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基本介紹

2003年完成(cheng)的人類基因組(zu)(zu)計劃成(cheng)功地對所有20,000個蛋白質(zhi)編碼(ma)基因（蛋白質(zhi)組(zu)(zu)）進行了(le)測(ce)序(xu)，這(zhe)是一項巨大的科學成(cheng)就，但這(zhe)實(shi)際(ji)上只是一個開(kai)始(shi)(shi)。下(xia)一步是檢(jian)查(cha)蛋白質(zhi)組(zu)(zu)以開(kai)始(shi)(shi)了(le)解所有這(zhe)些蛋白質(zhi)的功能。

人類(lei)蛋(dan)白(bai)(bai)質(zhi)(zhi)圖譜(HPA)項(xiang)目于(yu)2003年啟動，目標是使用基于(yu)抗(kang)體的(de)蛋(dan)白(bai)(bai)質(zhi)(zhi)組學(xue)系統地(di)繪制這些蛋(dan)白(bai)(bai)質(zhi)(zhi)的(de)表(biao)達。該計劃主要設在瑞(rui)典(dian)，由(you)非營利組織Knut和Alice Wallenberg基金會(KAW)資助。內部(bu)生產和商業購(gou)買的(de)抗(kang)體首先由(you)研究人員驗(yan)證(zheng)，然(ran)后用于(yu)表(biao)征每(mei)種(zhong)蛋(dan)白(bai)(bai)質(zhi)(zhi)。

數據可通過開放式交互式數據庫獲取：www.proteinatlas.org.

它包含(han)數(shu)百(bai)萬(wan)張高分(fen)辨率圖像，顯示(shi)44種不同正常人(ren)體組(zu)織(Tissue Atlas)和20種不同癌癥類型(Cancer Atlas)中76 種不同細胞(bao)類型的(de)蛋白質表達的(de)空間定(ding)位。

在美國細胞(bao)生物學學會（ASCB，2016年12月）上，一(yi)個(ge)新的Cell Atlas在HPA的更新版(ban)本（第(di)16版(ban)）中(zhong)發布，參加(jia)人數眾多。

特色功能

它的特點：

l 免疫熒光染色細(xi)胞的高分辨(bian)率、多色圖像(xiang)

l 代(dai)表人體不同器官細(xi)(xi)胞群的56種細(xi)(xi)胞系中(zhong)蛋白質的亞細(xi)(xi)胞空(kong)間定位

l 使(shi)用(yong)深度(du)RNA測序(xu)表征的所有(you)人類基因的mRNA表達

l > 12,000個基因和可用抗體映射到30種不(bu)同的細(xi)胞(bao)結構(gou)（即細(xi)胞(bao)核、胞(bao)質溶膠(jiao)、線粒體等）

精確(que)定(ding)位蛋(dan)白(bai)質(zhi)的亞細胞定(ding)位對于理(li)解其(qi)功(gong)能至關重要。當它們(men)定(ding)位到(dao)預期的微環境（即細胞器、囊(nang)泡或大分(fen)子復合物(wu)）時，它們(men)將在(zai)合適的生化條件下遇到(dao)其(qi)他蛋(dan)白(bai)質(zhi)或RNA以實現其(qi)分(fen)子功(gong)能（Breckles，2016）。這份全面的圖譜為世界各地的研究(jiu)人員對蛋(dan)白(bai)質(zhi)功(gong)能進行更復雜的研究(jiu)提供了(le)急(ji)需(xu)的工具。

以下是Cell Atlas中的一些示例圖像：

CCNB1：細(xi)胞周期(qi)(qi)蛋白(bai)B1是一種調節蛋白(bai)，位于細(xi)胞質中，參與人(ren)和小鼠細(xi)胞的有絲分裂。它(ta)主(zhu)要在細(xi)胞周期(qi)(qi)的G2/M 期(qi)(qi)以細(xi)胞周期(qi)(qi)依賴性的方(fang)式(shi)表達(da)。在圖中，U-2 OS人(ren)細(xi)胞系中的細(xi)胞周期(qi)(qi)蛋白(bai)B1蛋白(bai)表達(da)（抗體HPA030741）以綠(lv)色顯示，而細(xi)胞核為藍色，微(wei)管(guan)為紅色。

蛋白質圖譜

DAXX：死亡域相(xiang)關(guan)蛋(dan)白6是一種多功能蛋(dan)白，主要(yao)定位于人和小鼠(shu)細(xi)(xi)(xi)胞(bao)的細(xi)(xi)(xi)胞(bao)核和核體(ti)，但也在(zai)細(xi)(xi)(xi)胞(bao)質(zhi)(zhi)中(zhong)(zhong)(zhong)表(biao)達(da)。DAXX 與有(you)絲分裂G2期的著絲粒相(xiang)關(guan)。在(zai)細(xi)(xi)(xi)胞(bao)質(zhi)(zhi)中(zhong)(zhong)(zhong)，它通(tong)過與細(xi)(xi)(xi)胞(bao)凋亡抗原(yuan)Fas相(xiang)互作用來調(diao)節細(xi)(xi)(xi)胞(bao)凋亡。該圖顯示了細(xi)(xi)(xi)胞(bao)系(xi)A-431中(zhong)(zhong)(zhong)細(xi)(xi)(xi)胞(bao)核內的核體(ti)（GFP標記(ji)的抗體(ti)HPA008797）中(zhong)(zhong)(zhong)的表(biao)達(da)。