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基因芯片是什么 基因芯片檢測技術的原理和特點

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摘要:基因芯片又稱生物芯片或DNA芯片,它們起源于DNA雜交探針技術與半導體工業技術相結合的結晶。該技術系指將大量探針分子固定于支持物上后與帶熒光標記的DNA或其他樣品分子(例如蛋白,因子或小分子)進行雜交,通過檢測每個探針分子的雜交信號強度進而獲取樣品分子的數量和序列信息。下面小編就介紹一下基因芯片的原理與特點。

一、基因芯片是什么

通(tong)過微加(jia)工技術 ,將數以(yi)萬計(ji)、乃(nai)至百萬計(ji)的特定序列的DNA片(pian)段(基因探(tan)針),有規律(lv)地排列(lie)固定(ding)于(yu)2cm2 的(de)硅(gui)片、玻片 等(deng)支持(chi)物上,構成(cheng)的(de)一個二維DNA探針陣列,與計算機的電(dian)子芯(xin)片十(shi)分相似,所以被稱為基因芯(xin)片。

基因芯片的(de)(de)(de)測(ce)序(xu)(xu)(xu)原理是雜交測(ce)序(xu)(xu)(xu)方法,即通過與一組(zu)已(yi)知序(xu)(xu)(xu)列的(de)(de)(de)核(he)酸探針(zhen)(zhen)雜交進行核(he)酸序(xu)(xu)(xu)列測(ce)定的(de)(de)(de)方法,在一塊基片表面固定了序(xu)(xu)(xu)列已(yi)知的(de)(de)(de)靶核(he)苷酸的(de)(de)(de)探針(zhen)(zhen)。當溶液中帶(dai)有熒光標記的(de)(de)(de)核(he)酸序(xu)(xu)(xu)列TATGCAATCTAG,與基因芯片上對應(ying)位置的(de)核(he)酸(suan)探針(zhen)(zhen)(zhen)產生互補匹配時(shi),通(tong)過確(que)定熒(ying)光強(qiang)度最(zui)強(qiang)的(de)探針(zhen)(zhen)(zhen)位置,獲(huo)得一組序(xu)列(lie)完全互補的(de)探針(zhen)(zhen)(zhen)序(xu)列(lie)。據此可(ke)重組出靶核(he)酸(suan)的(de)序(xu)列(lie)。

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二、基因芯片技術原理

1DNA探(tan)針的大量收集和純化,基因(yin)芯片(pian)探(tan)針制(zhi)備方法(fa)可以是根據(ju)基因(yin)設計特(te)異性的PCR引物,對基因進行特異(yi)性地(di)擴張(zhang),也可以是建(jian)立均一化的DNA文庫(ku),通過克隆鑒(jian)定、篩選、擴增產生;

2、將(jiang)純化(hua)后的(de)(de)探針固定(ding)在(zai)片(pian)(pian)基(ji)上,首先(xian)要將(jiang)基(ji)片(pian)(pian)(主要用的(de)(de)是(shi)玻(bo)璃(li)片(pian)(pian))進(jin)行特殊(shu)的(de)(de)化(hua)學處理,使玻(bo)璃(li)片(pian)(pian)醛基(ji)化(hua)或(huo)氨基(ji)化(hua),然后將(jiang)純化(hua)的(de)(de)探針通過顯微(wei)打(da)印或(huo)噴打(da)在(zai)基(ji)片(pian)(pian)上,再將(jiang)打(da)印好(hao)的(de)(de)玻(bo)璃(li)片(pian)(pian)進(jin)行后處理,如水(shui)合化(hua)、加熱或(huo)紫外交聯等;

3、樣品的(de)標記,標記的(de)方(fang)法(fa)(fa)(fa)一般是采用逆轉(zhuan)錄法(fa)(fa)(fa)或隨機引物延伸法(fa)(fa)(fa)等;

4、雜交后芯片的掃描、圖像處理的采(cai)集(ji)和數據分析。

、基因芯片的特點

1、高通量(liang)、多參數同步(bu)分析

目前基因芯片制作工藝(yi)可達到在1cm2的載體平面(mian)上固定(ding)數(shu)萬至(zhi)數(shu)十萬的探針,可對樣品中(zhong)數(shu)量巨大的相(xiang)關基因(yin),甚至(zhi)整個(ge)基因(yin)組(zu)及(ji)信息進行同步檢測和分析(xi)。

2、快速全自動分(fen)析

在一定的條件下使樣品(pin)中的靶(ba)基因片段同時與(yu)芯片的多個(ge)探針進行雜交,并采用(yong)掃描儀器測量(liang)雜交信號和(he)分析處理(li)數據。從而(er),從根本(ben)上提(ti)高了測量(liang)工作的速度和(he)效(xiao)率,也(ye)極大(da)降(jiang)低了測量(liang)工作的強度和(he)難度。

3、高精確度分析(xi)

由于芯(xin)片上的每(mei)一點,即(ji)每(mei)個(ge)(ge)探(tan)針都可以(yi)(yi)精(jing)確(que)(que)定位和選址,加上每(mei)個(ge)(ge)探(tan)針都可以(yi)(yi)精(jing)確(que)(que)設計及(ji)制(zhi)備,因(yin)此可以(yi)(yi)精(jing)確(que)(que)檢測出(chu)不同的靶基(ji)因(yin)、同一靶基(ji)因(yin)不同的狀態以(yi)(yi)及(ji)在(zai)一個(ge)(ge)堿(jian)基(ji)上的差別(bie)。

4、高精密度分析

商品(pin)化芯片制作(zuo)上的精密(mi)及檢(jian)測試劑和(he)方法上的統(tong)一在一定程度上保證了(le)芯片檢(jian)測的高(gao)精密(mi)度和(he)重現性,使不(bu)同批次乃(nai)至不(bu)同實驗室之間的檢(jian)測結果,可以進行有效比對及分(fen)析。

5、高(gao)靈敏度分析

基因(yin)(yin)芯片選用(yong)了(le)不易產生擴(kuo)散(san)作(zuo)用(yong)的載體,探(tan)針及樣品(pin)靶基因(yin)(yin)的的雜交(jiao)(jiao)點非(fei)常集(ji)中,加上雜交(jiao)(jiao)前樣品(pin)靶基因(yin)(yin)的擴(kuo)增和雜交(jiao)(jiao)后檢測(ce)信號(hao)的擴(kuo)張,極大(da)地(di)提高了(le)檢測(ce)的靈敏(min)度,可(ke)以檢測(ce)出(chu)1個(ge)細胞中低至(zhi)1個拷貝的靶基因,從而使檢測所需的樣(yang)品量大(da)幅(fu)度減少(shao),一般只需要1020μL樣品。

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