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五源(yuan)河(he)濕(shi)地(di)地(di)理位(wei)置優越，水(shui)資源(yuan)充(chong)足，森林茂盛(sheng)，鳥(niao)類(lei)有著優越的(de)生存空間。但由于種(zhong)類(lei)和(he)數量季(ji)節(jie)性變(bian)化大(da)，冬季(ji)境內均(jun)呈現出鳥(niao)類(lei)種(zhong)類(lei)和(he)數量的(de)高峰(feng)期(qi)。這與這里的(de)河(he)流濕(shi)地(di)、湖泊(bo)、淡水(shui)泉以及水(shui)稻田等(deng)濕(shi)地(di)類(lei)型豐富有直接關系。此(ci)外，濕(shi)地(di)苦楝樹、小葉榕等(deng)，喬(qiao)木和(he)灌叢也較(jiao)為稠密(mi)，適于小型猛禽(qin)、攀(pan)禽(qin)、鳴(ming)禽(qin)棲息和(he)繁殖。
濕地內(nei)的(de)(de)山雀(que)科(ke)、杜鵑科(ke)等10余(yu)科(ke)鳥(niao)類(lei)(lei)(lei)大多(duo)數是(shi)食蟲鳥(niao)，占(zhan)鳥(niao)類(lei)(lei)(lei)較大的(de)(de)比(bi)例；鷹科(ke)、隼科(ke)的(de)(de)7種(zhong)鳥(niao)類(lei)(lei)(lei)都是(shi)食肉(rou)鳥(niao)；以植物(wu)種(zhong)子(zi)為主食的(de)(de)雀(que)科(ke)等鳥(niao)類(lei)(lei)(lei)盡(jin)管比(bi)例較少，且(qie)體型小，但(dan)數量(liang)(liang)龐大，繁(fan)殖量(liang)(liang)高。此外，還(huan)有一些以植物(wu)種(zhong)子(zi)和果實(shi)為食的(de)(de)鳥(niao)類(lei)(lei)(lei)，在自然界的(de)(de)自然更新中也扮(ban)演著傳(chuan)播種(zhong)子(zi)的(de)(de)角色。因此，鳥(niao)類(lei)(lei)(lei)的(de)(de)生(sheng)態學作用極其重要。
由于(yu)具有(you)(you)(you)良好的棲(qi)息場(chang)所和食物來源，五(wu)源河(he)濕地的爬(pa)行類、兩(liang)棲(qi)類和魚(yu)類也十分豐(feng)富，據調查，已在這里發現(xian)爬(pa)行動物有(you)(you)(you)4科(ke)(ke)8種，其(qi)中，壁虎科(ke)(ke)2種，鬣蜥(xi)科(ke)(ke)2種，石龍子科(ke)(ke)1種，游(you)蛇科(ke)(ke)3種。所有(you)(you)(you)爬(pa)行類均為(wei)《國家(jia)保護的有(you)(you)(you)益的或者有(you)(you)(you)重要(yao)經濟、科(ke)(ke)學研究(jiu)價值的陸生(sheng)野(ye)生(sheng)動物》物種。谷峰(feng)透露(lu)，大多數爬(pa)行類動物對人類都是有(you)(you)(you)益的，對維持濕地生(sheng)態系統的穩定(ding)有(you)(you)(you)著重要(yao)意(yi)義，且爬(pa)行類動物在食物鏈上處于(yu)重要(yao)位(wei)置，保護好爬(pa)行類至關重要(yao)。
五源(yuan)河濕(shi)地的(de)魚(yu)類發現29種(zhong)(zhong)(zhong)，其中(zhong)，鯉(li)科14種(zhong)(zhong)(zhong)，占魚(yu)類總種(zhong)(zhong)(zhong)數的(de)48.28%。此外，入(ru)海口段生(sheng)活著(zhu)多種(zhong)(zhong)(zhong)適合(he)咸(xian)水(shui)(shui)和淡水(shui)(shui)交匯環(huan)境(jing)的(de)海魚(yu)種(zhong)(zhong)(zhong)類。據(ju)了(le)解，魚(yu)類在維(wei)持濕(shi)地生(sheng)態(tai)系(xi)統平(ping)衡(heng)方面扮演著(zhu)重要的(de)角色(se)，對評價濕(shi)地生(sheng)態(tai)系(xi)統具有(you)重要的(de)指(zhi)示作用和價值。不(bu)少(shao)魚(yu)類由于對水(shui)(shui)質要求極(ji)高，故(gu)可作為水(shui)(shui)質指(zhi)示劑。此外，五源(yuan)河流域(yu)水(shui)(shui)環(huan)境(jing)差(cha)異明顯，入(ru)海口還有(you)對滲透(tou)壓(ya)變化適應的(de)魚(yu)類分布。
