xie)會(hui)授予(yu)“中(zhong)國(guo)麋鹿之鄉”的稱號(hao)。 [4]
