清(qing)統一準噶(ga)爾之(zhi)戰，又稱準清(qing)戰爭，是清(qing)朝康熙、雍正、乾隆三朝為(wei)統一西(xi)北地區(qu)并將其納入版圖(tu)與準噶(ga)爾貴族進行的多次戰爭。從康熙二十七年(nian)（1688年(nian)）正式打響(xiang)，一直到乾隆二十三年(nian)（1758年(nian)）才宣告結(jie)束，長達近70年(nian)。
1688年(nian)(nian)，噶爾(er)(er)(er)(er)(er)丹(dan)勢力侵入(ru)喀(ka)爾(er)(er)(er)(er)(er)喀(ka)蒙古。1690年(nian)(nian)6月，噶爾(er)(er)(er)(er)(er)丹(dan)又向漠(mo)北喀(ka)爾(er)(er)(er)(er)(er)喀(ka)蒙古進(jin)攻，康熙帝組織(zhi)左右兩路(lu)大軍(jun)親征，噶爾(er)(er)(er)(er)(er)丹(dan)潰逃。噶爾(er)(er)(er)(er)(er)丹(dan)敗亡(wang)后，策妄阿拉布坦繼任(ren)準(zhun)(zhun)噶爾(er)(er)(er)(er)(er)部(bu)(bu)(bu)臺(tai)吉(ji)，準(zhun)(zhun)噶爾(er)(er)(er)(er)(er)部(bu)(bu)(bu)又與清(qing)朝再次發(fa)生(sheng)沖突。1716年(nian)(nian)，準(zhun)(zhun)噶爾(er)(er)(er)(er)(er)部(bu)(bu)(bu)出兵西藏，占(zhan)領拉薩。清(qing)朝由(you)青海出兵入(ru)藏，全軍(jun)覆沒。1720年(nian)(nian)，清(qing)朝第二次出兵，趕走準(zhun)(zhun)噶爾(er)(er)(er)(er)(er)軍(jun)。1755年(nian)(nian)，乾隆(long)(long)帝趁準(zhun)(zhun)噶爾(er)(er)(er)(er)(er)內亂之機出兵進(jin)占(zhan)伊犁、擊潰達瓦(wa)齊軍(jun)，并于1757年(nian)(nian)平定阿睦爾(er)(er)(er)(er)(er)撒納的叛亂。乾隆(long)(long)二十(shi)三年(nian)(nian)（1758年(nian)(nian)）正月，俄國遣使告知(zhi)阿睦爾(er)(er)(er)(er)(er)撒納已死。清(qing)廷派(pai)人前(qian)往(wang)邊界(jie)驗(yan)看尸首。乾隆(long)(long)帝以平定阿睦爾(er)(er)(er)(er)(er)撒納，宣(xuan)諭中外。
清朝統(tong)(tong)治者(zhe)統(tong)(tong)一(yi)西北、平(ping)定準噶爾叛亂(luan)中(zhong)剿撫并用，為國(guo)家統(tong)(tong)一(yi)而戰。清軍平(ping)定準噶爾貴(gui)族(zu)的(de)(de)叛亂(luan)，是一(yi)次維護祖(zu)國(guo)統(tong)(tong)一(yi)、反對(dui)民(min)族(zu)分裂的(de)(de)正義戰爭(zheng)。鞏固了清朝對(dui)西北邊疆地(di)區的(de)(de)統(tong)(tong)治，打(da)擊了沙皇俄(e)國(guo)的(de)(de)侵略勢力(li)。西方也有清朝向西北擴張屬于近代早期的(de)(de)帝國(guo)對(dui)外擴張模式(shi)的(de)(de)觀點。
準(zhun)(zhun)噶爾原(yuan)屬于(yu)和(he)(he)明朝(chao)對峙的蒙(meng)古瓦(wa)剌，后來瓦(wa)剌部在(zai)崛起(qi)的蒙(meng)古韃(da)靼部打擊下向(xiang)(xiang)西(xi)遷移(yi)并發(fa)生分(fen)裂，在(zai)歷史上又(you)被稱(cheng)為(wei)(wei)衛拉特，下面又(you)分(fen)為(wei)(wei)準(zhun)(zhun)噶爾部、和(he)(he)碩特部、土(tu)(tu)爾扈特部和(he)(he)杜爾伯(bo)特部四部，也稱(cheng)為(wei)(wei)漠西(xi)蒙(meng)古（厄魯(lu)特蒙(meng)古）。其(qi)(qi)牧(mu)地，西(xi)北(bei)不(bu)斷向(xiang)(xiang)額爾齊斯(si)(si)河(he)中游、鄂畢(bi)河(he)以(yi)及哈薩(sa)克草原(yuan)移(yi)動(dong)，西(xi)南(nan)向(xiang)(xiang)伊犁河(he)流域(yu)推(tui)進，東(dong)南(nan)向(xiang)(xiang)青(qing)海(hai)遷徙。準(zhun)(zhun)噶爾部初游牧(mu)于(yu)額爾齊斯(si)(si)河(he)中上游至(zhi)(zhi)(zhi)霍(huo)博克河(he)、薩(sa)里(li)山一帶，后以(yi)伊犁河(he)流域(yu)為(wei)(wei)中心。杜爾伯(bo)特部游牧(mu)于(yu)額爾齊斯(si)(si)河(he)沿岸(an)。土(tu)(tu)爾扈特部原(yuan)游牧(mu)于(yu)塔爾巴(ba)哈臺(tai)及其(qi)(qi)以(yi)北(bei)，西(xi)徙后，輝特部居之。和(he)(he)碩特部游牧(mu)于(yu)額敏河(he)兩岸(an)至(zhi)(zhi)(zhi)烏魯(lu)木齊地區(qu)。諸(zhu)部分(fen)牧(mu)而居，互不(bu)相屬。所(suo)轄地區(qu)北(bei)至(zhi)(zhi)(zhi)額爾齊斯(si)(si)河(he)、鄂畢(bi)河(he)、葉尼塞河(he)上游地區(qu)，南(nan)至(zhi)(zhi)(zhi)天(tian)山，東(dong)到(dao)阿(a)爾泰山和(he)(he)蒙(meng)古杭(hang)愛(ai)山分(fen)界(jie)線，西(xi)包(bao)巴(ba)爾喀什湖地區(qu)。
天(tian)聰九年(nian)（1635年(nian)），衛(wei)拉特(te)盟主固始汗(han)就遣(qian)使(shi)至盛京(jing)向后(hou)金（清(qing)(qing)）統(tong)治者(zhe)貢馬(ma)匹、方物。固始汗(han)遣(qian)使(shi)表示歸順后(hou)金，就代表衛(wei)拉特(te)歸順后(hou)金政權。順治元(yuan)年(nian)（1644年(nian)）滿洲貴族的軍隊(dui)在明(ming)朝(chao)將(jiang)領吳三桂的帶引下(xia)大(da)舉進入山海關(guan)內(nei)，擊敗李自(zi)成(cheng)、攻占京(jing)師(shi)（今(jin)北京(jing)），開始取代明(ming)朝(chao)成(cheng)為(wei)統(tong)治中國的中央政府。在這(zhe)樣的大(da)背景下(xia)，順治三年(nian)（1646年(nian)），包括準(zhun)噶(ga)爾部(bu)在內(nei)的衛(wei)拉特(te)各(ge)部(bu)首(shou)領二(er)十二(er)人聯名(ming)奉(feng)表貢，清(qing)(qing)朝(chao)皇帝賜以甲胄弓矢，命其統(tong)轄諸部(bu)，準(zhun)噶(ga)爾部(bu)和清(qing)(qing)朝(chao)之間確定了主權關(guan)系，青(qing)藏高(gao)原(yuan)和新疆等地正(zheng)式(shi)納(na)入清(qing)(qing)朝(chao)的主權版圖(tu)。
準噶(ga)爾(er)(er)(er)為早期(qi)衛拉(la)特(te)聯盟的(de)(de)綽(chuo)羅斯部(bu)(bu)(bu)，17世紀，準噶(ga)爾(er)(er)(er)部(bu)(bu)(bu)強大起來(lai)。將土(tu)爾(er)(er)(er)扈(hu)特(te)部(bu)(bu)(bu)向西壓(ya)迫(po)，致(zhi)其與杜(du)爾(er)(er)(er)伯(bo)特(te)部(bu)(bu)(bu)、和(he)碩(shuo)特(te)部(bu)(bu)(bu)的(de)(de)一部(bu)(bu)(bu)被迫(po)遷到了(le)伏爾(er)(er)(er)加河下(xia)游地(di)(di)區。向東壓(ya)迫(po)杜(du)爾(er)(er)(er)伯(bo)特(te)部(bu)(bu)(bu)，奪其領(ling)地(di)(di)，逼其內附(fu)清朝。并企圖兼并和(he)碩(shuo)特(te)部(bu)(bu)(bu)，入侵青海。準噶(ga)爾(er)(er)(er)部(bu)(bu)(bu)又擊敗(bai)哈薩克人(ren)，翻過天山征服回部(bu)(bu)(bu)諸察合(he)臺汗及伊(yi)斯蘭教派(pai)(pai)白山派(pai)(pai)與黑山派(pai)(pai)，飛兵拉(la)薩，凌攝西藏，終(zhong)于(yu)建立起了(le)強大的(de)(de)準噶(ga)爾(er)(er)(er)汗國。其疆域北(bei)接(jie)額爾(er)(er)(er)齊斯河、鄂畢河、葉尼塞河上游，南(nan)到西藏阿里(li)(li)地(di)(di)區，西包巴爾(er)(er)(er)喀什湖，東至蒙(meng)古薩彥嶺(ling)及色愣格河流域，極盛時(shi)達四百多萬平方公里(li)(li)。
天聰八年(nian)(nian)(nian)（1634年(nian)(nian)(nian)），準噶爾(er)(er)部的首領(ling)哈(ha)喇忽(hu)剌去世，其子巴圖爾(er)(er)繼任首領(ling)，對外擴張疆土，并在(zai)崇德(de)三年(nian)(nian)(nian)（1638年(nian)(nian)(nian)）在(zai)博克塞里（今博克賽(sai)爾(er)(er)蒙古(gu)自治縣）建(jian)成自己(ji)的城；崇德(de)五年(nian)(nian)(nian)（1640年(nian)(nian)(nian)）參(can)與制定(ding)《喀爾(er)(er)喀—衛拉特法典(dian)》。巴圖爾(er)(er)被稱為(wei)巴圖爾(er)(er)琿(hun)臺吉(ji)，連(lian)續兩(liang)次擊退俄羅(luo)斯的侵(qin)略，迫使俄羅(luo)斯承(cheng)認了(le)準噶爾(er)(er)汗國，兩(liang)國互(hu)通貿易。此前后(hou)金已于崇德(de)元(yuan)年(nian)(nian)(nian)（1636年(nian)(nian)(nian)）改(gai)國號為(wei)大清(qing)。順治五年(nian)(nian)(nian)（1648年(nian)(nian)(nian)），巴圖爾(er)(er)琿(hun)臺吉(ji)授命喇嘛咱雅班(ban)第(di)達將過去的蒙文(wen)改(gai)造(zao)而(er)制定(ding)成“托(tuo)沁”文(wen)字(zi)，作為(wei)準噶爾(er)(er)的統一文(wen)字(zi)。
順治十(shi)年(nian)(nian)（1653年(nian)(nian)），巴(ba)圖(tu)(tu)爾(er)(er)(er)(er)琿(hun)臺(tai)(tai)吉(ji)去世(shi)(shi)，其第五子僧(seng)格(ge)繼承(cheng)臺(tai)(tai)吉(ji)，但其眾兄弟不(bu)服(fu)(fu)，起兵反叛，內戰爆發，至十(shi)七世(shi)(shi)紀六(liu)十(shi)年(nian)(nian)代，僧(seng)格(ge)才(cai)平定了(le)叛亂，但在(zai)康熙十(shi)年(nian)(nian)（1671年(nian)(nian)），他(ta)就(jiu)被自己的(de)(de)兩個哥哥車臣和卓(zhuo)特巴(ba)巴(ba)圖(tu)(tu)爾(er)(er)(er)(er)暗殺，他(ta)的(de)(de)三個兒子都年(nian)(nian)小，臺(tai)(tai)吉(ji)位(wei)難以(yi)得(de)到延續，正在(zai)西(xi)藏學習佛(fo)學的(de)(de)噶(ga)爾(er)(er)(er)(er)丹(dan)(dan)（僧(seng)格(ge)之弟）征(zheng)得(de)老師五世(shi)(shi)達賴喇嘛的(de)(de)同意(yi)，還俗(su)，快(kuai)速回國，在(zai)和碩特首(shou)領兼(jian)衛拉特盟主的(de)(de)鄂齊爾(er)(er)(er)(er)圖(tu)(tu)車臣汗援助下(xia)，擒殺了(le)車臣，并將卓(zhuo)特巴(ba)巴(ba)圖(tu)(tu)爾(er)(er)(er)(er)趕往青海。噶(ga)爾(er)(er)(er)(er)丹(dan)(dan)自立為準噶(ga)爾(er)(er)(er)(er)汗。噶(ga)爾(er)(er)(er)(er)丹(dan)(dan)首(shou)先(xian)統一了(le)西(xi)蒙古諸部，隨后，他(ta)起兵進攻葉爾(er)(er)(er)(er)羌的(de)(de)黑山派(pai)和喀(ka)什(shen)噶(ga)爾(er)(er)(er)(er)的(de)(de)白山派(pai)，征(zheng)服(fu)(fu)了(le)這個察合臺(tai)(tai)汗國。又(you)于(yu)1681年(nian)(nian)征(zheng)服(fu)(fu)了(le)土魯番汗國的(de)(de)察合臺(tai)(tai)汗。
準噶(ga)爾貴(gui)族(zu)統治厄魯(lu)特(te)蒙古各部后，與清政府仍保持著(zhu)地方與中央的隸(li)屬關系(xi)。準噶(ga)爾首領巴圖爾琿臺吉、僧格等(deng)，每兩年都要向清政府遣(qian)(qian)使(shi)(shi)「朝貢」。清政府也(ye)賜予(yu)大量(liang)財物(wu)給準噶(ga)爾，并經常遣(qian)(qian)使(shi)(shi)通報(bao)情況(kuang)。
但是，在(zai)(zai)(zai)準(zhun)噶(ga)(ga)(ga)爾(er)(er)(er)(er)貴(gui)族(zu)內部(bu)，也有一部(bu)分人堅持分裂主義立場。康(kang)熙(xi)(xi)九(jiu)年(nian)（1670年(nian)）僧(seng)格死后，他(ta)的(de)異母(mu)弟(di)噶(ga)(ga)(ga)爾(er)(er)(er)(er)丹殺害了他(ta)的(de)子嗣(si)，奪得了準(zhun)噶(ga)(ga)(ga)爾(er)(er)(er)(er)的(de)統治(zhi)權(quan)。噶(ga)(ga)(ga)爾(er)(er)(er)(er)丹是個(ge)野心(xin)勃勃的(de)陰謀家和(he)賣國賊，在(zai)(zai)(zai)他(ta)自任為(wei)準(zhun)噶(ga)(ga)(ga)爾(er)(er)(er)(er)汗以后，康(kang)熙(xi)(xi)十六年(nian)（1677年(nian)）用計襲(xi)殺了和(he)清政府關系最密切(qie)的(de)厄魯(lu)特首領(ling)車臣汗鄂齊(qi)爾(er)(er)(er)(er)圖，強占(zhan)了河(he)套(tao)和(he)碩特部(bu)，并在(zai)(zai)(zai)該部(bu)強征(zheng)兵丁，準(zhun)備侵犯青海地區。康(kang)熙(xi)(xi)十七年(nian)（1678年(nian)），噶(ga)(ga)(ga)爾(er)(er)(er)(er)丹出兵天(tian)山(shan)南(nan)路，占(zhan)領(ling)天(tian)山(shan)南(nan)北(bei)廣大(da)地區，把(ba)廣大(da)維吾爾(er)(er)(er)(er)族(zu)人民置于(yu)其(qi)統治(zhi)之下。噶(ga)(ga)(ga)爾(er)(er)(er)(er)丹取得準(zhun)噶(ga)(ga)(ga)爾(er)(er)(er)(er)的(de)統治(zhi)權(quan)后，一反其(qi)父(fu)兄抗擊外來侵略、捍衛民族(zu)主權(quan)的(de)立場，而逐(zhu)漸走上(shang)與沙俄相勾結(jie)的(de)道路。噶(ga)(ga)(ga)爾(er)(er)(er)(er)丹在(zai)(zai)(zai)沙俄的(de)挑(tiao)唆(suo)和(he)指(zhi)使下，開始(shi)把(ba)注意力(li)轉(zhuan)向(xiang)東方，把(ba)矛頭指(zhi)向(xiang)喀爾(er)(er)(er)(er)喀蒙(meng)古。
康(kang)熙(xi)二(er)(er)十七年(nian)（1688年(nian)），正當蒙古(gu)(gu)(gu)族人民(min)英勇(yong)抗擊戈洛文率(lv)領的(de)(de)(de)(de)(de)沙(sha)(sha)俄(e)(e)(e)侵(qin)略軍(jun)(jun)(jun)(jun)(jun)時，噶(ga)(ga)(ga)(ga)爾(er)(er)(er)丹(dan)(dan)竟突然(ran)率(lv)兵(bing)越過杭(hang)愛山，大舉進(jin)攻喀(ka)(ka)(ka)爾(er)(er)(er)喀(ka)(ka)(ka)的(de)(de)(de)(de)(de)土謝圖汗，從背后向喀(ka)(ka)(ka)爾(er)(er)(er)喀(ka)(ka)(ka)蒙古(gu)(gu)(gu)軍(jun)(jun)(jun)(jun)(jun)民(min)施放(fang)暗箭，迫使(shi)喀(ka)(ka)(ka)爾(er)(er)(er)喀(ka)(ka)(ka)蒙古(gu)(gu)(gu)諸(zhu)部(bu)南遷。噶(ga)(ga)(ga)(ga)爾(er)(er)(er)丹(dan)(dan)的(de)(de)(de)(de)(de)有恃無恐與沙(sha)(sha)皇俄(e)(e)(e)國的(de)(de)(de)(de)(de)慫恿和支持密切相關(guan)。從康(kang)熙(xi)十三年(nian)到康(kang)熙(xi)二(er)(er)十二(er)(er)年(nian)（1674—1683）間，噶(ga)(ga)(ga)(ga)爾(er)(er)(er)丹(dan)(dan)幾乎每年(nian)都派人與沙(sha)(sha)皇俄(e)(e)(e)國相勾結，并“企(qi)圖同(tong)俄(e)(e)(e)國訂立軍(jun)(jun)(jun)(jun)(jun)事同(tong)盟和求(qiu)得(de)俄(e)(e)(e)國給予(yu)‘軍(jun)(jun)(jun)(jun)(jun)隊和槍炮’的(de)(de)(de)(de)(de)援(yuan)助(zhu)”。噶(ga)(ga)(ga)(ga)爾(er)(er)(er)丹(dan)(dan)出兵(bing)喀(ka)(ka)(ka)爾(er)(er)(er)喀(ka)(ka)(ka)蒙古(gu)(gu)(gu)時，正是喀(ka)(ka)(ka)爾(er)(er)(er)喀(ka)(ka)(ka)蒙古(gu)(gu)(gu)土謝圖汗率(lv)領蒙古(gu)(gu)(gu)軍(jun)(jun)(jun)(jun)(jun)民(min)抗擊沙(sha)(sha)俄(e)(e)(e)侵(qin)略者并包圍(wei)了(le)沙(sha)(sha)俄(e)(e)(e)軍(jun)(jun)(jun)(jun)(jun)隊于(yu)色(se)楞(leng)格斯(si)城堡內(nei)的(de)(de)(de)(de)(de)關(guan)鍵時刻。結果由(you)于(yu)噶(ga)(ga)(ga)(ga)爾(er)(er)(er)丹(dan)(dan)從西面(mian)向喀(ka)(ka)(ka)爾(er)(er)(er)喀(ka)(ka)(ka)部(bu)發(fa)動進(jin)攻，使(shi)其腹背受(shou)敵，迫使(shi)土謝圖汗只得(de)撤退包圍(wei)沙(sha)(sha)俄(e)(e)(e)侵(qin)略者的(de)(de)(de)(de)(de)軍(jun)(jun)(jun)(jun)(jun)隊，噶(ga)(ga)(ga)(ga)爾(er)(er)(er)丹(dan)(dan)替沙(sha)(sha)俄(e)(e)(e)侵(qin)略者解(jie)了(le)圍(wei)。康(kang)熙(xi)二(er)(er)十九年(nian)（1690年(nian)）6月，噶(ga)(ga)(ga)(ga)爾(er)(er)(er)丹(dan)(dan)以追擊喀(ka)(ka)(ka)爾(er)(er)(er)喀(ka)(ka)(ka)為名，又向漠南喀(ka)(ka)(ka)爾(er)(er)(er)喀(ka)(ka)(ka)蒙古(gu)(gu)(gu)進(jin)攻，俘掠人口，搶劫牲畜。他(ta)還(huan)公然(ran)向康(kang)熙(xi)帝提出“圣上君南方，我長北方”的(de)(de)(de)(de)(de)要求(qiu)，妄圖把中國北部(bu)置于(yu)他(ta)的(de)(de)(de)(de)(de)統治之(zhi)下。清(qing)政(zheng)府為了(le)保衛邊(bian)疆的(de)(de)(de)(de)(de)安(an)寧，反抗沙(sha)(sha)俄(e)(e)(e)的(de)(de)(de)(de)(de)侵(qin)略，對準噶(ga)(ga)(ga)(ga)爾(er)(er)(er)部(bu)封建主噶(ga)(ga)(ga)(ga)爾(er)(er)(er)丹(dan)(dan)進(jin)行了(le)堅決的(de)(de)(de)(de)(de)斗爭(zheng)。
康熙(xi)二十九年(nian)（1690年(nian)）五月(yue)，康熙(xi)帝玄燁得知“噶爾(er)丹(dan)將借(jie)兵(bing)鄂(e)羅(luo)斯(si)（俄(e)(e)羅(luo)斯(si)）”，立(li)即傳諭在北(bei)京的俄(e)(e)國使臣吉里(li)古(gu)里(li)、伊法(fa)尼(ni)齊：“噶爾(er)丹(dan)迫于(yu)(yu)內(nei)亂(luan)，食盡無歸，內(nei)向行劫，今仍(reng)揚言(yan)會汝兵(bing)同侵喀爾(er)喀，喀爾(er)喀已歸順(shun)本朝，倘誤信(xin)其言(yan)，是負(fu)信(xin)誓而開兵(bing)端也”。既揭露了(le)噶爾(er)丹(dan)勾結沙(sha)俄(e)(e)的無恥行經，又警(jing)告了(le)沙(sha)皇俄(e)(e)國。但噶爾(er)丹(dan)仍(reng)一意(yi)孤(gu)行，遂于(yu)(yu)康熙(xi)二十九年(nian)（1690年(nian)）六(liu)月(yue)，率軍(jun)兩萬，以(yi)(yi)追擊喀爾(er)喀蒙(meng)古(gu)為名，大舉南犯，深入(ru)漠南蒙(meng)古(gu)烏(wu)(wu)珠(zhu)穆沁一帶(dai)。由于(yu)(yu)理藩院尚書(shu)阿喇尼(ni)等“違命輕戰”，以(yi)(yi)至清軍(jun)初(chu)戰失利，噶爾(er)丹(dan)軍(jun)隊得以(yi)(yi)乘(cheng)勢渡過西拉木倫河，深入(ru)到距(ju)北(bei)京僅700里(li)的烏(wu)(wu)蘭布通（今內(nei)蒙(meng)古(gu)昭烏(wu)(wu)達盟克什(shen)克騰旗(qi)南境）。
噶爾丹深入喀爾喀蒙古后，康熙帝(di)就謀劃剿滅(mie)這個與己(ji)爭奪蒙古高原(yuan)霸權的(de)(de)強(qiang)大敵手(shou)。清(qing)政府在(zai)外交上(shang)與沙俄侵(qin)略者展開針鋒相對的(de)(de)斗爭，同時(shi)(shi)在(zai)政治上(shang)和軍事上(shang)也作了一系列準(zhun)備。康熙帝(di)認為，若(ruo)聽任噶爾丹荼毒塞外，將勢(shi)成毒癰。要使邊境得(de)以(yi)安(an)定(ding)，國家得(de)以(yi)長治久安(an)，不能(neng)貪圖(tu)一時(shi)(shi)茍(gou)安(an)之計(ji)，而必須順其民心，消滅(mie)噶爾丹叛亂(luan)分子，才(cai)能(neng)保障國內安(an)定(ding)。因此，康熙帝(di)決計(ji)親征。
康(kang)熙(xi)二十九年(nian)（1690年(nian)）六(liu)月，康(kang)熙(xi)部署是(shi)分兵(bing)兩(liang)路(lu)出(chu)(chu)擊(ji)：左(zuo)(zuo)路(lu)軍(jun)(jun)(jun)出(chu)(chu)古北口(kou)（今(jin)河(he)北灤平南(nan)(nan)），右(you)路(lu)軍(jun)(jun)(jun)出(chu)(chu)喜峰口(kou)（今(jin)河(he)北寬城西(xi)南(nan)(nan)），從左(zuo)(zuo)右(you)兩(liang)翼迂(yu)回北進(jin)，消滅噶(ga)爾(er)丹軍(jun)(jun)(jun)于烏珠穆(mu)沁地區。康(kang)熙(xi)親臨博(bo)洛和(he)屯（今(jin)內蒙古正藍旗(qi)南(nan)(nan)）指揮。同時令盛(sheng)京將軍(jun)(jun)(jun)（治(zhi)所今(jin)遼(liao)寧沈陽）、吉林將軍(jun)(jun)(jun)（治(zhi)所今(jin)吉林市）各率所部兵(bing)力，西(xi)出(chu)(chu)西(xi)遼(liao)河(he)、洮兒河(he)，與科(ke)爾(er)沁蒙古兵(bing)會(hui)合(he)(he)，協同清(qing)軍(jun)(jun)(jun)主力作戰。右(you)路(lu)軍(jun)(jun)(jun)北進(jin)至烏珠穆(mu)沁境遇噶(ga)爾(er)丹軍(jun)(jun)(jun)，交戰不(bu)利(li)南(nan)(nan)退。噶(ga)爾(er)丹乘勢(shi)長驅南(nan)(nan)進(jin)，渡過西(xi)拉(la)木(mu)倫河(he)，進(jin)抵烏蘭布(bu)(bu)通(tong)（今(jin)內蒙古翁牛特(te)旗(qi)西(xi)南(nan)(nan)）。清(qing)左(zuo)(zuo)路(lu)軍(jun)(jun)(jun)也進(jin)至烏蘭布(bu)(bu)通(tong)南(nan)(nan)，康(kang)熙(xi)急令右(you)路(lu)軍(jun)(jun)(jun)停止南(nan)(nan)撤，與左(zuo)(zuo)路(lu)軍(jun)(jun)(jun)會(hui)合(he)(he)，合(he)(he)擊(ji)噶(ga)爾(er)丹于烏蘭布(bu)(bu)通(tong)，并派兵(bing)一(yi)部進(jin)駐歸化城（今(jin)內蒙古呼(hu)和(he)浩特(te)），伺(si)機側擊(ji)噶(ga)爾(er)丹歸路(lu)。
烏(wu)蘭(lan)布(bu)通位于克(ke)什克(ke)騰旗（今(jin)(jin)內蒙古翁牛(niu)特旗西(xi)南(nan)）之(zhi)西(xi)。該(gai)地北面(mian)靠山，南(nan)有高涼河(he)(he)（西(xi)拉木(mu)倫(lun)河(he)(he)上(shang)游的支流），地勢險要。噶爾丹背山面(mian)水布(bu)陣(zhen)，將(jiang)萬余駱駝縛蹄臥地，背負木(mu)箱(xiang)，蒙以(yi)濕氈，擺成一條如同城(cheng)柵(zha)的防線，謂之(zhi)“駝城(cheng)”，令士兵于駝城(cheng)之(zhi)內，依托(tuo)箱(xiang)垛放槍射(she)箭。清軍(jun)(jun)以(yi)火器部隊在前，步(bu)騎(qi)兵在后，隔河(he)(he)布(bu)陣(zhen)。八月初一中(zhong)午，交戰開始。清軍(jun)(jun)首(shou)先集中(zhong)火銃(chong)火炮(pao)，猛烈轟擊(ji)駝陣(zhen)，自午后至日落(luo)，將(jiang)駝陣(zhen)轟斷為二，然(ran)后揮軍(jun)(jun)渡河(he)(he)進(jin)攻，以(yi)步(bu)兵從正面(mian)發起沖擊(ji)，又(you)以(yi)騎(qi)兵從左翼迂回側擊(ji)，噶爾丹大(da)敗，倉皇率全部撤往(wang)山上(shang)。次日，遣使向清軍(jun)(jun)乞和(he)，乘機率殘部夜渡西(xi)拉木(mu)倫(lun)河(he)(he)，狼(lang)狽逃(tao)竄，逃(tao)回科布(bu)多(duo)（今(jin)(jin)蒙古吉爾噶朗圖）時只剩下數千人。
噶爾丹自烏(wu)蘭(lan)布通戰敗后(hou)，仍盤踞科布多(duo)地區，集合殘(can)部，休養生息(xi)，以期(qi)東山再起(qi)。他一面(mian)派人去沙俄活動，企圖獲(huo)取(qu)更多(duo)的(de)軍事(shi)支持；一面(mian)煽動內蒙古科爾沁等部作亂，并殺害清政府官員(yuan)，不斷(duan)騷(sao)(sao)擾邊地安(an)寧。針對噶爾丹的(de)騷(sao)(sao)擾滋(zi)事(shi)，清政府除加強軍備外，主要是(shi)展(zhan)開政治(zhi)攻勢，以期(qi)政治(zhi)解決。康熙(xi)三(san)十四年（1695年）5月(yue)，在沙俄的(de)慫恿和支持下，噶爾丹率騎兵3萬向(xiang)東進犯，到達巴顏(yan)烏(wu)蘭(lan)一帶，又(you)點燃起(qi)叛亂的(de)戰火。
康(kang)(kang)熙(xi)(xi)(xi)(xi)三十五(wu)年（1696年）2月，康(kang)(kang)熙(xi)(xi)(xi)(xi)帝(di)(di)發兵(bing)(bing)10萬，分三路(lu)大(da)(da)舉(ju)出擊：東路(lu)由(you)黑龍江將(jiang)軍(jun)(jun)薩布素率(lv)(lv)黑龍江等地軍(jun)(jun)隊越(yue)大(da)(da)興安(an)嶺出克魯倫河進剿；西(xi)路(lu)由(you)撫遠(yuan)大(da)(da)將(jiang)軍(jun)(jun)費揚古率(lv)(lv)陜(shan)西(xi)、甘肅兵(bing)(bing)勇由(you)寧夏北越(yue)沙漠沿翁(weng)金河北上，以斷準軍(jun)(jun)歸路(lu)；中(zhong)路(lu)為主(zhu)力，由(you)康(kang)(kang)熙(xi)(xi)(xi)(xi)帝(di)(di)親(qin)(qin)率(lv)(lv)出獨石口，直(zhi)(zhi)奔克魯倫河，與東西(xi)兩路(lu)協同(tong)夾擊。康(kang)(kang)熙(xi)(xi)(xi)(xi)帝(di)(di)做(zuo)了出征前的具(ju)體部(bu)署，任命各路(lu)將(jiang)領，分配軍(jun)(jun)隊名額，并精心籌備(bei)戰馬、軍(jun)(jun)糧、武器等項。中(zhong)路(lu)大(da)(da)軍(jun)(jun)由(you)康(kang)(kang)熙(xi)(xi)(xi)(xi)帝(di)(di)親(qin)(qin)自統率(lv)(lv)，決定于康(kang)(kang)熙(xi)(xi)(xi)(xi)三十五(wu)年二月三十日（1696年4月4日）由(you)北京出發，直(zhi)(zhi)奔克魯倫河，發起(qi)主(zhu)攻(gong)。中(zhong)路(lu)大(da)(da)軍(jun)(jun)包括(kuo)京師八旗(qi)滿兵(bing)(bing)、漢軍(jun)(jun)火器營(ying)、盛京兵(bing)(bing)、黑龍江兵(bing)(bing)、寧古塔(ta)兵(bing)(bing)、宣化(hua)府綠(lv)營(ying)兵(bing)(bing)、古北口綠(lv)營(ying)兵(bing)(bing)，加(jia)上喀(ka)爾喀(ka)諸扎薩克兵(bing)(bing)1萬，約4萬多人。另(ling)有預備(bei)兵(bing)(bing)及廝役1.7萬人。六位皇(huang)子、皇(huang)兄裕親(qin)(qin)王(wang)福全、皇(huang)弟(di)恭親(qin)(qin)王(wang)常寧，諸內大(da)(da)臣(chen)、侍衛、大(da)(da)學(xue)士(shi)、都統、前鋒(feng)統領、護軍(jun)(jun)統領等隨軍(jun)(jun)從征。康(kang)(kang)熙(xi)(xi)(xi)(xi)帝(di)(di)與士(shi)卒共甘苦，每日一餐，時常“俟(si)眾軍(jun)(jun)士(shi)結營(ying)畢(bi)，始入行宮。營(ying)中(zhong)皆炊飯，然后進膳”。由(you)于中(zhong)路(lu)軍(jun)(jun)準備(bei)充足，康(kang)(kang)熙(xi)(xi)(xi)(xi)帝(di)(di)事必躬親(qin)(qin)，行軍(jun)(jun)極為順利，幾乎未(wei)遭損失(shi)。
噶(ga)爾(er)丹(dan)(dan)得(de)知康(kang)熙(xi)(xi)皇帝(di)(di)親自統率(lv)(lv)大軍(jun)(jun)(jun)(jun)進抵(di)克(ke)魯倫河(he)時，不敢迎(ying)戰，盡(jin)棄廬帳、器械，乘(cheng)夜(ye)西(xi)竄。清(qing)軍(jun)(jun)(jun)(jun)進抵(di)巴顏(yan)烏蘭時，撲了個空。康(kang)熙(xi)(xi)帝(di)(di)為(wei)了捕捉噶(ga)爾(er)丹(dan)(dan)叛軍(jun)(jun)(jun)(jun)主(zhu)力，一(yi)面命總兵(bing)(bing)岳升(sheng)龍、馬進、白斌等率(lv)(lv)精兵(bing)(bing)輕騎窮追噶(ga)爾(er)丹(dan)(dan)叛軍(jun)(jun)(jun)(jun)；一(yi)面密諭西(xi)路(lu)(lu)軍(jun)(jun)(jun)(jun)統帥(shuai)費(fei)揚(yang)(yang)古(gu)(gu)堵(du)截噶(ga)爾(er)丹(dan)(dan)叛軍(jun)(jun)(jun)(jun)脫(tuo)逃之(zhi)路(lu)(lu)。撫遠大將軍(jun)(jun)(jun)(jun)費(fei)揚(yang)(yang)古(gu)(gu)正(zheng)率(lv)(lv)西(xi)路(lu)(lu)軍(jun)(jun)(jun)(jun)北進，得(de)報噶(ga)爾(er)丹(dan)(dan)蹤跡，即令署前鋒統領(ling)(ling)碩(shuo)岱等且(qie)戰且(qie)退，將噶(ga)爾(er)丹(dan)(dan)誘(you)至昭(zhao)莫多（今蒙古(gu)(gu)國(guo)烏蘭巴托宗莫德(de)市），昭(zhao)莫多北依肯(ken)特(te)嶺，東峙(zhi)丘陵，西(xi)臨河(he)水(shui)。十三日，費(fei)揚(yang)(yang)古(gu)(gu)分兵(bing)(bing)4隊：東翼為(wei)京城及西(xi)安八旗兵(bing)(bing)、察(cha)哈(ha)爾(er)蒙古(gu)(gu)兵(bing)(bing)，屯營高(gao)處；西(xi)翼為(wei)大同(tong)總兵(bing)(bing)康(kang)調元所(suo)率(lv)(lv)綠旗兵(bing)(bing)及右衛八旗兵(bing)(bing)、喀爾(er)喀蒙古(gu)(gu)兵(bing)(bing)，沿河(he)布陣；將軍(jun)(jun)(jun)(jun)孫思克(ke)率(lv)(lv)綠旗官兵(bing)(bing)居中占領(ling)(ling)山(shan)頭，大將軍(jun)(jun)(jun)(jun)費(fei)揚(yang)(yang)古(gu)(gu)統軍(jun)(jun)(jun)(jun)列(lie)后。遵照(zhao)康(kang)熙(xi)(xi)帝(di)(di)預授之(zhi)策，清(qing)軍(jun)(jun)(jun)(jun)一(yi)律下馬步戰，待令再(zai)行沖鋒。在清(qing)軍(jun)(jun)(jun)(jun)浴血(xue)奮戰下，自午至暮，大敗(bai)噶(ga)爾(er)丹(dan)(dan)軍(jun)(jun)(jun)(jun)，殺(sha)死叛軍(jun)(jun)(jun)(jun)3000余人，生(sheng)擒百余人，噶(ga)爾(er)丹(dan)(dan)僅率(lv)(lv)數騎逃脫(tuo)，清(qing)軍(jun)(jun)(jun)(jun)在此戰中擊斃噶(ga)爾(er)丹(dan)(dan)之(zhi)妻阿努可敦。
昭莫(mo)多(duo)一戰(zhan)(zhan)(zhan)，基(ji)本上殲滅了噶爾丹的(de)(de)(de)叛軍(jun)力量，清(qing)軍(jun)取(qu)得平叛戰(zhan)(zhan)(zhan)爭的(de)(de)(de)決定性勝利。噶爾丹戰(zhan)(zhan)(zhan)敗后，率殘部流竄(cuan)于塔米爾河(he)流域，成為一股走投無路、日暮途(tu)窮的(de)(de)(de)流匪。但他頑固到底，拒不接(jie)受清(qing)政府的(de)(de)(de)招撫，繼(ji)續(xu)堅持分裂祖國的(de)(de)(de)叛亂，作最(zui)后的(de)(de)(de)垂死掙(zheng)扎。
為了(le)徹底消滅噶爾(er)(er)丹勢力，康(kang)(kang)熙(xi)帝(di)認為必須乘其新敗(bai)之后，搗其巢(chao)穴，以其“萬年之計(ji)”。康(kang)(kang)熙(xi)三(san)十六年（1697年）2月(yue)，康(kang)(kang)熙(xi)帝(di)舉行(xing)(xing)第三(san)次平叛的(de)軍(jun)事(shi)行(xing)(xing)動，命(ming)費揚古、馬恩(en)哈分(fen)別統率兩路大軍(jun)，共6000人(ren)，由寧夏(xia)(xia)出發，進(jin)剿噶爾(er)(er)丹殘部(bu)(bu)。4月(yue)，康(kang)(kang)熙(xi)帝(di)親赴寧夏(xia)(xia)，指(zhi)揮這(zhe)次軍(jun)事(shi)行(xing)(xing)動。正當清(qing)軍(jun)進(jin)發之時，噶爾(er)(er)丹集團內部(bu)(bu)分(fen)崩(beng)離(li)析，眾叛親離(li)，軍(jun)隊只剩下(xia)(xia)五六百人(ren)，噶爾(er)(er)丹成了(le)孤家寡人(ren)。在清(qing)軍(jun)征剿下(xia)(xia)，噶爾(er)(er)丹走投無路，遂飲藥自盡。至此，沙俄支持(chi)下(xia)(xia)的(de)噶爾(er)(er)丹的(de)民族(zu)分(fen)裂(lie)叛亂被(bei)清(qing)政府平定下(xia)(xia)去(qu)。噶爾(er)(er)丹敗(bai)死后，他的(de)侄子策妄阿拉布坦繼續任準噶爾(er)(er)部(bu)(bu)臺吉，準噶爾(er)(er)部(bu)(bu)又逐(zhu)漸強大起來，和清(qing)政府發生矛盾沖突。
康熙五十四年(nian)（1715年(nian)），策(ce)妄阿(a)拉(la)布坦在沙(sha)俄支持下，又發動(dong)叛亂，率兵2000人竄(cuan)入哈密北境，侵掠(lve)五寨。后見哈密戒備森嚴，無法(fa)占據，又改(gai)為竄(cuan)擾西(xi)藏。清政府得知(zhi)策(ce)妄阿(a)拉(la)布坦派兵往西(xi)藏，即令出兵圍剿。
康熙五十七年(nian)（1718年(nian)），康熙帝(di)命皇(huang)十四(si)子(zi)愛新覺(jue)羅·胤禵為撫遠大將(jiang)軍(jun)(jun)，統帥大軍(jun)(jun)，駐節西寧(ning)，指揮進藏(zang)平叛的各路清軍(jun)(jun)。康熙五十九年(nian)（1720年(nian)），清軍(jun)(jun)兩路從青海和(he)四(si)川出發，進軍(jun)(jun)西藏(zang)，大敗準(zhun)噶爾軍(jun)(jun)，大策(ce)凌敦多布狼狽而逃，率殘部逃回伊犁。
康(kang)熙帝(di)沒有能(neng)徹底平定(ding)準噶爾貴族的(de)叛(pan)亂就于康(kang)熙六(liu)十(shi)一年（1722年）去(qu)世了。他所制定(ding)的(de)政策，由他的(de)兒子(zi)雍(yong)正帝(di)、孫子(zi)乾隆(long)帝(di)繼續推(tui)行并得到貫徹。
雍正(zheng)五年（1727年），策(ce)(ce)妄阿拉(la)布坦(tan)死，其子噶(ga)爾(er)丹策(ce)(ce)零(ling)繼(ji)為(wei)準噶(ga)爾(er)領(ling)袖。他的內外政策(ce)(ce)基本上(shang)遵循其父的路(lu)(lu)線(xian)，對東邊也沒有放棄向(xiang)喀(ka)爾(er)喀(ka)擴展的意圖。雍正(zheng)七(qi)年（1729年），雍正(zheng)帝決(jue)定發兵征討，命侍衛內大(da)臣(chen)傅爾(er)丹為(wei)靖邊大(da)將軍(jun)(jun)，屯(tun)阿爾(er)奉(feng)，出師(shi)北路(lu)(lu)；命川(chuan)陜總督(du)岳鐘琪(qi)為(wei)寧遠大(da)將軍(jun)(jun)，屯(tun)巴(ba)里坤，出師(shi)西路(lu)(lu)，分進合擊。噶(ga)爾(er)丹策(ce)(ce)零(ling)聞訊驚恐，忙遣(qian)使要求清廷緩兵一年。雍正(zheng)帝恩準。在緩兵期間，準噶(ga)爾(er)出兵2萬突襲西路(lu)(lu)清軍(jun)(jun)大(da)營，清軍(jun)(jun)損(sun)失很(hen)大(da)，清政府與(yu)準噶(ga)爾(er)貴(gui)族之間的關系(xi)進一步破裂。
康熙逝世后(hou)，雍正(zheng)(zheng)繼(ji)續堅持平定(ding)準(zhun)噶(ga)爾貴族割據(ju)勢力的(de)斗(dou)爭。雍正(zheng)(zheng)五年(nian)(nian)(nian)（1727年(nian)(nian)(nian)）冬，策妄(wang)阿拉布坦死(si)，其(qi)子噶(ga)爾丹策零(ling)繼(ji)位后(hou)，在沙俄支持下，繼(ji)續進行叛(pan)亂活動。從(cong)雍正(zheng)(zheng)六(liu)年(nian)(nian)(nian)（1728年(nian)(nian)(nian)）以(yi)后(hou)，清朝多次出兵平定(ding)噶(ga)爾丹策零(ling)叛(pan)軍。雍正(zheng)(zheng)年(nian)(nian)(nian)間的(de)西征準(zhun)噶(ga)爾之(zhi)役，從(cong)雍正(zheng)(zheng)七年(nian)(nian)(nian)（1729年(nian)(nian)(nian)）起，到(dao)雍正(zheng)(zheng)十一年(nian)(nian)(nian)冬準(zhun)噶(ga)爾遣使(shi)求和止，歷時4年(nian)(nian)(nian)半，經歷了4次大的(de)戰(zhan)役，即科舍圖之(zhi)戰(zhan)、和通泊之(zhi)戰(zhan)、鄂登楚勒(le)之(zhi)戰(zhan)和光顯寺之(zhi)戰(zhan)。
雍正九年（1731年）五至六月(yue)，清(qing)朝(chao)出兵(bing)平定噶爾丹(dan)策零(ling)叛軍，噶爾丹(dan)策零(ling)派出士卒向清(qing)軍詭稱，準噶爾有一支孤軍在察罕(han)哈(ha)達(da)，引誘清(qing)軍離開(kai)科布(bu)(bu)多(duo)大(da)本營，深入到瀚(han)海之中，然(ran)后圍殲。清(qing)朝(chao)靖邊大(da)將軍傅(fu)爾丹(dan)中計，挑(tiao)選精兵(bing)萬人，沿(yan)科布(bu)(bu)多(duo)河西進，在博克(ke)托嶺、和(he)通泊等處中伏，損(sun)失慘重。七(qi)月(yue)初一日，清(qing)軍僅存2000余人退(tui)至科布(bu)(bu)多(duo)。
在和通泊之戰中大(da)敗(bai)清軍后，遣部(bu)將(jiang)大(da)、小策(ce)零(ling)敦(dun)多布(bu)率兵2.6萬東攻(gong)喀(ka)爾喀(ka)蒙(meng)古。清廷遣喀(ka)爾喀(ka)親王丹津多爾濟偕額附策(ce)凌率兵1.8萬（一說2.8萬）將(jiang)其擊敗(bai)。隨即下令于拜達(da)里(li)克河、翁金河一帶筑城(cheng)屯兵，與(yu)察罕廋爾（今蒙(meng)古國烏里(li)雅蘇臺南）大(da)營互(hu)為犄角，加強喀(ka)爾喀(ka)西(xi)部(bu)的防(fang)守(shou)。
雍(yong)正(zheng)十年(nian)(nian)（1732年(nian)(nian)）七月(yue)，噶(ga)(ga)爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)丹策(ce)(ce)零(ling)率兵(bing)3萬(wan)(wan)(wan)，自額爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)齊(qi)斯河(he)（在今新疆境(jing)）上游，取道(dao)(dao)阿(a)爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)泰山(shan)南麓，繞避察罕(han)廋(sou)爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)清軍(jun)(jun)大(da)營，潛至杭愛山(shan)厄得勒(le)河(he)（依德爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)河(he)）地(di)區，攻掠喀爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)喀首領(ling)哲(zhe)卜(bu)尊丹巴領(ling)地(di)。策(ce)(ce)凌(ling)等奉命率兵(bing)疾馳本博圖山(shan)（烏(wu)里(li)雅蘇臺(tai)東(dong)南）阻(zu)擊。八月(yue)初，準(zhun)噶(ga)(ga)爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)軍(jun)(jun)偵(zhen)知策(ce)(ce)凌(ling)西(xi)出，即突(tu)襲(xi)其塔(ta)米爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)城（今車車爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)格(ge)勒(le)西(xi)南）牧地(di)。策(ce)(ce)凌(ling)途(tu)中聞警，回(hui)師(shi)馳救，率所部2萬(wan)(wan)(wan)人(ren)（一說3萬(wan)(wan)(wan)）乘夜繞道(dao)(dao)出山(shan)背(bei)向(xiang)塔(ta)米爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)逼近，黎(li)明時(shi)督兵(bing)從山(shan)上突(tu)下，突(tu)襲(xi)準(zhun)噶(ga)(ga)爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)軍(jun)(jun)營地(di)。準(zhun)噶(ga)(ga)爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)軍(jun)(jun)人(ren)不(bu)(bu)及甲，馬不(bu)(bu)就鞍，倉皇向(xiang)東(dong)南潰逃(tao)(tao)。清軍(jun)(jun)追(zhui)至喀喇(la)森齊(qi)泊(bo)，激戰二日屢(lv)捷(jie)。繼追(zhui)至杭愛山(shan)南麓，該地(di)右阻(zu)山(shan)，左逼水(shui)，道(dao)(dao)路狹窄，光(guang)顯寺（今烏(wu)蘭巴托西(xi)部哈拉(la)和(he)林額爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)德尼(ni)昭）橫亙于(yu)中，大(da)軍(jun)(jun)不(bu)(bu)易通行。清軍(jun)(jun)趁準(zhun)噶(ga)(ga)爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)軍(jun)(jun)慌亂之際，設(she)伏(fu)兵(bing)萬(wan)(wan)(wan)余(yu)于(yu)山(shan)側，又遣(qian)一部背(bei)水(shui)列陣(zhen)，誘(you)其往攻。旋佯(yang)敗(bai)，棄甲沿(yan)河(he)而走，待準(zhun)噶(ga)(ga)爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)軍(jun)(jun)進入谷地(di)，伏(fu)兵(bing)突(tu)起沖殺(sha)(sha)。準(zhun)噶(ga)(ga)爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)軍(jun)(jun)頓時(shi)大(da)亂，被(bei)擊殺(sha)(sha)萬(wan)(wan)(wan)余(yu)人(ren)，欲渡河(he)逃(tao)(tao)生者又被(bei)對岸清軍(jun)(jun)擊于(yu)半(ban)渡，溺死甚眾(zhong)。噶(ga)(ga)爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)丹策(ce)(ce)零(ling)率殘部乘夜拼死突(tu)圍，盡棄輜重牲畜塞滿山(shan)谷，遲(chi)滯(zhi)清軍(jun)(jun)前進，自鄂爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)渾(hun)河(he)逃(tao)(tao)遁。此(ci)戰，準(zhun)噶(ga)(ga)爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)部元(yuan)氣大(da)傷。雍(yong)正(zheng)十二年(nian)(nian)（1734年(nian)(nian)），噶(ga)(ga)爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)丹策(ce)(ce)零(ling)向(xiang)清廷請和(he)罷兵(bing)，乾隆初年(nian)(nian)議和(he)告(gao)成(cheng)。
乾隆十(shi)年（1745年），噶爾丹策零死(si)去，策妄(wang)多爾濟那木扎(zha)爾繼位。
乾隆(long)十(shi)五年(nian)(nian)（1750年(nian)(nian)），策(ce)妄多爾(er)(er)濟那(nei)木扎(zha)爾(er)(er)被殺，其兄喇嘛(ma)達爾(er)(er)扎(zha)篡位。乾隆(long)十(shi)七年(nian)(nian)（1752年(nian)(nian)），沙俄派人欲收買和(he)(he)碩(shuo)特拉藏汗(han)之孫阿(a)睦爾(er)(er)撒(sa)(sa)納(na)和(he)(he)準噶爾(er)(er)部大策(ce)凌敦多布之孫達瓦齊(qi)來推翻喇嘛(ma)達爾(er)(er)札，妄圖使(shi)他們取而代之，建立傀(kui)儡(lei)政權(quan)，陰謀未能(neng)得逞，后達瓦齊(qi)和(he)(he)阿(a)睦爾(er)(er)撒(sa)(sa)納(na)叛逃(tao)至哈薩克。同年(nian)(nian)底，阿(a)睦爾(er)(er)撒(sa)(sa)納(na)唆(suo)使(shi)達瓦齊(qi)暗選精兵(bing)一千五百行，采取買通內(nei)奸和(he)(he)突然襲擊的手(shou)段，殺死喇嘛(ma)達爾(er)(er)扎(zha)，篡奪了(le)汗(han)位。乾隆(long)十(shi)九年(nian)(nian)（1754年(nian)(nian)），阿(a)睦爾(er)(er)撒(sa)(sa)納(na)被達瓦齊(qi)打(da)敗，率領2萬余人投奔清(qing)朝。清(qing)政府認為統(tong)一西北(bei)地區的條件已經成熟，決定命將出師，消滅準噶爾(er)(er)貴族割據(ju)政權(quan)。
1754年，清(qing)(qing)(qing)(qing)政(zheng)府決定(ding)(ding)分(fen)兵(bing)兩路(lu)(lu)(lu)(lu)遠征伊犁(li)，平(ping)定(ding)(ding)達(da)瓦(wa)齊割據勢力(li)。乾隆(long)二(er)十(shi)年（1755年）二(er)月，乾隆(long)調集五萬兵(bing)、十(shi)四萬匹(pi)馬，派阿睦爾(er)(er)撒(sa)納為定(ding)(ding)邊左副將(jiang)(jiang)軍(jun)、薩喇勒為定(ding)(ding)邊右副將(jiang)(jiang)軍(jun)，分(fen)兩路(lu)(lu)(lu)(lu)向準噶(ga)爾(er)(er)進攻。阿的(de)一(yi)(yi)(yi)路(lu)(lu)(lu)(lu)，由(you)(you)(you)烏里(li)雅蘇(su)臺出發，歸定(ding)(ding)北將(jiang)(jiang)軍(jun)班第節制；薩喇勒的(de)一(yi)(yi)(yi)路(lu)(lu)(lu)(lu)，由(you)(you)(you)巴(ba)里(li)坤出發，歸定(ding)(ding)西(xi)將(jiang)(jiang)軍(jun)永常節制，由(you)(you)(you)巴(ba)里(li)坤向伊犁(li)地區進發。由(you)(you)(you)于厄魯特(te)和西(xi)域各(ge)族人(ren)(ren)民(min)對準噶(ga)爾(er)(er)貴族的(de)內訌和殘暴統治十(shi)分(fen)不(bu)滿(man)，希(xi)望早日實現統一(yi)(yi)(yi)和安定(ding)(ding)局(ju)面，也由(you)(you)(you)于清(qing)(qing)(qing)(qing)朝政(zheng)府制訂和貫(guan)徹了(le)對準噶(ga)爾(er)(er)比較(jiao)穩妥的(de)政(zheng)策，因而(er)清(qing)(qing)(qing)(qing)政(zheng)府統一(yi)(yi)(yi)西(xi)北的(de)行(xing)動(dong)，受(shou)到(dao)牧民(min)和各(ge)族人(ren)(ren)民(min)的(de)支持和擁護。當清(qing)(qing)(qing)(qing)軍(jun)往征達(da)瓦(wa)齊途中，準噶(ga)爾(er)(er)部(bu)大(da)的(de)封建(jian)主有的(de)數(shu)千戶(hu)，小的(de)數(shu)百戶(hu)，都拿著(zhu)奶酪、羊馬，絡繹不(bu)絕前(qian)來迎(ying)接清(qing)(qing)(qing)(qing)軍(jun)，沒有一(yi)(yi)(yi)個抵抗清(qing)(qing)(qing)(qing)軍(jun)的(de)。達(da)瓦(wa)齊沒有料到(dao)清(qing)(qing)(qing)(qing)軍(jun)會提前(qian)行(xing)動(dong)，部(bu)下(xia)的(de)不(bu)戰而(er)降(jiang)使其陣腳大(da)亂(luan)，僅帶親信(xin)七(qi)十(shi)余人(ren)(ren)逃往天山以南投奔(ben)烏什，結果為烏什城(cheng)阿奇木(mu)伯克霍(huo)集斯擒(qin)獲送交清(qing)(qing)(qing)(qing)軍(jun)。
清(qing)(qing)(qing)(qing)廷消滅(mie)達(da)瓦齊(qi)勢(shi)力后(hou)，決(jue)定(ding)“將衛拉特分封四(si)汗(han)，賞功策(ce)勛，用獎(jiang)勞(lao)績(ji)”。封車凌為(wei)杜(du)爾(er)(er)伯特汗(han)，阿睦(mu)爾(er)(er)撒納(na)(na)為(wei)輝特汗(han)，班(ban)珠爾(er)(er)為(wei)和碩特汗(han)，噶(ga)勒藏多爾(er)(er)濟為(wei)綽羅(luo)斯汗(han)，并晉封阿睦(mu)爾(er)(er)撒納(na)(na)為(wei)雙親(qin)(qin)王，食親(qin)(qin)王雙俸。但阿睦(mu)爾(er)(er)撒納(na)(na)并不(bu)(bu)滿足。他歸(gui)附清(qing)(qing)(qing)(qing)朝，本(ben)就是一(yi)個策(ce)略，現在(zai)借(jie)清(qing)(qing)(qing)(qing)廷之(zhi)手已把(ba)自己(ji)最大的對手達(da)瓦齊(qi)勢(shi)力消滅(mie)，統(tong)治四(si)衛拉特成為(wei)他下一(yi)個目標。阿睦(mu)爾(er)(er)撒納(na)(na)在(zai)率領(ling)清(qing)(qing)(qing)(qing)軍(jun)進兵伊犁前，就通過班(ban)珠爾(er)(er)、納(na)(na)噶(ga)察等親(qin)(qin)信制造他要當四(si)部總(zong)汗(han)的輿(yu)論(lun)。達(da)瓦齊(qi)被擒后(hou)，他便(bian)以(yi)總(zong)汗(han)自居。他雖貴(gui)為(wei)清(qing)(qing)(qing)(qing)朝的親(qin)(qin)王、定(ding)邊左副將軍(jun)，但不(bu)(bu)用清(qing)(qing)(qing)(qing)纛（古代(dai)軍(jun)隊中的大旗），不(bu)(bu)穿官(guan)服，不(bu)(bu)戴清(qing)(qing)(qing)(qing)廷所授黃帶孔雀翎，不(bu)(bu)用清(qing)(qing)(qing)(qing)朝所頒(ban)官(guan)印(yin)，并啟用噶(ga)爾(er)(er)丹策(ce)零時琿臺吉(ji)菊形篆印(yin)行文各部，并“用鈐記行文，調兵九千”至布魯特、哈薩克邊境，擁兵自重。
對(dui)阿(a)睦爾(er)(er)撒(sa)(sa)納(na)的這(zhe)些行為(wei)，清廷和乾(qian)(qian)隆帝早有察覺，便(bian)指(zhi)示(shi)定北(bei)將軍(jun)(jun)班(ban)第(di)力促阿(a)睦爾(er)(er)撒(sa)(sa)納(na)早日(ri)入覲(jin)，欲在其到(dao)達內地(di)后(hou)將其剪(jian)除。詭計多端(duan)的阿(a)睦爾(er)(er)撒(sa)(sa)納(na)亦察覺到(dao)事情有變，他于八月(yue)初十日(ri)從伊犁起程入覲(jin)，一路遲(chi)延不進，窺測(ce)局勢，行至烏(wu)隆古河(he)時，阿(a)睦爾(er)(er)撒(sa)(sa)納(na)便(bian)公開(kai)反(fan)叛(pan)，并(bing)急馳至伊犁。八月(yue)二十九日(ri)，阿(a)睦爾(er)(er)撒(sa)(sa)納(na)軍(jun)(jun)包圍了班(ban)第(di)的鎮守軍(jun)(jun)，清軍(jun)(jun)只有500人(ren)，班(ban)第(di)、鄂容安兵(bing)敗自殺，薩(sa)喇爾(er)(er)被俘。面對(dui)突變的形勢，乾(qian)(qian)隆帝及(ji)時采取了一些措(cuo)施。乾(qian)(qian)隆二十年（1755年）九月(yue)，乾(qian)(qian)隆帝重封(feng)衛拉(la)特(te)(te)四部(bu)汗王，噶(ga)勒(le)藏多爾(er)(er)濟為(wei)綽羅斯汗，車凌為(wei)杜爾(er)(er)伯特(te)(te)汗，沙克(ke)都(dou)爾(er)(er)曼濟為(wei)和碩特(te)(te)汗，巴雅爾(er)(er)為(wei)輝特(te)(te)汗，臺(tai)吉(ji)3人(ren)封(feng)公，4人(ren)授扎薩(sa)克(ke)一等臺(tai)吉(ji)，7人(ren)授扎薩(sa)克(ke)，宰桑2人(ren)授內大臣(chen)，5人(ren)為(wei)散秩大臣(chen)。這(zhe)一措(cuo)施旨在穩定衛拉(la)特(te)(te)貴(gui)族之心，解除后(hou)顧之憂。隨即令(ling)策楞為(wei)定西將軍(jun)(jun)、達爾(er)(er)黨阿(a)為(wei)定邊左(zuo)副將軍(jun)(jun)、扎拉(la)豐阿(a)為(wei)定邊右副將軍(jun)(jun)，組織第(di)二次(ci)遠征伊犁。
乾隆二(er)十一(yi)年(nian)（1756年(nian)）二(er)月(yue)，西路軍(jun)由策楞、玉保統率，北路軍(jun)由哈(ha)達哈(ha)等統率，向伊犁進發。阿(a)睦爾(er)(er)(er)(er)撒(sa)納(na)反叛(pan)后，并(bing)沒(mei)有出(chu)現如他(ta)所預期(qi)的(de)紛起(qi)響應反清的(de)局面。許(xu)多首(shou)領反叛(pan)不(bu)久(jiu)就(jiu)倒戈(ge)相向，與(yu)阿(a)睦爾(er)(er)(er)(er)撒(sa)納(na)為(wei)(wei)敵(di)。準噶(ga)爾(er)(er)(er)(er)部再次陷入混戰之中(zhong)。阿(a)睦爾(er)(er)(er)(er)撒(sa)納(na)面對清廷大軍(jun)壓(ya)境(jing)，無(wu)法組織有效抵(di)抗。為(wei)(wei)緩兵計(ji)，他(ta)曾兩次偽(wei)裝投誠，并(bing)取得清軍(jun)信任，停(ting)止對他(ta)的(de)追(zhui)剿(jiao)，贏得了喘(chuan)息(xi)時間(jian)，卻使清軍(jun)在近(jin)一(yi)年(nian)的(de)追(zhui)剿(jiao)中(zhong)無(wu)所進展。乾隆二(er)十二(er)年(nian)（1757年(nian)）二(er)月(yue)，清廷調整(zheng)統帥，決心全殲阿(a)睦爾(er)(er)(er)(er)撒(sa)納(na)。命成袞扎布為(wei)(wei)定邊將軍(jun)，兆(zhao)惠為(wei)(wei)定邊右副將軍(jun)，車布登扎布為(wei)(wei)定邊左副將軍(jun)，調集滿洲(zhou)、索倫、蒙古、察哈(ha)爾(er)(er)(er)(er)、吉(ji)林等地兵馬，兵分兩路，再次征伐準噶(ga)爾(er)(er)(er)(er)。
此(ci)時(shi)(shi)，準噶(ga)爾(er)(er)(er)(er)內叛亂(luan)的(de)(de)諸臺(tai)吉、宰桑等，內訌不(bu)已(yi)，加(jia)之部落內瘟疫流(liu)行(xing)，人(ren)畜大量死(si)亡(wang)。六月，清軍幾乎(hu)兵(bing)不(bu)血刃順利抵達伊犁。阿(a)(a)睦(mu)(mu)(mu)爾(er)(er)(er)(er)撒(sa)納(na)再(zai)次逃入哈(ha)薩克阿(a)(a)布賚汗處。當時(shi)(shi)，阿(a)(a)布賚懾于(yu)清廷(ting)的(de)(de)威力，恐招致清軍的(de)(de)攻擊，就遣使向(xiang)清廷(ting)表示愿將(jiang)(jiang)阿(a)(a)睦(mu)(mu)(mu)爾(er)(er)(er)(er)撒(sa)納(na)擒獻清廷(ting)。此(ci)舉(ju)被阿(a)(a)睦(mu)(mu)(mu)爾(er)(er)(er)(er)撒(sa)納(na)覺察，乘夜帶妻(qi)子親隨(sui)8人(ren)，盜馬沿額爾(er)(er)(er)(er)齊斯河投(tou)奔俄(e)(e)國(guo)。沙(sha)(sha)俄(e)(e)一直在密(mi)切關注著(zhu)準噶(ga)爾(er)(er)(er)(er)的(de)(de)形勢，并(bing)屢屢向(xiang)阿(a)(a)睦(mu)(mu)(mu)爾(er)(er)(er)(er)撒(sa)納(na)表示歡迎其(qi)投(tou)誠，故阿(a)(a)睦(mu)(mu)(mu)爾(er)(er)(er)(er)撒(sa)納(na)投(tou)奔俄(e)(e)國(guo)絕不(bu)偶然。乾隆(long)二(er)(er)十二(er)(er)年(nian)(nian)（1757年(nian)(nian)）九(jiu)月，阿(a)(a)睦(mu)(mu)(mu)爾(er)(er)(er)(er)撒(sa)納(na)染上天花病死(si)，時(shi)(shi)年(nian)(nian)35歲。當阿(a)(a)睦(mu)(mu)(mu)爾(er)(er)(er)(er)撒(sa)納(na)逃往沙(sha)(sha)俄(e)(e)時(shi)(shi)，乾隆(long)帝即命理藩院行(xing)文沙(sha)(sha)俄(e)(e)外交部進行(xing)交涉，要求其(qi)按兩國(guo)商(shang)定的(de)(de)彼此(ci)不(bu)納(na)逃人(ren)的(de)(de)協議，交出(chu)阿(a)(a)睦(mu)(mu)(mu)爾(er)(er)(er)(er)撒(sa)納(na)。沙(sha)(sha)俄(e)(e)則推延不(bu)交。直到阿(a)(a)睦(mu)(mu)(mu)爾(er)(er)(er)(er)撒(sa)納(na)死(si)后(hou)，沙(sha)(sha)俄(e)(e)才(cai)將(jiang)(jiang)其(qi)尸交給清朝。
1759年8月，清軍(jun)抵達喀什噶(ga)爾(er)，平定(ding)了支(zhi)持阿睦(mu)爾(er)撒納作亂的(de)大(da)和(he)卓波羅尼都和(he)小和(he)卓霍集(ji)占兄(xiong)弟的(de)叛(pan)亂。這年秋天(tian)(tian)，天(tian)(tian)山南路完全平定(ding)，結束了西北地區長期以來的(de)分裂局面。
清軍(jun)(jun)(jun)平(ping)定(ding)準(zhun)噶爾貴族(zu)的(de)叛亂(luan)，維護(hu)祖國統一(yi)、反對(dui)民族(zu)分(fen)裂。鞏固了清朝對(dui)西北(bei)邊疆(jiang)地區(qu)(qu)的(de)統治(zhi)，打擊(ji)了沙皇俄(e)國的(de)侵略勢(shi)力。清軍(jun)(jun)(jun)粉(fen)碎(sui)噶爾丹(dan)的(de)分(fen)裂企圖，驅逐入藏的(de)準(zhun)軍(jun)(jun)(jun)，平(ping)定(ding)青海羅卜藏丹(dan)津的(de)叛亂(luan)，粉(fen)碎(sui)達(da)瓦齊(qi)、阿睦爾撒納的(de)叛亂(luan)活動(dong)，將(jiang)(jiang)北(bei)疆(jiang)地區(qu)(qu)納入中國版圖。乾隆皇帝把這片失而復得的(de)疆(jiang)域命(ming)名為“新疆(jiang)”，立碑紀念(nian)。乾隆二十六年(nian)(nian)（1761年(nian)(nian)）至四十四年(nian)(nian)（1779年(nian)(nian)），清政府設(she)立最高(gao)行政、軍(jun)(jun)(jun)事(shi)長官伊(yi)犁將(jiang)(jiang)軍(jun)(jun)(jun)，修建“伊(yi)犁九城”。其中保存完(wan)好的(de)惠遠城曾經是(shi)伊(yi)犁的(de)政治(zhi)、軍(jun)(jun)(jun)事(shi)中心伊(yi)犁將(jiang)(jiang)軍(jun)(jun)(jun)府所在地，總管天山南(nan)北(bei)、巴爾喀(ka)什(shen)湖以東(dong)以南(nan)地區(qu)(qu)的(de)軍(jun)(jun)(jun)政事(shi)務。
清(qing)(qing)軍之所(suo)以取勝，首先，清(qing)(qing)軍進行(xing)的是維護祖國(guo)統一、反對(dui)準部(bu)貴(gui)族分裂叛(pan)亂的正義戰(zhan)爭，因而得到各族人民支持。其次，清(qing)(qing)廷剿撫(fu)并用的策略(lve)運用的比較成功。第三，清(qing)(qing)廷此時(shi)內部(bu)穩定，國(guo)力(li)強(qiang)盛，軍隊紀律嚴(yan)明，戰(zhan)斗力(li)較強(qiang)。第四，在戰(zhan)爭指(zhi)導(dao)上，能依據客觀情況(kuang)，制(zhi)定出切(qie)合時(shi)宜的作(zuo)戰(zhan)方針；針對(dui)作(zuo)戰(zhan)地區地理條件(jian)的特點，認(ren)真(zhen)作(zuo)好戰(zhan)爭準備(bei)，注意發(fa)揮騎兵快速機(ji)動作(zuo)戰(zhan)的能力(li)和發(fa)揮火器(qi)部(bu)隊的作(zuo)用。
清軍(jun)平定(ding)叛(pan)(pan)亂(luan)的(de)(de)(de)(de)戰爭所以延續70年之久，除了沙俄極力插手和支持叛(pan)(pan)亂(luan)者以及民族(zu)關系等原因，增加了戰爭的(de)(de)(de)(de)復雜性外，清軍(jun)在(zai)(zai)作(zuo)戰指導上的(de)(de)(de)(de)一些失誤也是重要原因。而準部貴族(zu)在(zai)(zai)沙俄支持下掀起的(de)(de)(de)(de)民族(zu)分裂叛(pan)(pan)亂(luan)戰爭，是違背(bei)各族(zu)人(ren)民利益的(de)(de)(de)(de)不義(yi)之戰，必(bi)然遭到各族(zu)人(ren)民的(de)(de)(de)(de)強烈反對(dui)，政(zheng)治(zhi)(zhi)上的(de)(de)(de)(de)不得人(ren)心(xin)，及其統(tong)治(zhi)(zhi)集團內部的(de)(de)(de)(de)爭權奪(duo)利和軍(jun)事(shi)上存在(zai)(zai)許多不可克服的(de)(de)(de)(de)致命(ming)弱(ruo)點，決(jue)定(ding)了其失敗(bai)是必(bi)不可免的(de)(de)(de)(de)。
白壽(shou)彝：清(qing)廷(ting)為了(le)(le)平(ping)定準部，不(bu)斷用兵西北，耗費了(le)(le)大(da)量人力和物力，增加了(le)(le)人民(min)的(de)負(fu)擔，但對準噶爾部的(de)平(ping)定，有利于(yu)多民(min)族國(guo)家的(de)統一，鞏固了(le)(le)清(qing)朝政府對西北邊疆地區的(de)統治，打擊了(le)(le)沙皇俄國(guo)的(de)侵略(lve)勢力。
呂(lv)思勉(mian)：清朝的武功(gong)，以(yi)此(ci)時(shi)為極盛。天山南(nan)北路既定，蔥嶺以(yi)西(xi)之(zhi)國，敖罕(han)、哈薩克、布魯特、乾竺特、博羅(luo)爾、巴達克山、布哈爾、阿富汗等，都朝貢于清，仿佛唐朝盛時(shi)的規模。
閻(yan)崇年：乾隆平準定(ding)回諸(zhu)役，統(tong)一了(le)準、回各部，加強(qiang)了(le)中央政(zheng)府對西(xi)(xi)域的統(tong)轄，鏟除了(le)準噶爾東犯(fan)喀爾喀、威脅京師及大(da)西(xi)(xi)北(bei)的禍根，保持了(le)西(xi)(xi)北(bei)、漠北(bei)及青海、西(xi)(xi)藏的社會(hui)安(an)定(ding)。
清政府平定(ding)準噶(ga)爾貴(gui)族叛亂，消(xiao)除了(le)西部邊(bian)疆(jiang)的(de)分(fen)裂(lie)割據狀況，加(jia)強(qiang)了(le)對西部邊(bian)疆(jiang)地(di)區的(de)管理，進一步促進了(le)全國的(de)統(tong)一。平叛之后，廢除了(le)準噶(ga)爾游牧(mu)封建貴(gui)族所實行的(de)農奴制統(tong)治(zhi)，促進了(le)西部邊(bian)疆(jiang)地(di)區社會經濟的(de)發展。清廷(ting)在(zai)平定(ding)天山北(bei)路準噶(ga)爾部和天山南路的(de)“回部”之后，隨即采取一系列措施，加(jia)強(qiang)清廷(ting)對新疆(jiang)的(de)統(tong)治(zhi)。
清朝強化了新疆(jiang)地方(fang)的(de)(de)統(tong)(tong)治機(ji)構，乾隆二十(shi)七年（1762年）設(she)置“總統(tong)(tong)新疆(jiang)南北(bei)兩路事務”的(de)(de)伊犁將軍，駐扎伊犁，統(tong)(tong)轄(xia)全疆(jiang)軍政(zheng)事務。然(ran)后在新疆(jiang)北(bei)路設(she)置烏(wu)魯(lu)木(mu)齊都統(tong)(tong)和(he)(he)塔爾巴(ba)哈臺參贊(zan)(zan)大臣，管轄(xia)烏(wu)魯(lu)木(mu)齊、巴(ba)里坤(kun)(kun)、吐魯(lu)番、塔城(cheng)諸處(chu)軍政(zheng)；又在新疆(jiang)南路設(she)置喀(ka)什(shen)噶爾參贊(zan)(zan)大臣，下轄(xia)葉爾羌、和(he)(he)闐、英吉沙爾、烏(wu)什(shen)、阿克蘇、辟展(zhan)、巴(ba)里坤(kun)(kun)、哈密等處(chu)的(de)(de)辦事大臣，以及吐魯(lu)番的(de)(de)領隊大臣。對(dui)于(yu)天(tian)山南路的(de)(de)“回部”維(wei)吾爾族聚居區，仍(reng)承襲原有(you)的(de)(de)伯克制，各城(cheng)仍(reng)設(she)阿奇(qi)木(mu)伯克（即正城(cheng)主）和(he)(he)伊什(shen)罕(han)伯克（即副城(cheng)主），但(dan)均由參贊(zan)(zan)大臣奏請皇帝(di)簡放，品(pin)級自三品(pin)至七品(pin)不(bu)等，管理當地的(de)(de)回城(cheng)民政(zheng)事務。
為了發(fa)(fa)展新(xin)疆(jiang)經(jing)濟和(he)加強對新(xin)疆(jiang)地(di)區(qu)的(de)統治，清廷在(zai)新(xin)疆(jiang)各(ge)地(di)大(da)力開展屯田。東(dong)起巴里坤，西(xi)至伊(yi)犁河，廣(guang)泛(fan)墾(ken)田開荒。早在(zai)康熙、雍正(zheng)年(nian)(nian)間用兵準(zhun)噶爾時，即于(yu)新(xin)疆(jiang)屯田，乾(qian)隆年(nian)(nian)間，屯田范圍(wei)日廣(guang)。據不完全統計，乾(qian)隆三十(shi)一年(nian)(nian)（1766年(nian)(nian)）僅新(xin)疆(jiang)綠營軍的(de)營屯畝(mu)數(shu)已達179290畝(mu)；到乾(qian)隆四十(shi)年(nian)(nian)（1775年(nian)(nian)）時，僅新(xin)疆(jiang)募民屯墾(ken)的(de)戶屯畝(mu)數(shu)已達280253畝(mu)。在(zai)大(da)興屯田的(de)同(tong)時，為了繁榮工商業，清廷在(zai)阿克蘇設鑄錢(qian)局，鑄造“乾(qian)隆通寶(bao)”銅(tong)幣，發(fa)(fa)行新(xin)疆(jiang)各(ge)地(di)。
新疆地處西(xi)部邊陲，交通不便，為了(le)及時傳遞(di)消息，清廷在天山南北主(zhu)要交通線普遍(bian)設立“軍臺(tai)”。
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