清統一(yi)準(zhun)噶爾之戰(zhan)，又稱準(zhun)清戰(zhan)爭(zheng)(zheng)，是清朝康(kang)熙、雍正、乾隆三朝為統一(yi)西北地區并(bing)將其納入版圖與(yu)準(zhun)噶爾貴(gui)族進(jin)行的(de)多次(ci)戰(zhan)爭(zheng)(zheng)。從康(kang)熙二十七年(nian)（1688年(nian)）正式打響，一(yi)直到乾隆二十三年(nian)（1758年(nian)）才宣告結(jie)束，長達近70年(nian)。
1688年(nian)，噶(ga)(ga)(ga)(ga)爾(er)(er)丹(dan)(dan)(dan)勢力侵入(ru)喀爾(er)(er)喀蒙古。1690年(nian)6月，噶(ga)(ga)(ga)(ga)爾(er)(er)丹(dan)(dan)(dan)又向漠北喀爾(er)(er)喀蒙古進(jin)攻，康熙帝(di)組(zu)織左(zuo)右兩路(lu)大軍(jun)親征(zheng)，噶(ga)(ga)(ga)(ga)爾(er)(er)丹(dan)(dan)(dan)潰逃(tao)。噶(ga)(ga)(ga)(ga)爾(er)(er)丹(dan)(dan)(dan)敗亡后，策妄阿拉布坦繼任準噶(ga)(ga)(ga)(ga)爾(er)(er)部(bu)臺吉，準噶(ga)(ga)(ga)(ga)爾(er)(er)部(bu)又與清朝(chao)再次(ci)發生沖突。1716年(nian)，準噶(ga)(ga)(ga)(ga)爾(er)(er)部(bu)出兵(bing)西藏，占(zhan)領拉薩(sa)。清朝(chao)由(you)青(qing)海(hai)出兵(bing)入(ru)藏，全軍(jun)覆沒。1720年(nian)，清朝(chao)第(di)二次(ci)出兵(bing)，趕走準噶(ga)(ga)(ga)(ga)爾(er)(er)軍(jun)。1755年(nian)，乾隆帝(di)趁準噶(ga)(ga)(ga)(ga)爾(er)(er)內亂之(zhi)機出兵(bing)進(jin)占(zhan)伊(yi)犁(li)、擊潰達瓦齊(qi)軍(jun)，并(bing)于1757年(nian)平定阿睦(mu)爾(er)(er)撒納(na)(na)的叛(pan)亂。乾隆二十(shi)三年(nian)（1758年(nian)）正(zheng)月，俄(e)國遣使(shi)告知阿睦(mu)爾(er)(er)撒納(na)(na)已死。清廷派人(ren)前往邊界驗看尸(shi)首。乾隆帝(di)以(yi)平定阿睦(mu)爾(er)(er)撒納(na)(na)，宣(xuan)諭中(zhong)外。
清朝統治者統一西(xi)北、平定準噶爾叛(pan)亂中(zhong)剿撫并用(yong)，為國(guo)家統一而戰(zhan)。清軍(jun)平定準噶爾貴(gui)族的(de)叛(pan)亂，是(shi)一次維護(hu)祖(zu)國(guo)統一、反對(dui)民族分(fen)裂的(de)正義戰(zhan)爭(zheng)。鞏(gong)固了清朝對(dui)西(xi)北邊疆地(di)區的(de)統治，打擊了沙皇俄國(guo)的(de)侵略勢力。西(xi)方也有清朝向(xiang)西(xi)北擴(kuo)張屬(shu)于近(jin)代早(zao)期(qi)的(de)帝國(guo)對(dui)外擴(kuo)張模式(shi)的(de)觀點。
準噶(ga)爾(er)(er)(er)(er)原屬(shu)于(yu)和明朝對峙的蒙(meng)古(gu)瓦(wa)剌，后來瓦(wa)剌部(bu)(bu)(bu)(bu)(bu)在崛起的蒙(meng)古(gu)韃靼部(bu)(bu)(bu)(bu)(bu)打擊下向西遷(qian)移并發(fa)生分裂，在歷史上(shang)(shang)又被稱為衛(wei)拉特(te)(te)，下面又分為準噶(ga)爾(er)(er)(er)(er)部(bu)(bu)(bu)(bu)(bu)、和碩特(te)(te)部(bu)(bu)(bu)(bu)(bu)、土(tu)爾(er)(er)(er)(er)扈(hu)特(te)(te)部(bu)(bu)(bu)(bu)(bu)和杜(du)爾(er)(er)(er)(er)伯(bo)特(te)(te)部(bu)(bu)(bu)(bu)(bu)四部(bu)(bu)(bu)(bu)(bu)，也稱為漠西蒙(meng)古(gu)（厄魯特(te)(te)蒙(meng)古(gu)）。其牧(mu)(mu)地(di)，西北不斷向額(e)爾(er)(er)(er)(er)齊(qi)斯(si)河(he)(he)(he)中游、鄂畢(bi)河(he)(he)(he)以及哈薩(sa)克草原移動，西南(nan)向伊犁河(he)(he)(he)流域推進，東南(nan)向青(qing)海遷(qian)徙(xi)。準噶(ga)爾(er)(er)(er)(er)部(bu)(bu)(bu)(bu)(bu)初游牧(mu)(mu)于(yu)額(e)爾(er)(er)(er)(er)齊(qi)斯(si)河(he)(he)(he)中上(shang)(shang)游至(zhi)(zhi)霍博克河(he)(he)(he)、薩(sa)里山一帶，后以伊犁河(he)(he)(he)流域為中心。杜(du)爾(er)(er)(er)(er)伯(bo)特(te)(te)部(bu)(bu)(bu)(bu)(bu)游牧(mu)(mu)于(yu)額(e)爾(er)(er)(er)(er)齊(qi)斯(si)河(he)(he)(he)沿岸。土(tu)爾(er)(er)(er)(er)扈(hu)特(te)(te)部(bu)(bu)(bu)(bu)(bu)原游牧(mu)(mu)于(yu)塔爾(er)(er)(er)(er)巴(ba)哈臺及其以北，西徙(xi)后，輝(hui)特(te)(te)部(bu)(bu)(bu)(bu)(bu)居之(zhi)。和碩特(te)(te)部(bu)(bu)(bu)(bu)(bu)游牧(mu)(mu)于(yu)額(e)敏河(he)(he)(he)兩岸至(zhi)(zhi)烏魯木齊(qi)地(di)區。諸部(bu)(bu)(bu)(bu)(bu)分牧(mu)(mu)而(er)居，互(hu)不相(xiang)屬(shu)。所轄地(di)區北至(zhi)(zhi)額(e)爾(er)(er)(er)(er)齊(qi)斯(si)河(he)(he)(he)、鄂畢(bi)河(he)(he)(he)、葉(xie)尼塞河(he)(he)(he)上(shang)(shang)游地(di)區，南(nan)至(zhi)(zhi)天山，東到阿(a)爾(er)(er)(er)(er)泰山和蒙(meng)古(gu)杭愛山分界線，西包(bao)巴(ba)爾(er)(er)(er)(er)喀什湖地(di)區。
天(tian)聰九年(nian)(nian)(nian)（1635年(nian)(nian)(nian)），衛拉(la)特盟主固始汗就遣使至盛京向后金（清）統治(zhi)者貢馬匹、方物(wu)。固始汗遣使表示歸(gui)順(shun)后金，就代表衛拉(la)特歸(gui)順(shun)后金政(zheng)權。順(shun)治(zhi)元(yuan)年(nian)(nian)(nian)（1644年(nian)(nian)(nian)）滿洲貴族(zu)的(de)(de)軍(jun)隊在(zai)明朝將領吳三桂的(de)(de)帶引下大舉進入山海關內，擊敗(bai)李自成(cheng)、攻占(zhan)京師(shi)（今北京），開始取代明朝成(cheng)為(wei)統治(zhi)中國的(de)(de)中央政(zheng)府(fu)。在(zai)這樣的(de)(de)大背景下，順(shun)治(zhi)三年(nian)(nian)(nian)（1646年(nian)(nian)(nian)），包括準(zhun)噶(ga)爾(er)(er)部(bu)在(zai)內的(de)(de)衛拉(la)特各部(bu)首領二(er)十二(er)人(ren)聯名(ming)奉表貢，清朝皇(huang)帝賜以甲胄弓矢，命其統轄諸(zhu)部(bu)，準(zhun)噶(ga)爾(er)(er)部(bu)和清朝之(zhi)間確定了主權關系，青藏高原和新疆等地正式納入清朝的(de)(de)主權版圖。
準(zhun)(zhun)噶爾為(wei)早期衛(wei)拉特聯盟的綽羅斯(si)部(bu)(bu)，17世紀(ji)，準(zhun)(zhun)噶爾部(bu)(bu)強(qiang)(qiang)大(da)起來。將(jiang)土爾扈特部(bu)(bu)向西(xi)(xi)壓迫，致其(qi)與杜爾伯(bo)特部(bu)(bu)、和碩特部(bu)(bu)的一部(bu)(bu)被迫遷到(dao)了(le)伏爾加河下游地區(qu)。向東壓迫杜爾伯(bo)特部(bu)(bu)，奪其(qi)領地，逼其(qi)內附清朝。并企圖兼(jian)并和碩特部(bu)(bu)，入侵青海。準(zhun)(zhun)噶爾部(bu)(bu)又(you)擊敗哈薩克人(ren)，翻過天山征服回(hui)部(bu)(bu)諸察合臺汗及伊(yi)斯(si)蘭教派(pai)(pai)白山派(pai)(pai)與黑(hei)山派(pai)(pai)，飛兵拉薩，凌(ling)攝西(xi)(xi)藏，終于建立起了(le)強(qiang)(qiang)大(da)的準(zhun)(zhun)噶爾汗國。其(qi)疆域(yu)北接額爾齊斯(si)河、鄂畢(bi)河、葉尼塞河上(shang)游，南到(dao)西(xi)(xi)藏阿(a)里地區(qu)，西(xi)(xi)包巴爾喀什湖，東至蒙古薩彥嶺(ling)及色(se)愣(leng)格河流域(yu)，極盛時達(da)四百多萬平方(fang)公里。
天聰八(ba)年(nian)（1634年(nian)），準(zhun)噶爾(er)部的(de)首領哈喇(la)忽剌去世，其子巴圖爾(er)繼(ji)任首領，對外(wai)擴張疆土，并(bing)在崇德(de)(de)三(san)年(nian)（1638年(nian)）在博克(ke)塞里（今博克(ke)賽(sai)爾(er)蒙(meng)古(gu)自(zi)治縣）建成(cheng)自(zi)己的(de)城(cheng)；崇德(de)(de)五(wu)年(nian)（1640年(nian)）參與制定(ding)(ding)《喀爾(er)喀—衛(wei)拉特法典(dian)》。巴圖爾(er)被(bei)稱為(wei)巴圖爾(er)琿(hun)臺吉，連續(xu)兩(liang)次擊(ji)退俄羅斯(si)的(de)侵略(lve)，迫使俄羅斯(si)承認了準(zhun)噶爾(er)汗(han)國(guo)(guo)，兩(liang)國(guo)(guo)互通貿(mao)易(yi)。此前(qian)后(hou)金(jin)已于崇德(de)(de)元年(nian)（1636年(nian)）改(gai)國(guo)(guo)號為(wei)大清。順治五(wu)年(nian)（1648年(nian)），巴圖爾(er)琿(hun)臺吉授(shou)命喇(la)嘛咱雅班(ban)第(di)達將過去的(de)蒙(meng)文(wen)改(gai)造(zao)而制定(ding)(ding)成(cheng)“托沁”文(wen)字(zi)，作為(wei)準(zhun)噶爾(er)的(de)統一文(wen)字(zi)。
順治十(shi)年(nian)(nian)(nian)(nian)（1653年(nian)(nian)(nian)(nian)），巴圖(tu)(tu)爾(er)(er)琿臺吉去世，其第五子僧(seng)格繼(ji)承臺吉，但其眾兄(xiong)弟不服(fu)，起(qi)兵(bing)反叛(pan)，內戰爆發，至(zhi)十(shi)七(qi)世紀六十(shi)年(nian)(nian)(nian)(nian)代，僧(seng)格才平定了叛(pan)亂，但在(zai)康熙十(shi)年(nian)(nian)(nian)(nian)（1671年(nian)(nian)(nian)(nian)），他(ta)就被自(zi)己的(de)(de)(de)(de)兩個(ge)哥(ge)哥(ge)車臣(chen)和(he)卓特(te)(te)巴巴圖(tu)(tu)爾(er)(er)暗殺，他(ta)的(de)(de)(de)(de)三個(ge)兒(er)子都年(nian)(nian)(nian)(nian)小，臺吉位難(nan)以(yi)得到延續，正在(zai)西藏學(xue)習佛學(xue)的(de)(de)(de)(de)噶爾(er)(er)丹（僧(seng)格之弟）征得老師五世達賴喇嘛的(de)(de)(de)(de)同意，還俗(su)，快(kuai)速(su)回國，在(zai)和(he)碩特(te)(te)首(shou)領兼衛拉特(te)(te)盟主的(de)(de)(de)(de)鄂齊爾(er)(er)圖(tu)(tu)車臣(chen)汗援助下(xia)，擒殺了車臣(chen)，并將卓特(te)(te)巴巴圖(tu)(tu)爾(er)(er)趕往(wang)青海。噶爾(er)(er)丹自(zi)立為準(zhun)噶爾(er)(er)汗。噶爾(er)(er)丹首(shou)先統一了西蒙古(gu)諸部，隨(sui)后，他(ta)起(qi)兵(bing)進攻葉(xie)爾(er)(er)羌的(de)(de)(de)(de)黑(hei)山(shan)派和(he)喀什噶爾(er)(er)的(de)(de)(de)(de)白山(shan)派，征服(fu)了這個(ge)察合(he)(he)臺汗國。又于1681年(nian)(nian)(nian)(nian)征服(fu)了土魯番汗國的(de)(de)(de)(de)察合(he)(he)臺汗。
準(zhun)噶爾貴(gui)族統治厄(e)魯特蒙古(gu)各部后，與(yu)清(qing)政(zheng)府(fu)仍保持著地方與(yu)中央的隸屬關系。準(zhun)噶爾首領巴圖爾琿(hun)臺(tai)吉、僧格等(deng)，每(mei)兩年都要向(xiang)清(qing)政(zheng)府(fu)遣使「朝貢」。清(qing)政(zheng)府(fu)也賜予大量財物給準(zhun)噶爾，并經常(chang)遣使通報情況。
但是(shi)，在(zai)準噶(ga)爾(er)(er)(er)貴族內部(bu)，也有一部(bu)分人堅持分裂主義(yi)立(li)場。康熙九年（1670年）僧(seng)格死后(hou)，他(ta)的(de)(de)異母弟噶(ga)爾(er)(er)(er)丹(dan)殺(sha)害了(le)(le)他(ta)的(de)(de)子嗣(si)，奪得了(le)(le)準噶(ga)爾(er)(er)(er)的(de)(de)統治權(quan)。噶(ga)爾(er)(er)(er)丹(dan)是(shi)個(ge)野心勃勃的(de)(de)陰謀家(jia)和(he)賣國賊，在(zai)他(ta)自(zi)任為準噶(ga)爾(er)(er)(er)汗(han)以(yi)后(hou)，康熙十(shi)(shi)六年（1677年）用(yong)計襲殺(sha)了(le)(le)和(he)清政(zheng)府關系(xi)最(zui)密切的(de)(de)厄魯(lu)特首領車臣汗(han)鄂(e)齊爾(er)(er)(er)圖，強占了(le)(le)河套(tao)和(he)碩特部(bu)，并(bing)在(zai)該部(bu)強征兵(bing)丁，準備(bei)侵(qin)犯青(qing)海地區。康熙十(shi)(shi)七年（1678年），噶(ga)爾(er)(er)(er)丹(dan)出兵(bing)天山(shan)南(nan)路(lu)，占領天山(shan)南(nan)北(bei)廣大地區，把(ba)廣大維吾爾(er)(er)(er)族人民置于其統治之下(xia)。噶(ga)爾(er)(er)(er)丹(dan)取(qu)得準噶(ga)爾(er)(er)(er)的(de)(de)統治權(quan)后(hou)，一反其父兄抗擊外(wai)來侵(qin)略(lve)、捍(han)衛民族主權(quan)的(de)(de)立(li)場，而(er)逐漸走上與沙俄(e)相勾結的(de)(de)道(dao)路(lu)。噶(ga)爾(er)(er)(er)丹(dan)在(zai)沙俄(e)的(de)(de)挑唆(suo)和(he)指(zhi)使(shi)下(xia)，開始把(ba)注意(yi)力轉向(xiang)東方，把(ba)矛頭指(zhi)向(xiang)喀(ka)爾(er)(er)(er)喀(ka)蒙古。
康熙二十七(qi)年(nian)(nian)(nian)（1688年(nian)(nian)(nian)），正當蒙(meng)(meng)古(gu)(gu)(gu)族人(ren)民英勇抗擊(ji)戈洛文率(lv)領(ling)的(de)(de)沙(sha)俄(e)(e)(e)侵略(lve)(lve)(lve)軍(jun)(jun)(jun)時，噶爾(er)丹竟(jing)突然率(lv)兵越過杭愛山，大舉進攻(gong)喀(ka)(ka)爾(er)喀(ka)(ka)的(de)(de)土(tu)謝圖(tu)(tu)汗，從(cong)背后向喀(ka)(ka)爾(er)喀(ka)(ka)蒙(meng)(meng)古(gu)(gu)(gu)軍(jun)(jun)(jun)民施放暗箭(jian)，迫(po)使喀(ka)(ka)爾(er)喀(ka)(ka)蒙(meng)(meng)古(gu)(gu)(gu)諸部(bu)南遷。噶爾(er)丹的(de)(de)有(you)恃無(wu)恐與沙(sha)皇俄(e)(e)(e)國(guo)(guo)的(de)(de)慫恿(yong)和支持密切相(xiang)關。從(cong)康熙十三年(nian)(nian)(nian)到康熙二十二年(nian)(nian)(nian)（1674—1683）間，噶爾(er)丹幾乎(hu)每年(nian)(nian)(nian)都派人(ren)與沙(sha)皇俄(e)(e)(e)國(guo)(guo)相(xiang)勾(gou)結，并“企圖(tu)(tu)同(tong)俄(e)(e)(e)國(guo)(guo)訂立軍(jun)(jun)(jun)事同(tong)盟(meng)和求(qiu)得俄(e)(e)(e)國(guo)(guo)給予‘軍(jun)(jun)(jun)隊(dui)和槍(qiang)炮’的(de)(de)援助”。噶爾(er)丹出兵喀(ka)(ka)爾(er)喀(ka)(ka)蒙(meng)(meng)古(gu)(gu)(gu)時，正是喀(ka)(ka)爾(er)喀(ka)(ka)蒙(meng)(meng)古(gu)(gu)(gu)土(tu)謝圖(tu)(tu)汗率(lv)領(ling)蒙(meng)(meng)古(gu)(gu)(gu)軍(jun)(jun)(jun)民抗擊(ji)沙(sha)俄(e)(e)(e)侵略(lve)(lve)(lve)者(zhe)并包圍了(le)沙(sha)俄(e)(e)(e)軍(jun)(jun)(jun)隊(dui)于色(se)楞格斯城堡內的(de)(de)關鍵時刻。結果由于噶爾(er)丹從(cong)西面向喀(ka)(ka)爾(er)喀(ka)(ka)部(bu)發動進攻(gong)，使其(qi)腹背受(shou)敵，迫(po)使土(tu)謝圖(tu)(tu)汗只得撤退包圍沙(sha)俄(e)(e)(e)侵略(lve)(lve)(lve)者(zhe)的(de)(de)軍(jun)(jun)(jun)隊(dui)，噶爾(er)丹替沙(sha)俄(e)(e)(e)侵略(lve)(lve)(lve)者(zhe)解了(le)圍。康熙二十九年(nian)(nian)(nian)（1690年(nian)(nian)(nian)）6月(yue)，噶爾(er)丹以追擊(ji)喀(ka)(ka)爾(er)喀(ka)(ka)為名(ming)，又向漠南喀(ka)(ka)爾(er)喀(ka)(ka)蒙(meng)(meng)古(gu)(gu)(gu)進攻(gong)，俘掠(lve)人(ren)口，搶劫牲畜(chu)。他還公然向康熙帝提出“圣上君(jun)南方，我長(chang)北方”的(de)(de)要求(qiu)，妄(wang)圖(tu)(tu)把(ba)中(zhong)國(guo)(guo)北部(bu)置于他的(de)(de)統治之下。清政府為了(le)保(bao)衛(wei)邊疆的(de)(de)安寧，反(fan)抗沙(sha)俄(e)(e)(e)的(de)(de)侵略(lve)(lve)(lve)，對(dui)準噶爾(er)部(bu)封建主噶爾(er)丹進行了(le)堅(jian)決的(de)(de)斗爭。
康熙二十九年(nian)（1690年(nian)）五(wu)月，康熙帝玄燁(ye)得知“噶(ga)(ga)爾(er)丹(dan)(dan)將借兵(bing)鄂羅(luo)斯(si)（俄(e)羅(luo)斯(si)）”，立即傳(chuan)諭在北京的俄(e)國使臣吉里(li)古里(li)、伊(yi)法尼齊：“噶(ga)(ga)爾(er)丹(dan)(dan)迫于(yu)內亂，食(shi)盡無歸(gui)，內向行(xing)劫，今仍(reng)揚(yang)言(yan)會汝兵(bing)同侵喀(ka)(ka)(ka)爾(er)喀(ka)(ka)(ka)，喀(ka)(ka)(ka)爾(er)喀(ka)(ka)(ka)已歸(gui)順(shun)本朝，倘誤(wu)信其言(yan)，是負信誓而開(kai)兵(bing)端也”。既揭露(lu)了噶(ga)(ga)爾(er)丹(dan)(dan)勾結沙俄(e)的無恥行(xing)經(jing)，又(you)警告了沙皇俄(e)國。但噶(ga)(ga)爾(er)丹(dan)(dan)仍(reng)一意孤行(xing)，遂于(yu)康熙二十九年(nian)（1690年(nian)）六月，率(lv)軍兩萬，以追擊(ji)喀(ka)(ka)(ka)爾(er)喀(ka)(ka)(ka)蒙古為名，大舉南(nan)犯，深入漠南(nan)蒙古烏珠(zhu)穆沁一帶。由于(yu)理藩(fan)院尚書阿喇尼等“違命輕戰”，以至清軍初(chu)戰失利，噶(ga)(ga)爾(er)丹(dan)(dan)軍隊得以乘勢渡過西拉木倫河(he)，深入到距(ju)北京僅(jin)700里(li)的烏蘭(lan)布通（今內蒙古昭烏達(da)盟克什克騰旗南(nan)境(jing)）。
噶(ga)爾丹深(shen)入喀爾喀蒙(meng)古后，康(kang)熙(xi)帝(di)(di)就謀劃(hua)剿滅這個與己爭奪(duo)蒙(meng)古高原霸(ba)權(quan)的強(qiang)大敵手。清政府在外(wai)交(jiao)上(shang)與沙俄侵略(lve)者(zhe)展開(kai)針鋒(feng)相對的斗爭，同(tong)時在政治上(shang)和軍事上(shang)也作了(le)一系列準備。康(kang)熙(xi)帝(di)(di)認為，若聽任噶(ga)爾丹荼毒(du)塞外(wai)，將勢成毒(du)癰。要使邊(bian)境(jing)得以安定，國家得以長治久安，不能貪圖一時茍安之計，而必須順其民(min)心，消滅噶(ga)爾丹叛(pan)亂分子(zi)，才能保障(zhang)國內安定。因此，康(kang)熙(xi)帝(di)(di)決計親征。
康(kang)熙(xi)(xi)二十(shi)九(jiu)年（1690年）六(liu)月(yue)，康(kang)熙(xi)(xi)部(bu)署(shu)是(shi)分(fen)兵(bing)兩路(lu)(lu)(lu)出(chu)擊(ji)：左(zuo)(zuo)路(lu)(lu)(lu)軍出(chu)古北口（今(jin)(jin)(jin)(jin)河(he)(he)北灤平南），右(you)(you)路(lu)(lu)(lu)軍出(chu)喜峰口（今(jin)(jin)(jin)(jin)河(he)(he)北寬城西(xi)南），從左(zuo)(zuo)右(you)(you)兩翼(yi)迂回北進(jin)(jin)(jin)(jin)，消滅噶(ga)爾(er)丹(dan)軍于烏珠穆沁(qin)地區。康(kang)熙(xi)(xi)親臨博洛和(he)屯（今(jin)(jin)(jin)(jin)內(nei)蒙(meng)(meng)古正藍(lan)旗(qi)南）指揮。同時令盛京將軍（治所今(jin)(jin)(jin)(jin)遼寧沈陽(yang)）、吉林將軍（治所今(jin)(jin)(jin)(jin)吉林市）各率(lv)所部(bu)兵(bing)力，西(xi)出(chu)西(xi)遼河(he)(he)、洮兒河(he)(he)，與科爾(er)沁(qin)蒙(meng)(meng)古兵(bing)會合，協同清軍主(zhu)力作戰。右(you)(you)路(lu)(lu)(lu)軍北進(jin)(jin)(jin)(jin)至(zhi)烏珠穆沁(qin)境(jing)遇噶(ga)爾(er)丹(dan)軍，交(jiao)戰不利(li)南退。噶(ga)爾(er)丹(dan)乘勢長驅南進(jin)(jin)(jin)(jin)，渡過西(xi)拉木(mu)倫河(he)(he)，進(jin)(jin)(jin)(jin)抵烏蘭(lan)布(bu)通（今(jin)(jin)(jin)(jin)內(nei)蒙(meng)(meng)古翁(weng)牛(niu)特旗(qi)西(xi)南）。清左(zuo)(zuo)路(lu)(lu)(lu)軍也進(jin)(jin)(jin)(jin)至(zhi)烏蘭(lan)布(bu)通南，康(kang)熙(xi)(xi)急(ji)令右(you)(you)路(lu)(lu)(lu)軍停止(zhi)南撤，與左(zuo)(zuo)路(lu)(lu)(lu)軍會合，合擊(ji)噶(ga)爾(er)丹(dan)于烏蘭(lan)布(bu)通，并(bing)派兵(bing)一部(bu)進(jin)(jin)(jin)(jin)駐歸(gui)化城（今(jin)(jin)(jin)(jin)內(nei)蒙(meng)(meng)古呼和(he)浩特），伺(si)機側(ce)擊(ji)噶(ga)爾(er)丹(dan)歸(gui)路(lu)(lu)(lu)。
烏蘭(lan)布(bu)通(tong)位于(yu)克(ke)什(shen)克(ke)騰旗（今內蒙古翁牛(niu)特旗西南）之西。該地北面(mian)靠山，南有高涼河（西拉(la)木(mu)倫(lun)河上游的支流），地勢險要。噶爾(er)(er)丹(dan)背山面(mian)水布(bu)陣(zhen)(zhen)，將(jiang)萬余駱駝縛蹄臥(wo)地，背負(fu)木(mu)箱，蒙以濕氈，擺成一條如(ru)同(tong)城(cheng)柵的防線，謂(wei)之“駝城(cheng)”，令士(shi)兵于(yu)駝城(cheng)之內，依(yi)托箱垛放槍射(she)箭。清(qing)軍(jun)以火器(qi)部隊在前，步騎兵在后，隔(ge)河布(bu)陣(zhen)(zhen)。八月(yue)初一中(zhong)午，交戰開始(shi)。清(qing)軍(jun)首(shou)先(xian)集中(zhong)火銃火炮，猛烈轟(hong)擊駝陣(zhen)(zhen)，自午后至日落，將(jiang)駝陣(zhen)(zhen)轟(hong)斷為二，然后揮軍(jun)渡(du)(du)河進攻，以步兵從正面(mian)發起沖(chong)擊，又以騎兵從左(zuo)翼(yi)迂回側擊，噶爾(er)(er)丹(dan)大敗，倉(cang)皇(huang)率全部撤(che)往(wang)山上。次日，遣使(shi)向清(qing)軍(jun)乞和，乘機(ji)率殘部夜渡(du)(du)西拉(la)木(mu)倫(lun)河，狼狽逃竄，逃回科(ke)布(bu)多（今蒙古吉爾(er)(er)噶朗圖）時只剩下數千人。
噶爾丹(dan)自(zi)烏(wu)蘭(lan)布通戰(zhan)敗后(hou)，仍盤踞(ju)科(ke)布多地區，集合殘部(bu)，休養(yang)生息，以(yi)期東山再起。他一(yi)面(mian)派人(ren)去沙俄活動，企圖獲取更(geng)多的軍事(shi)支(zhi)持(chi)；一(yi)面(mian)煽動內(nei)蒙古科(ke)爾沁等(deng)部(bu)作亂，并殺害(hai)清政府(fu)官員(yuan)，不(bu)斷騷擾(rao)邊地安寧。針對噶爾丹(dan)的騷擾(rao)滋(zi)事(shi)，清政府(fu)除加強(qiang)軍備外，主(zhu)要(yao)是展開政治攻勢，以(yi)期政治解決(jue)。康熙三十四年(nian)（1695年(nian)）5月(yue)，在沙俄的慫恿和支(zhi)持(chi)下，噶爾丹(dan)率騎兵3萬向東進犯，到達巴(ba)顏烏(wu)蘭(lan)一(yi)帶(dai)，又點燃起叛(pan)亂的戰(zhan)火。
康(kang)(kang)熙三十五年(nian)(nian)（1696年(nian)(nian)）2月，康(kang)(kang)熙帝(di)(di)(di)發(fa)兵10萬(wan)，分三路(lu)(lu)(lu)(lu)大(da)(da)舉(ju)出擊：東路(lu)(lu)(lu)(lu)由(you)黑龍江將軍(jun)薩(sa)布素率黑龍江等地軍(jun)隊越大(da)(da)興(xing)安嶺(ling)出克(ke)魯倫(lun)(lun)河進剿；西路(lu)(lu)(lu)(lu)由(you)撫(fu)遠大(da)(da)將軍(jun)費揚古率陜西、甘(gan)肅兵勇由(you)寧(ning)夏北(bei)越沙(sha)漠沿翁金(jin)河北(bei)上，以斷(duan)準(zhun)(zhun)軍(jun)歸路(lu)(lu)(lu)(lu)；中(zhong)路(lu)(lu)(lu)(lu)為主(zhu)力(li)，由(you)康(kang)(kang)熙帝(di)(di)(di)親率出獨石口，直奔克(ke)魯倫(lun)(lun)河，與(yu)東西兩路(lu)(lu)(lu)(lu)協同(tong)夾擊。康(kang)(kang)熙帝(di)(di)(di)做了出征前(qian)的(de)具體部署，任命(ming)各路(lu)(lu)(lu)(lu)將領(ling)，分配軍(jun)隊名額，并精心(xin)籌備(bei)戰馬(ma)、軍(jun)糧、武器等項(xiang)。中(zhong)路(lu)(lu)(lu)(lu)大(da)(da)軍(jun)由(you)康(kang)(kang)熙帝(di)(di)(di)親自(zi)統(tong)率，決定于(yu)康(kang)(kang)熙三十五年(nian)(nian)二月三十日(ri)（1696年(nian)(nian)4月4日(ri)）由(you)北(bei)京出發(fa)，直奔克(ke)魯倫(lun)(lun)河，發(fa)起主(zhu)攻。中(zhong)路(lu)(lu)(lu)(lu)大(da)(da)軍(jun)包括京師八旗(qi)滿兵、漢軍(jun)火器營(ying)、盛京兵、黑龍江兵、寧(ning)古塔兵、宣化(hua)府綠營(ying)兵、古北(bei)口綠營(ying)兵，加上喀爾喀諸(zhu)扎(zha)薩(sa)克(ke)兵1萬(wan)，約4萬(wan)多人。另有(you)預備(bei)兵及廝役1.7萬(wan)人。六位皇子、皇兄裕親王福全、皇弟恭親王常(chang)寧(ning)，諸(zhu)內(nei)大(da)(da)臣、侍衛、大(da)(da)學士(shi)、都(dou)統(tong)、前(qian)鋒(feng)統(tong)領(ling)、護軍(jun)統(tong)領(ling)等隨軍(jun)從征。康(kang)(kang)熙帝(di)(di)(di)與(yu)士(shi)卒共甘(gan)苦(ku)，每日(ri)一餐(can)，時常(chang)“俟眾(zhong)軍(jun)士(shi)結營(ying)畢，始入行宮。營(ying)中(zhong)皆炊飯(fan)，然后進膳”。由(you)于(yu)中(zhong)路(lu)(lu)(lu)(lu)軍(jun)準(zhun)(zhun)備(bei)充足，康(kang)(kang)熙帝(di)(di)(di)事必躬親，行軍(jun)極為順利，幾(ji)乎未遭損失。
噶(ga)爾(er)(er)丹(dan)得(de)知康熙(xi)皇(huang)帝(di)親(qin)自(zi)統率(lv)(lv)大(da)軍(jun)(jun)(jun)(jun)進抵克魯(lu)倫(lun)河(he)(he)時，不(bu)敢迎(ying)戰(zhan)(zhan)(zhan)，盡棄廬(lu)帳、器(qi)械，乘(cheng)夜西(xi)(xi)竄。清(qing)軍(jun)(jun)(jun)(jun)進抵巴(ba)顏(yan)烏(wu)蘭(lan)時，撲(pu)了(le)個空。康熙(xi)帝(di)為(wei)了(le)捕捉噶(ga)爾(er)(er)丹(dan)叛(pan)軍(jun)(jun)(jun)(jun)主(zhu)力(li)，一(yi)面(mian)命總兵(bing)(bing)(bing)岳升龍(long)、馬進、白斌等率(lv)(lv)精兵(bing)(bing)(bing)輕(qing)騎(qi)窮追(zhui)噶(ga)爾(er)(er)丹(dan)叛(pan)軍(jun)(jun)(jun)(jun)；一(yi)面(mian)密諭西(xi)(xi)路(lu)(lu)軍(jun)(jun)(jun)(jun)統帥(shuai)費揚古堵截噶(ga)爾(er)(er)丹(dan)叛(pan)軍(jun)(jun)(jun)(jun)脫逃(tao)之(zhi)路(lu)(lu)。撫遠(yuan)大(da)將(jiang)(jiang)軍(jun)(jun)(jun)(jun)費揚古正(zheng)率(lv)(lv)西(xi)(xi)路(lu)(lu)軍(jun)(jun)(jun)(jun)北進，得(de)報噶(ga)爾(er)(er)丹(dan)蹤跡，即令(ling)署前(qian)鋒(feng)統領碩岱等且戰(zhan)(zhan)(zhan)且退(tui)，將(jiang)(jiang)噶(ga)爾(er)(er)丹(dan)誘至昭莫多(duo)（今(jin)蒙古國烏(wu)蘭(lan)巴(ba)托(tuo)宗莫德市），昭莫多(duo)北依肯特嶺，東峙丘陵(ling)，西(xi)(xi)臨(lin)河(he)(he)水(shui)。十(shi)三日，費揚古分兵(bing)(bing)(bing)4隊：東翼為(wei)京城(cheng)及西(xi)(xi)安八旗(qi)兵(bing)(bing)(bing)、察哈爾(er)(er)蒙古兵(bing)(bing)(bing)，屯(tun)營高(gao)處；西(xi)(xi)翼為(wei)大(da)同(tong)總兵(bing)(bing)(bing)康調元所率(lv)(lv)綠(lv)旗(qi)兵(bing)(bing)(bing)及右衛八旗(qi)兵(bing)(bing)(bing)、喀(ka)爾(er)(er)喀(ka)蒙古兵(bing)(bing)(bing)，沿(yan)河(he)(he)布陣(zhen)；將(jiang)(jiang)軍(jun)(jun)(jun)(jun)孫思克率(lv)(lv)綠(lv)旗(qi)官(guan)兵(bing)(bing)(bing)居中(zhong)占(zhan)領山頭，大(da)將(jiang)(jiang)軍(jun)(jun)(jun)(jun)費揚古統軍(jun)(jun)(jun)(jun)列后。遵照康熙(xi)帝(di)預授之(zhi)策，清(qing)軍(jun)(jun)(jun)(jun)一(yi)律下(xia)馬步戰(zhan)(zhan)(zhan)，待令(ling)再行沖(chong)鋒(feng)。在清(qing)軍(jun)(jun)(jun)(jun)浴血(xue)奮戰(zhan)(zhan)(zhan)下(xia)，自(zi)午至暮，大(da)敗噶(ga)爾(er)(er)丹(dan)軍(jun)(jun)(jun)(jun)，殺死叛(pan)軍(jun)(jun)(jun)(jun)3000余人，生(sheng)擒百(bai)余人，噶(ga)爾(er)(er)丹(dan)僅率(lv)(lv)數騎(qi)逃(tao)脫，清(qing)軍(jun)(jun)(jun)(jun)在此(ci)戰(zhan)(zhan)(zhan)中(zhong)擊斃噶(ga)爾(er)(er)丹(dan)之(zhi)妻阿努可敦。
昭莫多一戰(zhan)，基本上殲滅了噶爾丹的叛(pan)(pan)軍力(li)量，清(qing)軍取得平叛(pan)(pan)戰(zhan)爭(zheng)的決定性勝(sheng)利(li)。噶爾丹戰(zhan)敗后，率殘(can)部流竄于塔(ta)米(mi)爾河流域(yu)，成為(wei)一股走投無路、日暮途窮的流匪(fei)。但(dan)他頑固到(dao)底，拒不接受清(qing)政府的招撫，繼續堅持分裂祖國的叛(pan)(pan)亂，作(zuo)最后的垂(chui)死掙扎(zha)。
為了徹(che)底消滅噶爾(er)丹(dan)(dan)(dan)勢力，康熙(xi)帝認為必(bi)須乘其(qi)新敗之后，搗(dao)其(qi)巢穴，以(yi)其(qi)“萬(wan)年之計”。康熙(xi)三十六年（1697年）2月(yue)，康熙(xi)帝舉行第三次平叛的(de)軍(jun)事行動(dong)，命費揚古、馬(ma)恩哈分別統率兩路(lu)大(da)軍(jun)，共6000人，由寧(ning)(ning)夏(xia)出發(fa)，進剿噶爾(er)丹(dan)(dan)(dan)殘部(bu)。4月(yue)，康熙(xi)帝親赴寧(ning)(ning)夏(xia)，指揮這次軍(jun)事行動(dong)。正當(dang)清軍(jun)進發(fa)之時，噶爾(er)丹(dan)(dan)(dan)集團內部(bu)分崩離(li)析，眾叛親離(li)，軍(jun)隊(dui)只剩下(xia)五六百(bai)人，噶爾(er)丹(dan)(dan)(dan)成了孤家寡人。在清軍(jun)征(zheng)剿下(xia)，噶爾(er)丹(dan)(dan)(dan)走投無路(lu)，遂飲藥(yao)自盡(jin)。至此，沙俄支持下(xia)的(de)噶爾(er)丹(dan)(dan)(dan)的(de)民族分裂叛亂被清政府平定下(xia)去。噶爾(er)丹(dan)(dan)(dan)敗死后，他的(de)侄子策妄阿拉布坦繼(ji)續任準噶爾(er)部(bu)臺吉(ji)，準噶爾(er)部(bu)又逐漸強大(da)起(qi)來，和清政府發(fa)生矛盾沖突。
康(kang)熙五十四年（1715年），策妄阿拉(la)布坦在沙俄(e)支持下(xia)，又發動叛亂，率(lv)兵2000人竄(cuan)入哈(ha)密北境，侵掠五寨。后(hou)見哈(ha)密戒(jie)備(bei)森嚴，無法占據，又改為竄(cuan)擾西藏。清政府(fu)得知(zhi)策妄阿拉(la)布坦派兵往西藏，即令出(chu)兵圍剿。
康熙五十七(qi)年（1718年），康熙帝(di)命皇十四子愛(ai)新覺(jue)羅(luo)·胤禵為(wei)撫遠大(da)(da)將軍(jun)(jun)，統(tong)帥大(da)(da)軍(jun)(jun)，駐節西寧，指揮進(jin)藏平叛的各路清軍(jun)(jun)。康熙五十九年（1720年），清軍(jun)(jun)兩路從青海和(he)四川出發，進(jin)軍(jun)(jun)西藏，大(da)(da)敗(bai)準(zhun)噶爾軍(jun)(jun)，大(da)(da)策凌(ling)敦(dun)多布狼狽(bei)而逃，率殘部逃回伊(yi)犁。
康(kang)(kang)熙帝沒有能徹底平定準噶爾(er)貴(gui)族的(de)叛亂就于康(kang)(kang)熙六十一年（1722年）去世了。他所(suo)制(zhi)定的(de)政策(ce)，由他的(de)兒子雍正帝、孫子乾隆帝繼(ji)續(xu)推行并得到(dao)貫徹。
雍(yong)(yong)正(zheng)五年（1727年），策妄阿(a)拉布(bu)坦死，其子(zi)噶爾(er)(er)丹策零繼為準噶爾(er)(er)領袖。他(ta)的內外政策基本上遵循其父(fu)的路(lu)線，對東邊也(ye)沒有(you)放棄(qi)向喀爾(er)(er)喀擴展(zhan)的意圖。雍(yong)(yong)正(zheng)七年（1729年），雍(yong)(yong)正(zheng)帝(di)決定發(fa)兵征討，命侍衛(wei)內大臣(chen)傅爾(er)(er)丹為靖(jing)邊大將軍(jun)，屯(tun)阿(a)爾(er)(er)奉，出(chu)師北路(lu)；命川(chuan)陜總督岳(yue)鐘琪為寧遠大將軍(jun)，屯(tun)巴里坤，出(chu)師西(xi)路(lu)，分進(jin)合擊。噶爾(er)(er)丹策零聞訊驚恐，忙遣使要(yao)求清廷(ting)緩兵一(yi)年。雍(yong)(yong)正(zheng)帝(di)恩準。在緩兵期間，準噶爾(er)(er)出(chu)兵2萬突襲(xi)西(xi)路(lu)清軍(jun)大營，清軍(jun)損失很大，清政府與準噶爾(er)(er)貴族之(zhi)間的關系進(jin)一(yi)步(bu)破裂。
康(kang)熙逝世后(hou)，雍(yong)正繼續堅持平(ping)定準(zhun)噶(ga)爾(er)貴族割據勢力的斗爭(zheng)。雍(yong)正五年(nian)(nian)(nian)(nian)(nian)（1727年(nian)(nian)(nian)(nian)(nian)）冬，策(ce)(ce)妄阿(a)拉布(bu)坦死，其子噶(ga)爾(er)丹(dan)策(ce)(ce)零(ling)繼位后(hou)，在沙俄支持下，繼續進行(xing)叛亂(luan)活(huo)動。從(cong)雍(yong)正六年(nian)(nian)(nian)(nian)(nian)（1728年(nian)(nian)(nian)(nian)(nian)）以后(hou)，清朝多次出兵平(ping)定噶(ga)爾(er)丹(dan)策(ce)(ce)零(ling)叛軍。雍(yong)正年(nian)(nian)(nian)(nian)(nian)間的西征準(zhun)噶(ga)爾(er)之役，從(cong)雍(yong)正七年(nian)(nian)(nian)(nian)(nian)（1729年(nian)(nian)(nian)(nian)(nian)）起，到雍(yong)正十一年(nian)(nian)(nian)(nian)(nian)冬準(zhun)噶(ga)爾(er)遣(qian)使(shi)求和(he)止，歷(li)時4年(nian)(nian)(nian)(nian)(nian)半，經歷(li)了4次大的戰(zhan)役，即(ji)科舍圖之戰(zhan)、和(he)通泊(bo)之戰(zhan)、鄂登楚勒之戰(zhan)和(he)光顯寺(si)之戰(zhan)。
雍正(zheng)九年(nian)（1731年(nian)）五(wu)至六(liu)月，清(qing)(qing)朝出兵平定噶(ga)(ga)爾(er)丹策(ce)零(ling)叛軍(jun)(jun)，噶(ga)(ga)爾(er)丹策(ce)零(ling)派出士卒向清(qing)(qing)軍(jun)(jun)詭稱(cheng)，準噶(ga)(ga)爾(er)有(you)一(yi)(yi)支孤軍(jun)(jun)在察罕哈達，引(yin)誘清(qing)(qing)軍(jun)(jun)離開科布多大(da)本營，深入到瀚(han)海之中(zhong)(zhong)，然后圍殲。清(qing)(qing)朝靖(jing)邊大(da)將軍(jun)(jun)傅(fu)爾(er)丹中(zhong)(zhong)計，挑選精兵萬人，沿(yan)科布多河西(xi)進，在博克托嶺、和通泊等處中(zhong)(zhong)伏，損失慘重。七月初一(yi)(yi)日(ri)，清(qing)(qing)軍(jun)(jun)僅存2000余人退(tui)至科布多。
在和通泊之戰(zhan)中大(da)敗清軍后，遣部(bu)將(jiang)大(da)、小策零敦多布(bu)率(lv)兵(bing)(bing)2.6萬東攻喀(ka)爾喀(ka)蒙(meng)古(gu)(gu)。清廷遣喀(ka)爾喀(ka)親王(wang)丹津多爾濟偕額附策凌率(lv)兵(bing)(bing)1.8萬（一說2.8萬）將(jiang)其擊(ji)敗。隨即下令于拜達里(li)克河、翁金河一帶筑城屯兵(bing)(bing)，與察罕廋爾（今蒙(meng)古(gu)(gu)國烏里(li)雅(ya)蘇臺南）大(da)營互為犄(ji)角，加強喀(ka)爾喀(ka)西部(bu)的防守。
雍(yong)(yong)正(zheng)十年(nian)(nian)（1732年(nian)(nian)）七月，噶(ga)爾(er)(er)(er)(er)(er)丹策零(ling)率兵(bing)(bing)3萬(wan)(wan)，自(zi)額爾(er)(er)(er)(er)(er)齊斯河(he)（在今新疆境(jing)）上(shang)游，取道(dao)(dao)阿爾(er)(er)(er)(er)(er)泰山(shan)(shan)(shan)南(nan)(nan)麓，繞避察罕廋(sou)爾(er)(er)(er)(er)(er)清(qing)(qing)軍(jun)(jun)(jun)大(da)營，潛至(zhi)杭愛山(shan)(shan)(shan)厄得勒河(he)（依德(de)(de)爾(er)(er)(er)(er)(er)河(he)）地區，攻掠喀(ka)爾(er)(er)(er)(er)(er)喀(ka)首(shou)領(ling)哲(zhe)卜尊(zun)丹巴領(ling)地。策凌等奉(feng)命率兵(bing)(bing)疾馳本博圖山(shan)(shan)(shan)（烏(wu)(wu)里雅蘇臺(tai)東(dong)南(nan)(nan)）阻(zu)擊(ji)。八月初，準(zhun)噶(ga)爾(er)(er)(er)(er)(er)軍(jun)(jun)(jun)偵知策凌西(xi)出(chu)，即突襲(xi)其(qi)塔(ta)米(mi)爾(er)(er)(er)(er)(er)城（今車(che)車(che)爾(er)(er)(er)(er)(er)格(ge)勒西(xi)南(nan)(nan)）牧地。策凌途中(zhong)聞警，回師馳救(jiu)，率所部(bu)(bu)2萬(wan)(wan)人（一(yi)說3萬(wan)(wan)）乘夜(ye)繞道(dao)(dao)出(chu)山(shan)(shan)(shan)背(bei)向塔(ta)米(mi)爾(er)(er)(er)(er)(er)逼近，黎明時督兵(bing)(bing)從山(shan)(shan)(shan)上(shang)突下，突襲(xi)準(zhun)噶(ga)爾(er)(er)(er)(er)(er)軍(jun)(jun)(jun)營地。準(zhun)噶(ga)爾(er)(er)(er)(er)(er)軍(jun)(jun)(jun)人不(bu)及甲，馬(ma)不(bu)就(jiu)鞍，倉皇向東(dong)南(nan)(nan)潰逃(tao)(tao)。清(qing)(qing)軍(jun)(jun)(jun)追至(zhi)喀(ka)喇森齊泊，激戰二日屢捷。繼追至(zhi)杭愛山(shan)(shan)(shan)南(nan)(nan)麓，該地右阻(zu)山(shan)(shan)(shan)，左(zuo)逼水，道(dao)(dao)路狹窄，光(guang)顯寺（今烏(wu)(wu)蘭(lan)巴托西(xi)部(bu)(bu)哈拉和林額爾(er)(er)(er)(er)(er)德(de)(de)尼昭）橫亙(gen)于中(zhong)，大(da)軍(jun)(jun)(jun)不(bu)易通行。清(qing)(qing)軍(jun)(jun)(jun)趁準(zhun)噶(ga)爾(er)(er)(er)(er)(er)軍(jun)(jun)(jun)慌亂(luan)之(zhi)際，設(she)伏(fu)兵(bing)(bing)萬(wan)(wan)余于山(shan)(shan)(shan)側，又(you)遣一(yi)部(bu)(bu)背(bei)水列陣，誘其(qi)往攻。旋佯敗，棄甲沿河(he)而走，待準(zhun)噶(ga)爾(er)(er)(er)(er)(er)軍(jun)(jun)(jun)進入谷地，伏(fu)兵(bing)(bing)突起沖殺。準(zhun)噶(ga)爾(er)(er)(er)(er)(er)軍(jun)(jun)(jun)頓時大(da)亂(luan)，被(bei)擊(ji)殺萬(wan)(wan)余人，欲渡河(he)逃(tao)(tao)生者又(you)被(bei)對岸(an)清(qing)(qing)軍(jun)(jun)(jun)擊(ji)于半渡，溺死甚眾。噶(ga)爾(er)(er)(er)(er)(er)丹策零(ling)率殘部(bu)(bu)乘夜(ye)拼死突圍，盡棄輜(zi)重牲畜塞滿(man)山(shan)(shan)(shan)谷，遲滯(zhi)清(qing)(qing)軍(jun)(jun)(jun)前進，自(zi)鄂爾(er)(er)(er)(er)(er)渾河(he)逃(tao)(tao)遁。此(ci)戰，準(zhun)噶(ga)爾(er)(er)(er)(er)(er)部(bu)(bu)元氣大(da)傷。雍(yong)(yong)正(zheng)十二年(nian)(nian)（1734年(nian)(nian)），噶(ga)爾(er)(er)(er)(er)(er)丹策零(ling)向清(qing)(qing)廷請(qing)和罷兵(bing)(bing)，乾隆初年(nian)(nian)議和告成。
乾隆十(shi)年(nian)（1745年(nian)），噶爾丹策零死去(qu)，策妄多爾濟那木扎爾繼位。
乾隆十五年(nian)（1750年(nian)），策妄(wang)多(duo)爾濟那(nei)木扎(zha)(zha)爾被殺(sha)(sha)，其兄喇(la)嘛(ma)達爾扎(zha)(zha)篡(cuan)位。乾隆十七年(nian)（1752年(nian)），沙俄派人欲收(shou)買(mai)和碩特拉藏汗之(zhi)孫阿(a)睦爾撒納和準噶爾部(bu)大策凌敦(dun)多(duo)布之(zhi)孫達瓦(wa)(wa)(wa)齊(qi)來推翻喇(la)嘛(ma)達爾札，妄(wang)圖(tu)使(shi)他們取而代之(zhi)，建(jian)立傀儡政(zheng)(zheng)權，陰謀未能得逞(cheng)，后達瓦(wa)(wa)(wa)齊(qi)和阿(a)睦爾撒納叛逃至哈(ha)薩(sa)克。同年(nian)底，阿(a)睦爾撒納唆(suo)使(shi)達瓦(wa)(wa)(wa)齊(qi)暗選精(jing)兵一千(qian)五百行(xing)，采取買(mai)通內奸和突然襲擊的手段，殺(sha)(sha)死喇(la)嘛(ma)達爾扎(zha)(zha)，篡(cuan)奪(duo)了汗位。乾隆十九年(nian)（1754年(nian)），阿(a)睦爾撒納被達瓦(wa)(wa)(wa)齊(qi)打敗，率(lv)領2萬余人投奔清朝。清政(zheng)(zheng)府認為統一西北(bei)地(di)區(qu)的條件已經(jing)成熟，決定命將出師，消滅準噶爾貴族割據政(zheng)(zheng)權。
1754年，清政(zheng)(zheng)府決定(ding)分兵兩路(lu)遠(yuan)征(zheng)伊犁，平定(ding)達(da)瓦齊割(ge)據勢力。乾隆(long)二十(shi)年（1755年）二月，乾隆(long)調(diao)集五萬兵、十(shi)四萬匹馬，派阿睦(mu)爾撒納為(wei)定(ding)邊左副(fu)將(jiang)軍(jun)(jun)(jun)、薩喇(la)勒為(wei)定(ding)邊右副(fu)將(jiang)軍(jun)(jun)(jun)，分兩路(lu)向(xiang)準噶爾進攻。阿的(de)(de)(de)(de)一路(lu)，由(you)烏里(li)雅蘇臺出發(fa)，歸(gui)定(ding)北將(jiang)軍(jun)(jun)(jun)班第(di)節制；薩喇(la)勒的(de)(de)(de)(de)一路(lu)，由(you)巴里(li)坤(kun)出發(fa)，歸(gui)定(ding)西將(jiang)軍(jun)(jun)(jun)永常節制，由(you)巴里(li)坤(kun)向(xiang)伊犁地區進發(fa)。由(you)于厄(e)魯特和(he)(he)(he)西域各族人(ren)民對(dui)準噶爾貴族的(de)(de)(de)(de)內訌和(he)(he)(he)殘暴統治十(shi)分不滿，希望早(zao)日實現統一和(he)(he)(he)安定(ding)局面，也(ye)由(you)于清朝政(zheng)(zheng)府制訂和(he)(he)(he)貫徹(che)了對(dui)準噶爾比較穩妥的(de)(de)(de)(de)政(zheng)(zheng)策(ce)，因而(er)(er)清政(zheng)(zheng)府統一西北的(de)(de)(de)(de)行動(dong)，受到牧民和(he)(he)(he)各族人(ren)民的(de)(de)(de)(de)支(zhi)持和(he)(he)(he)擁(yong)護(hu)。當(dang)清軍(jun)(jun)(jun)往征(zheng)達(da)瓦齊途中，準噶爾部大(da)(da)的(de)(de)(de)(de)封建主(zhu)有的(de)(de)(de)(de)數千戶(hu)，小(xiao)的(de)(de)(de)(de)數百戶(hu)，都拿著奶(nai)酪、羊馬，絡繹不絕前來(lai)迎(ying)接清軍(jun)(jun)(jun)，沒有一個抵抗(kang)清軍(jun)(jun)(jun)的(de)(de)(de)(de)。達(da)瓦齊沒有料到清軍(jun)(jun)(jun)會提(ti)前行動(dong)，部下的(de)(de)(de)(de)不戰而(er)(er)降使其陣腳(jiao)大(da)(da)亂，僅帶親(qin)信七十(shi)余(yu)人(ren)逃往天山以(yi)南(nan)投奔烏什，結果為(wei)烏什城阿奇(qi)木伯克(ke)霍集斯擒獲送交清軍(jun)(jun)(jun)。
清(qing)(qing)(qing)(qing)廷消滅(mie)達瓦(wa)(wa)齊勢力后，決定(ding)“將衛(wei)拉特(te)分封(feng)四(si)汗(han)(han)(han)(han)，賞功策(ce)勛，用(yong)獎勞績(ji)”。封(feng)車凌為杜爾(er)(er)伯特(te)汗(han)(han)(han)(han)，阿睦(mu)爾(er)(er)撒(sa)納為輝特(te)汗(han)(han)(han)(han)，班珠爾(er)(er)為和(he)碩特(te)汗(han)(han)(han)(han)，噶(ga)勒藏多爾(er)(er)濟為綽(chuo)羅斯汗(han)(han)(han)(han)，并(bing)晉封(feng)阿睦(mu)爾(er)(er)撒(sa)納為雙親王，食親王雙俸(feng)。但阿睦(mu)爾(er)(er)撒(sa)納并(bing)不滿足(zu)。他(ta)(ta)(ta)歸附清(qing)(qing)(qing)(qing)朝，本就(jiu)(jiu)是一個策(ce)略，現在(zai)借清(qing)(qing)(qing)(qing)廷之手已把(ba)自己(ji)最大(da)的(de)對手達瓦(wa)(wa)齊勢力消滅(mie)，統治四(si)衛(wei)拉特(te)成為他(ta)(ta)(ta)下一個目標。阿睦(mu)爾(er)(er)撒(sa)納在(zai)率領清(qing)(qing)(qing)(qing)軍(jun)進兵伊犁前，就(jiu)(jiu)通過班珠爾(er)(er)、納噶(ga)察(cha)等親信制造他(ta)(ta)(ta)要當(dang)四(si)部(bu)總汗(han)(han)(han)(han)的(de)輿論。達瓦(wa)(wa)齊被擒后，他(ta)(ta)(ta)便以(yi)總汗(han)(han)(han)(han)自居。他(ta)(ta)(ta)雖貴(gui)為清(qing)(qing)(qing)(qing)朝的(de)親王、定(ding)邊左副將軍(jun)，但不用(yong)清(qing)(qing)(qing)(qing)纛（古代軍(jun)隊(dui)中的(de)大(da)旗(qi)），不穿官服，不戴清(qing)(qing)(qing)(qing)廷所授黃帶孔雀翎，不用(yong)清(qing)(qing)(qing)(qing)朝所頒官印，并(bing)啟用(yong)噶(ga)爾(er)(er)丹策(ce)零時琿(hun)臺吉菊形篆印行(xing)文各部(bu)，并(bing)“用(yong)鈐記行(xing)文，調兵九千”至布魯特(te)、哈薩克(ke)邊境，擁兵自重(zhong)。
對(dui)阿(a)(a)睦(mu)爾(er)(er)(er)(er)撒(sa)(sa)(sa)納(na)(na)的這(zhe)些行為(wei)(wei)(wei)(wei)，清廷和乾(qian)隆(long)帝早(zao)有察覺(jue)，便指(zhi)示定(ding)北(bei)將(jiang)(jiang)軍(jun)(jun)班第(di)力(li)促阿(a)(a)睦(mu)爾(er)(er)(er)(er)撒(sa)(sa)(sa)納(na)(na)早(zao)日(ri)入覲，欲在(zai)其到(dao)達(da)內(nei)地后將(jiang)(jiang)其剪除(chu)。詭計多端(duan)的阿(a)(a)睦(mu)爾(er)(er)(er)(er)撒(sa)(sa)(sa)納(na)(na)亦察覺(jue)到(dao)事(shi)情有變(bian)，他于八月(yue)初(chu)十日(ri)從伊犁起程入覲，一路遲延(yan)不進(jin)，窺測局勢，行至烏隆(long)古河時，阿(a)(a)睦(mu)爾(er)(er)(er)(er)撒(sa)(sa)(sa)納(na)(na)便公(gong)(gong)開(kai)反叛，并急馳至伊犁。八月(yue)二(er)十九(jiu)日(ri)，阿(a)(a)睦(mu)爾(er)(er)(er)(er)撒(sa)(sa)(sa)納(na)(na)軍(jun)(jun)包(bao)圍了(le)班第(di)的鎮守軍(jun)(jun)，清軍(jun)(jun)只有500人(ren)(ren)，班第(di)、鄂容(rong)安兵敗自殺，薩喇爾(er)(er)(er)(er)被俘。面對(dui)突變(bian)的形勢，乾(qian)隆(long)帝及時采取了(le)一些措(cuo)施。乾(qian)隆(long)二(er)十年(nian)（1755年(nian)）九(jiu)月(yue)，乾(qian)隆(long)帝重(zhong)封衛拉特四部汗王，噶勒藏多爾(er)(er)(er)(er)濟為(wei)(wei)(wei)(wei)綽(chuo)羅斯(si)汗，車(che)凌為(wei)(wei)(wei)(wei)杜爾(er)(er)(er)(er)伯特汗，沙(sha)克(ke)都爾(er)(er)(er)(er)曼(man)濟為(wei)(wei)(wei)(wei)和碩特汗，巴雅(ya)爾(er)(er)(er)(er)為(wei)(wei)(wei)(wei)輝(hui)特汗，臺吉(ji)3人(ren)(ren)封公(gong)(gong)，4人(ren)(ren)授扎(zha)薩克(ke)一等(deng)臺吉(ji)，7人(ren)(ren)授扎(zha)薩克(ke)，宰桑2人(ren)(ren)授內(nei)大臣(chen)，5人(ren)(ren)為(wei)(wei)(wei)(wei)散(san)秩大臣(chen)。這(zhe)一措(cuo)施旨在(zai)穩定(ding)衛拉特貴(gui)族(zu)之心，解除(chu)后顧之憂(you)。隨即令策楞為(wei)(wei)(wei)(wei)定(ding)西將(jiang)(jiang)軍(jun)(jun)、達(da)爾(er)(er)(er)(er)黨阿(a)(a)為(wei)(wei)(wei)(wei)定(ding)邊左副(fu)將(jiang)(jiang)軍(jun)(jun)、扎(zha)拉豐阿(a)(a)為(wei)(wei)(wei)(wei)定(ding)邊右副(fu)將(jiang)(jiang)軍(jun)(jun)，組織(zhi)第(di)二(er)次遠征伊犁。
乾隆(long)(long)二十一年(nian)（1756年(nian)）二月，西路(lu)軍(jun)(jun)由(you)策(ce)楞、玉保統率，北路(lu)軍(jun)(jun)由(you)哈達(da)哈等統率，向伊犁進(jin)發。阿(a)睦(mu)爾(er)(er)撒納反叛(pan)后(hou)，并(bing)沒有出現如他(ta)所(suo)預期(qi)的(de)(de)紛起響應反清的(de)(de)局面(mian)。許多首領反叛(pan)不久就倒(dao)戈相(xiang)向，與阿(a)睦(mu)爾(er)(er)撒納為(wei)敵。準(zhun)噶爾(er)(er)部(bu)再次(ci)陷入混戰之中(zhong)(zhong)。阿(a)睦(mu)爾(er)(er)撒納面(mian)對清廷大軍(jun)(jun)壓境，無法組織(zhi)有效(xiao)抵抗。為(wei)緩兵計，他(ta)曾兩(liang)次(ci)偽裝投誠(cheng)，并(bing)取得清軍(jun)(jun)信任，停(ting)止對他(ta)的(de)(de)追(zhui)剿(jiao)，贏得了喘息時間，卻(que)使清軍(jun)(jun)在近一年(nian)的(de)(de)追(zhui)剿(jiao)中(zhong)(zhong)無所(suo)進(jin)展(zhan)。乾隆(long)(long)二十二年(nian)（1757年(nian)）二月，清廷調整統帥，決心全殲阿(a)睦(mu)爾(er)(er)撒納。命成袞扎布為(wei)定邊(bian)將軍(jun)(jun)，兆惠為(wei)定邊(bian)右副(fu)將軍(jun)(jun)，車布登(deng)扎布為(wei)定邊(bian)左副(fu)將軍(jun)(jun)，調集滿洲、索倫(lun)、蒙古、察哈爾(er)(er)、吉林(lin)等地兵馬，兵分(fen)兩(liang)路(lu)，再次(ci)征伐準(zhun)噶爾(er)(er)。
此(ci)(ci)時(shi)(shi)，準(zhun)(zhun)噶爾(er)(er)(er)內(nei)(nei)叛亂的(de)(de)諸(zhu)臺吉、宰桑(sang)等，內(nei)(nei)訌不(bu)已(yi)，加之(zhi)部落(luo)內(nei)(nei)瘟疫流行(xing)，人(ren)畜大(da)量(liang)死(si)(si)亡(wang)。六月，清(qing)(qing)軍幾乎兵不(bu)血刃順利抵達伊(yi)犁。阿(a)(a)睦(mu)(mu)爾(er)(er)(er)撒(sa)(sa)(sa)(sa)(sa)納(na)再次逃(tao)入哈(ha)薩克阿(a)(a)布賚(lai)汗處。當時(shi)(shi)，阿(a)(a)布賚(lai)懾于清(qing)(qing)廷的(de)(de)威力，恐招致清(qing)(qing)軍的(de)(de)攻擊，就(jiu)遣使向清(qing)(qing)廷表(biao)示(shi)愿將阿(a)(a)睦(mu)(mu)爾(er)(er)(er)撒(sa)(sa)(sa)(sa)(sa)納(na)擒獻清(qing)(qing)廷。此(ci)(ci)舉被阿(a)(a)睦(mu)(mu)爾(er)(er)(er)撒(sa)(sa)(sa)(sa)(sa)納(na)覺察，乘夜帶妻子親隨(sui)8人(ren)，盜馬(ma)沿額爾(er)(er)(er)齊斯(si)河投奔俄(e)(e)國(guo)。沙(sha)(sha)俄(e)(e)一直在(zai)密切關注著準(zhun)(zhun)噶爾(er)(er)(er)的(de)(de)形(xing)勢，并屢(lv)屢(lv)向阿(a)(a)睦(mu)(mu)爾(er)(er)(er)撒(sa)(sa)(sa)(sa)(sa)納(na)表(biao)示(shi)歡迎其投誠，故阿(a)(a)睦(mu)(mu)爾(er)(er)(er)撒(sa)(sa)(sa)(sa)(sa)納(na)投奔俄(e)(e)國(guo)絕不(bu)偶(ou)然。乾隆二(er)十二(er)年（1757年）九月，阿(a)(a)睦(mu)(mu)爾(er)(er)(er)撒(sa)(sa)(sa)(sa)(sa)納(na)染(ran)上天(tian)花病死(si)(si)，時(shi)(shi)年35歲。當阿(a)(a)睦(mu)(mu)爾(er)(er)(er)撒(sa)(sa)(sa)(sa)(sa)納(na)逃(tao)往(wang)沙(sha)(sha)俄(e)(e)時(shi)(shi)，乾隆帝即命理藩院行(xing)文沙(sha)(sha)俄(e)(e)外交(jiao)部進行(xing)交(jiao)涉，要求其按兩國(guo)商定(ding)的(de)(de)彼此(ci)(ci)不(bu)納(na)逃(tao)人(ren)的(de)(de)協議，交(jiao)出阿(a)(a)睦(mu)(mu)爾(er)(er)(er)撒(sa)(sa)(sa)(sa)(sa)納(na)。沙(sha)(sha)俄(e)(e)則推延(yan)不(bu)交(jiao)。直到阿(a)(a)睦(mu)(mu)爾(er)(er)(er)撒(sa)(sa)(sa)(sa)(sa)納(na)死(si)(si)后，沙(sha)(sha)俄(e)(e)才將其尸交(jiao)給清(qing)(qing)朝。
1759年(nian)8月，清軍(jun)抵達喀(ka)什噶(ga)爾，平定(ding)了支(zhi)持阿(a)睦(mu)爾撒納(na)作(zuo)亂的大和(he)卓波羅尼都和(he)小和(he)卓霍(huo)集占(zhan)兄弟的叛亂。這年(nian)秋天，天山南路完全平定(ding)，結束(shu)了西北(bei)地(di)區長期(qi)以(yi)來的分裂局面(mian)。
清(qing)(qing)軍(jun)平定準噶爾(er)貴族的(de)(de)叛亂，維(wei)護祖國(guo)(guo)統一、反對(dui)民族分(fen)(fen)裂。鞏固了清(qing)(qing)朝對(dui)西北邊疆地(di)區的(de)(de)統治，打擊了沙皇(huang)俄國(guo)(guo)的(de)(de)侵略勢(shi)力(li)。清(qing)(qing)軍(jun)粉碎噶爾(er)丹(dan)的(de)(de)分(fen)(fen)裂企圖(tu)，驅逐入藏(zang)(zang)的(de)(de)準軍(jun)，平定青(qing)海羅卜藏(zang)(zang)丹(dan)津的(de)(de)叛亂，粉碎達瓦(wa)齊、阿睦爾(er)撒納(na)(na)的(de)(de)叛亂活動，將(jiang)(jiang)(jiang)北疆地(di)區納(na)(na)入中國(guo)(guo)版圖(tu)。乾隆(long)(long)皇(huang)帝把這片失而復得的(de)(de)疆域(yu)命名為(wei)“新疆”，立碑紀念。乾隆(long)(long)二十六(liu)年（1761年）至四十四年（1779年），清(qing)(qing)政府設立最高行(xing)政、軍(jun)事(shi)長官伊(yi)犁將(jiang)(jiang)(jiang)軍(jun)，修建“伊(yi)犁九城”。其中保存完好的(de)(de)惠遠(yuan)城曾(ceng)經是伊(yi)犁的(de)(de)政治、軍(jun)事(shi)中心伊(yi)犁將(jiang)(jiang)(jiang)軍(jun)府所在地(di)，總管天山南(nan)北、巴爾(er)喀什湖(hu)以(yi)(yi)東以(yi)(yi)南(nan)地(di)區的(de)(de)軍(jun)政事(shi)務。
清(qing)軍之所以取(qu)勝(sheng)，首先，清(qing)軍進(jin)行的(de)(de)(de)(de)是維護祖國統一、反(fan)對準(zhun)部貴族分裂叛亂的(de)(de)(de)(de)正(zheng)義(yi)戰(zhan)爭，因(yin)而得到各族人民支(zhi)持。其次，清(qing)廷(ting)剿撫并用(yong)的(de)(de)(de)(de)策略運用(yong)的(de)(de)(de)(de)比較成功。第(di)三，清(qing)廷(ting)此(ci)時內部穩定(ding)，國力強盛，軍隊紀律嚴(yan)明，戰(zhan)斗力較強。第(di)四，在戰(zhan)爭指導上，能(neng)依(yi)據客觀(guan)情況，制定(ding)出切合時宜的(de)(de)(de)(de)作(zuo)(zuo)戰(zhan)方針；針對作(zuo)(zuo)戰(zhan)地區地理(li)條件的(de)(de)(de)(de)特點，認真作(zuo)(zuo)好戰(zhan)爭準(zhun)備，注意發(fa)揮騎兵(bing)快速機動作(zuo)(zuo)戰(zhan)的(de)(de)(de)(de)能(neng)力和發(fa)揮火器部隊的(de)(de)(de)(de)作(zuo)(zuo)用(yong)。
清軍平(ping)定(ding)(ding)叛(pan)(pan)亂(luan)的(de)(de)戰(zhan)爭(zheng)所以延續70年之(zhi)久，除了(le)沙俄極力(li)插(cha)手和支(zhi)持(chi)叛(pan)(pan)亂(luan)者以及民(min)族關系等(deng)原因，增加了(le)戰(zhan)爭(zheng)的(de)(de)復雜性(xing)外(wai)，清軍在作(zuo)戰(zhan)指導上(shang)(shang)的(de)(de)一(yi)些失誤也(ye)是(shi)重(zhong)要原因。而準部(bu)貴族在沙俄支(zhi)持(chi)下(xia)掀起的(de)(de)民(min)族分裂叛(pan)(pan)亂(luan)戰(zhan)爭(zheng)，是(shi)違背各(ge)族人民(min)利(li)益的(de)(de)不義之(zhi)戰(zhan)，必(bi)然(ran)遭(zao)到各(ge)族人民(min)的(de)(de)強烈反對，政治上(shang)(shang)的(de)(de)不得人心，及其(qi)統治集團內(nei)部(bu)的(de)(de)爭(zheng)權奪利(li)和軍事上(shang)(shang)存在許多(duo)不可克服的(de)(de)致命弱點(dian)，決定(ding)(ding)了(le)其(qi)失敗是(shi)必(bi)不可免(mian)的(de)(de)。
白壽彝：清(qing)(qing)廷為了平定準部，不(bu)斷用兵西北，耗費了大量人(ren)力和(he)物力，增(zeng)加了人(ren)民的負擔(dan)，但對準噶爾(er)部的平定，有(you)利于多民族國(guo)(guo)家的統一，鞏(gong)固了清(qing)(qing)朝政府(fu)對西北邊疆地(di)區的統治，打擊了沙(sha)皇俄國(guo)(guo)的侵略勢力。
呂思勉：清(qing)朝(chao)的(de)武(wu)功，以此時(shi)為極盛。天山南(nan)北路既定，蔥嶺以西之(zhi)國(guo)，敖(ao)罕、哈薩(sa)克、布(bu)魯(lu)特、乾竺特、博羅爾、巴達克山、布(bu)哈爾、阿富汗等，都朝(chao)貢于清(qing)，仿佛唐(tang)朝(chao)盛時(shi)的(de)規模(mo)。
閻(yan)崇年：乾隆平準定回諸役，統一了(le)準、回各部，加強了(le)中(zhong)央政(zheng)府對西(xi)域的統轄，鏟(chan)除了(le)準噶爾東犯喀爾喀、威脅京師及(ji)大(da)西(xi)北(bei)的禍根，保持了(le)西(xi)北(bei)、漠北(bei)及(ji)青(qing)海、西(xi)藏的社會安定。
清(qing)(qing)政府(fu)平定(ding)準噶(ga)(ga)爾(er)貴族叛(pan)亂，消除了(le)西(xi)部邊疆(jiang)的分裂割(ge)據狀況，加強了(le)對(dui)西(xi)部邊疆(jiang)地區的管理，進一步促(cu)進了(le)全國(guo)的統一。平叛(pan)之(zhi)后，廢除了(le)準噶(ga)(ga)爾(er)游牧封建貴族所(suo)實(shi)行的農奴(nu)制統治，促(cu)進了(le)西(xi)部邊疆(jiang)地區社會經濟(ji)的發展。清(qing)(qing)廷在平定(ding)天山北(bei)路準噶(ga)(ga)爾(er)部和天山南路的“回部”之(zhi)后，隨即采(cai)取一系(xi)列措(cuo)施，加強清(qing)(qing)廷對(dui)新疆(jiang)的統治。
清朝(chao)強化了新(xin)疆(jiang)(jiang)地(di)方的(de)統治機構(gou)，乾隆二十(shi)七(qi)年(nian)（1762年(nian)）設(she)置(zhi)“總統新(xin)疆(jiang)(jiang)南(nan)北兩(liang)路(lu)(lu)事務(wu)(wu)”的(de)伊犁將軍(jun)，駐扎伊犁，統轄全疆(jiang)(jiang)軍(jun)政(zheng)(zheng)事務(wu)(wu)。然后(hou)在新(xin)疆(jiang)(jiang)北路(lu)(lu)設(she)置(zhi)烏(wu)魯(lu)木齊都統和(he)(he)(he)塔爾(er)巴(ba)(ba)哈(ha)臺(tai)參贊大(da)臣(chen)(chen)，管轄烏(wu)魯(lu)木齊、巴(ba)(ba)里坤、吐(tu)魯(lu)番、塔城諸處軍(jun)政(zheng)(zheng)；又在新(xin)疆(jiang)(jiang)南(nan)路(lu)(lu)設(she)置(zhi)喀什(shen)噶爾(er)參贊大(da)臣(chen)(chen)，下轄葉爾(er)羌(qiang)、和(he)(he)(he)闐、英吉沙爾(er)、烏(wu)什(shen)、阿克蘇(su)、辟展、巴(ba)(ba)里坤、哈(ha)密等(deng)處的(de)辦事大(da)臣(chen)(chen)，以及吐(tu)魯(lu)番的(de)領隊大(da)臣(chen)(chen)。對于(yu)天山南(nan)路(lu)(lu)的(de)“回(hui)部”維(wei)吾爾(er)族聚居區，仍承襲原(yuan)有的(de)伯(bo)克制，各(ge)城仍設(she)阿奇木伯(bo)克（即正(zheng)城主(zhu)）和(he)(he)(he)伊什(shen)罕(han)伯(bo)克（即副(fu)城主(zhu)），但均(jun)由參贊大(da)臣(chen)(chen)奏請皇帝簡(jian)放，品級自三品至七(qi)品不等(deng)，管理當(dang)地(di)的(de)回(hui)城民政(zheng)(zheng)事務(wu)(wu)。
為(wei)了(le)發(fa)展(zhan)新(xin)疆(jiang)(jiang)經濟和加強(qiang)對新(xin)疆(jiang)(jiang)地(di)區的統治，清廷在新(xin)疆(jiang)(jiang)各地(di)大力(li)開展(zhan)屯(tun)(tun)田。東起巴(ba)里坤，西至伊犁(li)河，廣泛墾田開荒。早在康熙(xi)、雍(yong)正(zheng)年(nian)(nian)間用兵準噶爾時，即于(yu)新(xin)疆(jiang)(jiang)屯(tun)(tun)田，乾(qian)(qian)隆年(nian)(nian)間，屯(tun)(tun)田范圍日廣。據不完全統計，乾(qian)(qian)隆三十(shi)一年(nian)(nian)（1766年(nian)(nian)）僅(jin)新(xin)疆(jiang)(jiang)綠(lv)營(ying)軍(jun)的營(ying)屯(tun)(tun)畝(mu)數已達(da)179290畝(mu)；到乾(qian)(qian)隆四十(shi)年(nian)(nian)（1775年(nian)(nian)）時，僅(jin)新(xin)疆(jiang)(jiang)募民屯(tun)(tun)墾的戶(hu)屯(tun)(tun)畝(mu)數已達(da)280253畝(mu)。在大興屯(tun)(tun)田的同(tong)時，為(wei)了(le)繁(fan)榮工商業，清廷在阿克(ke)蘇設(she)鑄錢局，鑄造(zao)“乾(qian)(qian)隆通寶”銅幣，發(fa)行新(xin)疆(jiang)(jiang)各地(di)。
新疆地處西部邊(bian)陲，交通不(bu)便，為(wei)了(le)及時(shi)傳遞消息，清廷在(zai)天山(shan)南北(bei)主(zhu)要交通線(xian)普遍設(she)立(li)“軍臺(tai)”。
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