深圳市中醫院始建于1975年，包含光明院區、福田院區、針灸分院和科教中心“一院四區”，下屬機構有深圳市中醫藥研究所、深圳市國際中醫藥人才培訓中心、深圳市中藥制劑中心。醫院已成為集醫療、教學、科研、預防、保健、康復為一體的大型綜合性三級甲等中醫醫院，是深圳市中醫醫療聯盟、深圳治未病聯盟、深圳市中醫男科醫療技術專業聯盟、粵港澳大灣區中醫藥臨床傳承創新研究中心抗痛風聯盟、深圳市中醫護理區域聯盟牽頭單位。

北京中醫藥大學深圳醫院（深圳市龍崗區中醫院）是一所集醫療、教學、科研、預防保健、康復、社區服務為一體的三級甲等中醫醫院。醫院是北京中醫藥大學第五臨床醫學院，作為“中華中醫藥學會海峽兩岸暨港澳地區中醫藥國際交流中心”和“珠三角中醫院發展創新聯盟”的掛靠單位，擁有首家館藏罕見中醫藥標本的深圳中醫藥博物館，正在積極創建“全國中醫藥健康旅游示范區”。

深圳市寶安區中醫院（深圳市第三中醫院）始建于1988年。醫院經過二十多年的建設與發展，各項工作取得了長足的進步。現已成為集醫療、預防、保健、教學、科研為一體的國家三級甲等中醫醫院、廣東省中醫名院、廣州中醫藥大學非直屬附屬醫院、廣州中醫藥大學研究生培養基地、廣東省中醫藥文化養生旅游示范基地、廣東省百家文明醫院、深圳市社會保險定點醫療機構信用等級AAA單位、全國中醫醫院中醫藥文化建設試點單位、全國治未病預防保健服務試點單位和廣東省中醫治未病試點單位。

深圳平樂骨傷科醫院是一所集醫療、教學、科研、康復和保健于一體的三級甲等中醫骨傷科專科醫院，為廣州中醫藥大學非直屬附屬醫院，南方醫科大學教學醫院，河南中醫學院教學醫院，中華醫學會疼痛學分會臨床培訓定點醫院，中國中西醫結合學會頸肩腰腿痛培訓基地，廣東省中西醫結合學會骨科微創專業委員會主委單位、廣東省中醫藥學會疼痛專業委員會主委單位、深圳市中西醫結合學會疼痛專業委員會主委單位。醫院主要技術“平樂郭氏正骨醫術”是我國中醫正骨四大流派之一，先后被深圳市、廣東省、國家文化部列入非物質文化遺產保護項目。

深圳市羅湖區中醫院是羅湖區衛生與人口計劃生育局主管的二級甲等中醫醫院，是一所集醫療、教學、科研、康復、預防保健、治未病于一體的綜合性中醫醫院。醫院前身為1959年成立的“附城醫院”，1986年更名為“羅湖區第二人民醫院”，1991年正式易名為“深圳市羅湖區中醫院”。醫院經過歷代人的不懈努力，醫院事業不斷發展：1998年成為深圳特區首家“二級甲等中醫醫院”，而后成為“廣州中醫藥大學實習醫院”，羅湖公立醫院集團成員。

廣州中醫藥大學深圳醫院（福田區中醫院）坐落在深圳市中心城區，著名的蓮花山腳下。是一所設備先進、功能齊全、特色突出的公立三級甲等中醫醫院、廣州中醫藥大學直屬附屬醫院、深圳市中醫治未病及中醫適宜技術推廣基地，也是全國首家五星級中醫院。目前占地面積17500㎡，建筑面積111586㎡，開放病床數800余張。目前醫院已經進入跨越式發展的新階段，通過體制機制創新加強與國內高水平院校進行全方位合作，全力打造一所中醫特色鮮明、綜合實力領先的高水平大學附屬醫院和臨床醫學院。