該(gai)寺院(yuan)歷(li)史詳情無現有(you)文字史料(liao)記載,當(dang)地傳說史建(jian)于(yu)(yu)(yu)唐代,后(hou)多次(ci)(ci)戰火兵匪多次(ci)(ci)毀壞嚴重,最后(hou)一(yi)(yi)次(ci)(ci)修(xiu)繕在清(qing)末民(min)國(guo)初年,后(hou)香火鼎盛(sheng)寺院(yuan)無力承受分建(jian)三(san)(san)處(chu)(chu)下院(yuan):靈(ling)山(shan)庵(位于(yu)(yu)(yu)現廣(guang)東(dong)省河(he)(he)源(yuan)市(shi)(shi)連(lian)平(ping)(ping)縣(xian)高(gao)莞鎮丁村后(hou)靈(ling)山(shan)坑內),龍(long)馴庵(位于(yu)(yu)(yu)現廣(guang)東(dong)省河(he)(he)源(yuan)市(shi)(shi)連(lian)平(ping)(ping)縣(xian)忠信中學食堂(tang)處(chu)(chu)),獅(shi)子巖(yan)(位于(yu)(yu)(yu)現廣(guang)東(dong)省河(he)(he)源(yuan)市(shi)(shi)和平(ping)(ping)縣(xian)獅(shi)子巖(yan))。三(san)(san)處(chu)(chu)下院(yuan)歷(li)史在雍(yong)正八年版連(lian)平(ping)(ping)州志寺觀一(yi)(yi)章有(you)記載。高(gao)莞鎮徐村瓦窯屋村民(min)吳娘(niang)石(shi)于(yu)(yu)(yu)2005年無意(yi)發現家中一(yi)(yi)民(min)國(guo)年間寺院(yuan)手抄本(ben)《靈(ling)鷲(jiu)山(shan)寺記》并送(song)交寺院(yuan)作為僅存文物保管。該(gai)游記是當(dang)地一(yi)(yi)鄉紳(shen)曾紹貫于(yu)(yu)(yu)民(min)國(guo)年間游歷(li)本(ben)寺所(suo)寫,開篇寫有(you):“靈(ling)鷲(jiu)山(shan)寺者,吾鄉之(zhi)名勝(sheng)。山(shan)未有(you)名,是有(you)是寺,山(shan)因而名之(zhi)。”現該(gai)文物保存與靈(ling)鷲(jiu)禪寺,復印件由寺院(yuan)報送(song)連(lian)平(ping)(ping)縣(xian)檔案局、連(lian)平(ping)(ping)縣(xian)宗教局,河(he)(he)源(yuan)市(shi)(shi)宗教局、高(gao)莞鎮人民(min)政府作為歷(li)史資料(liao)存檔。
2004年(nian)(nian)4月,連平(ping)縣(xian)(xian)民族宗教(jiao)(jiao)(jiao)局批準(zhun)寺(si)院恢復開(kai)放宗教(jiao)(jiao)(jiao)活動,2007年(nian)(nian),經(jing)縣(xian)(xian)宗教(jiao)(jiao)(jiao)局協調,當地村民同意歸還寺(si)院土地264.22畝山地支持(chi)寺(si)院恢復重建(jian),并于當年(nian)(nian)在縣(xian)(xian)國土局登記發給寺(si)院土地證(zheng)。2007年(nian)(nian),省(sheng)民族宗教(jiao)(jiao)(jiao)委員(yuan)會將該寺(si)院進行登記備案。
目前該寺(si)院正在(zai)恢復重(zhong)建中(zhong),現道(dao)路和供(gong)電并未接通,交通可通過山間便道(dao)抵達。