臺(tai)灣(wan)自古以(yi)來就與大陸的關系(xi)密不可分，所以(yi)統(tong)一是必然(ran)的規律和趨勢，特別是自元(yuan)朝以(yi)來，臺(tai)灣(wan)直接歸于中央政府管轄。天啟(qi)四(si)年（1624年）荷蘭(lan)東印(yin)度公(gong)司(si)部(bu)隊登(deng)陸大員，開始占(zhan)領(ling)臺(tai)灣(wan)。清兵(bing)入(ru)關后，勢力逐(zhu)漸進入(ru)福建(jian)。順治十六年（1659年）鄭(zheng)成功率(lv)領(ling)十萬(wan)大軍攻(gong)打南京，慘敗(bai)而回。鄭(zheng)軍元(yuan)氣大傷，鄭(zheng)成功感到清朝統(tong)治逐(zhu)漸穩固，而鄭(zheng)軍困守思明（廈門）孤島糧草(cao)匱乏，難(nan)以(yi)提供數萬(wan)大軍給養，開始思考(kao)取得另(ling)外的根據地以(yi)為整補。
順治十八年(nian)（1661年(nian)）三(san)月，鄭(zheng)成(cheng)(cheng)功(gong)親率2.5萬(wan)名(ming)兵將(jiang)，分乘百(bai)艘(sou)戰(zhan)船(chuan)，從(cong)金門出發。他(ta)們冒著風浪，越過臺(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)(wan)海峽，在(zai)澎(peng)湖休整幾(ji)天準備直取(qu)臺(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)(wan)。荷(he)蘭侵(qin)(qin)略(lve)軍(jun)(jun)(jun)聽說鄭(zheng)成(cheng)(cheng)功(gong)要進攻臺(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)(wan)，十分驚恐。他(ta)們把軍(jun)(jun)(jun)隊(dui)集中(zhong)(zhong)在(zai)臺(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)(wan)（今臺(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)(wan)東平地區(qu)）、赤嵌(qian)(qian)（今臺(tai)(tai)南）兩座(zuo)城堡(bao)，還在(zai)港口沉破(po)船(chuan)阻止鄭(zheng)成(cheng)(cheng)功(gong)船(chuan)隊(dui)登岸(an)。鄭(zheng)軍(jun)(jun)(jun)乘海水漲潮將(jiang)船(chuan)隊(dui)駛(shi)進鹿耳門內海，主力從(cong)禾寮港登陸，從(cong)側背進攻赤嵌(qian)(qian)城，并切斷(duan)了(le)與(yu)(yu)臺(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)(wan)城的(de)聯(lian)系。戰(zhan)斗中(zhong)(zhong)，侵(qin)(qin)略(lve)軍(jun)(jun)(jun)以(yi)“赫克(ke)(ke)托”號戰(zhan)艦攻擊(ji)，鄭(zheng)成(cheng)(cheng)功(gong)一(yi)聲令下(xia)，把敵軍(jun)(jun)(jun)緊緊圍住(zhu)，60多只戰(zhan)船(chuan)一(yi)齊發炮，把“赫克(ke)(ke)托”號擊(ji)沉。與(yu)(yu)此(ci)同時(shi)，又擊(ji)潰了(le)臺(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)(wan)城的(de)援軍(jun)(jun)(jun)。赤嵌(qian)(qian)的(de)荷(he)蘭軍(jun)(jun)(jun)在(zai)水源被切斷(duan)，外(wai)援無望(wang)的(de)情(qing)況(kuang)下(xia)，向(xiang)鄭(zheng)軍(jun)(jun)(jun)投降。盤踞(ju)臺(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)(wan)城的(de)侵(qin)(qin)略(lve)軍(jun)(jun)(jun)企圖(tu)負隅頑(wan)抗，鄭(zheng)成(cheng)(cheng)功(gong)在(zai)城周圍修(xiu)筑(zhu)土臺(tai)(tai)，圍困敵軍(jun)(jun)(jun)8個月后，下(xia)令向(xiang)臺(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)(wan)城發起強攻。至此(ci)，鄭(zheng)成(cheng)(cheng)功(gong)從(cong)荷(he)蘭侵(qin)(qin)略(lve)者手(shou)里(li)收復了(le)淪陷38年(nian)的(de)中(zhong)(zhong)國(guo)領土臺(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)(wan)。這場(chang)戰(zhan)爭(zheng)結束了(le)荷(he)蘭東印度公司在(zai)中(zhong)(zhong)國(guo)臺(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)(wan)的(de)經(jing)營(ying)，開啟了(le)明鄭(zheng)政權對臺(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)(wan)的(de)統(tong)治。
清(qing)(qing)(qing)朝(chao)(chao)入(ru)關之初，因(yin)(yin)忙于統一戰爭，無暇(xia)顧及(ji)臺(tai)(tai)灣(wan)。自從康(kang)熙(xi)(xi)以來，清(qing)(qing)(qing)朝(chao)(chao)內地的(de)(de)(de)反(fan)抗逐(zhu)漸平(ping)息，政局趨于穩(wen)固，而在(zai)臺(tai)(tai)灣(wan)的(de)(de)(de)鄭(zheng)(zheng)氏(shi)則時刻(ke)想侵擾清(qing)(qing)(qing)政權。鄭(zheng)(zheng)成功收臺(tai)(tai)的(de)(de)(de)次年即病逝(shi)，繼位的(de)(de)(de)鄭(zheng)(zheng)經(jing)(jing)利用(yong)康(kang)熙(xi)(xi)初年三(san)(san)藩(fan)之亂的(de)(de)(de)機會，渡(du)海(hai)西攻(gong)清(qing)(qing)(qing)朝(chao)(chao)福建(jian)、廣東(dong)(dong)沿(yan)(yan)海(hai)。康(kang)熙(xi)(xi)十三(san)(san)年（1674年）耿精忠響應(ying)吳三(san)(san)桂發起的(de)(de)(de)叛亂，以提(ti)供戰船給鄭(zheng)(zheng)經(jing)(jing)，換取出兵，鄭(zheng)(zheng)經(jing)(jing)應(ying)允此事。泉(quan)州、漳州、潮州陸續投靠鄭(zheng)(zheng)經(jing)(jing)。康(kang)熙(xi)(xi)十五年（1676年），廣東(dong)(dong)尚(shang)之信再次遭鄭(zheng)(zheng)軍(jun)擊(ji)敗，只(zhi)得加入(ru)三(san)(san)藩(fan)反(fan)清(qing)(qing)(qing)陣營，并(bing)將惠州割讓給鄭(zheng)(zheng)經(jing)(jing)。三(san)(san)藩(fan)之亂后期(qi)，清(qing)(qing)(qing)軍(jun)逐(zhu)漸占據優勢(shi)，鄭(zheng)(zheng)氏(shi)在(zai)閩粵沿(yan)(yan)海(hai)的(de)(de)(de)勢(shi)力開始被驅逐(zhu)出去。一方(fang)面，鄭(zheng)(zheng)氏(shi)不斷對(dui)東(dong)(dong)南沿(yan)(yan)海(hai)的(de)(de)(de)侵襲影響到清(qing)(qing)(qing)朝(chao)(chao)東(dong)(dong)南賦稅之地的(de)(de)(de)穩(wen)定(ding)，同時也不利南方(fang)民心的(de)(de)(de)穩(wen)定(ding)；另(ling)一方(fang)面，臺(tai)(tai)灣(wan)的(de)(de)(de)鄭(zheng)(zheng)氏(shi)也被認為是明朝(chao)(chao)正統，成為反(fan)清(qing)(qing)(qing)復明的(de)(de)(de)最(zui)后基地。臺(tai)(tai)灣(wan)繼續孤懸(xuan)海(hai)外(wai)，不利多民族封建(jian)專制主義中(zhong)央集權國家的(de)(de)(de)鞏固和(he)統一。因(yin)(yin)此，清(qing)(qing)(qing)朝(chao)(chao)收取臺(tai)(tai)灣(wan)勢(shi)在(zai)必行。
早在(zai)(zai)康熙(xi)初(chu)年(nian)(nian)(nian)(nian)，清(qing)(qing)朝(chao)(chao)就與臺(tai)(tai)灣(wan)(wan)鄭(zheng)(zheng)(zheng)氏當(dang)(dang)局有(you)了(le)(le)交流。在(zai)(zai)康熙(xi)元(yuan)年(nian)(nian)(nian)(nian)（1662年(nian)(nian)(nian)(nian)）鄭(zheng)(zheng)(zheng)成功(gong)(gong)病逝后(hou)不(bu)久，清(qing)(qing)廷即(ji)派(pai)人前往廈(sha)門招撫鄭(zheng)(zheng)(zheng)經。其時，鄭(zheng)(zheng)(zheng)經與其叔父(fu)鄭(zheng)(zheng)(zheng)世(shi)襲(xi)火并正烈，鄭(zheng)(zheng)(zheng)經害怕清(qing)(qing)廷“指(zhi)日加兵(bing)，內外受困”，因(yin)(yin)此，陽奉(feng)陰(yin)違，虛與應(ying)付，以“茍延歲月”。第二年(nian)(nian)(nian)(nian)，鄭(zheng)(zheng)(zheng)經得勢，則提(ti)出“請如琉球、朝(chao)(chao)鮮例(li)，不(bu)登岸，不(bu)剔發(fa)易衣冠”。清(qing)(qing)廷當(dang)(dang)然不(bu)會答應(ying)，雙方(fang)仍(reng)成對峙局面。當(dang)(dang)年(nian)(nian)(nian)(nian)十月，清(qing)(qing)軍(jun)分三(san)路攻(gong)廈(sha)門等地，清(qing)(qing)軍(jun)擊(ji)敗鄭(zheng)(zheng)(zheng)軍(jun)，攻(gong)占(zhan)了(le)(le)廈(sha)門。鄭(zheng)(zheng)(zheng)經退守銅山。后(hou)鄭(zheng)(zheng)(zheng)軍(jun)軍(jun)官(guan)眼看大勢已去，紛(fen)(fen)紛(fen)(fen)率(lv)兵(bing)降(jiang)清(qing)(qing)，致使(shi)鄭(zheng)(zheng)(zheng)軍(jun)在(zai)(zai)大陸(lu)沿海(hai)據點紛(fen)(fen)紛(fen)(fen)失守。康熙(xi)三(san)年(nian)(nian)(nian)(nian)（1664年(nian)(nian)(nian)(nian)）清(qing)(qing)廷授(shou)福(fu)建提(ti)督水師(shi)總兵(bing)官(guan)施(shi)(shi)瑯(lang)(lang)為靖海(hai)將軍(jun)，令(ling)其統(tong)帥水師(shi)，前往征剿鄭(zheng)(zheng)(zheng)經。施(shi)(shi)瑯(lang)(lang)率(lv)水師(shi)先(xian)后(hou)三(san)次(ci)渡海(hai)，均因(yin)(yin)臺(tai)(tai)風襲(xi)擊(ji)而未(wei)(wei)成功(gong)(gong)。康熙(xi)六年(nian)(nian)(nian)(nian)（1667年(nian)(nian)(nian)(nian)），清(qing)(qing)廷又(you)派(pai)福(fu)建招撫總兵(bing)官(guan)孔元(yuan)章先(xian)后(hou)兩次(ci)渡海(hai)招撫鄭(zheng)(zheng)(zheng)經，但鄭(zheng)(zheng)(zheng)經仍(reng)頑固地堅持(chi)所謂“朝(chao)(chao)鮮例(li)”，招撫未(wei)(wei)成。康熙(xi)七年(nian)(nian)(nian)(nian)（1668年(nian)(nian)(nian)(nian)）初(chu)令(ling)施(shi)(shi)瑯(lang)(lang)來京師(shi)，商討(tao)進兵(bing)臺(tai)(tai)灣(wan)(wan)的大計。施(shi)(shi)瑯(lang)(lang)到(dao)京師(shi)后(hou)，詳(xiang)陳武力統(tong)一臺(tai)(tai)灣(wan)(wan)的意(yi)見(jian)，但因(yin)(yin)當(dang)(dang)時天下初(chu)定，沿海(hai)地區人心未(wei)(wei)穩，施(shi)(shi)瑯(lang)(lang)的意(yi)見(jian)未(wei)(wei)被采納。不(bu)過，康熙(xi)帝(di)意(yi)識到(dao)武力統(tong)一臺(tai)(tai)灣(wan)(wan)只是時間(jian)問(wen)題，因(yin)(yin)此盡管未(wei)(wei)采納施(shi)(shi)瑯(lang)(lang)的意(yi)見(jian)，但命他為內大臣，留在(zai)(zai)京師(shi)，以備(bei)應(ying)急之(zhi)用。
三藩之亂結(jie)束后，清(qing)朝的統治更加穩固，收復臺(tai)灣事宜就被提上(shang)了日程。康熙(xi)帝(di)玄燁對收取臺(tai)灣的事務十分熱心，康熙(xi)十六年(nian)(nian)(nian)(nian)（1677年(nian)(nian)(nian)(nian)），康熙(xi)帝(di)恢復福建水(shui)師(shi)(shi)體制(zhi)；康熙(xi)十八年(nian)(nian)(nian)(nian)（1679年(nian)(nian)(nian)(nian)），康熙(xi)帝(di)任命湖南岳州水(shui)師(shi)(shi)總(zong)兵官萬(wan)正色為福建水(shui)師(shi)(shi)提督(du)(du)。至是年(nian)(nian)(nian)(nian)年(nian)(nian)(nian)(nian)底(di)，福建水(shui)師(shi)(shi)有戰船240艘(sou)，官兵28580名(ming)。康熙(xi)十九(jiu)年(nian)(nian)(nian)(nian)（1680年(nian)(nian)(nian)(nian)），鄭經和(he)清(qing)朝的戰爭失利，放(fang)棄廈門(men)、金門(men)，退往臺(tai)灣。福建總(zong)督(du)(du)姚啟圣打算趁勢(shi)進(jin)攻臺(tai)灣，但遭福建水(shui)師(shi)(shi)提督(du)(du)萬(wan)正色反(fan)對，加上(shang)一些大臣支持萬(wan)正色的看法(fa)，康熙(xi)帝(di)也顧慮在西南的吳世璠未(wei)解(jie)決，決定暫緩進(jin)攻。
康熙(xi)二十年(nian)(nian)（1681年(nian)(nian)），鄭經中風而死(si)，鄭氏(shi)臺灣(wan)內(nei)部發生(sheng)政變(bian)，年(nian)(nian)僅12歲的(de)鄭克塽(shuang)繼任(ren)延平王(wang)，大權實際(ji)上為馮錫(xi)范、劉國軒掌握，鄭氏(shi)官員向心力開始動搖(yao)，負責與(yu)清朝(chao)(chao)談和(he)的(de)傅(fu)為霖甚至愿當內(nei)應。姚啟圣認為是進攻臺灣(wan)的(de)好時機，但萬正(zheng)(zheng)(zheng)色仍反對出兵(bing)。姚啟圣知道施(shi)(shi)瑯(lang)(lang)仇(chou)視鄭氏(shi)王(wang)朝(chao)(chao)，必能(neng)幫(bang)助他擊(ji)敗鄭軍，便(bian)向康熙(xi)帝(di)推薦施(shi)(shi)瑯(lang)(lang)。康熙(xi)帝(di)也不滿(man)萬正(zheng)(zheng)(zheng)色反戰的(de)態(tai)度，便(bian)同(tong)意施(shi)(shi)瑯(lang)(lang)擔任(ren)水師提督，萬正(zheng)(zheng)(zheng)色調任(ren)陸師提督。
按(an)照康熙帝規(gui)劃，應由姚(yao)(yao)啟圣、萬(wan)正色、巡撫吳興祚(zuo)一起商討作(zuo)戰(zhan)，施瑯卻打算排(pai)除(chu)姚(yao)(yao)啟圣等人的節制，以便能全(quan)權(quan)進(jin)攻臺灣，不過(guo)康熙帝只同意吳興祚(zuo)負責后(hou)勤，仍然命令姚(yao)(yao)啟圣和施瑯共同出兵。
康(kang)熙(xi)二十(shi)(shi)一(yi)年(nian)五(wu)月(yue)初(chu)五(wu)（1682年(nian)6月(yue)10日(ri)），清軍(jun)抵達銅山島，姚(yao)啟圣和施(shi)瑯(lang)卻在爭(zheng)執出兵時機，姚(yao)啟圣主張(zhang)利(li)用冬(dong)天的(de)北風(feng)，施(shi)瑯(lang)主張(zhang)利(li)用夏天的(de)南風(feng)，導致清軍(jun)無法順利(li)出兵。最(zui)后(hou)康(kang)熙(xi)帝于十(shi)(shi)月(yue)初(chu)六（11月(yue)15日(ri)）裁定(ding)施(shi)瑯(lang)負責(ze)前(qian)線(xian)作戰，姚(yao)啟圣改任后(hou)勤(qin)作業(ye)，才讓施(shi)瑯(lang)如愿取得統(tong)帥權。十(shi)(shi)一(yi)月(yue)初(chu)三(san)（12月(yue)1日(ri)）施(shi)瑯(lang)率領約(yue)21000人，軍(jun)艦238艘前(qian)往興化平海衛訓練(lian)軍(jun)隊(dui)。
姚啟圣(sheng)軍權旁落后(hou)，為避(bi)免(mian)施(shi)瑯獨得戰(zhan)(zhan)功，轉而和鄭氏王朝談(tan)判。但是(shi)施(shi)瑯主戰(zhan)(zhan)意志堅決，且負(fu)責談(tan)判的(de)劉國軒不接受剃(ti)發易服，談(tan)判因(yin)此(ci)破裂。康(kang)熙二(er)十二(er)年五月(yue)(yue)廿三日（1683年6月(yue)(yue)17日）康(kang)熙帝下令施(shi)瑯盡速進(jin)攻，因(yin)此(ci)爆發六月(yue)(yue)（陽歷(li)7月(yue)(yue)）的(de)澎湖海(hai)戰(zhan)(zhan)。
康熙(xi)十八(ba)年(nian)（1679年(nian)）起，清(qing)(qing)朝實施(shi)遷界令，嚴重打擊(ji)鄭氏王朝的貿易，糧食(shi)補給也(ye)出現(xian)問(wen)題(ti)，鄭經下令每戶人(ren)家每個月必(bi)須多繳一斗(dou)米，將領也(ye)必(bi)須用自己(ji)的俸祿(lu)充軍(jun)，仍沒辦(ban)法解除危(wei)機。當時英(ying)國商館就如此看待鄭氏王朝：“臺灣王之境況甚不安定，不易抵抗(kang)滿(man)(man)清(qing)(qing)人(ren)，滿(man)(man)清(qing)(qing)人(ren)常(chang)施(shi)恫赫，國王因其(qi)財(cai)富被消耗，故(gu)每日向(xiang)人(ren)民橫征(zheng)暴斂，亦不能使(shi)軍(jun)隊滿(man)(man)意。是以我國不惟受敵人(ren)（清(qing)(qing)軍(jun)）之威(wei)脅，亦恐軍(jun)隊（鄭軍(jun)）因缺餉而(er)叛變。”
康熙十九年(nian)(nian)（1680年(nian)(nian)），鄭經退守臺灣后，澎湖(hu)成為(wei)前線要地，防守卻很薄弱。直(zhi)到十月，施瑯抵達廈門以及傅為(wei)霖為(wei)清軍內應事情爆發(fa)，劉(liu)國軒才前往澎湖(hu)強化守備。劉(liu)國軒抵達澎湖(hu)后，在娘媽(ma)宮、風柜尾(wei)、四角嶼(yu)、雞籠嶼(yu)筑城；東(dong)蒔、西蒔、內塹(qian)(qian)、外塹(qian)(qian)、西嶼(yu)頭、牛心山設置炮(pao)臺。同時在海邊建造矮墻并配置火(huo)銃，阻止清軍登陸。
康熙(xi)二(er)(er)十二(er)(er)年(nian)（1683年(nian)），劉國軒得(de)知施瑯(lang)準備進(jin)攻，便(bian)從臺灣本島調度(du)鄉兵(bing)到澎湖，并將(jiang)商(shang)船(chuan)(chuan)(chuan)(chuan)以及私人用船(chuan)(chuan)(chuan)(chuan)都改為軍艦（大小(xiao)炮(pao)船(chuan)(chuan)(chuan)(chuan)、鳥船(chuan)(chuan)(chuan)(chuan)、趕繒(zeng)船(chuan)(chuan)(chuan)(chuan)、洋(yang)船(chuan)(chuan)(chuan)(chuan)、雙帆(fan)等(deng)各式戰船(chuan)(chuan)(chuan)(chuan)約200艘），準備決戰。
康熙二(er)十(shi)二(er)年六月(yue)十(shi)四日（1683年7月(yue)8日），施瑯從(cong)銅山(shan)島出發，姚啟圣也撥3000人(ren)同施瑯出征（清(qing)軍(jun)24000人(ren)，大鳥船(chuan)70艘(sou)、趕繒船(chuan)103艘(sou)、雙帆(fan)居(ju)船(chuan)65艘(sou)）。十(shi)五(wu)日（9日）鄭軍(jun)哨船(chuan)發現(xian)清(qing)軍(jun)已到花(hua)嶼(yu)、貓嶼(yu)一帶，趕緊回報劉國(guo)軒，當晚(wan)清(qing)軍(jun)在八罩島過夜(ye)。
十六日（10日）施(shi)瑯進攻(gong)娘媽宮，以(yi)速(su)度快的鳥船(chuan)當作先鋒。劉國軒(xuan)讓林升、江勝指揮水軍(jun)(jun)；邱輝為(wei)先鋒，自己在娘媽宮港口(kou)督戰。當時受風(feng)勢(shi)阻擾(rao)，清(qing)軍(jun)(jun)不(bu)敢前進，只(zhi)有以(yi)藍理為(wei)首(shou)的7只(zhi)艦隊突入鄭軍(jun)(jun)。
施(shi)(shi)(shi)瑯(lang)(lang)再派出第二波鳥船部隊(dui)，交戰不久后開(kai)始漲潮，一些清(qing)軍船只被海水沖向岸邊，鄭(zheng)軍趁勢將艦隊(dui)分成兩翼(yi)包圍(wei)清(qing)軍。施(shi)(shi)(shi)瑯(lang)(lang)見狀趕(gan)緊(jin)突入鄭(zheng)軍，想解救被圍(wei)困的(de)(de)船只，卻被林升(sheng)率軍包圍(wei)。施(shi)(shi)(shi)瑯(lang)(lang)在交戰中被火(huo)銃射(she)傷右眼，不過沒有失明(ming)；林升(sheng)也被大炮打斷左腿。林升(sheng)負傷讓(rang)鄭(zheng)軍失去指揮(hui)，施(shi)(shi)(shi)瑯(lang)(lang)借(jie)機(ji)撤離戰場(chang)，到(dao)西嶼附近的(de)(de)海上休息。
施瑯在(zai)(zai)十(shi)七日（11日）返回八(ba)(ba)罩(zhao)島(dao)(dao)(dao)，八(ba)(ba)罩(zhao)島(dao)(dao)(dao)地形(xing)險惡，船只遇暴風很容易撞上島(dao)(dao)(dao)邊的(de)暗(an)礁，農歷六月(yue)又是容易發(fa)生臺(tai)風的(de)時節，施瑯卻(que)很幸運沒(mei)碰到臺(tai)風。劉國(guo)軒得知清軍(jun)在(zai)(zai)八(ba)(ba)罩(zhao)島(dao)(dao)(dao)休息，親自進攻卻(que)被(bei)施瑯擊退。施瑯趁勢在(zai)(zai)十(shi)八(ba)(ba)日（12日）先(xian)派戰船攻取澎湖港外虎井嶼、桶(tong)盤嶼。
二(er)十二(er)日（16日）早七時，施瑯決定發動總(zong)攻擊，將艦隊分(fen)成三路進攻，剩下(xia)約(yue)80艘當后援部(bu)隊：
中路：共有56艘船(chuan)，分成8隊，每隊有7艘船(chuan)。由(you)施瑯親(qin)自(zi)指揮，作(zuo)為主力(li)進攻(gong)娘媽(ma)宮。
右路(lu)：共有50艘船，由總(zong)兵(bing)陳蠎(mang)等從澎湖港口東側(ce)東蒔(shi)攻入雞籠(long)嶼(yu)、四角嶼(yu)，后會合中央部隊夾(jia)攻鄭軍(jun)。
左路：共有(you)50艘(sou)船，由總(zong)兵董義等(deng)從澎湖港口西側內塹攻入牛心灣，讓鄭(zheng)軍(jun)誤判清軍(jun)要(yao)在此地登陸。
天(tian)(tian)亮前(qian)，開始刮起臺(tai)風(feng)。辰時(shi)(shi)（7時(shi)(shi)—9時(shi)(shi)）受(shou)臺(tai)風(feng)影響(xiang)，海(hai)上吹起西北(bei)風(feng)，鄭(zheng)(zheng)軍(jun)(jun)(jun)順著風(feng)勢進攻(gong)，一(yi)時(shi)(shi)處于優(you)勢，清將(jiang)朱(zhu)天(tian)(tian)貴被炮擊(ji)而(er)死。到了中午，臺(tai)風(feng)受(shou)到赤道鋒面帶的影響(xiang)，海(hai)上開始吹南風(feng)，風(feng)向轉變成對清軍(jun)(jun)(jun)有利(li)。施瑯命令(ling)全軍(jun)(jun)(jun)反攻(gong)，順著風(feng)勢發射各種火器，并且(qie)以數船(chuan)圍攻(gong)鄭(zheng)(zheng)軍(jun)(jun)(jun)一(yi)船(chuan)，鄭(zheng)(zheng)軍(jun)(jun)(jun)全面崩潰，江勝戰(zhan)死、邱(qiu)輝(hui)自(zi)焚。共(gong)斃傷鄭(zheng)(zheng)軍(jun)(jun)(jun)12000人(ren)，俘5000余(yu)人(ren)。擊(ji)毀(hui)、繳獲戰(zhan)船(chuan)190余(yu)艘。劉(liu)國軒眼見大勢已去(qu)，率領殘余(yu)部隊(dui)從北(bei)面吼門退往臺(tai)灣，澎湖各島鄭(zheng)(zheng)軍(jun)(jun)(jun)都向施瑯投降(jiang)。清軍(jun)(jun)(jun)陣亡329人(ren)，傷1800余(yu)人(ren)，船(chuan)只無一(yi)損失。
施(shi)瑯戰勝后，考慮臺(tai)灣水道非常(chang)險惡(e)，進(jin)軍困難。施(shi)瑯決定暫緩進(jin)攻(gong)，采取攻(gong)心戰術，讓鄭(zheng)氏(shi)王朝(chao)從(cong)內(nei)部崩潰(kui)。施(shi)瑯在澎湖禁止殺戮，張(zhang)榜安民(min)；發布《安撫輸誠示》。派(pai)原(yuan)劉國軒副將(jiang)(jiang)曾蜚赴臺(tai)。派(pai)人(ren)醫治受(shou)傷戰俘，并配給他們衣服、糧(liang)食(shi)，再將(jiang)(jiang)士兵送回臺(tai)灣。還拉攏鄭(zheng)軍將(jiang)(jiang)領為(wei)內(nei)應，防守淡水的何佑首先(xian)私通施(shi)瑯，其他將(jiang)(jiang)領也跟(gen)進(jin)。
鄭軍(jun)戰敗消息傳到(dao)臺(tai)灣，人心開始不(bu)安。為了延續政(zheng)權的生存(cun)，有將領提出(chu)進攻菲(fei)律賓，得(de)到(dao)馮錫范同意。卻傳出(chu)遠(yuan)征(zheng)軍(jun)只想搶劫，還(huan)打(da)算(suan)逃往海外，因(yin)此劉國軒阻止(zhi)此計劃。七月(yue)十三日(ri)(ri)（9月(yue)3日(ri)(ri)），施瑯率軍(jun)在臺(tai)灣登陸。后(hou)來在劉國軒大力主張下，鄭克塽于(yu)七月(yue)十五日(ri)(ri)（9月(yue)5日(ri)(ri)）向(xiang)施瑯投降，并于(yu)八(ba)月(yue)十八(ba)日(ri)(ri)（10月(yue)8日(ri)(ri)）剃發(fa)易(yi)服(fu)，鄭氏王(wang)朝正(zheng)式滅亡(wang)。
鄭克塽投降后(hou)，清廷為了是否把(ba)臺灣并(bing)入版圖產生爭論，不少大臣認為臺灣孤(gu)懸海上，治理以及防守(shou)花費不小，主張棄守(shou)。最(zui)后(hou)施瑯以臺灣戰(zhan)略地位重要，說服(fu)清廷將臺灣并(bing)入版圖。
施瑯(lang)軍(jun)隊到(dao)達(da)臺(tai)(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)(wan)(wan)后(hou)，鄭(zheng)氏無力抵抗清(qing)(qing)軍(jun)，只得(de)投降，結束在臺(tai)(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)(wan)(wan)歷經22年(nian)的統治，臺(tai)(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)(wan)(wan)也因此成為(wei)(wei)清(qing)(qing)朝的領(ling)土。康(kang)熙二(er)十(shi)(shi)二(er)年(nian)（1683年(nian)）六月十(shi)(shi)四(si)日，施瑯(lang)率領(ling)戰(zhan)船300余艘，水(shui)師2萬余人，仍自(zi)銅山出洋，第二(er)天上午，戰(zhan)船即(ji)陸續到(dao)達(da)澎湖海(hai)外。十(shi)(shi)六日曾發生小規模海(hai)戰(zhan)，雙方各有損傷。二(er)十(shi)(shi)二(er)日清(qing)(qing)軍(jun)分三路出擊(ji)，與(yu)鄭(zheng)軍(jun)決戰(zhan)，施瑯(lang)親(qin)率主(zhu)力擔任中路主(zhu)攻。清(qing)(qing)軍(jun)利(li)(li)用“風(feng)利(li)(li)舟快，瞬息飛駛，居上風(feng)上流之勢，壓攻擠擊(ji)”，一鼓作(zuo)氣，經過七(qi)八個(ge)小時激戰(zhan)，大敗鄭(zheng)軍(jun)。劉(liu)國軒(xuan)率所剩幾只小舟逃回臺(tai)(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)(wan)(wan)。澎湖為(wei)(wei)臺(tai)(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)(wan)(wan)門戶，一旦失守，臺(tai)(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)(wan)(wan)即(ji)失去(qu)了(le)屏障。由于(yu)鄭(zheng)氏集團(tuan)政(zheng)治腐敗，所以清(qing)(qing)廷(ting)統一臺(tai)(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)(wan)(wan)得(de)到(dao)臺(tai)(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)(wan)(wan)各族(zu)人民的支(zhi)持和擁護，清(qing)(qing)軍(jun)至臺(tai)(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)(wan)(wan)時“百姓壺漿(jiang)相繼(ji)于(yu)路，海(hai)兵(bing)皆預制清(qing)(qing)朝旗號(hao)以迎王師”。施瑯(lang)派員到(dao)臺(tai)(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)(wan)(wan)勸降，聯絡(luo)劉(liu)國軒(xuan)。劉(liu)國軒(xuan)見(jian)大勢已去(qu)，于(yu)是派兵(bing)監(jian)視鄭(zheng)氏統治集團(tuan)，鄭(zheng)克塽、馮錫范只得(de)上表求(qiu)降。八月，清(qing)(qing)軍(jun)勝(sheng)利(li)(li)進駐臺(tai)(tai)(tai)灣(wan)(wan)(wan)(wan)(wan)。
交(jiao)戰雙方的兵力大體相當，鄭軍經營澎湖多(duo)年(nian)，設防據(ju)守，以(yi)逸(yi)待勞(lao)；清軍渡海作戰，遠來疲憊(bei)。鄭軍處(chu)于有利態勢(shi)，而結果(guo)卻一敗涂(tu)地，全軍覆(fu)沒。除政治腐敗，士氣不高以(yi)外，指揮上(shang)的失著應(ying)是一個(ge)重(zhong)要原因。
首先(xian)是防御部署上的錯誤(wu)。鄭軍(jun)只注(zhu)意防守八(ba)罩水道以北(bei)的北(bei)大山(shan)、西嶼、北(bei)山(shan)等大島，而忽視了在(zai)八(ba)罩水道以南的八(ba)罩、虎井(jing)、桶盤、花嶼、貓嶼等諸小嶼設防，這就使(shi)南來的清(qing)軍(jun)水師得以乘(cheng)虛入據，成了清(qing)軍(jun)駐(zhu)泊、休整和出(chu)擊的前(qian)進基地。
其次是消極防(fang)御，貽誤(wu)戰(zhan)機(ji)。當(dang)清軍(jun)水師經過30多小時的(de)航行(xing)，抵近澎湖時，鄭軍(jun)宣毅左鎮邱(qiu)輝對劉(liu)(liu)(liu)國(guo)(guo)軒說(shuo)：“乘(cheng)彼(bi)(bi)船(chuan)(chuan)初(chu)到(dao)，安澳未定(ding)，兵(bing)心尚(shang)搖，輝愿領煩船(chuan)(chuan)十(shi)只(zhi)，同左虎衛江(jiang)勝貫陣卻之(zhi)。”建威(wei)中鎮黃良驥(ji)也(ye)說(shuo)：“先發制人，半(ban)渡(du)而(er)擊，正合兵(bing)法(fa)。”劉(liu)(liu)(liu)國(guo)(guo)軒卻說(shuo)：“炮臺處處謹守，彼(bi)(bi)何處灣泊？當(dang)此(ci)六月時候，一(yi)旦風(feng)起(qi)，則彼(bi)(bi)何所容身？此(ci)乃以(yi)逸(yi)待(dai)勞，不戰(zhan)可收全功(gong)也(ye)。”遂按兵(bing)不動，使清軍(jun)水師得以(yi)順(shun)利到(dao)達澎湖，環泊花、貓二嶼。邱(qiu)輝又(you)建議(yi)：“乘(cheng)夜(ye)潮落，沖舟(zhou)宗擊之(zhi)”，又(you)遭拒絕(jue)。十(shi)六日，清軍(jun)出(chu)戰(zhan)不利，千(qian)帥(shuai)受傷。邱(qiu)輝建議(yi)乘(cheng)勝夜(ye)襲，劉(liu)(liu)(liu)國(guo)(guo)軒仍以(yi)等待(dai)颶風(feng)使彼(bi)(bi)自覆為(wei)由未予采納。邱(qiu)輝說(shuo)：“兵(bing)法(fa)有云：半(ban)渡(du)可擊，立(li)營未定(ding)可擊，乘(cheng)虛可擊；今敵患三者，而(er)不乘(cheng)其勢，若早晚無(wu)風(feng)，合萬人為(wei)一(yi)心而(er)死戰(zhan)，將奈何？”劉(liu)(liu)(liu)國(guo)(guo)軒不聽(ting)部屬的(de)合理建議(yi)，三次放(fang)棄殲敵的(de)有利戰(zhan)機(ji)，把取(qu)勝的(de)希望完全寄(ji)托(tuo)在(zai)可期而(er)不可必的(de)風(feng)暴上，結果是風(feng)未至(zhi)而(er)兵(bing)已(yi)敗。
第三是冒(mao)險(xian)決戰(zhan)(zhan)，全(quan)軍覆(fu)沒(mei)。戰(zhan)(zhan)史上因(yin)主帥胸無全(quan)局，遷(qian)就眼前事(shi)變，由消(xiao)極防御(yu)變為冒(mao)險(xian)決戰(zhan)(zhan)的(de)事(shi)例時有發(fa)生(sheng)。鄭軍的(de)作戰(zhan)(zhan)方針本(ben)來是以(yi)澎湖(hu)為重點設防固守(shou)，劉(liu)國軒(xuan)(xuan)本(ben)人(ren)也不(bu)(bu)愿主動出擊，而是指望海上風暴會使(shi)清(qing)軍不(bu)(bu)戰(zhan)(zhan)而敗。既然如此(ci)，就應該充分利用防御(yu)工事(shi)，保存(cun)有生(sheng)力量(liang)，避免與清(qing)軍決戰(zhan)(zhan)。劉(liu)國軒(xuan)(xuan)見不(bu)(bu)及此(ci)，當施(shi)瑯發(fa)起總攻時，亦率全(quan)部海上兵力迎戰(zhan)(zhan)，終于全(quan)軍覆(fu)沒(mei)。
在(zai)澎湖(hu)海戰(zhan)中，清(qing)軍(jun)之所以(yi)(yi)取勝，除戰(zhan)船(chuan)裝備(bei)精(jing)良，將士作戰(zhan)勇(yong)敢之外，也是與作戰(zhan)指揮(hui)的(de)(de)正確分不(bu)開的(de)(de)。清(qing)軍(jun)水師統(tong)(tong)帥(shuai)施瑯“治軍(jun)嚴整，通(tong)陣法，尤善水戰(zhan)，諳海中風(feng)(feng)候”，因此在(zai)指揮(hui)上有(you)許多(duo)獨到之處(chu)。在(zai)渡海時間上，他(ta)一反(fan)在(zai)東北風(feng)(feng)季(ji)節渡海的(de)(de)傳統(tong)(tong)，選在(zai)西南風(feng)(feng)始發(fa)的(de)(de)六月(yue)中旬。有(you)人間這是什么原(yuan)故，施瑯說：“北風(feng)(feng)日夜猛，今攻澎湖(hu)，未能一戰(zhan)克(ke)，風(feng)(feng)起舟散，將何(he)以(yi)(yi)戰(zhan)？夏至前(qian)后二十余日，風(feng)(feng)微，夜尤靜，可聚泊(bo)大洋，觀釁(xin)而功，不(bu)過七日，舉之必矣(yi)。”
這種(zhong)選(xuan)擇曾經(jing)遭到(dao)(dao)姚啟圣等人(ren)的(de)(de)強烈(lie)反(fan)對，但施(shi)瑯始終(zhong)不(bu)(bu)為所動。實戰(zhan)(zhan)(zhan)(zhan)證明，這一選(xuan)擇是正確的(de)(de)，它保障了(le)清(qing)軍(jun)水師在發起總攻前(qian)的(de)(de)安全錨泊。在渡海航(hang)(hang)路上，以(yi)往從大(da)陸到(dao)(dao)臺(tai)灣，都從金(jin)、廈出(chu)航(hang)(hang)，而施(shi)瑯又一反(fan)慣例，把出(chu)航(hang)(hang)點選(xuan)在靠南(nan)的(de)(de)銅山(shan)島。因(yin)為水師從銅山(shan)出(chu)航(hang)(hang)后可利(li)用西南(nan)風，直取澎(peng)湖(hu)以(yi)南(nan)鄭軍(jun)未設防(fang)的(de)(de)諸(zhu)島嶼(yu)，以(yi)作為前(qian)進(jin)基地(di)，然后向北轉(zhuan)入(ru)澎(peng)湖(hu)海域，這樣便始終(zhong)處于順(shun)風順(shun)流的(de)(de)有利(li)陣位。實戰(zhan)(zhan)(zhan)(zhan)證明，這種(zhong)選(xuan)擇是正確的(de)(de)，取得了(le)預期的(de)(de)效果。在戰(zhan)(zhan)(zhan)(zhan)術上，集中(zhong)兵(bing)力，速戰(zhan)(zhan)(zhan)(zhan)速決。澎(peng)湖(hu)海域六月多風，深(shen)諳海情的(de)(de)施(shi)瑯是知道的(de)(de)，在初戰(zhan)(zhan)(zhan)(zhan)小挫之后，便立即(ji)抓緊再戰(zhan)(zhan)(zhan)(zhan)準(zhun)備，并不(bu)(bu)失(shi)時(shi)機地(di)發起總攻。施(shi)瑯除分(fen)兵(bing)二路，從東、西兩個方向進(jin)行佯動和箝(qian)制以(yi)外，在主(zhu)(zhu)攻方向上集中(zhong)了(le)56艘主(zhu)(zhu)力戰(zhan)(zhan)(zhan)(zhan)船(chuan)，并以(yi)五船(chuan)合攻一船(chuan)，逐次殲(jian)滅了(le)鄭軍(jun)主(zhu)(zhu)力，而清(qing)軍(jun)水師卻無一船(chuan)損(sun)(sun)失(shi)。一場(chang)大(da)規(gui)模海戰(zhan)(zhan)(zhan)(zhan)，損(sun)(sun)傷如此懸殊，這在海戰(zhan)(zhan)(zhan)(zhan)史(shi)上也屬鮮見。
清朝統一(yi)臺(tai)(tai)灣(wan)(wan)后，施瑯懇切陳(chen)辭，闡述(shu)利害(hai)，得到大學士李蔚(yu)、工(gong)部侍郎蘇拜、都察院左御史趙麟等人的贊同和支持，于(yu)是康(kang)熙帝(di)始(shi)決(jue)定堅守臺(tai)(tai)灣(wan)(wan)，在(zai)臺(tai)(tai)灣(wan)(wan)設(she)(she)臺(tai)(tai)灣(wan)(wan)府，下轄臺(tai)(tai)灣(wan)(wan)、諸羅、鳳山(shan)三縣，隸屬福建省。臺(tai)(tai)灣(wan)(wan)、廈門合(he)派一(yi)道(dao)官管轄。并派兵8000人駐防，設(she)(she)總兵一(yi)員，副(fu)將二員，澎(peng)湖亦派副(fu)將一(yi)員統兵2000人駐防。這樣，臺(tai)(tai)灣(wan)(wan)重新統一(yi)于(yu)清王(wang)朝中央政(zheng)府的管轄。
施瑯：夫炎(yan)徼(jiao)僻壤，職方不載；天威遐播，遂入版圖(tu)。推恩陶俗，銷兵氣以光文(wen)治，端(duan)有望于官斯土(tu)者。
楊文魁：從茲不特各省沿邊(bian)獲(huo)享敉(mi)寧，而化外來依赤(chi)子，快睹(du)帡幪；土著(zhu)蚩番，漸濡聲教。誠盛(sheng)化無遠(yuan)不屆(jie)，廓(kuo)千(qian)古未(wei)有(you)之弘模(mo)、啟千(qian)古未(wei)辟之遐(xia)陬也。
劉(liu)良(liang)璧：大業疏天派，膚功列(lie)上班。龍旗開(kai)敵壘(lei)，虎竹賁仙關。浪靜(jing)平甌越(yue)，烽晴靖海蠻。朱甍輝玉(yu)鑰，碧甃燦(can)金(jin)環。謨烈青編著，賢良(liang)紫(zi)誥頒。勛(xun)名縈兩浙，世澤衍三(san)山。頌溢鰲峰上，謳興鹿島間。東(dong)南槎萬里，長此奉王(wang)顏。
高拱干：臺以(yi)海外地(di)，明季(ji)通商，始有(you)(you)漢人。迨鄭氏遁踞，舊家世族或從而(er)東，生聚(ju)有(you)(you)年(nian)，而(er)弦誦猶未(wei)廣也。越至于今，輸誠(cheng)納土，島民得睹天(tian)日(ri)；分設郡縣(xian)，招(zhao)徠愈眾。十余年(nian)間，聲(sheng)教大通，人文(wen)骎骎蔚起；即(ji)深山邃(sui)谷文(wen)身黑齒(chi)之番(fan)，皆知向(xiang)風(feng)慕學。有(you)(you)識之士，咸謂治(zhi)以(yi)道隆、道隨(sui)治(zhi)廣；從此海波不(bu)揚，內(nei)外如鄒魯矣。
吳昌祚：維郡伯倡(chang)牧令，以靖地寧人，厥任(ren)綦重；而臺(tai)灣(wan)獨加難，孤懸海(hai)東(dong)，番黎雜處，縱長幾三千里，實(shi)為閩、粵、江、浙(zhe)之籬垣，非(fei)果(guo)卓(zhuo)循，豈易(yi)理此！辛丑夏，高君天木(mu)，特奉(feng)簡調而來。當(dang)其時匪變初平，大師(shi)云集，糗(qiu)糧(liang)蒭茭(jiao)立待(dai)騰飽，君乃(nai)咄嗟辦之。捕(bu)黨(dang)孽、寬脅從，全臺(tai)底定(ding)，襄力居多。已而秋颶為災(zai)，酷逾兵燹(xian)；請(qing)蠲、議賑，心曲殫焉(yan)。由是集哀鴻、銷偑犢，務簡靜以息耕，廣教化(hua)以培士。比及三載，民用大和；則君之大有造于斯臺(tai)，而膏(gao)澤良(liang)已深矣。
夏之(zhi)(zhi)芳：臺(tai)灣僻處海隅，自(zi)入版圖(tu)歷(li)今，垂(chui)五十(shi)載。舊制：郡邑守(shou)令外(wai)，以觀察使領之(zhi)(zhi)。康熙六十(shi)年，始以臺(tai)臣出(chu)司巡視，滿、漢各一(yi)員(yuan)，歲一(yi)更替(ti)；蓋重海疆也。我皇上御極以來，文德(de)覃敷、聲教暨訖，休風(feng)雅化，已(yi)遍遐陬；猶(you)于臨軒遣策(ce)，如意遴選，再(zai)三(san)訓(xun)誡，俾奉命諸臣得所(suo)遵(zun)循，以為觀風(feng)訓(xun)俗之(zhi)(zhi)軌，則(ze)圣明洵周且至矣。
張(zhang)湄：臺灣者(zhe)，萬川環流(liu)、一(yi)島(dao)中(zhong)屹，與(yu)世殊絕(jue)；六十年來(lai)，沐浴圣(sheng)教，暗沕(wu)躍乎光明。海邦(bang)人士，璘璘然(ran)(ran)、紛(fen)紛(fen)然(ran)(ran)質有(you)其(qi)文矣。
白壽彝：清(qing)(qing)朝統一(yi)臺(tai)(tai)灣(wan)，使(shi)臺(tai)(tai)灣(wan)重新回到(dao)祖國統一(yi)的(de)多民族大家庭中(zhong)，這不僅對國家統一(yi)具(ju)有重要(yao)意義(yi)，對臺(tai)(tai)灣(wan)的(de)經濟、文化(hua)的(de)進一(yi)步(bu)發展(zhan)也具(ju)有重要(yao)意義(yi)。后來事實證明，臺(tai)(tai)灣(wan)經濟、文化(hua)的(de)進一(yi)步(bu)振興，正是在臺(tai)(tai)灣(wan)重新統一(yi)于清(qing)(qing)朝中(zhong)央(yang)政權(quan)管(guan)轄(xia)之(zhi)后。
丁紹儀：至(zhi)是臺灣蕩(dang)平，民再(zai)康矣。臺灣滅而天下無事(shi)，詔息(xi)天下兵。
依據《天(tian)妃顯圣(sheng)錄》記載：施(shi)瑯進攻澎湖(hu)時(shi)，抵達八罩島，島上(shang)缺乏淡水。清軍(jun)挖開退潮(chao)后(hou)的(de)沙地，發現有淡水可(ke)供飲用(yong)。媽(ma)祖(zu)還告訴清軍(jun)“二十(shi)(shi)一日必得澎湖(hu)，七月可(ke)得臺灣。”和鄭軍(jun)決戰的(de)日期，清軍(jun)將士還看到媽(ma)祖(zu)現身(shen)。施(shi)瑯認(ren)為是媽(ma)祖(zu)庇(bi)佑清軍(jun)戰勝，因此于(yu)康熙(xi)二十(shi)(shi)三年(nian)（1684年(nian)），康熙(xi)帝(di)加封(feng)媽(ma)祖(zu)為護國庇(bi)民妙靈昭應仁慈天(tian)后(hou)。
