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同(tong)治七(qi)年十一月(yue)三十日（1869年1月(yue)12日），章(zhang)太炎出(chu)生于一個地主家庭。章(zhang)太炎起初跟從外(wai)祖父(fu)朱(zhu)(zhu)有(you)虔（左(zuo)卿(qing)）學習，自(zi)稱(cheng)：“余(yu)十一歲(sui)時，外(wai)祖朱(zhu)(zhu)左(zuo)卿(qing)授(shou)余(yu)讀(du)經(jing)，偶讀(du)蔣氏《東華錄》曾靜(jing)案(an)，外(wai)祖謂(wei)：‘夷夏之(zhi)(zhi)防，同(tong)于君臣之(zhi)(zhi)義。’余(yu)問(wen)：‘前人(ren)有(you)談此(ci)語(yu)否？’外(wai)祖曰：‘王(wang)(wang)船(chuan)山、顧(gu)亭林已言之(zhi)(zhi)，尤以王(wang)(wang)氏之(zhi)(zhi)言為(wei)甚(shen)。謂(wei)‘歷代亡(wang)(wang)(wang)國，無足輕重，惟南(nan)宋之(zhi)(zhi)亡(wang)(wang)(wang)，則衣冠文物，亦與(yu)之(zhi)(zhi)俱(ju)亡(wang)(wang)(wang)。’余(yu)曰：‘明亡(wang)(wang)(wang)于清，反不如(ru)亡(wang)(wang)(wang)于李闖。’外(wai)祖曰：‘今不必作(zuo)此(ci)論(lun)，若果李闖得明天下，闖雖(sui)不善(shan)，其子孫未必皆不善(shan)，惟今不必作(zuo)此(ci)論(lun)耳。’余(yu)之(zhi)(zhi)革命(ming)思想伏根于此(ci)。”
光(guang)緒(xu)十(shi)六年（1890年），章(zhang)太炎到杭(hang)州詁經精舍學(xue)習，詁經精舍的(de)(de)主持(chi)人是俞(yu)樾(yue)，俞(yu)樾(yue)是從顧炎武、戴震、王念孫、王引之(zhi)等一脈相承下(xia)來的(de)(de)清代著(zhu)名樸(pu)學(xue)大(da)師，撰有(you)(you)《群經平(ping)議(yi)》、《諸子(zi)平(ping)議(yi)》、《古(gu)書疑義舉(ju)例》，校正群經，諸子(zi)句讀，審定(ding)文義，并分析其(qi)特殊文法與修辭，治學(xue)方法縝(zhen)密(mi)，章(zhang)太炎受其(qi)影(ying)響，埋頭研究學(xue)問，前后(hou)一共有(you)(you)八年之(zhi)久，期(qi)間章(zhang)太炎收獲頗大(da)。
光緒(xu)二十年(nian)（1894年(nian)），中日(ri)甲午戰爭中中國(guo)被(bei)日(ri)本侵略者打敗，在(zai)民族危機深重的(de)(de)(de)刺激下，章(zhang)(zhang)太炎毅然走出書齋(zhai)，聽到康有為(wei)(wei)設立強學會(hui)(hui)(hui)，“寄會(hui)(hui)(hui)費(fei)銀(yin)十六(liu)圓入會(hui)(hui)(hui)”。并(bing)于光緒(xu)二十二年(nian)（1896年(nian)）年(nian)末辭別俞樾，來到上(shang)海，擔任《時(shi)(shi)(shi)(shi)務(wu)報(bao)(bao)(bao)》編務(wu)。章(zhang)(zhang)太炎當時(shi)(shi)(shi)(shi)的(de)(de)(de)辦(ban)(ban)(ban)報(bao)(bao)(bao)主(zhu)張(zhang)是(shi)(shi)“馳騁百家”，“引(yin)古鑒(jian)今”，“證今則不(bu)為(wei)(wei)巵(zhi)言，陳(chen)古則不(bu)觸時(shi)(shi)(shi)(shi)忌”。他(ta)(ta)(ta)在(zai)《時(shi)(shi)(shi)(shi)務(wu)報(bao)(bao)(bao)》任職不(bu)久，文(wen)章(zhang)(zhang)也只發表《論(lun)亞洲宜(yi)自為(wei)(wei)唇齒》和《論(lun)學會(hui)(hui)(hui)有大益(yi)于黃人(ren)亟宜(yi)保護》兩篇。他(ta)(ta)(ta)認(ren)為(wei)(wei)凡(fan)是(shi)(shi)西方資(zi)本主(zhu)義國(guo)家的(de)(de)(de)長技，都可(ke)以(yi)(yi)被(bei)中國(guo)所借鑒(jian)，并(bing)且(qie)可(ke)以(yi)(yi)作為(wei)(wei)改變成法(fa)的(de)(de)(de)參考，例如(ru)舉辦(ban)(ban)(ban)“有益(yi)于黃人(ren)”的(de)(de)(de)學會(hui)(hui)(hui)。應該(gai)“修內(nei)政(zheng)(zheng)”，行(xing)“新(xin)(xin)制度”，不(bu)能“惟(wei)舊(jiu)章(zhang)(zhang)之(zhi)守”，而須“發憤為(wei)(wei)天下雄”。他(ta)(ta)(ta)認(ren)為(wei)(wei)“變郊號，柴(chai)社稷，謂之(zhi)革(ge)(ge)(ge)(ge)命(ming)；禮秀民，聚俊才，謂之(zhi)革(ge)(ge)(ge)(ge)政(zheng)(zheng)。”在(zai)當時(shi)(shi)(shi)(shi)的(de)(de)(de)社會(hui)(hui)(hui)條件(jian)下，應該(gai)“以(yi)(yi)革(ge)(ge)(ge)(ge)政(zheng)(zheng)挽革(ge)(ge)(ge)(ge)命(ming)”，亦即實(shi)(shi)施(shi)政(zheng)(zheng)治改革(ge)(ge)(ge)(ge)。與此同(tong)時(shi)(shi)(shi)(shi)，章(zhang)(zhang)太炎又編撰《經世報(bao)(bao)(bao)》、《實(shi)(shi)學報(bao)(bao)(bao)》和《譯書公(gong)會(hui)(hui)(hui)報(bao)(bao)(bao)》。還(huan)于光緒(xu)二十四年(nian)（1898年(nian)）上(shang)書李(li)鴻章(zhang)(zhang)，企求他(ta)(ta)(ta)能把握世界的(de)(de)(de)潮流(liu)實(shi)(shi)行(xing)改革(ge)(ge)(ge)(ge)。也曾跑到武昌，幫助張(zhang)之(zhi)洞辦(ban)(ban)(ban)《正學報(bao)(bao)(bao)》，幻想(xiang)借助他(ta)(ta)(ta)的(de)(de)(de)實(shi)(shi)力推(tui)動(dong)維(wei)(wei)新(xin)(xin)變法(fa)。不(bu)久，維(wei)(wei)新(xin)(xin)派推(tui)動(dong)的(de)(de)(de)百日(ri)維(wei)(wei)新(xin)(xin)夭折，章(zhang)(zhang)太炎避(bi)地臺灣。他(ta)(ta)(ta)對戊戌六(liu)君子(zi)的(de)(de)(de)慘遭殺戮深表憤慨(kai)；對康有為(wei)(wei)“內(nei)不(bu)容于讒構”而“見詆于俗(su)儒鄉愿者”為(wei)(wei)之(zhi)解(jie)脫；對以(yi)(yi)慈禧太后為(wei)(wei)首的(de)(de)(de)頑固(gu)派的(de)(de)(de)專制驕橫極為(wei)(wei)仇(chou)恨，“討(tao)之(zhi)猶可(ke)，況數(shu)其罪乎？”經歷維(wei)(wei)新(xin)(xin)新(xin)(xin)政(zheng)(zheng)的(de)(de)(de)破滅，他(ta)(ta)(ta)的(de)(de)(de)“革(ge)(ge)(ge)(ge)政(zheng)(zheng)”思想(xiang)較(jiao)前又有發展。
光緒二(er)十(shi)五年（1899年）夏天，章太炎東(dong)(dong)渡(du)日本(ben)，在京都、東(dong)(dong)京等地為反清(qing)做準備，并與(yu)(yu)梁啟(qi)超(chao)等人修好，之后返(fan)回上海參與(yu)(yu)《亞東(dong)(dong)時(shi)報(bao)》編(bian)務工作(zuo)。此時(shi)章太炎的(de)排滿觀(guan)和(he)古文經立(li)場日益明確，在蘇(su)州出版(ban)了其著作(zuo)《訄書》的(de)第一版(ban)，由梁啟(qi)超(chao)題簽。
光(guang)(guang)緒(xu)二(er)十六年（1900年），義和團運動爆發(fa)，八(ba)國(guo)聯軍(jun)侵華等(deng)相繼發(fa)生，慈(ci)禧太后等(deng)頑固派(pai)的(de)(de)賣國(guo)原(yuan)形暴露(lu)無遺，章太炎受到極大(da)震動，從維(wei)新夢中(zhong)醒來。7月(yue)，在上海召(zhao)開的(de)(de)中(zhong)國(guo)議會上，他激烈反對改良派(pai)提(ti)出的(de)(de)“一面排滿，一面勤王”的(de)(de)模糊口(kou)號，“宣言脫社，割(ge)辮(bian)與(yu)絕”，撰《解辮(bian)發(fa)》以(yi)(yi)明志。對過去設想的(de)(de)“客帝(di)(di)”、“分(fen)鎮”也進(jin)行了糾正(zheng)，說是“余(yu)自戊、己違難，與(yu)尊清(qing)(qing)者(zhe)(zhe)游而作《客帝(di)(di)》，飾茍且之(zhi)(zhi)心，棄本崇教，其違于(yu)形勢遠(yuan)矣”。進(jin)而提(ti)出：“滿洲弗逐，欲(yu)士之(zhi)(zhi)愛國(guo)，民之(zhi)(zhi)敵愾，不可得也。浸微浸削，亦終為歐、美之(zhi)(zhi)陪隸(li)已矣。”接(jie)著，章太炎樹起反清(qing)(qing)的(de)(de)旗幟，開始向改良派(pai)展開斗爭(zheng)。光(guang)(guang)緒(xu)二(er)十七年（1901年），章太炎在東京《國(guo)民報》發(fa)表《正(zheng)仇滿論》，尖(jian)銳批判梁(liang)啟(qi)超(chao)：“梁(liang)子所悲痛(tong)者(zhe)(zhe)，革(ge)(ge)命耳；所悲痛(tong)于(yu)革(ge)(ge)命，而思以(yi)(yi)憲法易(yi)之(zhi)(zhi)者(zhe)(zhe)，為其圣明之(zhi)(zhi)主(zhu)耳。”
光緒(xu)二十八年正月(yue)(yue)（1902年2月(yue)(yue)），章太(tai)炎再次被追捕，流亡(wang)日(ri)本。初住(zhu)橫(heng)濱，后入東京(jing)，和(he)孫(sun)中(zhong)山結識，他(ta)們(men)共同商討(tao)推翻清朝之(zhi)后的(de)典(dian)章制(zhi)度和(he)中(zhong)國(guo)的(de)土地賦稅以至建都問(wen)題(ti)，《訄書(shu)》重(zhong)印本《相宅》和(he)《定版籍》中(zhong)，就(jiu)記錄(lu)了他(ta)倆(lia)當時的(de)討(tao)論情況。6月(yue)(yue)，章太(tai)炎返回祖國(guo)，為(wei)(wei)上海廣智書(shu)局(ju)修(xiu)改(gai)他(ta)的(de)譯文(wen)，曾譯述日(ri)本岸本能武(wu)太(tai)所著《社會學(xue)》。他(ta)還修(xiu)改(gai)了《訄書(shu)》，并立下了編修(xiu)《中(zhong)國(guo)通史》的(de)志向，認為(wei)(wei)“所貴乎(hu)通史者，固(gu)有(you)二方(fang)面：一(yi)(yi)方(fang)以發明社會政(zheng)治(zhi)進化衰(shuai)微之(zhi)原理為(wei)(wei)主(zhu)，則(ze)于(yu)典(dian)志見之(zhi)；一(yi)(yi)方(fang)以鼓(gu)舞民氣，啟導(dao)方(fang)來為(wei)(wei)主(zhu)，則(ze)亦必于(yu)紀傳見之(zhi)”。
光緒(xu)二十(shi)(shi)九(jiu)年二月(yue)（1903年3月(yue)），章太炎(yan)到中(zhong)國(guo)(guo)(guo)(guo)教(jiao)育會贊(zan)助成(cheng)(cheng)立(li)的(de)上海愛國(guo)(guo)(guo)(guo)社任教(jiao)。這時，抗法(fa)拒俄運動展開(kai)(kai)，革(ge)命(ming)(ming)(ming)形勢發展，而(er)康(kang)(kang)有(you)為卻發表了《與同學諸子梁啟超等論印度亡國(guo)(guo)(guo)(guo)由于各省自(zi)立(li)書(shu)(shu)》和《答南北(bei)美(mei)洲諸華(hua)商(shang)論中(zhong)國(guo)(guo)(guo)(guo)只可(ke)行(xing)立(li)憲(xian)不(bu)(bu)可(ke)行(xing)革(ge)命(ming)(ming)(ming)書(shu)(shu)》，反對革(ge)命(ming)(ming)(ming)黨公(gong)開(kai)(kai)攻擊滿(man)(man)族(zu)統治者(zhe)，以(yi)為立(li)憲(xian)可(ke)以(yi)避免革(ge)命(ming)(ming)(ming)造(zao)成(cheng)(cheng)的(de)慘(can)劇，鼓吹光緒(xu)帝復辟。章太炎(yan)看(kan)到后，公(gong)開(kai)(kai)批駁康(kang)(kang)有(you)為，指出康(kang)(kang)有(you)為所謂的(de)“滿(man)(man)漢不(bu)(bu)分，君民(min)同治”，實際(ji)上是(shi)(shi)“屈心忍志以(yi)處奴隸之地”。光緒(xu)帝只是(shi)(shi)“未辨菽麥”的(de)“小(xiao)丑”，他當初贊(zan)成(cheng)(cheng)變(bian)法(fa)，不(bu)(bu)過(guo)是(shi)(shi)“保吾權(quan)位”，如果(guo)一旦復辟，必然將中(zhong)國(guo)(guo)(guo)(guo)引(yin)向滅(mie)亡。章太炎(yan)贊(zan)美(mei)革(ge)命(ming)(ming)(ming)：“公(gong)理之未明，即以(yi)革(ge)命(ming)(ming)(ming)明之；舊俗之俱(ju)在(zai)，即以(yi)革(ge)命(ming)(ming)(ming)去(qu)之。革(ge)命(ming)(ming)(ming)非天雄(xiong)、大黃之猛劑，而(er)實補瀉兼備之良藥矣。”他又為鄒容《革(ge)命(ming)(ming)(ming)軍(jun)》撰序，說是(shi)(shi)“夫中(zhong)國(guo)(guo)(guo)(guo)吞噬于逆胡(hu)二百六十(shi)(shi)年矣，宰(zai)割之酷，詐暴之工，人人所身(shen)受，當無不(bu)(bu)昌言革(ge)命(ming)(ming)(ming)”。
光緒三十二(er)(er)年（1906年）6月29日(ri)，章太(tai)炎出獄(yu)，中(zhong)國(guo)(guo)(guo)同(tong)(tong)盟會(hui)(hui)派員(yuan)至滬迎(ying)章太(tai)炎赴日(ri)。他(ta)在(zai)日(ri)本加入中(zhong)國(guo)(guo)(guo)同(tong)(tong)盟會(hui)(hui)，主編中(zhong)國(guo)(guo)(guo)同(tong)(tong)盟會(hui)(hui)機關報(bao)《民(min)報(bao)》。他(ta)在(zai)東京留學生(sheng)歡迎(ying)會(hui)(hui)上(shang)發(fa)(fa)表(biao)(biao)演說，述“平生(sheng)的(de)(de)(de)(de)(de)歷史與近日(ri)辦(ban)事(shi)的(de)(de)(de)(de)(de)方法(fa)”，認(ren)為最緊要的(de)(de)(de)(de)(de)是(shi)(shi)：“第一，是(shi)(shi)用宗教發(fa)(fa)起信(xin)心(xin)，增(zeng)進國(guo)(guo)(guo)民(min)的(de)(de)(de)(de)(de)道德；第二(er)(er)，是(shi)(shi)用國(guo)(guo)(guo)粹激(ji)動(dong)種(zhong)性(xing)，增(zeng)進愛(ai)(ai)國(guo)(guo)(guo)的(de)(de)(de)(de)(de)熱(re)腸。”他(ta)說：“近來有一種(zhong)歐(ou)化主義(yi)的(de)(de)(de)(de)(de)人(ren)，總說中(zhong)國(guo)(guo)(guo)人(ren)比西洋(yang)人(ren)所(suo)差甚遠，所(suo)以(yi)(yi)自甘暴棄，說中(zhong)國(guo)(guo)(guo)必定(ding)滅亡，黃種(zhong)必定(ding)剿(jiao)絕。因為他(ta)不(bu)(bu)曉得中(zhong)國(guo)(guo)(guo)的(de)(de)(de)(de)(de)長處，見(jian)得別無可(ke)愛(ai)(ai)，就把愛(ai)(ai)國(guo)(guo)(guo)愛(ai)(ai)種(zhong)之(zhi)心(xin)，一日(ri)衰薄一日(ri)。若他(ta)曉得，我想就是(shi)(shi)全無心(xin)肝(gan)的(de)(de)(de)(de)(de)人(ren)，那愛(ai)(ai)國(guo)(guo)(guo)愛(ai)(ai)種(zhong)之(zhi)心(xin)，必定(ding)風發(fa)(fa)泉涌，不(bu)(bu)可(ke)遏抑的(de)(de)(de)(de)(de)。”認(ren)為“古(gu)事(shi)古(gu)跡，都(dou)可(ke)以(yi)(yi)動(dong)人(ren)愛(ai)(ai)國(guo)(guo)(guo)的(de)(de)(de)(de)(de)心(xin)思(si)”。章太(tai)炎在(zai)《民(min)報(bao)》上(shang)發(fa)(fa)表(biao)(biao)了(le)不(bu)(bu)少政(zheng)論(lun)，基(ji)本上(shang)是(shi)(shi)宣揚同(tong)(tong)盟會(hui)(hui)的(de)(de)(de)(de)(de)革命(ming)綱領的(de)(de)(de)(de)(de)。在(zai)《民(min)報(bao)一周年紀念會(hui)(hui)祝(zhu)辭》中(zhong)強調(diao)：“掃除腥(xing)羶，建立(li)(li)民(min)國(guo)(guo)(guo)。”《民(min)報(bao)一周年紀念會(hui)(hui)演說辭》說：“革命(ming)大事(shi)，不(bu)(bu)怕不(bu)(bu)成；中(zhong)華(hua)民(min)國(guo)(guo)(guo)，不(bu)(bu)怕不(bu)(bu)立(li)(li)。”由章太(tai)炎手撰(zhuan)，以(yi)(yi)“軍政(zheng)府”名義(yi)發(fa)(fa)表(biao)(biao)的(de)(de)(de)(de)(de)《討(tao)滿洲檄》，更(geng)明確指出：“自盟而后(hou)，為掃除韃虜(lu)，恢復中(zhong)華(hua)，建立(li)(li)民(min)國(guo)(guo)(guo)，平均地權。有諭(yu)此盟，四萬(wan)萬(wan)人(ren)共擊(ji)之(zhi)。”
章太(tai)炎(yan)在論(lun)文(wen)中強調革(ge)命黨自身(shen)的建設，認為(wei)“優于私德者(zhe)亦必(bi)優于公德，薄于私德者(zhe)亦必(bi)薄于公德。而(er)(er)無道德者(zhe)之(zhi)(zhi)不(bu)(bu)能革(ge)命，較然明矣(yi)”。指(zhi)出(chu)(chu)革(ge)命者(zhe)必(bi)須“確(que)固堅(jian)厲(li)，重(zhong)然諾(nuo)，輕死(si)生”，應該(gai)做(zuo)到“知恥”、“重(zhong)厚”、“耿介”、“必(bi)信”，要有“革(ge)命之(zhi)(zhi)道德”。章太(tai)炎(yan)在論(lun)文(wen)中深刻揭露改良派“競(jing)名死(si)利”、“志(zhi)在千祿”的丑(chou)態。并(bing)說：“夫其(qi)所(suo)操技術，豈謂上(shang)(shang)足以(yi)(yi)給當世之(zhi)(zhi)用，下足以(yi)(yi)成一(yi)家之(zhi)(zhi)言耶？汗漫(man)之(zhi)(zhi)策論(lun)，不(bu)(bu)可(ke)以(yi)(yi)為(wei)成文(wen)之(zhi)(zhi)法；雜博之(zhi)(zhi)記誦，不(bu)(bu)可(ke)以(yi)(yi)當說經(jing)之(zhi)(zhi)詁；單篇之(zhi)(zhi)文(wen)筆，不(bu)(bu)可(ke)以(yi)(yi)承儒、墨之(zhi)(zhi)流；匿采之(zhi)(zhi)華辭，不(bu)(bu)可(ke)以(yi)(yi)備瞽(gu)蒙之(zhi)(zhi)頌；淫哇之(zhi)(zhi)賦詠，不(bu)(bu)可(ke)以(yi)(yi)瞻國政之(zhi)(zhi)違。既失(shi)其(qi)末，而(er)(er)又不(bu)(bu)得其(qi)本，視經(jing)方陶冶(ye)之(zhi)(zhi)流，猶尚弗及，亦曰以(yi)(yi)是(shi)(shi)嘩世取寵而(er)(er)已”，指(zhi)出(chu)(chu)改良派的“謀立憲”，只(zhi)能使“豪民(min)(min)得志(zhi)，苞苴(ju)橫流，朝有黨援(yuan)，吏依門戶，士習囂競(jing)，民(min)(min)苦騷煩”，表示堅(jian)決反對。他還在《民(min)(min)報》上(shang)(shang)刊發(fa)別人批駁《新民(min)(min)叢報》的文(wen)章。章太(tai)炎(yan)在《民(min)(min)報》上(shang)(shang)發(fa)表的文(wen)章，大都針鋒(feng)相對，文(wen)字銳(rui)利，“真是(shi)(shi)所(suo)向披靡，令人神旺”。
自(zi)光(guang)緒(xu)三十一(yi)年(nian)(nian)（1905年(nian)(nian)）起，章太炎在《國粹學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)報(bao)》上發(fa)表若(ruo)干學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)術(shu)文字，并在東京開設國學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)講習班，“宏獎光(guang)復(fu)，不廢(fei)講學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)”。此前，光(guang)緒(xu)二十九(jiu)年(nian)(nian)（1903年(nian)(nian)），章太炎與近代(dai)古文經(jing)學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)另(ling)一(yi)重鎮劉師培定交，此后因學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)術(shu)祈向(xiang)相近而交往(wang)日密，遂發(fa)生被劉師培與妻(qi)子何(he)震誣蔑叛(pan)變事件。又與孫中(zhong)山(shan)、汪精衛、黃興等因《民報(bao)》不合，乃由提倡光(guang)復(fu)轉入專心論(lun)學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)，著(zhu)有《文始》《新方言》《國故(gu)論(lun)衡》《齊(qi)物論(lun)釋》等。其中(zhong)《國故(gu)論(lun)衡》為近代(dai)學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)術(shu)史上有數之巨制，開辟了漢(han)語言文字學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)、經(jing)學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)、文學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)及哲學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)、心理(li)學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)的(de)現(xian)代(dai)化研究的(de)先河。宣統元年(nian)(nian)（1909年(nian)(nian)）又編有《教育今語雜志》，撰寫若(ruo)干白(bai)話(hua)述(shu)學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)著(zhu)作(zuo)，以普及學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)術(shu)。
宣統三年（1911年），武昌起義(yi)勝(sheng)利(li)之(zhi)(zhi)后，章(zhang)太(tai)(tai)炎提出了“革(ge)(ge)命(ming)軍起，革(ge)(ge)命(ming)黨消”的錯誤口號，主(zhu)(zhu)(zhu)(zhu)張(zhang)(zhang)(zhang)解(jie)散同(tong)盟會，并和(he)一些(xie)立憲黨人在(zai)一起，組(zu)織中(zhong)(zhong)華(hua)民(min)國(guo)(guo)聯(lian)合會。民(min)國(guo)(guo)元年（1912年）1月(yue)1日，孫中(zhong)(zhong)山在(zai)南京(jing)就任(ren)中(zhong)(zhong)華(hua)民(min)國(guo)(guo)臨(lin)時大總統，聘任(ren)章(zhang)太(tai)(tai)炎為總統府樞(shu)密顧問(wen)(wen)，他(ta)(ta)不愿(yuan)常駐南京(jing)，返回上海(hai)。2月(yue)中(zhong)(zhong)旬，在(zai)討論(lun)建(jian)都(dou)問(wen)(wen)題時，章(zhang)太(tai)(tai)炎主(zhu)(zhu)(zhu)(zhu)張(zhang)(zhang)(zhang)建(jian)都(dou)北京(jing)，認(ren)為“中(zhong)(zhong)國(guo)(guo)本因舊之(zhi)(zhi)國(guo)(guo)，非(fei)新辟之(zhi)(zhi)國(guo)(guo)，其良法美(mei)俗，應保存(cun)者則存(cun)留之(zhi)(zhi)，不能事事更張(zhang)(zhang)(zhang)也”。他(ta)(ta)依戀舊制度，說“專制非(fei)無(wu)良規，共(gong)和(he)非(fei)無(wu)粃政”，“政治法律，皆依習慣而(er)(er)成”，主(zhu)(zhu)(zhu)(zhu)張(zhang)(zhang)(zhang)中(zhong)(zhong)央“特(te)建(jian)都(dou)察院(yuan)”，“限制元首”，地方(fang)“廢省(sheng)存(cun)道(dao)”，而(er)(er)對代議民(min)主(zhu)(zhu)(zhu)(zhu)制則表示(shi)反對，主(zhu)(zhu)(zhu)(zhu)張(zhang)(zhang)(zhang)“限制財產”，又以(yi)“奪(duo)富者之(zhi)(zhi)田以(yi)與(yu)貧民(min)”為“大悖(bei)乎理”。
南(nan)(nan)北(bei)議和告成，袁(yuan)世凱(kai)上臺，章(zhang)太炎幻想(xiang)袁(yuan)世凱(kai)“厲精(jing)法治”，“以(yi)厝中夏于(yu)泰山(shan)磐石(shi)之(zhi)(zhi)安”。在用人問題上，以(yi)為“同盟(meng)會人材(cai)乏(fa)絕，清流(liu)不歸”。反對“政黨(dang)(dang)內(nei)閣”，提出“取清時南(nan)(nan)方督撫有材(cai)名者以(yi)充閣員之(zhi)(zhi)選”。說什么(me)：“漢之(zhi)(zhi)良相，即亡秦之(zhi)(zhi)退官(guan)；唐之(zhi)(zhi)名臣，即敗隋之(zhi)(zhi)故吏(li)。”主(zhu)張“循舊貫”，用“老吏(li)”。將中華民(min)國聯合(he)會與一(yi)(yi)些小政團合(he)并(bing)，改組(zu)為統一(yi)(yi)黨(dang)(dang)，以(yi)后(hou)更與民(min)社等并(bing)為共和黨(dang)(dang)，推黎(li)元洪為理事(shi)長。
袁(yuan)世(shi)凱給了(le)章(zhang)(zhang)(zhang)太炎(yan)一個(ge)總統府(fu)高等顧問(wen)的(de)空銜，不久又委(wei)任(ren)為東(dong)三(san)省籌邊使(shi)，調出(chu)北京。章(zhang)(zhang)(zhang)太炎(yan)興致勃勃地跑到東(dong)北去“興辦實業”，設東(dong)三(san)省籌邊使(shi)署于長春，擬《東(dong)三(san)省實業計劃書(shu)》，提出(chu)“設立三(san)省銀行，以(yi)圓易吊，使(shi)民易知”，并鑄(zhu)造金(jin)幣(bi)。“欲(yu)鑄(zhu)金(jin)幣(bi)，又不可不預浚金(jin)源(yuan)，非開(kai)辦金(jin)礦，收買金(jin)砂(sha)，不足以(yi)供鼓鑄(zhu)。又請開(kai)浚松花江、遼河，去其淤梗，以(yi)利交通(tong)”。還(huan)擬“組(zu)織(zhi)報(bao)館”，“設會研究”。但沒有多久，宋(song)教(jiao)仁(ren)遇刺，血的(de)教(jiao)訓使(shi)他(ta)猛醒(xing)過來，他(ta)沉痛(tong)地《挽宋(song)教(jiao)仁(ren)》：“愿君(jun)化彗孛；為我掃(sao)幽燕”，開(kai)始對袁(yuan)世(shi)凱不信任(ren)了(le)。4月，章(zhang)(zhang)(zhang)太炎(yan)托事南行。5月，他(ta)又親赴武昌，拜謁了(le)黎元洪，在湖北致電袁(yuan)世(shi)凱，請求免除梁士(shi)詒、陳宧、段芝(zhi)貴、趙秉鈞“四兇(xiong)”的(de)職位。接著(zhu)，由武漢到了(le)北京，袁(yuan)世(shi)凱設法(fa)籠(long)絡(luo)章(zhang)(zhang)(zhang)太炎(yan)。5月25日(ri)發令“章(zhang)(zhang)(zhang)炳(bing)麟授以(yi)勛二(er)位”，“冀以(yi)歆動”。6月4日(ri)，章(zhang)(zhang)(zhang)太炎(yan)離(li)京來滬。而他(ta)早先提議(yi)在東(dong)北籌設實業銀行的(de)借款，財政部長梁士(shi)詒不肯蓋章(zhang)(zhang)(zhang)，章(zhang)(zhang)(zhang)太炎(yan)“實業計劃”落空，感到“大抵政府(fu)之與我輩，忌疾(ji)甚深，罵亦阻撓(nao)，不罵亦阻撓(nao)”，于是(shi)決計“辭(ci)差”，“奉身而退”。
民國(guo)二年（1913年）4月，章(zhang)太炎從長(chang)春返回(hui)上海。7月，孫中山(shan)、黃(huang)(huang)(huang)興舉兵武(wu)力討袁，章(zhang)太炎卻不信賴，說什么“討袁者亦非(fei)其人(ren)”。他既罵袁世(shi)凱“用心陰摯，正與(yu)西太后大(da)同”，又說孫中山(shan)“與(yu)項城一(yi)(yi)丘之(zhi)(zhi)(zhi)貉”。“謂宜(yi)雙退袁與(yu)孫、黃(huang)(huang)(huang)，改建(jian)賢哲，仆(pu)則(ze)承命”。以(yi)(yi)為(wei)(wei)“若(ruo)為(wei)(wei)久遠計，凡一(yi)(yi)政(zheng)黨，非(fei)有實業(ye)為(wei)(wei)中堅(jian)，即有俠(xia)士(shi)為(wei)(wei)后應，無此(ci)即不足以(yi)(yi)自樹。非(fei)實業(ye)則(ze)費(fei)用不給，而政(zheng)府得以(yi)(yi)利用之(zhi)(zhi)(zhi)矣(yi)；非(fei)俠(xia)士(shi)則(ze)氣勢不壯，而政(zheng)府得以(yi)(yi)威喝之(zhi)(zhi)(zhi)矣(yi)”。以(yi)(yi)為(wei)(wei)總統改選，“大(da)抵(di)仍宜(yi)推舉黃(huang)(huang)(huang)陂，必不肯任(ren)，然后求之(zhi)(zhi)(zhi)西林”。“黃(huang)(huang)(huang)陂之(zhi)(zhi)(zhi)廉讓，可(ke)望責任(ren)內閣；西林之(zhi)(zhi)(zhi)果(guo)毅，可(ke)望廓清貪邪”。黎元洪（黃(huang)(huang)(huang)陂）也好，岑春煊（西林）也好，都是清朝舊官僚(liao)，民國(guo)新(xin)軍閥(fa)，章(zhang)太炎對這些人(ren)寄以(yi)(yi)厚望，他已彷徨歧途了。
6月(yue)，章(zhang)(zhang)太炎與湯國梨結婚。8月(yue)，章(zhang)(zhang)太炎“冒(mao)危入京師”，一(yi)方(fang)面看到(dao)“京邑(yi)崎嶇，道路以目”，以為“吾雖微末，以一(yi)身攖暴人之刃，使(shi)天(tian)下皆曉然(ran)于(yu)彼之兇戾，亦(yi)何惜此孱(chan)形(xing)為”，表示不畏(wei)強(qiang)暴，敢臨虎穴；另一(yi)方(fang)面又以為“共和黨勢漸擴張，此為可熹”，“連日議(yi)員入黨者，已(yi)增(zeng)三十(shi)人矣，驥(ji)老(lao)伏(fu)櫪，志(zhi)在千里，況吾猶(you)未老(lao)耶？”但(dan)是，袁世凱(kai)對(dui)章(zhang)(zhang)太炎還(huan)是不肯(ken)放松，對(dui)他加緊迫害，把他軟禁起(qi)來，梁(liang)士詒(yi)、趙秉鈞(jun)等(deng)還(huan)欲(yu)“捏造證據(ju)，置章(zhang)(zhang)于(yu)死”。
民(min)國(guo)三年(nian)(nian)（1914年(nian)(nian)）1月，章太炎欲乘車離京，為軍警所阻。7日，“以大勛章作扇墜，臨總統府(fu)之(zhi)(zhi)(zhi)門(men)，大詬袁世凱之(zhi)(zhi)(zhi)包(bao)藏禍心”，仍被(bei)監(jian)禁(jin)。曾決意絕食(shi)，“以死爭之(zhi)(zhi)(zhi)”，自云：“不死于清廷購捕之(zhi)(zhi)(zhi)時，而(er)死于民(min)國(guo)告成之(zhi)(zhi)(zhi)后(hou)，吾(wu)何言(yan)哉！”直到民(min)國(guo)五年(nian)(nian)（1916年(nian)(nian)）袁世凱死后(hou)，才被(bei)釋放。在監(jian)禁(jin)期間，編成《章氏叢書》初編。
民國(guo)五(wu)年（1916年）6月，章太炎由北京南(nan)返。這(zhe)時，孫中(zhong)(zhong)山(shan)也在上海，曾(ceng)兩電(dian)黎元洪(hong)規復(fu)約法，尊重國(guo)會(hui)；章太炎也認為“約法、國(guo)會(hui)，本民國(guo)固(gu)有(you)之物，為袁(yuan)氏所摧殘”，主(zhu)張(zhang)維(wei)護。此后，他多次(ci)和孫中(zhong)(zhong)山(shan)一起(qi)參加會(hui)議，基(ji)本主(zhu)張(zhang)與孫中(zhong)(zhong)山(shan)尚相契(qi)合(he)。8月，章太炎南(nan)赴(fu)肇慶(qing)，去看望岑春(chun)煊，更出游南(nan)洋群島，一直到年末才回國(guo)。孫中(zhong)(zhong)山(shan)致(zhi)電(dian)黎元洪(hong)，認為章太炎“碩(shuo)學卓識，不(bu)畏強御，古之良史(shi)，無以(yi)過之，為事(shi)擇人，竊謂最當(dang)”，推(tui)舉章為國(guo)史(shi)館(guan)長。
民(min)國(guo)六年(nian)（1917年(nian)）3月，段祺瑞(rui)召集(ji)督(du)軍團(tuan)在北(bei)京開會，商(shang)討(tao)對德(de)宣戰。5月7日(ri)，國(guo)會討(tao)論(lun)參戰案；10日(ri)，段祺瑞(rui)組織(zhi)“公(gong)民(min)請(qing)愿(yuan)團(tuan)”等，包圍國(guo)會，毆辱(ru)議(yi)員(yuan)。章(zhang)太(tai)炎和孫(sun)中山兩次致電黎元洪，要(yao)求嚴懲“偽公(gong)民(min)犯法亂紀之(zhi)人(ren)”，“嚴懲暴徒主名”，“勿令(ling)勢(shi)要(yao)從旁掣(che)肘”。6月7日(ri)，張(zhang)勛率軍北(bei)上(shang)，與段派集(ji)議(yi)，電黎“調(diao)停須先解散(san)國(guo)會”。孫(sun)、章(zhang)聯電陸榮廷等南方各省督(du)軍、省長，指出：“調(diao)停戰事之(zhi)人(ren)，即主張(zhang)復辟之(zhi)人(ren)；擁護元首之(zhi)人(ren)，即主張(zhang)廢立(li)之(zhi)人(ren)。”“叛人(ren)秉政，則共和遺民(min)必無噍類(lei)”。又(you)聯名致電陳炯明(ming)：“國(guo)會為民(min)國(guo)之(zhi)命脈，調(diao)和乃借寇之(zhi)資糧”，“今者群盜(dao)鴟張(zhang)，叛形已著，黃陂與之(zhi)講解，實同降伏”。
7月(yue)1日(ri)，張(zhang)勛復(fu)辟(pi)。3日(ri)，章(zhang)(zhang)(zhang)太炎與海(hai)軍(jun)(jun)總長程(cheng)璧光等(deng)在孫(sun)中(zhong)(zhong)(zhong)山(shan)的住(zhu)處秘密(mi)商議，籌劃反對張(zhang)勛的復(fu)辟(pi)舉動。接著，與孫(sun)中(zhong)(zhong)(zhong)山(shan)、廖(liao)仲愷(kai)、朱執信、何香(xiang)凝(ning)乘海(hai)琛艦由(you)上海(hai)啟程(cheng)赴廣(guang)州，于(yu)(yu)7月(yue)17日(ri)抵(di)粵。當(dang)(dang)有人詢以(yi)(yi)討(tao)(tao)逆計劃時，章(zhang)(zhang)(zhang)太炎即答以(yi)(yi)：“余(yu)(yu)此次偕孫(sun)中(zhong)(zhong)(zhong)山(shan)來(lai)粵，所抱(bao)之希望(wang)頗大(da)”，“討(tao)(tao)逆之舉，即為護(hu)法(fa)而(er)起(qi)(qi)，惟不(bu)違法(fa)之人而(er)后(hou)(hou)(hou)可以(yi)(yi)討(tao)(tao)逆”。永豐、同安、豫章(zhang)(zhang)(zhang)三(san)艦抵(di)達黃埔，孫(sun)、章(zhang)(zhang)(zhang)一起(qi)(qi)前往迎(ying)迓。廣(guang)東各界開歡迎(ying)海(hai)軍(jun)(jun)大(da)會(hui)，孫(sun)中(zhong)(zhong)(zhong)山(shan)、程(cheng)璧光到(dao)會(hui)，章(zhang)(zhang)(zhang)太炎亦參加。9月(yue)1日(ri)，國民(min)非常會(hui)議選舉孫(sun)中(zhong)(zhong)(zhong)山(shan)為中(zhong)(zhong)(zhong)華民(min)國軍(jun)(jun)政(zheng)(zheng)府大(da)元(yuan)帥，章(zhang)(zhang)(zhang)太炎任護(hu)法(fa)軍(jun)(jun)政(zheng)(zheng)府秘書(shu)長，《大(da)元(yuan)帥就(jiu)職宣(xuan)言》就(jiu)是(shi)章(zhang)(zhang)(zhang)太炎起(qi)(qi)草的。《宣(xuan)言》中(zhong)(zhong)(zhong)說：“民(min)國根本(ben)，掃地無余(yu)(yu)，猶幸共和大(da)義，浹于(yu)(yu)人心，舉國同聲，誓(shi)(shi)殲元(yuan)惡”，誓(shi)(shi)“與天(tian)下共擊破壞共和者”。此后(hou)(hou)(hou)，因護(hu)法(fa)軍(jun)(jun)政(zheng)(zheng)府中(zhong)(zhong)(zhong)派系斗爭激烈，章(zhang)(zhang)(zhang)“欲西(xi)行”，孫(sun)中(zhong)(zhong)(zhong)山(shan)勸以(yi)(yi)“不(bu)當(dang)(dang)先去以(yi)(yi)失人望(wang)”，章(zhang)(zhang)(zhang)太炎表示愿為軍(jun)(jun)政(zheng)(zheng)府爭取外援，到(dao)云(yun)南聯絡唐繼(ji)(ji)堯(yao)。當(dang)(dang)他抵(di)達昆明后(hou)(hou)(hou)，多次向唐繼(ji)(ji)堯(yao)進(jin)言，促唐繼(ji)(ji)堯(yao)東下，但唐繼(ji)(ji)堯(yao)始終是(shi)托故(gu)不(bu)出。
民國(guo)(guo)八年（1919年），五(wu)四運動(dong)爆(bao)發，工人革命運動(dong)日(ri)漸(jian)發展(zhan)，章太炎卻(que)由(you)反對軍(jun)(jun)閥割據逐漸(jian)演變為(wei)贊成軍(jun)(jun)閥割據。民國(guo)(guo)九年（1920年）11月(yue)，湖南通電湘省(sheng)(sheng)自治(zhi)，章太炎隨即(ji)在北(bei)京《益世(shi)報》發表《聯(lian)(lian)省(sheng)(sheng)自治(zhi)虛置政府議》，認為(wei)宜虛置中(zhong)央(yang)政府，軍(jun)(jun)政則分于(yu)各省(sheng)(sheng)督軍(jun)(jun)。接著(zhu)，又(you)主(zhu)張(zhang)使地方權(quan)重而中(zhong)央(yang)權(quan)輕，各省(sheng)(sheng)自治(zhi)為(wei)第(di)一(yi)步，聯(lian)(lian)省(sheng)(sheng)自治(zhi)為(wei)第(di)二步，聯(lian)(lian)省(sheng)(sheng)政府為(wei)第(di)三(san)步，還必(bi)以(yi)本省(sheng)(sheng)人充軍(jun)(jun)民長官。這種(zhong)聯(lian)(lian)省(sheng)(sheng)自治(zhi)說，和(he)孫中(zhong)山的統一(yi)主(zhu)張(zhang)背(bei)道(dao)而馳。民國(guo)(guo)十年（1921年）5月(yue)，孫中(zhong)山在廣州就任非常大總統職，章太炎以(yi)為(wei)非法，并以(yi)“聯(lian)(lian)合自治(zhi)不可反對為(wei)獻”。
民國(guo)(guo)(guo)(guo)(guo)十(shi)二年（1923年）1月(yue)，孫中(zhong)(zhong)(zhong)山(shan)在上(shang)海發表(biao)(biao)《和(he)(he)平統(tong)一宣言(yan)》，章(zhang)太(tai)炎(yan)以為(wei)“統(tong)一利害，久處南方(fang)者自(zi)(zi)知，若謂借此以緩(huan)最高問題，則亦非計”。次(ci)年1月(yue)，中(zhong)(zhong)(zhong)國(guo)(guo)(guo)(guo)(guo)國(guo)(guo)(guo)(guo)(guo)民黨第一次(ci)全(quan)(quan)國(guo)(guo)(guo)(guo)(guo)代表(biao)(biao)大會(hui)(hui)在廣州召開，通過了(le)《中(zhong)(zhong)(zhong)國(guo)(guo)(guo)(guo)(guo)國(guo)(guo)(guo)(guo)(guo)民黨第一次(ci)全(quan)(quan)國(guo)(guo)(guo)(guo)(guo)代表(biao)(biao)大會(hui)(hui)宣言(yan)》，接受(shou)了(le)中(zhong)(zhong)(zhong)國(guo)(guo)(guo)(guo)(guo)共產(chan)黨所提出(chu)的(de)反(fan)帝反(fan)封建(jian)的(de)主張，分析和(he)(he)批判(pan)了(le)當(dang)時(shi)社(she)會(hui)(hui)上(shang)流行(xing)的(de)各種錯誤的(de)、反(fan)動的(de)政治流派，包括(kuo)“聯省(sheng)自(zi)(zi)治派”，宣告(gao)取(qu)消不(bu)平等條約；孫中(zhong)(zhong)(zhong)山(shan)又(you)系(xi)統(tong)講述了(le)三(san)民主義(yi)。10日(ri)，決定應馮(feng)(feng)玉祥(xiang)的(de)電(dian)邀，“即日(ri)北上(shang)”。章(zhang)太(tai)炎(yan)對改組(zu)后的(de)中(zhong)(zhong)(zhong)國(guo)(guo)(guo)(guo)(guo)國(guo)(guo)(guo)(guo)(guo)民黨表(biao)(biao)示不(bu)滿，在國(guo)(guo)(guo)(guo)(guo)民黨右派馮(feng)(feng)玉祥(xiang)自(zi)(zi)由(you)等的(de)慫恿下，發出(chu)《護黨救國(guo)(guo)(guo)(guo)(guo)宣言(yan)》，“冀以同(tong)盟舊人(ren)，重行(xing)集合(he)團體(ti)”。不(bu)久，馮(feng)(feng)玉祥(xiang)自(zi)(zi)由(you)組(zu)織中(zhong)(zhong)(zhong)國(guo)(guo)(guo)(guo)(guo)國(guo)(guo)(guo)(guo)(guo)民黨同(tong)志俱(ju)樂部，章(zhang)太(tai)炎(yan)也組(zu)織了(le)辛亥革命(ming)同(tong)志俱(ju)樂部，背離(li)孫中(zhong)(zhong)(zhong)山(shan)，反(fan)對共產(chan)黨。
民國十四(si)年（1925年），“五卅運動”發(fa)生，章(zhang)(zhang)太(tai)炎發(fa)出(chu)《為上海英(ying)租界巡捕慘殺(sha)學生之(zhi)通電(dian)》。“以(yi)為英(ying)捕而不治罪，固不足以(yi)肅刑(xing)章(zhang)(zhang)；英(ying)捕而果治罪，亦未必足以(yi)防后(hou)患。惟有責成外交(jiao)當局(ju)，迅速收回租界市(shi)政(zheng)，庶幾一勞永逸，民慶(qing)再生”。
民國(guo)(guo)(guo)(guo)(guo)十(shi)(shi)六年（1927年），章(zhang)(zhang)太炎賦詩自述：“見(jian)說興亡事(shi)，拿(na)舟望五湖”。晚年在蘇州講學(xue)(xue)(xue)(xue)，組(zu)織(zhi)國(guo)(guo)(guo)(guo)(guo)學(xue)(xue)(xue)(xue)會，欲“甄明(ming)學(xue)(xue)(xue)(xue)術，發揚國(guo)(guo)(guo)(guo)(guo)光”。民國(guo)(guo)(guo)(guo)(guo)二(er)(er)十(shi)(shi)二(er)(er)年（1933年），刻(ke)《章(zhang)(zhang)氏(shi)叢書(shu)續編》于北平，所收不多，而更純謹，且不取舊作(zuo)(zuo)，當(dang)然(ran)也(ye)無斗(dou)爭之(zhi)(zhi)作(zuo)(zuo)，先生(sheng)遂身衣學(xue)(xue)(xue)(xue)術之(zhi)(zhi)華袞，粹然(ran)成為儒宗”。但是，當(dang)帝國(guo)(guo)(guo)(guo)(guo)主義蹂(rou)躪中(zhong)國(guo)(guo)(guo)(guo)(guo)，中(zhong)華民族(zu)災難深(shen)重的(de)時候，章(zhang)(zhang)太炎起來(lai)譴責(ze)國(guo)(guo)(guo)(guo)(guo)民黨(dang)“怯(qie)于御亂而勇(yong)于內(nei)爭”。民國(guo)(guo)(guo)(guo)(guo)二(er)(er)十(shi)(shi)一年（1932年），北上(shang)見(jian)張學(xue)(xue)(xue)(xue)良；次(ci)年，又與馬相伯等聯(lian)合(he)發表“二(er)(er)老(lao)宣言”、“三老(lao)宣言”：“對于當(dang)前日(ri)本之(zhi)(zhi)侵略暴行，不僅作(zuo)(zuo)消極(ji)之(zhi)(zhi)抵抗(kang)，同時更應動員全民族(zu)積(ji)極(ji)收復失地、根本消滅偽國(guo)(guo)(guo)(guo)(guo)”，呼吁抗(kang)日(ri)。民國(guo)(guo)(guo)(guo)(guo)二(er)(er)十(shi)(shi)四年（1935年），一二(er)(er)九運動發生(sheng)，宋哲元進行壓制。章(zhang)(zhang)太炎致電宋哲元：“學(xue)(xue)(xue)(xue)生(sheng)請愿，事(shi)出公誠，縱有(you)加(jia)入(ru)共(gong)黨(dang)者，但問今之(zhi)(zhi)主張何如，何論其平素。”
12月24日，上海學(xue)生(sheng)北(bei)(bei)(bei)上請(qing)愿(yuan)(yuan)，國(guo)民(min)黨(dang)(dang)加以阻撓，章(zhang)太(tai)炎“對(dui)學(xue)生(sheng)愛國(guo)運(yun)動(dong)深表(biao)(biao)同情。但(dan)(dan)認政府(fu)當局，應(ying)善為處理，不(bu)應(ying)貿(mao)然(ran)加以共(gong)產頭銜，武力制止”。請(qing)愿(yuan)(yuan)學(xue)生(sheng)經(jing)過蘇州時，又“派代表(biao)(biao)慰勞，并囑縣長(chang)饋食(shi)”。他(ta)“瞻顧民(min)族(zu)之(zhi)(zhi)前(qian)途，輒(zhe)中心忉怛而未(wei)能自己”，臨終(zhong)前(qian)，在(zai)《答友人書》中還說：“北(bei)(bei)(bei)平既急，縱令勉力支持，察(cha)省必難兼顧。蓋非常之(zhi)(zhi)時，必以非常之(zhi)(zhi)事應(ying)之(zhi)(zhi)。令共(gong)黨(dang)(dang)之(zhi)(zhi)在(zai)晉北(bei)(bei)(bei)者，其意不(bu)過欲北(bei)(bei)(bei)據河(he)套(tao)，與蘇俄通聲勢耳。此輩雖多(duo)狙(ju)詐，然(ran)其對(dui)于日軍，必不(bu)肯俯首馴伏明甚(shen)”。盡管章(zhang)太(tai)炎不(bu)可能對(dui)共(gong)產黨(dang)(dang)有真正(zheng)認識，但(dan)(dan)他(ta)對(dui)共(gong)產黨(dang)(dang)的(de)(de)堅持抗(kang)戰、國(guo)民(min)黨(dang)(dang)的(de)(de)“不(bu)抵抗(kang)主義”還是覺察(cha)的(de)(de)。盡管章(zhang)太(tai)炎晚年的(de)(de)行為也有使人失望之(zhi)(zhi)處，卻(que)仍保持了愛國(guo)主義晚節。民(min)國(guo)二十五年（1936年）6月14日，章(zhang)太(tai)炎病逝。
《章氏叢書》，1915年右(you)文社(she)鉛印(yin)本，1919年浙江(jiang)圖(tu)書館木刻本，1924年上海(hai)古書流(liu)通處木刻本。
《章(zhang)氏叢書續(xu)編(bian)》，北平1933年。
《章氏叢書三編》，1939年章氏國學講習(xi)會鉛印(yin)本(ben)。
《章太炎(yan)全集》1-8集（尚(shang)未(wei)出完），上海人(ren)民出版社，1980-94年點校本。
《國學講習(xi)會略說》，1906年東(dong)京秀光社。
《國故論衡(heng)》，1910年(nian)東(dong)京秀光社本(ben)(ben)，叢書增(zeng)訂本(ben)(ben)。陳平原點校本(ben)(ben)，朱維錚點校本(ben)(ben)（《全集》第(di)9集，對照(zhao)本(ben)(ben)）。
《國學概論》，曹聚仁筆記本(ben)（又有張冥飛本(ben)，劣）。1922年泰(tai)東(dong)圖書(shu)館排印本(ben)。
《菿(dao)漢三(san)言》，虞云國校點，遼寧教(jiao)育出版社。
《國(guo)學略說》，涂(tu)小馬(ma)校點，上海文藝出版社(she)。
《章炳麟論(lun)學(xue)集》，北京(jing)師范大學(xue)出版社，1982年。
《章太炎(yan)書信(xin)集》，馬勇編。
《章太炎(yan)的(de)白話文(wen)》，1921年(nian)泰東圖書館排印(yin)本。
《章太炎政論選(xuan)集》，湯志(zhi)鈞編于1961年，中(zhong)華書(shu)局，1977年點校本。
《章太炎說文(wen)解字(zi)授課筆記》，朱希祖、錢玄同、周樹人(ren)筆記，王寧整理抄錄，影印謄鈔本，中華書局，2008年(nian)11月。
《太炎先(xian)生自定年譜》，1928年撰（同治七年至民國(guo)十一年），手稿本(ben)(ben)，章氏(shi)國(guo)學講習會刪改排印(yin)本(ben)(ben)。1986年上(shang)海書店影印(yin)本(ben)(ben)。
《章太炎(yan)年(nian)譜長編(bian)》，湯志鈞(jun)編(bian)，中華書局，1979年(nian)。
《章太炎年(nian)譜摭(zhi)遺(yi)》，謝櫻(ying)寧編，中(zhong)國社會科學出版社，1987年(nian)。
《章(zhang)太炎(yan)學術(shu)年譜》，姚奠中、董國炎(yan)編，山西古籍出版社，1993年。
《自述學(xue)術(shu)次第》，學(xue)術(shu)自述，1913年。
《菿漢微言》末條，1915年(nian)。
諸祖耿《記本師章公自述治學之功夫及(ji)志(zhi)向》，1933年。
《國故(gu)論(lun)衡疏證》，龐俊(jun)注，1940年華(hua)西大(da)學鉛印(yin)本。僅含中(zhong)、下卷；郭誠(cheng)永補注上卷，北京中(zhong)華(hua)書(shu)局2008年全排印(yin)本。
《齊物(wu)論釋注(zhu)》，繆篆注(zhu)，油(you)印本。未見(jian)。《齊物(wu)論釋訓(xun)注(zhu)》，荒木(mu)見(jian)悟注(zhu)，九州大(da)學文學部哲學研究會《哲學年報》29-31。未見(jian)。
《章太(tai)炎(yan)選集(ji)》（注(zhu)釋本），朱維錚、姜義華注(zhu)，上海人民(min)出版社，1981年。
《訄書(shu)詳(xiang)注(zhu)》，徐復注(zhu)，上海古(gu)籍(ji)出版社(she)，2000年。注(zhu)名(ming)物(wu)。
《文(wen)學(xue)總(zong)略注》，程千(qian)帆《文(wen)論(lun)十箋》，朱東(dong)潤《中(zhong)國歷代文(wen)論(lun)選》。
英國斯(si)賓塞爾（Herbert Spencer）著，曾廣(guang)銓(quan)、章太炎譯《斯(si)賓塞爾文(wen)集》，上海《昌(chang)言報》第1至7本，1898年。
日本(ben)岸本(ben)能武太著、章太炎(yan)譯《社會學》，上海廣智書(shu)局，1902年鉛印本(ben)。
章(zhang)太炎的主筆有(you)《時務報(bao)(bao)(bao)》、《昌言報(bao)(bao)(bao)》、《經世報(bao)(bao)(bao)》、《實學報(bao)(bao)(bao)》、《譯書公會報(bao)(bao)(bao)》、《亞東時報(bao)(bao)(bao)》、《臺(tai)灣日(ri)日(ri)新報(bao)(bao)(bao)》、《民報(bao)(bao)(bao)》、《國粹學報(bao)(bao)(bao)》、《教育今語雜志(zhi)》、《大共和(he)日(ri)報(bao)(bao)(bao)》、《華國》、《制言》等。
章氏的(de)思想受到多方影響(xiang)，因為變化(hua)的(de)歷程相(xiang)(xiang)當(dang)繁復(fu)，依其《菿漢微言》中的(de)自述，是(shi)以(yi)(yi)“始則(ze)轉(zhuan)俗成真，終(zhong)則(ze)回真向(xiang)俗”十二字予以(yi)(yi)歸(gui)結。大(da)抵而言可以(yi)(yi)光緒二十四年(nian)（1908年(nian)）著成《齊物論(lun)釋》為界。在(zai)此(ci)之前，章氏先習樸學(xue)、諸子(zi)學(xue)以(yi)(yi)及西方進化(hua)論(lun)和社會學(xue)，在(zai)因蘇報案入獄之后(hou)，則(ze)改(gai)習法(fa)相(xiang)(xiang)宗，而后(hou)思想便(bian)以(yi)(yi)唯識學(xue)為尚(shang)，認為先秦諸子(zi)之學(xue)皆不足比擬(ni)，固可謂(wei)“轉(zhuan)俗成真”。
自《齊物論(lun)釋》著(zhu)成(cheng)之后(hou)(hou)，章(zhang)太炎(yan)因齊物思(si)想的(de)(de)(de)(de)啟示，不再(zai)僅以(yi)(yi)唯(wei)(wei)識為(wei)唯(wei)(wei)一標(biao)準，轉而認(ren)為(wei)凡“外(wai)能利物，內以(yi)(yi)遣憂(you)”之學(xue)(xue)(xue)(xue)皆有價值(zhi)，開始對古今中外(wai)的(de)(de)(de)(de)學(xue)(xue)(xue)(xue)術思(si)想進行(xing)重估。即進入“回真(zhen)向俗”的(de)(de)(de)(de)境界。形成(cheng)章(zhang)太炎(yan)思(si)想的(de)(de)(de)(de)背景主(zhu)要來自四個淵(yuan)源：一為(wei)受乾嘉學(xue)(xue)(xue)(xue)派考證學(xue)(xue)(xue)(xue)的(de)(de)(de)(de)影(ying)響(xiang)，講求客觀實證；二為(wei)跟隨晚清諸子學(xue)(xue)(xue)(xue)興起(qi)的(de)(de)(de)(de)潮流(liu)，對荀(xun)子、莊(zhuang)子、老(lao)子三家思(si)想加(jia)以(yi)(yi)揄揚，尊子貶孔；三為(wei)受到嚴復(fu)的(de)(de)(de)(de)影(ying)響(xiang)，在其(qi)早年(nian)的(de)(de)(de)(de)文(wen)章(zhang)中尤(you)其(qi)多以(yi)(yi)進化論(lun)作(zuo)為(wei)理論(lun)架構；四為(wei)佛學(xue)(xue)(xue)(xue)，尤(you)其(qi)是(shi)佛學(xue)(xue)(xue)(xue)中的(de)(de)(de)(de)唯(wei)(wei)識論(lun)，是(shi)章(zhang)氏后(hou)(hou)期思(si)想的(de)(de)(de)(de)支柱，使其(qi)思(si)想體(ti)系中充滿個體(ti)主(zhu)義、相對主(zhu)義的(de)(de)(de)(de)色彩。除了這四大(da)淵(yuan)源外(wai)，顧炎(yan)武(wu)、王夫之的(de)(de)(de)(de)民(min)族思(si)想，章(zhang)學(xue)(xue)(xue)(xue)誠、戴震、孫詒讓等人的(de)(de)(de)(de)思(si)想也(ye)對章(zhang)太炎(yan)具有相當的(de)(de)(de)(de)影(ying)響(xiang)力。
戊戌變法之(zhi)(zhi)后，章(zhang)太炎既對清(qing)朝(chao)統治(zhi)(zhi)不(bu)滿(man)，又同(tong)情(qing)康、梁；既孕有民(min)族(zu)(zu)思想，又沒有轉(zhuan)向(xiang)革命。他(ta)提出了“客帝”和“分(fen)(fen)鎮(zhen)(zhen)”的(de)(de)課題，認(ren)(ren)為(wei)(wei)(wei)滿(man)洲(zhou)(zhou)貴族(zu)(zu)，是客帝；中(zhong)國的(de)(de)“共主(zhu)”應為(wei)(wei)(wei)“仲尼之(zhi)(zhi)世(shi)胄(zhou)”。只要清(qing)朝(chao)皇帝承(cheng)認(ren)(ren)過去民(min)族(zu)(zu)壓迫的(de)(de)錯(cuo)誤，擁護孔子后裔，做“虛君”，自(zi)己退居為(wei)(wei)(wei)齊桓公、晉文公般(ban)的(de)(de)霸(ba)主(zhu)，發憤自(zi)強(qiang)，那(nei)么反滿(man)情(qing)緒可以(yi)(yi)平息，可以(yi)(yi)防(fang)止(zhi)“逐加于(yu)(yu)滿(man)人(ren)(ren)，而地(di)割于(yu)(yu)白(bai)人(ren)(ren)”。“分(fen)(fen)鎮(zhen)(zhen)”也(ye)是章(zhang)太炎在(zai)外國侵(qin)略、清(qing)政(zheng)腐朽的(de)(de)情(qing)況下提出的(de)(de)一種改良設想。認(ren)(ren)為(wei)(wei)(wei)政(zheng)治(zhi)(zhi)危急之(zhi)(zhi)際，“猶賴有數鎮(zhen)(zhen)稍自(zi)奮起，足以(yi)(yi)扶危而定傾(qing)”。因此，不(bu)能削弱藩(fan)鎮(zhen)(zhen)，而“甘心于(yu)(yu)白(bai)種之(zhi)(zhi)陵籍(ji)”。藩(fan)鎮(zhen)(zhen)和立(li)憲政(zheng)并不(bu)矛盾。“板蕩之(zhi)(zhi)世(shi)，非(fei)得藩(fan)鎮(zhen)(zhen)以(yi)(yi)尊(zun)攘，則(ze)憲政(zheng)不(bu)立(li)”。他(ta)舉明治(zhi)(zhi)維新(xin)為(wei)(wei)(wei)例，“若皇德貞觀，廓夷歸(gui)章(zhang)，示民(min)版法，陶(tao)冶天下，而歸(gui)之(zhi)(zhi)一憲，藩(fan)鎮(zhen)(zhen)將奔走(zou)趨令(ling)，如(ru)日(ri)本(ben)之(zhi)(zhi)薩、長(chang)二藩(fan)，始(shi)于(yu)(yu)建功(gong)，而終于(yu)(yu)納土，何惠自(zi)擅？”此后，進而指出：“瓜分(fen)(fen)而授(shou)之(zhi)(zhi)外人(ren)(ren)，孰與瓜分(fen)(fen)而授(shou)之(zhi)(zhi)方(fang)鎮(zhen)(zhen)。”他(ta)反對滿(man)洲(zhou)(zhou)貴族(zu)(zu)統治(zhi)(zhi)的(de)(de)喪權辱國，而對漢(han)族(zu)(zu)地(di)主(zhu)階級還存幻想。他(ta)向(xiang)往的(de)(de)還是明治(zhi)(zhi)維新(xin)式的(de)(de)“革政(zheng)”。在(zai)旅臺期間，他(ta)曾(ceng)將所寫論文匯成《訄書》。光緒二十五年5月(yue)，由基(ji)隆去日(ri)本(ben)，7月(yue)下旬，由日(ri)返國。
章太炎(yan)認(ren)(ren)為共和政體(ti)(ti)不如專(zhuan)制(zhi)政體(ti)(ti)。章太炎(yan)闡(chan)述的，有三層意思：代議(yi)制(zhi)的民主共和政體(ti)(ti)不能行之于中國；政黨與議(yi)員勾結(jie)，這種共和政體(ti)(ti)還不如專(zhuan)制(zhi)政體(ti)(ti)為宜(yi)。結(jie)論是建(jian)立共和政體(ti)(ti)只能是不得已(yi)之舉。認(ren)(ren)為清(qing)朝推翻后，中國還是行專(zhuan)制(zhi)政體(ti)(ti)為好。
章(zhang)太炎早年在日本(ben)主(zhu)(zhu)編《民報》時(shi)，曾主(zhu)(zhu)張社(she)會(hui)主(zhu)(zhu)義，與(yu)片山潛(qian)等(deng)日本(ben)社(she)會(hui)主(zhu)(zhu)義者過從甚密，并(bing)由此反思西方的進(jin)化(hua)論及現代文明(ming)，撰寫了《俱分(fen)進(jin)化(hua)論》、《五無論》等(deng)著作。
章太炎是(shi)近代中國(guo)國(guo)學(xue)(xue)大師，也是(shi)學(xue)(xue)者型的(de)資(zi)產階級革(ge)命家(jia)；但(dan)學(xue)(xue)術與(yu)政治畢(bi)竟不(bu)同(tong)，政治方面，章太炎確有(you)他(ta)的(de)局限(xian)，這些局限(xian)在辛亥革(ge)命及民國(guo)初年表現得(de)很明(ming)顯(xian)。章太炎的(de)一(yi)些主張與(yu)孫(sun)中山(shan)不(bu)同(tong)，但(dan)他(ta)仍是(shi)一(yi)位有(you)功于辛亥革(ge)命的(de)民主革(ge)命宣(xuan)傳家(jia)。
胡(hu)適則(ze)在《五十年來(lai)中國之(zhi)文(wen)學(xue)》（1922年）中說：“章(zhang)炳(bing)麟的古文(wen)學(xue)是五十年來(lai)的第一作家，這(zhe)是無可疑(yi)的。但他的成績只夠替古文(wen)學(xue)做一個很光榮的下場，仍(reng)舊不能救古文(wen)學(xue)的必死之(zhi)癥，仍(reng)舊不能做到那‘取千年朽蠹之(zhi)馀(yu)，反之(zhi)正則(ze)’的盛(sheng)業。”
梁啟(qi)超(chao)《清代學(xue)術(shu)概論》（1922年）稱(cheng)章太炎為清學(xue)正統派的(de)“殿軍”。
魯(lu)迅在1936年臨(lin)終時回憶其(qi)師章太炎：“考其(qi)生平(ping)，以(yi)大勛(xun)章作扇墜，臨(lin)總統府之門，大詬袁世(shi)凱包藏(zang)禍(huo)心者(zhe)，并(bing)世(shi)無第二(er)人；七被追捕，三入(ru)牢獄，而革(ge)命(ming)之志終不屈撓者(zhe)，并(bing)世(shi)亦無第二(er)人。這(zhe)才是先(xian)哲的(de)(de)精神，后生的(de)(de)楷模(mo)。”
汪炳評價他是一位“有革命業(ye)績(ji)的(de)學(xue)問(wen)家”。
薛(xue)慧山說他(ta)是“權威性(xing)的國學大師，推翻滿清(qing)的革命先(xian)進”。
謝俊美認為(wei)他應該(gai)是一位“有革命業(ye)績的大學問家”。
