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五源河濕(shi)地(di)地(di)理(li)位置優(you)越，水資源充足(zu)，森林茂盛，鳥(niao)類(lei)(lei)(lei)有著優(you)越的生存(cun)空(kong)間。但由于種(zhong)類(lei)(lei)(lei)和數量季節性變化大，冬季境內均呈現出(chu)鳥(niao)類(lei)(lei)(lei)種(zhong)類(lei)(lei)(lei)和數量的高峰(feng)期(qi)。這與這里的河流濕(shi)地(di)、湖泊、淡水泉以及水稻田等濕(shi)地(di)類(lei)(lei)(lei)型豐富(fu)有直接(jie)關系。此外，濕(shi)地(di)苦楝樹、小葉榕等，喬木和灌叢也較為稠密，適(shi)于小型猛禽(qin)、攀禽(qin)、鳴禽(qin)棲息和繁殖。

濕(shi)地(di)內的(de)山雀科、杜鵑科等10余科鳥(niao)(niao)類大多數(shu)是(shi)食蟲鳥(niao)(niao)，占鳥(niao)(niao)類較大的(de)比(bi)例；鷹科、隼科的(de)7種鳥(niao)(niao)類都是(shi)食肉(rou)鳥(niao)(niao)；以植物(wu)種子(zi)為(wei)主食的(de)雀科等鳥(niao)(niao)類盡管(guan)比(bi)例較少，且體型小，但數(shu)量龐大，繁殖量高。此(ci)外(wai)，還有一些以植物(wu)種子(zi)和果(guo)實為(wei)食的(de)鳥(niao)(niao)類，在自然界(jie)的(de)自然更(geng)新中也扮演著(zhu)傳播種子(zi)的(de)角(jiao)色。因此(ci)，鳥(niao)(niao)類的(de)生態學作用極其重要。

由于具(ju)有(you)良(liang)好的棲息場所和食物來源，五源河(he)濕(shi)(shi)地的爬(pa)(pa)行(xing)(xing)類、兩棲類和魚(yu)類也(ye)十(shi)分豐富，據調(diao)查，已在(zai)這(zhe)里(li)發現(xian)爬(pa)(pa)行(xing)(xing)動(dong)物有(you)4科(ke)8種，其中，壁虎科(ke)2種，鬣蜥(xi)科(ke)2種，石(shi)龍子科(ke)1種，游蛇科(ke)3種。所有(you)爬(pa)(pa)行(xing)(xing)類均為《國家保護的有(you)益(yi)的或者有(you)重要經濟、科(ke)學研究(jiu)價值的陸生野生動(dong)物》物種。谷峰透露，大多數爬(pa)(pa)行(xing)(xing)類動(dong)物對人(ren)類都是有(you)益(yi)的，對維持濕(shi)(shi)地生態系統的穩定有(you)著重要意義(yi)，且爬(pa)(pa)行(xing)(xing)類動(dong)物在(zai)食物鏈上處(chu)于重要位置，保護好爬(pa)(pa)行(xing)(xing)類至(zhi)關重要。

五源(yuan)河(he)濕(shi)地的魚類發現29種(zhong)，其(qi)中，鯉(li)科14種(zhong)，占魚類總種(zhong)數的48.28%。此外，入(ru)海(hai)口(kou)(kou)段生活著(zhu)多種(zhong)適合咸水和淡水交匯環(huan)境的海(hai)魚種(zhong)類。據(ju)了解，魚類在維持濕(shi)地生態系統平衡方面扮(ban)演(yan)著(zhu)重(zhong)要(yao)(yao)的角色，對(dui)評價(jia)濕(shi)地生態系統具(ju)有(you)重(zhong)要(yao)(yao)的指示作用(yong)和價(jia)值。不少魚類由于(yu)對(dui)水質要(yao)(yao)求極高，故可作為水質指示劑。此外，五源(yuan)河(he)流域(yu)水環(huan)境差異明顯，入(ru)海(hai)口(kou)(kou)還有(you)對(dui)滲透壓變化適應的魚類分布。