該寺(si)(si)院(yuan)(yuan)歷(li)史(shi)詳(xiang)情無(wu)(wu)現(xian)有(you)(you)(you)文(wen)字史(shi)料記(ji)(ji)載,當地傳(chuan)說(shuo)史(shi)建于唐代,后(hou)多次(ci)戰(zhan)火(huo)兵(bing)匪多次(ci)毀壞嚴重,最(zui)后(hou)一次(ci)修繕在(zai)清末民國(guo)初年,后(hou)香(xiang)火(huo)鼎(ding)盛寺(si)(si)院(yuan)(yuan)無(wu)(wu)力承受分建三(san)處(chu)下院(yuan)(yuan):靈(ling)(ling)山(shan)庵(位于現(xian)廣東(dong)省(sheng)河源(yuan)(yuan)市(shi)連平(ping)縣(xian)(xian)高(gao)莞鎮(zhen)丁(ding)村(cun)后(hou)靈(ling)(ling)山(shan)坑內),龍馴庵(位于現(xian)廣東(dong)省(sheng)河源(yuan)(yuan)市(shi)連平(ping)縣(xian)(xian)忠信中(zhong)學食堂(tang)處(chu)),獅(shi)子(zi)巖(位于現(xian)廣東(dong)省(sheng)河源(yuan)(yuan)市(shi)和平(ping)縣(xian)(xian)獅(shi)子(zi)巖)。三(san)處(chu)下院(yuan)(yuan)歷(li)史(shi)在(zai)雍正八年版連平(ping)州志(zhi)寺(si)(si)觀一章有(you)(you)(you)記(ji)(ji)載。高(gao)莞鎮(zhen)徐村(cun)瓦窯屋村(cun)民吳娘(niang)石于2005年無(wu)(wu)意發(fa)現(xian)家(jia)中(zhong)一民國(guo)年間(jian)寺(si)(si)院(yuan)(yuan)手抄本《靈(ling)(ling)鷲山(shan)寺(si)(si)記(ji)(ji)》并(bing)送交寺(si)(si)院(yuan)(yuan)作(zuo)為(wei)僅存文(wen)物(wu)保管(guan)。該游記(ji)(ji)是(shi)當地一鄉紳(shen)曾紹貫(guan)于民國(guo)年間(jian)游歷(li)本寺(si)(si)所寫,開篇寫有(you)(you)(you):“靈(ling)(ling)鷲山(shan)寺(si)(si)者,吾鄉之名(ming)(ming)勝(sheng)。山(shan)未有(you)(you)(you)名(ming)(ming),是(shi)有(you)(you)(you)是(shi)寺(si)(si),山(shan)因而名(ming)(ming)之。”現(xian)該文(wen)物(wu)保存與靈(ling)(ling)鷲禪寺(si)(si),復(fu)印件由寺(si)(si)院(yuan)(yuan)報送連平(ping)縣(xian)(xian)檔(dang)案局(ju)、連平(ping)縣(xian)(xian)宗教(jiao)局(ju),河源(yuan)(yuan)市(shi)宗教(jiao)局(ju)、高(gao)莞鎮(zhen)人(ren)民政府(fu)作(zuo)為(wei)歷(li)史(shi)資料存檔(dang)。
2004年4月(yue),連(lian)平(ping)縣(xian)民族(zu)宗(zong)教局(ju)批準寺院(yuan)恢復開(kai)放(fang)宗(zong)教活動,2007年,經(jing)縣(xian)宗(zong)教局(ju)協調,當(dang)地(di)村民同意歸還寺院(yuan)土地(di)264.22畝(mu)山地(di)支持寺院(yuan)恢復重(zhong)建(jian),并于當(dang)年在(zai)縣(xian)國土局(ju)登記發給寺院(yuan)土地(di)證。2007年,省民族(zu)宗(zong)教委員(yuan)會將該(gai)寺院(yuan)進行登記備案。
目前該寺(si)院正在恢復重建(jian)中,現道路和供電并未(wei)接通(tong),交通(tong)可(ke)通(tong)過山間便道抵達(da)。