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基本介紹

2003年(nian)完成的(de)人類基(ji)因(yin)(yin)組計劃成功地對所(suo)有(you)20,000個蛋白(bai)質(zhi)編(bian)碼基(ji)因(yin)(yin)（蛋白(bai)質(zhi)組）進(jin)行了(le)測序，這是一項巨大的(de)科學成就，但(dan)這實際上只是一個開始。下(xia)一步是檢查蛋白(bai)質(zhi)組以開始了(le)解(jie)所(suo)有(you)這些蛋白(bai)質(zhi)的(de)功能(neng)。

人類蛋白質(zhi)(zhi)圖(tu)譜(HPA)項目于(yu)2003年啟動，目標是使(shi)用(yong)基(ji)(ji)于(yu)抗(kang)體(ti)的蛋白質(zhi)(zhi)組學系(xi)統地(di)繪制這(zhe)些蛋白質(zhi)(zhi)的表達。該計(ji)劃主要設在瑞典(dian)，由(you)非(fei)營(ying)利組織Knut和Alice Wallenberg基(ji)(ji)金會(KAW)資助。內部生產(chan)和商業(ye)購買的抗(kang)體(ti)首先由(you)研究人員驗證，然后用(yong)于(yu)表征每(mei)種蛋白質(zhi)(zhi)。

數(shu)據(ju)可通過開放式(shi)交互式(shi)數(shu)據(ju)庫(ku)獲取：www.proteinatlas.org.

它包含數百萬張(zhang)高分(fen)辨率圖(tu)像，顯示44種不同正常人(ren)體組織(zhi)(Tissue Atlas)和20種不同癌癥(zheng)類型(xing)(Cancer Atlas)中(zhong)76 種不同細胞類型(xing)的蛋白(bai)質表達的空間(jian)定位。

在美國細胞生(sheng)物(wu)學(xue)學(xue)會(hui)（ASCB，2016年12月）上(shang)，一個新(xin)的Cell Atlas在HPA的更新(xin)版本(ben)（第16版）中發布，參加人數眾多。

特色功能

它的特點：

l 免疫熒光染色細胞的高分辨率(lv)、多色圖像(xiang)

l 代表人(ren)體不同器(qi)官(guan)細胞群的56種細胞系中蛋白質的亞細胞空(kong)間(jian)定位(wei)

l 使用深度RNA測(ce)序表征(zheng)的(de)所(suo)有人類基因(yin)的(de)mRNA表達

l > 12,000個基(ji)因和可用抗體映射到(dao)30種不同的細(xi)胞(bao)結(jie)構（即細(xi)胞(bao)核、胞(bao)質溶膠、線粒體等）

精確定(ding)位(wei)蛋白(bai)質(zhi)的(de)(de)(de)亞細胞定(ding)位(wei)對于理解其(qi)功能(neng)至關重要。當它(ta)們定(ding)位(wei)到(dao)預期的(de)(de)(de)微(wei)環境（即細胞器(qi)、囊(nang)泡(pao)或大分子復合物）時，它(ta)們將在(zai)合適的(de)(de)(de)生化條件下遇到(dao)其(qi)他蛋白(bai)質(zhi)或RNA以實(shi)現其(qi)分子功能(neng)（Breckles，2016）。這份全面的(de)(de)(de)圖譜(pu)為世界(jie)各地的(de)(de)(de)研究人員(yuan)對蛋白(bai)質(zhi)功能(neng)進行更復雜(za)的(de)(de)(de)研究提(ti)供了(le)急需的(de)(de)(de)工(gong)具。

以下是Cell Atlas中(zhong)的一些示(shi)例圖像：

CCNB1：細(xi)胞(bao)(bao)周期蛋(dan)(dan)白B1是一種調節蛋(dan)(dan)白，位于細(xi)胞(bao)(bao)質中(zhong)，參與人(ren)和小鼠細(xi)胞(bao)(bao)的(de)有絲分(fen)裂。它主要在細(xi)胞(bao)(bao)周期的(de)G2/M 期以(yi)(yi)細(xi)胞(bao)(bao)周期依賴性的(de)方式表達(da)。在圖中(zhong)，U-2 OS人(ren)細(xi)胞(bao)(bao)系(xi)中(zhong)的(de)細(xi)胞(bao)(bao)周期蛋(dan)(dan)白B1蛋(dan)(dan)白表達(da)（抗體HPA030741）以(yi)(yi)綠(lv)色(se)顯示，而細(xi)胞(bao)(bao)核為藍色(se)，微管(guan)為紅色(se)。

蛋白質圖譜

DAXX：死亡(wang)域(yu)相(xiang)關蛋(dan)(dan)白6是一(yi)種多功能蛋(dan)(dan)白，主要定位于(yu)人和小鼠細(xi)胞(bao)(bao)(bao)(bao)的(de)(de)細(xi)胞(bao)(bao)(bao)(bao)核和核體(ti)，但(dan)也在(zai)細(xi)胞(bao)(bao)(bao)(bao)質中(zhong)(zhong)表達。DAXX 與有絲分(fen)裂G2期的(de)(de)著(zhu)絲粒相(xiang)關。在(zai)細(xi)胞(bao)(bao)(bao)(bao)質中(zhong)(zhong)，它通過與細(xi)胞(bao)(bao)(bao)(bao)凋(diao)亡(wang)抗原Fas相(xiang)互作(zuo)用來調節細(xi)胞(bao)(bao)(bao)(bao)凋(diao)亡(wang)。該圖顯(xian)示了(le)細(xi)胞(bao)(bao)(bao)(bao)系A-431中(zhong)(zhong)細(xi)胞(bao)(bao)(bao)(bao)核內的(de)(de)核體(ti)（GFP標記(ji)的(de)(de)抗體(ti)HPA008797）中(zhong)(zhong)的(de)(de)表達。