十八世紀前期(qi)的(de)(de)(de)尼泊(bo)爾(er)分(fen)為(wei)數十個互(hu)不統屬的(de)(de)(de)部族(zu)。居住在加(jia)德(de)(de)滿(man)(man)都(dou)谷地(di)的(de)(de)(de)陽布(bu)(bu)（今加(jia)德(de)(de)滿(man)(man)都(dou)）、廓庫穆（巴德(de)(de)崗(gang)）、葉楞（帕坦）三(san)部落于雍正年(nian)間入貢中國(guo)，清(qing)人依(yi)藏語讀音稱之為(wei)巴勒布(bu)(bu)。十八世紀后期(qi)，居于巴勒布(bu)(bu)西北(bei)的(de)(de)(de)廓爾(er)喀部族(zu)興起。廓爾(er)喀人在沙阿王朝的(de)(de)(de)普(pu)利(li)特維·納拉揚·沙阿（清(qing)朝譯作“博納喇赤”）統治時期(qi)，趁巴勒布(bu)(bu)內亂(luan)，“漸次將巴勒布(bu)(bu)三(san)部落侵奪(duo)，周圍二十余(yu)處部落，全行占據”。乾(qian)隆三(san)十四年(nian)（1769年(nian)），廓爾(er)喀遷(qian)都(dou)至原(yuan)屬巴勒布(bu)(bu)的(de)(de)(de)陽布(bu)(bu)，形成(cheng)了統一的(de)(de)(de)尼泊(bo)爾(er)王國(guo)（又稱廓爾(er)喀王國(guo)）。
尼(ni)泊爾(er)境內(nei)多高山(shan)，地狹人稠，“國內(nei)之民難于自給，亦必別覓出(chu)口”，迫切需要向(xiang)周邊(bian)擴(kuo)張領土(tu)。乾隆四(si)十二年（1777年），年幼的喇納巴(ba)(ba)都爾(er)（拉納·巴(ba)(ba)哈杜爾(er)·沙(sha)阿）繼承王位后，其叔巴(ba)(ba)都爾(er)薩野(ye)（Bahadur Shah）攝政，將擴(kuo)張矛頭(tou)指(zhi)向(xiang)北(bei)方(fang)的西藏。
廓(kuo)(kuo)爾(er)(er)喀與后藏(zang)交界，貿易(yi)關系密切。乾(qian)隆帝五十三年(nian)（1788年(nian)），藏(zang)廓(kuo)(kuo)發生(sheng)貿易(yi)糾紛，適(shi)逢六世班(ban)禪(chan)之弟沙瑪爾(er)(er)巴正(zheng)與其兄仲巴呼(hu)圖克圖發生(sheng)內爭，沙瑪爾(er)(er)巴請求廓(kuo)(kuo)爾(er)(er)喀兵相(xiang)助(zhu)。于是(shi)，廓(kuo)(kuo)爾(er)(er)喀兵以“西藏(zang)運往(wang)之食(shi)鹽(yan)摻土”等(deng)為借(jie)口，乘機進攻西藏(zang)。
乾隆四(si)十五年（1780年），六世(shi)班(ban)禪額爾(er)(er)(er)德尼(ni)在北京圓寂。班(ban)禪之兄(xiong)仲(zhong)巴(ba)(ba)(ba)(ba)呼圖克圖護送班(ban)禪靈柩(jiu)返回日喀(ka)則札什(shen)(shen)倫布寺，得到乾隆皇(huang)帝(di)(di)賞(shang)賜及(ji)王公貴族(zu)供奉(feng)的大量(liang)金(jin)銀(yin)寶物，“無慮(lv)數十萬金(jin)”，“珍寶不(bu)可勝計”。仲(zhong)巴(ba)(ba)(ba)(ba)呼圖克圖有一同(tong)母異父之弟(di)，為(wei)白教沙(sha)瑪爾(er)(er)(er)巴(ba)(ba)(ba)(ba)活(huo)佛，與信(xin)奉(feng)黃教的仲(zhong)巴(ba)(ba)(ba)(ba)呼圖克圖不(bu)睦(mu)。仲(zhong)巴(ba)(ba)(ba)(ba)呼圖克圖將乾隆皇(huang)帝(di)(di)賞(shang)賜之財物“悉踞為(wei)己有，既不(bu)布施各寺，番兵、喇(la)嘛(ma)等亦一無所與”。沙(sha)瑪爾(er)(er)(er)巴(ba)(ba)(ba)(ba)垂(chui)涎(xian)其財物不(bu)得，遂生怨忿，乃以朝(chao)拜佛塔(ta)為(wei)名出走至尼(ni)泊爾(er)(er)(er)。廓爾(er)(er)(er)喀(ka)王族(zu)尊崇紅教，素與沙(sha)瑪爾(er)(er)(er)巴(ba)(ba)(ba)(ba)通(tong)好。沙(sha)瑪爾(er)(er)(er)巴(ba)(ba)(ba)(ba)極言札什(shen)(shen)倫布寺所得財物之豐厚(hou)，又將藏兵虛實(shi)相告(gao)，唆(suo)使廓爾(er)(er)(er)喀(ka)入藏劫掠(lve)。
清代(dai)西藏(zang)所用之銀(yin)錢，原為(wei)藏(zang)人(ren)(ren)將白(bai)銀(yin)交予(yu)巴(ba)(ba)勒布(bu)(bu)人(ren)(ren)，委托其(qi)鑄(zhu)成巴(ba)(ba)勒布(bu)(bu)銀(yin)幣(bi)（藏(zang)語稱之為(wei)“章噶(ga)”），再運回藏(zang)內使用。巴(ba)(ba)勒布(bu)(bu)人(ren)(ren)往(wang)往(wang)從中摻(chan)雜銅(tong)、鉛，再運回西藏(zang)換(huan)取純銀(yin)，以謀(mou)厚利(li)。廓(kuo)爾喀兼(jian)并巴(ba)(ba)勒布(bu)(bu)各部(bu)之后，鑄(zhu)造新錢，其(qi)成色(se)較巴(ba)(ba)勒布(bu)(bu)錢為(wei)高，故(gu)要(yao)求西藏(zang)將廓(kuo)爾喀新錢1圓折(zhe)巴(ba)(ba)勒布(bu)(bu)舊錢兩圓使用。西藏(zang)噶(ga)廈認為(wei)折(zhe)價不公，未予(yu)應允。
乾(qian)隆五十三年（1788年）五月，廓爾喀致書噶廈(sha)，聲(sheng)稱：“西藏(zang)境內(nei)所用(yong)的(de)(de)錢(qian)兩，都是我(wo)(wo)們(men)(men)(men)巴(ba)勒布(bu)镕(rong)鑄的(de)(de)。此后(hou)都使(shi)用(yong)新鑄錢(qian)文(wen)，舊錢(qian)不(bu)可(ke)再使(shi)用(yong)。而(er)且西藏(zang)與巴(ba)勒布(bu)接壤(rang)地(di)區(qu)的(de)(de)聶拉木、濟(ji)嚨兩個地(di)區(qu)，原本就是我(wo)(wo)們(men)(men)(men)巴(ba)勒布(bu)的(de)(de)地(di)方(fang)，仍然應(ying)該歸還我(wo)(wo)們(men)(men)(men)。如果你(ni)們(men)(men)(men)還覺(jue)得應(ying)該理論，可(ke)以派遣官員前來。”
噶廈回(hui)復廓爾(er)喀稱(cheng)：新鑄之錢數(shu)量甚少，不(bu)足(zu)以流通，仍將新舊銀錢混用；聶拉木、濟嚨兩處(chu)都系西藏(zang)地方(fang)，雙(shuang)方(fang)并(bing)無疑議；現在(zai)天氣炎熱，待立(li)冬時再派人前(qian)往與之理(li)論。但(dan)噶廈未向(xiang)駐藏(zang)大臣稟告(gao)此事。廓爾(er)喀又指責西藏(zang)對(dui)巴(ba)勒布貨(huo)物“任意加收稅(shui)項”，并(bing)向(xiang)販往巴(ba)勒布的食鹽中摻土，決(jue)意入侵藏(zang)地。
尼泊爾方(fang)(fang)(fang)面的文獻記載，則與中國略有不同。尼泊爾方(fang)(fang)(fang)面聲稱，廓(kuo)爾喀(ka)同西(xi)藏(zang)發生(sheng)銀錢糾(jiu)紛之后，攝政王巴哈(ha)都爾·沙(sha)阿（巴都爾薩野(ye)）希望(wang)同西(xi)藏(zang)地方(fang)(fang)(fang)簽訂新的貿(mao)易條約(yue)，但(dan)遭到(dao)粗魯(lu)拒絕，并警(jing)告廓(kuo)爾喀(ka)不要(yao)動(dong)用武力。廓(kuo)爾喀(ka)第二次派往(wang)拉薩的使(shi)團又遭到(dao)扣(kou)留，因此使(shi)得巴哈(ha)都爾·沙(sha)阿非常憤怒(nu)，決定入(ru)侵西(xi)藏(zang)。
乾隆(long)五十三年（1788年）六月，素爾(er)巴爾(er)達布(bu)率廓爾(er)喀(ka)兵(bing)3000人(ren)，先后占領西藏(zang)南(nan)部邊(bian)境之聶拉(la)木(mu)、濟嚨宗(zong)（今(jin)西藏(zang)吉隆(long)東南(nan)）、宗(zong)喀(ka)宗(zong)（今(jin)吉隆(long)）等地(di)，圍攻協噶爾(er)宗(zong)（今(jin)西藏(zang)定日）。
七(qi)月，清軍(jun)(jun)反擊。命駐(zhu)(zhu)藏(zang)(zang)(zang)(zang)大臣雅滿(man)泰(tai)率駐(zhu)(zhu)藏(zang)(zang)(zang)(zang)綠(lv)營(ying)兵(bing)(bing)及(ji)駐(zhu)(zhu)達(da)木(mu)厄魯特蒙古兵(bing)(bing)，前往札什倫布(bu)（今(jin)(jin)西藏(zang)(zang)(zang)(zang)日喀(ka)則(ze)）慰問班禪(chan)，并(bing)與班禪(chan)之(zhi)兄仲巴(ba)呼圖(tu)(tu)克圖(tu)(tu)部署沿邊防(fang)御(yu)(yu)；命駐(zhu)(zhu)藏(zang)(zang)(zang)(zang)大臣慶(qing)麟(lin)主持(chi)前藏(zang)(zang)(zang)(zang)地區之(zhi)防(fang)御(yu)(yu)；命四(si)川(chuan)總(zong)(zong)督(du)(du)李世杰(jie)(jie)、四(si)川(chuan)提(ti)督(du)(du)成(cheng)德，抽調(diao)滿(man)、漢、藏(zang)(zang)(zang)(zang)兵(bing)(bing)4000余(yu)人(ren)(ren)，由成(cheng)德統領，馳赴后藏(zang)(zang)(zang)(zang)，命尚(shang)在熱河之(zhi)成(cheng)都(dou)將軍(jun)(jun)鄂輝速返(fan)成(cheng)都(dou)，至(zhi)西藏(zang)(zang)(zang)(zang)統兵(bing)(bing)。為保(bao)證(zheng)作(zuo)戰軍(jun)(jun)隊糧草(cao)，暫撥達(da)賴(lai)、班禪(chan)庫存(cun)，并(bing)于(yu)藏(zang)(zang)(zang)(zang)內買(mai)糧。乾(qian)隆帝(di)并(bing)遣御(yu)(yu)前侍衛(wei)巴(ba)忠(zhong)為欽(qin)差大臣，赴藏(zang)(zang)(zang)(zang)主持(chi)用兵(bing)(bing)。時(shi)西藏(zang)(zang)(zang)(zang)駐(zhu)(zhu)有清軍(jun)(jun)500人(ren)(ren)，藏(zang)(zang)(zang)(zang)兵(bing)(bing)1600人(ren)(ren)，臺站兵(bing)(bing)1300人(ren)(ren)。慶(qing)麟(lin)在接到(dao)朝(chao)廷諭(yu)旨之(zhi)前，便調(diao)藏(zang)(zang)(zang)(zang)內500人(ren)(ren)綠(lv)營(ying)兵(bing)(bing)及(ji)察木(mu)多、達(da)木(mu)等兵(bing)(bing)700人(ren)(ren)，分路堵御(yu)(yu)廓爾喀(ka)侵略(lve)軍(jun)(jun)。四(si)川(chuan)總(zong)(zong)督(du)(du)李世杰(jie)(jie)亦于(yu)成(cheng)都(dou)抽調(diao)滿(man)兵(bing)(bing)500名，綠(lv)營(ying)兵(bing)(bing)1300人(ren)(ren)，屯練降“番”兵(bing)(bing)1200人(ren)(ren)，俱(ju)交提(ti)督(du)(du)成(cheng)德、總(zong)(zong)兵(bing)(bing)穆克登(deng)阿率領，經(jing)由打(da)箭爐（今(jin)(jin)四(si)川(chuan)康(kang)定）、巴(ba)塘(tang)、里塘(tang)（今(jin)(jin)四(si)川(chuan)理(li)塘(tang)）、察木(mu)多，馳赴后藏(zang)(zang)(zang)(zang)。但是，當(dang)清軍(jun)(jun)日夜兼(jian)程，奔(ben)赴藏(zang)(zang)(zang)(zang)廓邊境之(zhi)時(shi)，達(da)賴(lai)喇嘛、仲巴(ba)呼圖(tu)(tu)克圖(tu)(tu)和噶(ga)布(bu)倫班第(di)達(da)、慶(qing)麟(lin)、雅滿(man)泰(tai)等，已私下(xia)同(tong)廓爾喀(ka)議和，后得到(dao)巴(ba)忠(zhong)、鄂輝、成(cheng)德等贊同(tong)。
乾隆(long)五十四年（1789年）初，藏廓簽定協議，由西藏噶布倫每年向廓爾喀交納元寶300錠，作(zuo)為聶拉木(mu)、濟(ji)嚨宗(zong)、宗(zong)喀宗(zong)三地(di)(di)的(de)贖金，廓爾喀退兵(bing)(bing)。此事，巴忠(zhong)、雅滿泰等隱瞞不上報。三月，鄂輝等率清(qing)軍“收復”失地(di)(di)。因(yin)廓爾喀兵(bing)(bing)先已(yi)陸續撤回，故(gu)未遇任(ren)何抵抗。六月，清(qing)廷調整西藏之(zhi)(zhi)防(fang)(fang)務，加強(qiang)札什倫布等地(di)(di)防(fang)(fang)兵(bing)(bing)，于宗(zong)喀宗(zong)、聶拉木(mu)、濟(ji)嚨宗(zong)等要地(di)(di)修砌卡碉。并調整與(yu)廓爾喀貿易之(zhi)(zhi)政策。清(qing)軍此次出兵(bing)(bing)雖(sui)未交戰，已(yi)耗費軍餉百余(yu)萬兩(liang)白銀(yin)。巴忠(zhong)以(yi)有功之(zhi)(zhi)臣離藏回京(jing)。
廓爾喀退兵(bing)后，清廷不得(de)不撤(che)換一批擅權(quan)、失職的西(xi)藏(zang)(zang)官員(yuan)。駐藏(zang)(zang)辦(ban)事大(da)臣舒濂(lian)包庇聚(ju)斂舞弊(bi)的達(da)賴(lai)喇嘛之(zhi)兄羅布藏(zang)(zang)多吉(ji)、同母(mu)弟羅布藏(zang)(zang)根敦扎克巴，與幫辦(ban)大(da)臣普(pu)福(fu)互相參奏(zou)。
乾隆五十五年（1790年）四月，成都將軍(jun)鄂輝奉旨入藏(zang)查辦。五月，乾隆皇帝將舒濂革職，以普福(fu)為辦事大(da)臣，雅(ya)滿泰(tai)為幫(bang)辦大(da)臣。七月，又將普福(fu)革職，降(jiang)為三等侍衛(wei)，命保泰(tai)入藏(zang)接替(ti)駐藏(zang)辦事大(da)臣普福(fu)之職。八月，命舒濂解送達(da)(da)賴(lai)喇(la)嘛之兄弟來京。同時，令西藏(zang)的攝政活(huo)佛濟嚨呼圖(tu)克圖(tu)來京，遣噶(ga)勒(le)丹錫哷圖(tu)呼圖(tu)克圖(tu)阿旺楚(chu)爾(er)提木入藏(zang)主(zhu)政。雅(ya)滿泰(tai)、保泰(tai)分(fen)別與當(dang)年十月二十日、十一月二十九(jiu)日抵(di)達(da)(da)拉薩上任。
乾隆五(wu)十(shi)五(wu)年(nian)（1790年(nian)）十(shi)月，廓爾喀遣大(da)頭目(mu)(mu)一人(ren)、小頭目(mu)(mu)兩(liang)人(ren)來到(dao)拉薩(sa)，依照乾隆五(wu)十(shi)四年(nian)（1789年(nian)）的約定，索(suo)要(yao)贖地(di)銀兩(liang)。新(xin)上任主(zhu)政(zheng)的噶勒丹錫哷圖呼圖克(ke)圖拒絕給(gei)付。達賴喇嘛還派喇嘛敦珠布(bu)朋楚克(ke)、博爾東到(dao)邊境上放言，廓爾喀既已成為大(da)清屬(shu)國，則(ze)不應(ying)照前約索(suo)要(yao)贖地(di)銀兩(liang)。廓使(shi)又請朝廷賞給(gei)廓爾喀王拉納·巴哈都爾·沙阿俸祿(lu)及土地(di)，也被駐藏大(da)臣普福回絕。廓使(shi)一事無成，只得返回。
達賴喇嘛則派堪布(bu)托格(ge)穆(mu)特(te)(te)、商卓特(te)(te)巴吉(ji)彌敦第、仔琫第卜巴赴廓(kuo)爾(er)喀(ka)(ka)商談，打算付給廓(kuo)爾(er)喀(ka)(ka)150個(ge)元寶，同時(shi)將原訂合約撤回，永絕瓜葛。廓(kuo)方以托格(ge)穆(mu)特(te)(te)地位不(bu)高，指名要求達賴喇嘛叔父阿(a)古(gu)拉(la)與噶倫丹津(jin)班(ban)珠爾(er)來邊境(jing)商談。此時(shi)阿(a)古(gu)拉(la)已去(qu)世，不(bu)久，派去(qu)商談的堪布(bu)托格(ge)穆(mu)特(te)(te)也(ye)在廓(kuo)爾(er)喀(ka)(ka)病逝(shi)。
西藏地方(fang)的(de)一系列舉措，令(ling)廓(kuo)爾(er)喀(ka)攝政王巴哈都爾(er)·沙(sha)阿非常憤怒。巴哈都爾(er)·沙(sha)阿感到進退兩(liang)難：若(ruo)(ruo)發(fa)動戰爭(zheng)，則(ze)(ze)必然要投入(ru)大量經費(fei)、部(bu)隊和(he)武器，因(yin)為清廷方(fang)面顯然已經對廓(kuo)爾(er)喀(ka)有(you)所(suo)戒(jie)備；若(ruo)(ruo)放(fang)棄(qi)戰爭(zheng)，則(ze)(ze)之前盟(meng)約的(de)被撕毀令(ling)他非常不甘。最終他聲稱要懲(cheng)治西藏地方(fang)的(de)背盟(meng)，仍然決定：再次入(ru)侵西藏。
乾隆(long)五十六年（1791年），噶(ga)(ga)勒丹(dan)錫(xi)哷圖(tu)呼圖(tu)克(ke)圖(tu)圓寂，八世達賴(lai)喇嘛(ma)再度執政。五月(yue)，達賴(lai)喇嘛(ma)令噶(ga)(ga)倫丹(dan)津班珠(zhu)爾赴邊界，與(yu)廓(kuo)(kuo)爾喀密談撤約事宜(yi)。五月(yue)十一日，丹(dan)津班珠(zhu)爾、扎什(shen)端(duan)珠(zhu)布、札薩克(ke)喇嘛(ma)格桑(sang)定結自拉薩啟(qi)程前(qian)往聶拉木，向駐(zhu)藏大臣稟稱檢閱軍隊、修(xiu)葺廟宇，實則繼續與(yu)廓(kuo)(kuo)方商談贖銀撤約之事。噶(ga)(ga)倫丹(dan)津班珠(zhu)爾等(deng)認為，此前(qian)帶去的元(yuan)寶只及半數(shu)，難以撤回(hui)合(he)同，于是(shi)又攜150個元(yuan)寶前(qian)往。一路(lu)上，扎什(shen)倫布寺、薩迦寺喇嘛(ma)及駐(zhu)守聶拉木之戴琫江結也加入談判使(shi)團。
六月(yue)上旬，噶倫(lun)(lun)丹津班珠(zhu)爾抵達(da)聶拉(la)木(mu)之沖堆（今(jin)(jin)聶拉(la)木(mu)鎮(zhen)充(chong)堆），札薩克喇嘛(ma)格(ge)桑(sang)定(ding)(ding)結與扎(zha)、薩二(er)(er)寺喇嘛(ma)則受(shou)沙(sha)瑪爾巴活佛之邀來到扎(zha)木(mu)（今(jin)(jin)聶拉(la)木(mu)縣樟木(mu)鎮(zhen)）。六月(yue)二(er)(er)十二(er)(er)日(ri)（西歷7月(yue)22日(ri)），噶倫(lun)(lun)丹津班珠(zhu)爾、扎(zha)什(shen)端珠(zhu)布、戴琫江結在(zai)(zai)沖堆，遭到廓爾喀(ka)(ka)兵突(tu)襲，被俘后押(ya)往廓爾喀(ka)(ka)都城陽布。格(ge)桑(sang)定(ding)(ding)結、扎(zha)、薩二(er)(er)寺喇嘛(ma)、聶拉(la)木(mu)教習軍官(guan)王(wang)剛(gang)、馮(feng)大成等(deng)人也同時被拘押(ya)。七(qi)月(yue)，廓爾喀(ka)(ka)軍隊再次侵入(ru)聶拉(la)木(mu)和(he)濟(ji)嚨(long)(long)。廓軍兵分兩路(lu)，一(yi)路(lu)由達(da)莫達(da)爾·潘德（《清史稿》稱之為“噶箕·旦姆達(da)爾·邦(bang)里(li)”）率領，自濟(ji)嚨(long)(long)進攻宗喀(ka)(ka)；一(yi)路(lu)由阿比曼·辛格(ge)率領，從聶拉(la)木(mu)進攻定(ding)(ding)日(ri)（在(zai)(zai)今(jin)(jin)定(ding)(ding)日(ri)縣西）；另有一(yi)路(lu)繞過定(ding)(ding)日(ri)，經薩迦直趨日(ri)喀(ka)(ka)則。
八月(yue)三日(ri)(ri)，廓軍攻(gong)占(zhan)定日(ri)(ri)、濟嚨(long)。八月(yue)十六(liu)日(ri)(ri)，廓軍攻(gong)陷薩(sa)迦(jia)。同日(ri)(ri)，保泰送年僅(jin)10歲的七(qi)世班(ban)禪(chan)(chan)額爾(er)德尼前往拉(la)薩(sa)，命仲(zhong)巴呼(hu)(hu)圖克圖留守札(zha)什倫(lun)布(bu)寺(si)(si)(si)。札(zha)什倫(lun)布(bu)寺(si)(si)(si)濟仲(zhong)喇(la)嘛羅布(bu)藏丹巴與(yu)群僧(seng)占(zhan)卜，得(de)到“不可(ke)與(yu)賊(zei)作戰”的神示。仲(zhong)巴呼(hu)(hu)圖克圖遂遣人(ren)赴廓營求和。然而(er)，該使者半路逃走，于是寺(si)(si)(si)內外喇(la)嘛三千(qian)余人(ren)紛紛潰(kui)散。仲(zhong)巴呼(hu)(hu)圖克圖也(ye)攜金銀及班(ban)禪(chan)(chan)所(suo)余貴重物(wu)件(jian)，裝(zhuang)為233捆，先行逃出(chu)。二十一日(ri)(ri)，廓軍隊(dui)長（Captain，清人(ren)譯作“噶(ga)布(bu)黨”）瑪木薩(sa)野攻(gong)入(ru)札(zha)什倫(lun)布(bu)寺(si)(si)(si)，寺(si)(si)(si)內僅(jin)余9人(ren)。瑪木薩(sa)野即入(ru)住(zhu)班(ban)禪(chan)(chan)額爾(er)德尼禪(chan)(chan)房內，大小頭(tou)目分據各(ge)處(chu)，將金銀佛像(xiang)、供器(qi)、貯藏及靈塔鑲嵌(qian)之(zhi)珍珠珊瑚寶石(shi)等物(wu)盡行掠去。冊(ce)封六(liu)世班(ban)禪(chan)(chan)的金冊(ce)也(ye)被盜走。
九月初，廓軍進攻(gong)(gong)日喀則(ze)宗城，都(dou)司徐(xu)南(nan)鵬率(lv)80人堅守，擊(ji)斃廓軍10余人、頭目(mu)1人。圍攻(gong)(gong)八(ba)晝夜后，廓軍仍不能破城，遂攜所掠財寶退往邊境(jing)。
乾隆(long)皇(huang)帝判(pan)定(ding)廓爾喀此(ci)次(ci)犯邊，志在(zai)劫掠后藏(zang)財物；此(ci)時冬雪迫近，廓軍(jun)(jun)必不(bu)能進兵(bing)前藏(zang)。一(yi)俟朝廷調集大軍(jun)(jun)進討(tao)，廓軍(jun)(jun)便(bian)可從容遁去(qu)。因(yin)此(ci)，乾隆(long)皇(huang)帝決定(ding)大舉出(chu)兵(bing)，待來年春雪消(xiao)融(rong)后攻入廓爾喀腹地，令(ling)其徹底臣服，不(bu)敢復萌故志。因(yin)成都(dou)將軍(jun)(jun)鄂(e)輝(hui)等人資(zi)望尚淺，乾隆(long)五十(shi)六年（1791年）九月(yue)(yue)二十(shi)五日，皇(huang)帝召平(ping)定(ding)臺(tai)(tai)(tai)灣林爽(shuang)文叛亂的兩廣總督福(fu)康(kang)安(an)(an)來京(jing)。十(shi)月(yue)(yue)，福(fu)康(kang)安(an)(an)抵(di)京(jing)，授(shou)將軍(jun)(jun)銜，督辦西(xi)藏(zang)軍(jun)(jun)事。以平(ping)臺(tai)(tai)(tai)之役(yi)中福(fu)康(kang)安(an)(an)的副手海(hai)蘭察、臺(tai)(tai)(tai)斐英阿等為參(can)贊大臣，率黑(hei)龍江索倫、達呼爾兵(bing)丁千名(ming)，由青海(hai)入藏(zang)，征討(tao)廓爾喀。十(shi)二月(yue)(yue)，四川提督成德在(zai)聶拉木拍(pai)甲嶺一(yi)役(yi)戰(zhan)勝(sheng)廓軍(jun)(jun)。
從西(xi)(xi)北前后入藏的官兵(bing)有（1）福(fu)康安(an)及(ji)其隨員(yuan)，（2）海蘭察及(ji)100名(ming)侍衛，（3）烏(wu)什哈(ha)達(da)(da)(da)、岱森保及(ji)所率1500名(ming)索(suo)(suo)倫(lun)達(da)(da)(da)斡(wo)爾兵(bing)。陜(shan)甘(gan)總(zong)(zong)督勒(le)保、青(qing)(qing)海辦事(shi)(shi)大(da)臣奎(kui)舒(shu)奉旨預為籌辦乘騎(qi)、運(yun)畜、糧秣、柴薪、臺站、向導(dao)等事(shi)(shi)宜。乾隆五十(shi)六年(nian)（1791年(nian)）十(shi)二月(yue)十(shi)五日(ri)，福(fu)康安(an)抵達(da)(da)(da)青(qing)(qing)海西(xi)(xi)寧，一切(qie)都已準(zhun)備就緒(xu)，大(da)致是，陜(shan)甘(gan)總(zong)(zong)督勒(le)保從屬下(xia)甘(gan)肅綠營(ying)調出了(le)1500匹(pi)馬(ma)供(gong)官員(yuan)使用(yong)(yong)，青(qing)(qing)海辦事(shi)(shi)大(da)臣奎(kui)舒(shu)通過青(qing)(qing)海蒙古(gu)王公從各旗采(cai)購了(le)3000多匹(pi)馬(ma)，供(gong)索(suo)(suo)倫(lun)達(da)(da)(da)斡(wo)爾兵(bing)騎(qi)用(yong)(yong)；遙(yao)接西(xi)(xi)藏沿途(tu)設立了(le)傳遞文書(shu)信息的臺站，派(pai)綠營(ying)兵(bing)和當(dang)地蒙古(gu)兵(bing)共(gong)同(tong)駐守，后因另(ling)有川藏驛(yi)路可(ke)用(yong)(yong)，這一線臺站在全軍分批經(jing)過完畢(bi)即卷(juan)撤。福(fu)康安(an)于十(shi)二月(yue)二十(shi)日(ri)離(li)開西(xi)(xi)寧，嚴冬中走上寒冷(leng)荒涼(liang)崎嶇的青(qing)(qing)藏高原，并(bing)站兼(jian)行(xing)，乾隆五十(shi)七年(nian)正月(yue)二十(shi)日(ri)（1792年(nian)2月(yue)12日(ri)）到拉(la)薩(sa)，全程將及(ji)5000華里，包括耽擱日(ri)數(shu)在內(nei)，用(yong)(yong)了(le)50天。他詢問藏人(ren)，皆云(yun)對比喇嘛等行(xing)走需一百(bai)二三十(shi)日(ri)，可(ke)謂快速。
福(fu)康安進入(ru)藏境后，接見達賴(lai)喇嘛遣來迎接的(de)高級官員，即逐(zhu)一詢問廓爾喀兩次(ci)滋事的(de)緣由，并札詢鄂輝(hui)、成德，令將先后情節據實答復。
乾隆五十(shi)(shi)七年(nian)（1792年(nian)）正月二十(shi)(shi)三日，福康(kang)安于布達(da)(da)拉(la)宮會(hui)見(jian)達(da)(da)賴(lai)喇嘛(ma)、班(ban)禪等，以面奉諭旨(zhi)再(zai)次傳達(da)(da)嘉獎達(da)(da)賴(lai)喇嘛(ma)深明大(da)義，不聽保泰內遷妄請，并正式提出，將來(lai)(lai)事定，辦(ban)理(li)善(shan)后時，必須另立《章程》，逐條辦(ban)事，務使邊圉永寧。對于達(da)(da)賴(lai)喇嘛(ma)、班(ban)禪的回答相當滿意。及至談論公事訖，福康(kang)安斟(zhen)酌上諭及實情，擬遵佛法(fa)，向達(da)(da)賴(lai)喇嘛(ma)、班(ban)禪施(shi)禮(li)，為喇嘛(ma)婉拒(ju)，但后來(lai)(lai)私下仍(reng)向達(da)(da)賴(lai)行(xing)了叩首(shou)禮(li)。
福(fu)康(kang)安(an)在拉(la)薩停留了近二(er)十七天后(hou)(hou)(hou)，去(qu)后(hou)(hou)(hou)藏。在這(zhe)期間，憑借他(ta)的地(di)位威望(wang)，及(ji)大(da)軍將到(dao)的聲勢，向西藏上(shang)層(ceng)宣諭(yu)援(yuan)藏用(yong)兵(bing)的意義。二(er)月(yue)間，福(fu)康(kang)安(an)檄令布魯克巴（不丹）、哲(zhe)孟雄（錫(xi)金）及(ji)界外的作木朗、披楞(leng)（指英(ying)國(guo)東印度公司）等(deng)。發兵(bing)合攻(gong)廓(kuo)(kuo)爾(er)喀，但(dan)被乾隆皇帝批評(ping)為時(shi)過早，不夠策略。上(shang)述各部接到(dao)福(fu)康(kang)安(an)檄令后(hou)(hou)(hou)，反(fan)應消極。達(da)賴喇嘛也于二(er)月(yue)九日（1792年3月(yue)1日）致函(han)英(ying)國(guo)東印度公司首(shou)腦，促請勿(wu)聽信(xin)廓(kuo)(kuo)爾(er)喀求援(yuan)的讕言。
福康(kang)安(an)奉詔檢讀(du)后，認為廓爾(er)喀當滋擾(rao)之(zhi)后，尚(shang)逞此詭譎之(zhi)辭，實堪痛恨。二月(yue)十(shi)日，海蘭察也到(dao)了(le)，福康(kang)安(an)得到(dao)了(le)兩名(ming)軍(jun)(jun)事助手。三(san)月(yue)十(shi)五日，乾(qian)隆皇帝特授(shou)福康(kang)安(an)為“大將(jiang)軍(jun)(jun)”，俾(bi)其等(deng)列(lie)威嚴在一般(ban)外省駐防將(jiang)軍(jun)(jun)之(zhi)上。旨(zhi)意傳至西藏(zang)，當在四月(yue)。三(san)月(yue)內，福康(kang)安(an)檄諭(yu)廓爾(er)喀王(wang)子，希望能夠和(he)平罷(ba)兵，但如果(guo)廓爾(er)喀執(zhi)意開戰，清廷也時刻準(zhun)備著。清廷檄諭(yu)口(kou)氣很強硬(ying)。
稍(shao)前，即乾(qian)隆五十(shi)七年（1792年）正月(yue)，成德收(shou)復(fu)聶拉木東官寨(zhai)，陣斬(zhan)廓(kuo)軍(jun)(jun)將(jiang)領呢瑪叭噶嘶、踏巴。二(er)月(yue)，川軍(jun)(jun)攻克聶拉木的廓(kuo)軍(jun)(jun)西北碉寨(zhai)，俘獲瑪木薩(sa)野之侄咱(zan)瑪達阿(a)爾曾薩(sa)野，聶拉木全境收(shou)復(fu)。閏四月(yue)十(shi)八日，福康安、海蘭察(cha)(cha)、惠齡由(you)日喀(ka)則(ze)馳往(wang)江孜(zi)，督運軍(jun)(jun)糧(liang)。二(er)十(shi)七日，抵達定(ding)日之第(di)哩朗古(gu)，與成德會合。福康安、海蘭察(cha)(cha)等分頭察(cha)(cha)看聶拉木、絨轄等地后，率主(zhu)力(li)前往(wang)宗(zong)喀(ka)，決(jue)定(ding)由(you)濟嚨向南，攻入廓(kuo)爾喀(ka)。
五(wu)月六日，福康安、海蘭察(cha)(cha)領兵行(xing)至宗(zong)(zong)喀以南的轄布(bu)基(ji)，進攻(gong)擦木山隘（在(zai)今吉隆縣宗(zong)(zong)喀鎮南）。是(shi)日夜，清(qing)軍(jun)乘雨分兵五(wu)路，海蘭察(cha)(cha)居(ju)中，哲(zhe)森保(bao)(bao)等由東西兩山夾擊廓軍(jun)營寨，莫爾(er)根保(bao)(bao)繞到(dao)營后偷襲(xi)。
初七(qi)日黎明之時，清兵(bing)攻克(ke)擦木山梁(liang)上的兩座(zuo)廓軍石(shi)碉樓，斬殺二百余人。初八日，清軍進至(zhi)瑪(ma)噶爾轄爾甲，擊潰由濟(ji)嚨(long)前來迎(ying)戰的廓軍。初十日，清兵(bing)攻克(ke)濟(ji)嚨(long)，斬殺640余人，俘(fu)虜200余人。至(zhi)此，西藏(zang)全境(jing)收(shou)復。
熱索橋之戰
乾隆(long)五(wu)十七年(nian)（1792年(nian)）五(wu)月(yue)十三日(ri)（西歷1792年(nian)7月(yue)1日(ri)），福康安(an)、海蘭察率軍由濟嚨啟程，沿(yan)吉(ji)隆(long)河(he)(he)東岸(an)南下。十四日(ri)，清(qing)(qing)軍過藏廓(kuo)(kuo)邊界(jie)之(zhi)擺嗎奈撒，進(jin)入(ru)廓(kuo)(kuo)爾喀境內之(zhi)熱(re)(re)(re)索瓦（尼(ni)泊(bo)爾語Rasuwa），與廓(kuo)(kuo)軍隔熱(re)(re)(re)索河(he)(he)對峙。熱(re)(re)(re)索河(he)(he)為吉(ji)隆(long)河(he)(he)支流(liu)，其(qi)上有木(mu)板(ban)浮(fu)橋(qiao)(qiao)，即熱(re)(re)(re)索橋(qiao)(qiao)。廓(kuo)(kuo)兵(bing)(bing)在熱(re)(re)(re)索河(he)(he)北岸(an)索喇拉山上筑碉(diao)樓一座(zuo)(zuo)，南岸(an)臨(lin)河(he)(he)有碉(diao)樓兩座(zuo)(zuo)，并將熱(re)(re)(re)索橋(qiao)(qiao)木(mu)板(ban)撤(che)去(qu)，憑河(he)(he)據守。十五(wu)日(ri)，清(qing)(qing)兵(bing)(bing)佯攻河(he)(he)北岸(an)的廓(kuo)(kuo)軍碉(diao)樓；另遣金川藏兵(bing)(bing)翻越兩座(zuo)(zuo)高山，繞(rao)道至熱(re)(re)(re)索河(he)(he)上游六七里處，伐(fa)木(mu)做筏(fa)，渡河(he)(he)后沿(yan)南岸(an)疾行，突襲臨(lin)河(he)(he)碉(diao)房。南岸(an)廓(kuo)(kuo)兵(bing)(bing)出(chu)卡抵御之(zhi)際(ji)，北岸(an)的清(qing)(qing)兵(bing)(bing)主(zhu)力搭橋(qiao)(qiao)渡河(he)(he)，一舉奪取三座(zuo)(zuo)石碉(diao)，是為熱(re)(re)(re)索橋(qiao)(qiao)之(zhi)戰(zhan)。
協布嚕、東覺山之戰
得知清軍將(jiang)至首都(dou)的(de)時候，廓爾(er)喀王(wang)拉納(na)·巴(ba)(ba)(ba)哈(ha)都(dou)爾(er)·沙(sha)(sha)阿(a)逃往臨近英屬(shu)印度的(de)邊(bian)境。留守陽布的(de)王(wang)叔巴(ba)(ba)(ba)哈(ha)都(dou)爾(er)·沙(sha)(sha)阿(a)召(zhao)見被扣(kou)押的(de)噶倫丹(dan)津班(ban)珠爾(er)，請求(qiu)其轉(zhuan)告福康安(an)，廓爾(er)喀侵犯藏境，全因沙(sha)(sha)瑪爾(er)巴(ba)(ba)(ba)活佛唆(suo)使，并保證歸還(huan)扎什倫布寺財物(wu)，賠償在沖都(dou)被襲的(de)官兵命價。此外，巴(ba)(ba)(ba)哈(ha)都(dou)爾(er)·沙(sha)(sha)阿(a)向英屬(shu)印度殖民(min)政府求(qiu)助，希望得到(dao)武器(qi)彈藥的(de)支持。
印度總督康沃(wo)利斯侯(hou)爵考慮到若公開支持(chi)廓爾喀(ka)，勢必會使英國人在廣(guang)州的(de)貿易受到影響，因此(ci)拒絕(jue)了(le)這個(ge)要(yao)求(qiu)。但后來，康沃(wo)利斯又發現(xian)，這是(shi)控制廓爾喀(ka)地區商業貿易的(de)絕(jue)佳時機，便派海德拉巴邦的(de)執政(zheng)者詹姆斯·阿基琉(liu)斯·克爾帕(pa)特(te)里克率英國使團前往廓爾喀(ka)。
六(liu)月二十五(wu)日，廓爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)喀頭(tou)人(ren)(ren)(ren)噶布(bu)黨普都(dou)爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)幫(bang)(bang)里(li)、噶箕朗穆幾爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)幫(bang)(bang)里(li)、達薩爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)（Taksari，官職名，掌管鑄錢）乃爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)興(xing)、小頭(tou)目(mu)巴(ba)(ba)(ba)拉巴(ba)(ba)(ba)都(dou)爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)哈瓦斯4人(ren)(ren)(ren)及隨從20余人(ren)(ren)(ren)，來到雍鴉大營(ying)，將去年在(zai)沖堆(dui)被擄走的丹(dan)(dan)津(jin)班珠(zhu)爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)、扎什(shen)端珠(zhu)布(bu)、藏軍營(ying)官聶堆(dui)、盧獻麟、馮(feng)大成等人(ren)(ren)(ren)送(song)還。福康(kang)安(an)面諭廓爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)喀頭(tou)人(ren)(ren)(ren)，令其(qi)(qi)遵辦五(wu)條事宜，方(fang)準其(qi)(qi)投(tou)降(jiang)：“廓兵(bing)須退出噶勒(le)拉、堆(dui)補木(mu)、甲(jia)爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)古拉、集(ji)木(mu)集(ji)等處山梁；廓爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)喀王(wang)(wang)喇納巴(ba)(ba)(ba)都(dou)爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)、王(wang)(wang)叔巴(ba)(ba)(ba)都(dou)爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)薩野親自前來；將沙瑪爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)巴(ba)(ba)(ba)活(huo)佛(fo)尸骨(gu)及其(qi)(qi)徒弟(di)交出；所掠之扎什(shen)倫(lun)布(bu)寺(si)財寶全(quan)行歸還；交出乾隆五(wu)十四年與丹(dan)(dan)津(jin)班珠(zhu)爾(er)(er)(er)(er)(er)(er)私訂之合同，不(bu)得(de)再提(ti)西藏交付贖銀(yin)之事。”清兵(bing)將廓使(shi)送(song)還7天后，并無回音。廓軍仍占據諸處山梁。
帕朗古之戰
乾隆五十七(qi)年(nian)（1792年(nian)）七(qi)月二日，清(qing)軍(jun)進(jin)攻噶勒拉、堆補(bu)木(mu)。在(zai)進(jin)攻甲爾古拉山時，廓(kuo)爾喀軍(jun)隊誘清(qing)軍(jun)進(jin)入叢林(lin)，隨(sui)后三面放火(huo)燒林(lin)。清(qing)軍(jun)失利(li)，臺斐英阿、阿滿泰(tai)、莫爾根保(bao)、英貴、張占魁(kui)等人(ren)戰死，是為帕(pa)朗(lang)古之戰。
廓爾喀請降
乾(qian)隆(long)五十七年八月八日(ri)（西(xi)歷1792年9月23日(ri)），廓爾喀管(guan)事頭人噶箕(ji)第烏(wu)達特塔巴來到(dao)清(qing)(qing)軍大營，請求歸誠，并代(dai)廓王、王叔(shu)進(jin)京朝覲。十九日(ri)，福康(kang)安準其歸降。二十一日(ri)，清(qing)(qing)軍開始從帕朗古撤回。九月四(si)日(ri)，清(qing)(qing)兵全部撤回濟嚨。
清兵撤退的同時，福(fu)(fu)康安(an)(an)派穆克登(deng)阿(a)勘察西藏(zang)、廓爾喀邊界。十(shi)月(yue)十(shi)五日，福(fu)(fu)康安(an)(an)來到拉(la)薩(sa)，達賴喇嘛率僧俗官員(yuan)出迎。福(fu)(fu)康安(an)(an)在拉(la)薩(sa)停留(liu)了四個(ge)多月(yue)，與惠齡(ling)、孫士毅、和(he)琳擬定了《藏(zang)內善后章程》。十(shi)二月(yue)二十(shi)三日，廓爾喀貢(gong)使抵達京師，并(bing)謁見和(he)珅。次(ci)日，貢(gong)使覲(jin)見乾隆皇帝。二十(shi)七日，皇帝準許恢復喇納巴(ba)都爾的王爵、巴(ba)都爾薩(sa)野的公(gong)爵名號。白(bai)教活佛夏瑪巴(ba)欽定不準轉世，弟子一律改(gai)宗黃教。
乾隆五十(shi)(shi)七年八月(yue)八日（1792年9月(yue)23日），廓(kuo)爾喀在清軍的凌厲攻勢下請求投降，八月(yue)十(shi)(shi)九日，清軍準(zhun)降。清兵撤退的同時還勘(kan)察西藏(zang)(zang)、廓(kuo)爾喀的邊(bian)界(jie)。福康安等人擬定了(le)《藏(zang)(zang)內善(shan)(shan)后章程(cheng)》。雙方(fang)經過會商，共提出(chu)一百零二項條款(kuan)。次年正(zheng)月(yue)，經清政府修(xiu)訂為二十(shi)(shi)九條，即《欽(qin)定藏(zang)(zang)內善(shan)(shan)后章程(cheng)》，改革并(bing)充(chong)實了(le)多(duo)項方(fang)針(zhen)，加強了(le)駐(zhu)藏(zang)(zang)大臣(chen)的職權和地位(wei)。
經過(guo)(guo)了這場(chang)戰(zhan)爭，廓(kuo)爾(er)(er)喀(ka)的(de)(de)勢力受到削弱(ruo)。之前(qian)被其所滅的(de)(de)錫金也得以(yi)復國(guo)，不過(guo)(guo)其原有領土仍有一部分被廓(kuo)爾(er)(er)喀(ka)占據(ju)。在廓(kuo)爾(er)(er)喀(ka)與清(qing)朝議和(he)之后(hou)，由克爾(er)(er)帕特(te)里克率(lv)領的(de)(de)英國(guo)使團才到達(da)廓(kuo)爾(er)(er)喀(ka)，希望同廓(kuo)爾(er)(er)喀(ka)就(jiu)武器之事進行會談。巴哈都(dou)爾(er)(er)·沙(sha)阿拒絕了英國(guo)人的(de)(de)建議，將這個(ge)使團禮送出境。雖(sui)然和(he)約已(yi)經達(da)成，但西藏地(di)方對(dui)廓(kuo)爾(er)(er)喀(ka)依然非常(chang)戒備。八(ba)世達(da)賴希望聯合(he)廓(kuo)爾(er)(er)喀(ka)的(de)(de)鄰國(guo)來與之對(dui)抗，曾派遣一個(ge)代表團去(qu)英屬印度當時的(de)(de)首都(dou)的(de)(de)加爾(er)(er)各答，希望與不列顛東(dong)印度公司合(he)作，來牽制(zhi)廓(kuo)爾(er)(er)喀(ka)。
清(qing)朝(chao)用(yong)兵西藏(zang)(zang)(zang)(zang)，進(jin)(jin)一步提高了(le)清(qing)朝(chao)中央(yang)的(de)(de)威望，促進(jin)(jin)了(le)西藏(zang)(zang)(zang)(zang)地(di)方對(dui)清(qing)中央(yang)政(zheng)(zheng)府(fu)的(de)(de)向心(xin)力作用(yong)。清(qing)朝(chao)用(yong)兵西藏(zang)(zang)(zang)(zang)又(you)推進(jin)(jin)了(le)民(min)族(zu)關(guan)系和民(min)族(zu)融合的(de)(de)發(fa)展。在西藏(zang)(zang)(zang)(zang)人(ren)民(min)的(de)(de)支(zhi)持下，清(qing)軍迅速(su)收復失地(di)。清(qing)軍旋即而歸，廓(kuo)(kuo)爾喀派(pai)人(ren)至北京認(ren)罪。清(qing)朝(chao)兩次(ci)派(pai)軍入(ru)藏(zang)(zang)(zang)(zang)，驅逐廓(kuo)(kuo)爾喀的(de)(de)入(ru)侵，保衛了(le)西藏(zang)(zang)(zang)(zang)，鞏固了(le)邊(bian)防(fang)，增(zeng)強了(le)漢藏(zang)(zang)(zang)(zang)等(deng)各族(zu)人(ren)民(min)的(de)(de)愛國主(zhu)義精神。此外，清(qing)政(zheng)(zheng)府(fu)又(you)對(dui)藏(zang)(zang)(zang)(zang)事(shi)作了(le)重大整(zheng)頓。乾(qian)隆(long)帝批準了(le)由福康(kang)安、和琳(lin)、惠琳(lin)等(deng)奉(feng)旨酌(zhuo)籌的(de)(de)《藏(zang)(zang)(zang)(zang)內善后(hou)(hou)章程(cheng)》，即清(qing)政(zheng)(zheng)府(fu)于乾(qian)隆(long)五十(shi)八年（1793年）頒(ban)發(fa)的(de)(de)著名的(de)(de)《新訂章程(cheng)二十(shi)九條(tiao)》，又(you)稱(cheng)為《藏(zang)(zang)(zang)(zang)內善后(hou)(hou)章程(cheng)二十(shi)九條(tiao)》。章程(cheng)對(dui)西藏(zang)(zang)(zang)(zang)地(di)方的(de)(de)政(zheng)(zheng)治、經(jing)濟、軍事(shi)、法制和外事(shi)等(deng)方面均作了(le)明確(que)規定。
清政(zheng)府(fu)為了(le)加(jia)強(qiang)西藏(zang)地(di)方管理、鞏(gong)固勝利、穩(wen)定政(zheng)局(ju)，參(can)照慣例，決(jue)定在前(qian)后藏(zang)邊防要(yao)隘、交通樞紐、重(zhong)要(yao)城鎮，以及川邊至(zhi)拉薩的臺站，均派兵駐(zhu)防，總計(ji)兵力1300余名。
章(zhang)程規定(ding)(ding)(ding)整編藏(zang)軍(jun)(jun)，設藏(zang)兵3000名(ming)，駐(zhu)(zhu)(zhu)(zhu)扎前藏(zang)1000名(ming)、后藏(zang)1000名(ming)、定(ding)(ding)(ding)日500名(ming)、江孜(zi)500名(ming)。《藏(zang)內(nei)善后章(zhang)程二十九(jiu)條》對(dui)(dui)藏(zang)軍(jun)(jun)的(de)各級軍(jun)(jun)官（代本、如本、甲本等(deng)）、藏(zang)軍(jun)(jun)薪俸(feng)、餉銀、操防(fang)、軍(jun)(jun)器、馬(ma)匹等(deng)，以及(ji)(ji)清(qing)朝派駐(zhu)(zhu)(zhu)(zhu)前后藏(zang)及(ji)(ji)各地的(de)官兵額數、駐(zhu)(zhu)(zhu)(zhu)防(fang)等(deng)方(fang)面章(zhang)程也作了(le)具體的(de)規定(ding)(ding)(ding)。整編后的(de)藏(zang)軍(jun)(jun)作為清(qing)中(zhong)(zhong)央政府領導下的(de)一(yi)支(zhi)地方(fang)軍(jun)(jun)隊，在以后維護地方(fang)安定(ding)(ding)(ding)和(he)抗(kang)擊外(wai)敵侵略的(de)斗(dou)爭中(zhong)(zhong)發揮(hui)了(le)積極作用。章(zhang)程規定(ding)(ding)(ding)駐(zhu)(zhu)(zhu)(zhu)藏(zang)大(da)臣每年五(wu)、六月(yue)輪流一(yi)人(ren)，到(dao)后藏(zang)巡(xun)邊(bian)，“操閱番兵”；檢查(cha)和(he)維護邊(bian)界(jie)；在重(zhong)要(yao)(yao)的(de)邊(bian)防(fang)要(yao)(yao)隘設立定(ding)(ding)(ding)額駐(zhu)(zhu)(zhu)(zhu)軍(jun)(jun)，分防(fang)巡(xun)守(shou)。隨著乾隆年間(jian)在西藏(zang)重(zhong)新布(bu)署駐(zhu)(zhu)(zhu)(zhu)防(fang)清(qing)軍(jun)(jun)、頒布(bu)和(he)執行章(zhang)程以及(ji)(ji)藏(zang)軍(jun)(jun)的(de)整編，清(qing)朝用兵西藏(zang)的(de)能量(liang)達(da)到(dao)極至(zhi)，駐(zhu)(zhu)(zhu)(zhu)兵西藏(zang)形成制度化和(he)法律化。上述舉(ju)措(cuo)，作為歷史(shi)定(ding)(ding)(ding)制，直(zhi)至(zhi)清(qing)末。它對(dui)(dui)于(yu)鞏固和(he)加強清(qing)朝統(tong)一(yi)、維護對(dui)(dui)西藏(zang)的(de)主權、鞏固國防(fang)、促進西藏(zang)社(she)會的(de)穩定(ding)(ding)(ding)和(he)發展都發揮(hui)了(le)重(zhong)要(yao)(yao)作用。
清(qing)(qing)軍(jun)(jun)(jun)平定廓(kuo)爾喀，進(jin)藏(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)駐藏(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)對(dui)(dui)西藏(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)地方社會經(jing)濟的(de)(de)(de)發展也產(chan)生(sheng)了(le)積(ji)極(ji)的(de)(de)(de)影(ying)響。清(qing)(qing)朝自康熙五(wu)十(shi)(shi)九(jiu)年（1720年）用(yong)兵(bing)西藏(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)后(hou)，即打通了(le)川藏(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)、滇藏(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)和(he)青藏(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)三條進(jin)藏(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)主(zhu)干驛路，沿途添設(she)軍(jun)(jun)(jun)站，設(she)置糧臺，派兵(bing)守護，保障了(le)進(jin)藏(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)交通的(de)(de)(de)通暢。這(zhe)有利于(yu)西藏(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)與內地之間的(de)(de)(de)貿易往(wang)來，當(dang)時留駐中甸(dian)、打箭爐、巴塘(tang)、理塘(tang)、察木多(duo)(duo)、拉薩等地的(de)(de)(de)漢(han)人和(he)商貿小販(fan)日益(yi)增(zeng)多(duo)(duo)。清(qing)(qing)朝每次用(yong)兵(bing)西藏(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)，均動員了(le)川、滇、青等藏(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)區的(de)(de)(de)僧俗民眾、土(tu)司和(he)部(bu)落(luo)頭人，征調大量(liang)的(de)(de)(de)人力、畜力和(he)物(wu)(wu)(wu)力擔當(dang)后(hou)勤供應(ying)(ying)，保障軍(jun)(jun)(jun)需物(wu)(wu)(wu)資運藏(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)。清(qing)(qing)朝官(guan)府對(dui)(dui)所征烏拉都付給(gei)腳價(jia)，對(dui)(dui)西藏(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)地方政府的(de)(de)(de)供應(ying)(ying)采(cai)取(qu)購買(mai)方式付給(gei)銀兩。如乾(qian)隆五(wu)十(shi)(shi)三年（1788年），就西藏(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)籌辦軍(jun)(jun)(jun)用(yong)糧餉事(shi)，對(dui)(dui)于(yu)駐藏(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)官(guan)兵(bing)的(de)(de)(de)口(kou)糧供應(ying)(ying)，形式多(duo)(duo)樣。如雍正帝曾下旨將駐藏(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)官(guan)兵(bing)的(de)(de)(de)口(kou)糧，由官(guan)府發給(gei)銀兩，到藏(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)之日，由士兵(bing)自行買(mai)備。乾(qian)隆十(shi)(shi)八年（1753年）以后(hou)又實行提(ti)前采(cai)買(mai)貯(zhu)存，以免出現(xian)供糧危(wei)機。清(qing)(qing)軍(jun)(jun)(jun)出錢在藏(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)區購買(mai)數(shu)量(liang)龐(pang)大的(de)(de)(de)軍(jun)(jun)(jun)糧物(wu)(wu)(wu)資，多(duo)(duo)少帶有商品買(mai)賣的(de)(de)(de)性(xing)質(zhi)，在某種意義上有利于(yu)刺(ci)激西藏(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)(zang)農(nong)牧業生(sheng)產(chan)和(he)商品經(jing)濟的(de)(de)(de)興起(qi)。
推行軍(jun)屯(tun)是清代就近解決(jue)戍邊(bian)部隊(dui)糧(liang)餉(xiang)問題的(de)(de)(de)(de)又(you)一(yi)辦法(fa)。清自康熙年(nian)間用兵(bing)西藏(zang)(zang)(zang)后，逐漸在(zai)鄰(lin)近的(de)(de)(de)(de)川（如大(da)小(xiao)金川）、滇（如中(zhong)甸和維(wei)西）、青(qing)（如西寧至格爾木(mu)(mu)）等(deng)省藏(zang)(zang)(zang)區(qu)推行軍(jun)屯(tun)。雍正九(jiu)年(nian)（1731年(nian)），清廷即派(pai)兵(bing)在(zai)青(qing)海柴達(da)木(mu)(mu)盆(pen)地的(de)(de)(de)(de)額色爾津(jin)地方筑(zhu)城(cheng)建(jian)廒，進(jin)(jin)行屯(tun)田。官府還(huan)將直隸、山西、河南(nan)、山東、陜(shan)西五省軍(jun)流罪人(ren)犯發配(pei)到青(qing)海大(da)通布隆吉爾等(deng)處(chu)，令他(ta)們一(yi)同(tong)開墾那里的(de)(de)(de)(de)土地。屯(tun)田地區(qu)除接(jie)受犯人(ren)之外(wai)，還(huan)吸引不少漢(han)(han)人(ren)向藏(zang)(zang)(zang)區(qu)遷(qian)移(yi)，官府給予屯(tun)田眷屬的(de)(de)(de)(de)待(dai)遇。對投(tou)誠的(de)(de)(de)(de)藏(zang)(zang)(zang)民，官府也安插與漢(han)(han)人(ren)一(yi)體屯(tun)墾。屯(tun)田帶有軍(jun)民混合、漢(han)(han)藏(zang)(zang)(zang)結(jie)合的(de)(de)(de)(de)特點。這些屯(tun)田，支持(chi)了(le)(le)西藏(zang)(zang)(zang)，解決(jue)了(le)(le)駐(zhu)藏(zang)(zang)(zang)清軍(jun)的(de)(de)(de)(de)一(yi)部分養(yang)贍問題，減少了(le)(le)內地供糧(liang)的(de)(de)(de)(de)壓力。屯(tun)田不僅是對藏(zang)(zang)(zang)區(qu)農牧(mu)業生產有示范效應，而且(qie)也有利于促進(jin)(jin)藏(zang)(zang)(zang)區(qu)的(de)(de)(de)(de)開發。
平定廓爾喀后(hou)，清(qing)(qing)軍(jun)(jun)進藏(zang)(zang)和駐藏(zang)(zang)極大地(di)推動(dong)(dong)了西藏(zang)(zang)與內地(di)、藏(zang)(zang)族(zu)與漢族(zu)之間的(de)(de)文(wen)化(hua)(hua)交(jiao)(jiao)流(liu)。清(qing)(qing)軍(jun)(jun)把軍(jun)(jun)用(yong)物資(zi)、生(sheng)活用(yong)品以及內地(di)先進的(de)(de)農耕、畜牧、建筑、藝術等(deng)方(fang)面的(de)(de)技術帶進西藏(zang)(zang)，又(you)把西藏(zang)(zang)的(de)(de)文(wen)化(hua)(hua)及地(di)方(fang)特產、各(ge)種藝術品等(deng)帶回內地(di)，形成廣(guang)泛的(de)(de)交(jiao)(jiao)流(liu)。清(qing)(qing)軍(jun)(jun)進藏(zang)(zang)后(hou)主動(dong)(dong)學習(xi)藏(zang)(zang)族(zu)文(wen)化(hua)(hua)，清(qing)(qing)統治者鼓勵清(qing)(qing)軍(jun)(jun)要“熟悉夷(yi)情”，士兵主動(dong)(dong)適應高(gao)原(yuan)生(sheng)活，甚至與藏(zang)(zang)族(zu)通(tong)婚。藏(zang)(zang)族(zu)也(ye)向清(qing)(qing)軍(jun)(jun)學習(xi)先進的(de)(de)內地(di)文(wen)化(hua)(hua)和生(sheng)產技術。清(qing)(qing)軍(jun)(jun)作為一(yi)個(ge)文(wen)化(hua)(hua)的(de)(de)載(zai)體(ti)，在與藏(zang)(zang)族(zu)的(de)(de)接觸中，留(liu)下了許多反(fan)映藏(zang)(zang)漢民族(zu)文(wen)化(hua)(hua)交(jiao)(jiao)流(liu)的(de)(de)歷史遺跡(ji)。由清(qing)(qing)軍(jun)(jun)建造的(de)(de)分布于拉薩等(deng)西藏(zang)(zang)各(ge)地(di)的(de)(de)關帝廟(miao)就是其(qi)中的(de)(de)重要反(fan)映。
巧笑倩兮 
