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基因芯片是什么 基因芯片檢測技術的原理和特點

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摘要:基因芯片又稱生物芯片或DNA芯片,它們起源于DNA雜交探針技術與半導體工業技術相結合的結晶。該技術系指將大量探針分子固定于支持物上后與帶熒光標記的DNA或其他樣品分子(例如蛋白,因子或小分子)進行雜交,通過檢測每個探針分子的雜交信號強度進而獲取樣品分子的數量和序列信息。下面小編就介紹一下基因芯片的原理與特點。

一、基因芯片是什么

通過(guo)微(wei)加工技術 ,將數以(yi)萬(wan)計、乃(nai)至百萬(wan)計的(de)特定序列的(de)DNA片段(基(ji)因探針),有(you)規律地排列固定于2cm2 的硅片、玻片 等支持物上(shang),構(gou)成的一個二(er)維(wei)DNA探針(zhen)陣列,與計算機(ji)的電子(zi)芯(xin)片十分(fen)相似(si),所(suo)以被稱(cheng)為基(ji)因(yin)芯(xin)片。

基因芯片的(de)(de)(de)測(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu)(xu)原(yuan)理是雜(za)交測(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu)(xu)方法,即通(tong)過與一組已知序(xu)(xu)(xu)(xu)列的(de)(de)(de)核(he)酸(suan)(suan)探針雜(za)交進行核(he)酸(suan)(suan)序(xu)(xu)(xu)(xu)列測(ce)(ce)定的(de)(de)(de)方法,在(zai)一塊基片表面固(gu)定了序(xu)(xu)(xu)(xu)列已知的(de)(de)(de)靶核(he)苷酸(suan)(suan)的(de)(de)(de)探針。當溶(rong)液中帶(dai)有熒光(guang)標(biao)記的(de)(de)(de)核(he)酸(suan)(suan)序(xu)(xu)(xu)(xu)列TATGCAATCTAG,與基因(yin)芯(xin)片上對應位置的(de)(de)核(he)酸探針產生互補匹配(pei)時,通過確(que)定熒光強(qiang)度最強(qiang)的(de)(de)探針位置,獲(huo)得一組(zu)序列完(wan)全互補的(de)(de)探針序列。據此可重組(zu)出靶(ba)核(he)酸的(de)(de)序列。

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二、基因芯片技術原理

1DNA探(tan)針的(de)大量收集和純化,基因芯(xin)片探(tan)針制備方法可以是根據基因設計特異性的(de)PCR引(yin)物(wu),對(dui)基(ji)因進行(xing)特異(yi)性地擴張,也可以是建立均一化的DNA文庫,通過克隆(long)鑒定、篩選、擴增產生;

2、將(jiang)純化(hua)(hua)(hua)后的(de)(de)探針固(gu)定在片基上,首先要將(jiang)基片(主要用的(de)(de)是玻璃片)進(jin)行(xing)特殊的(de)(de)化(hua)(hua)(hua)學(xue)處理,使玻璃片醛基化(hua)(hua)(hua)或(huo)氨基化(hua)(hua)(hua),然后將(jiang)純化(hua)(hua)(hua)的(de)(de)探針通(tong)過顯微(wei)打(da)印或(huo)噴打(da)在基片上,再將(jiang)打(da)印好(hao)的(de)(de)玻璃片進(jin)行(xing)后處理,如水合化(hua)(hua)(hua)、加(jia)熱或(huo)紫外交聯等(deng);

3、樣品(pin)的(de)標記,標記的(de)方法一(yi)般(ban)是采用逆轉錄(lu)法或隨機引物延伸法等;

4、雜交后芯片(pian)的掃(sao)描、圖像處理的采集和數據(ju)分析。

、基因芯片的特點

1、高通量、多參(can)數同步分析

目(mu)前基(ji)因芯片制作工(gong)藝可達到在1cm2的(de)載(zai)體平面上固(gu)定數(shu)萬(wan)至數(shu)十(shi)萬(wan)的(de)探針,可對樣(yang)品中數(shu)量巨大的(de)相關(guan)基因,甚至整個基因組(zu)及信息進行(xing)同步(bu)檢測和分析。

2、快速全自動分(fen)析

在一定的條件下使樣品中的靶基因片段(duan)同時與芯片的多(duo)個(ge)探針進行雜交(jiao),并采用(yong)掃描儀器測量(liang)雜交(jiao)信號(hao)和(he)(he)分(fen)析處(chu)理數據。從(cong)而,從(cong)根本上提高了測量(liang)工作的速度(du)和(he)(he)效率,也極大(da)降(jiang)低(di)了測量(liang)工作的強度(du)和(he)(he)難度(du)。

3、高精(jing)確度分析(xi)

由于芯(xin)片上(shang)的(de)每(mei)一點,即每(mei)個(ge)探針都(dou)(dou)可以(yi)精確(que)定(ding)位和選址,加上(shang)每(mei)個(ge)探針都(dou)(dou)可以(yi)精確(que)設計(ji)及(ji)制備,因此可以(yi)精確(que)檢測出不(bu)同的(de)靶(ba)(ba)基(ji)因、同一靶(ba)(ba)基(ji)因不(bu)同的(de)狀態以(yi)及(ji)在一個(ge)堿(jian)基(ji)上(shang)的(de)差別。

4、高(gao)精密度分析

商品化芯(xin)片制作上的精密及檢(jian)測(ce)(ce)試劑和方法上的統一在一定程度(du)上保(bao)證了(le)芯(xin)片檢(jian)測(ce)(ce)的高(gao)精密度(du)和重(zhong)現性(xing),使(shi)不同(tong)批(pi)次乃至不同(tong)實驗室(shi)之間的檢(jian)測(ce)(ce)結(jie)果,可以進行有效比對及分析。

5、高(gao)靈敏度分析

基因芯片選用(yong)了不易產(chan)生擴散作用(yong)的(de)載體,探針及(ji)樣品(pin)靶基因的(de)的(de)雜交(jiao)點非常集中,加(jia)上雜交(jiao)前樣品(pin)靶基因的(de)擴增和雜交(jiao)后檢測信號的(de)擴張,極大地提高了檢測的(de)靈(ling)敏度,可(ke)以(yi)檢測出(chu)1個細胞(bao)中(zhong)低(di)至1個拷貝的靶基因(yin),從而使檢測所需的樣品量大幅度(du)減(jian)少,一般(ban)只需要1020μL樣品(pin)。

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