內蒙古自治區人民醫院成立于1947年，歷經67年的建設發展，現已成為集醫療、科研、教學、預防、保健、急救為一體的全區最大的“三級甲等”綜合性醫院。醫院先后榮獲全國“五·一”勞動獎狀，全國百姓放心示范醫院，全國衛生系統先進集體，全國科技、文化、衛生三下鄉先進集體，全國“百佳醫院”、全國精神文明建設先進單位，全國醫院文化工作先進單位，內蒙古自治區“五一”勞動獎狀、首府百姓最滿意品牌醫院（連續七年）等50多項國家級和自治區級榮譽。

內蒙古國際蒙醫醫院是以蒙醫藥醫療為主的集醫療、科研、教學、預防、保健、康復、急救、制劑為一體的現代化三級甲等蒙醫綜合醫院，醫院建筑面積7萬余平方米（含蒙醫老年病分院、租用的附屬病房、科研用房、蒙醫兒童腦癱中心），定編床位1500張（含蒙醫老年病分院400張），設臨床、醫技、制劑、行政職能等91個科室，其中蒙醫臨床科室48個，占醫院臨床科室比例的77.6%，現有職工近2000人。

內蒙古自治區婦幼保健院、兒童醫院、婦產醫院是自治區一家集婦女兒童保健、醫療、科研、教學、培訓于一體的三級甲等婦幼保健院、三級甲等兒童醫院、三級甲等婦產醫院。曾榮獲“全國衛生系統先進集體”、“愛嬰醫院”、“母嬰友好醫院”、“百佳醫院”、“中國醫學基金楊崇瑞婦幼衛生獎勵基金先進單位”、“全國三八紅旗集體”、“首府十佳百姓公益醫院”、“服務百姓健康先進集體”、“全國醫院醫療保險服務規范先進單位”、“內蒙古民族團結先進集體”、“平安醫院示范單位”、“國家級母嬰安全優質服務單位”等榮譽稱號。

內蒙古醫科大學附屬醫院始建于1958年，經過五十多年的發展建設，已成為內蒙古自治區一所集醫療、教學、科研和預防保健為一體的現代化綜合型三級甲等醫院。另外，內蒙古自治區心血管研究所、自治區首家“分子與功能影像工程技術研究中心”均設在內蒙古醫科大學附屬醫院，并于2010年掛牌成為內蒙古醫科大學第一臨床醫學院。2013年，內蒙古醫科大學口腔醫學院落戶。同時還承擔著對二連浩特市醫院第二周期的托管工作。

內蒙古醫科大學附屬醫院位于內蒙古自治區呼和浩特市賽罕區昭烏達路42號，創建于1958年，占地67626平方米，總建筑面積27萬平方米。醫院是一所集醫療、教學、科研和預防保健為一體的三級綜合醫院，獲得“全國百姓放心示范醫院”、“中國誠信醫院AAA級示范單位”、“百佳醫院”、“愛嬰醫院”、“醫院文化建設先進集體”等榮譽稱號。

內蒙古醫科大學第二附屬醫院成立于1985年，是集自治區骨科研究所、骨科質量控制中心、國家骨病防治基地、國家臨床重點專科和自治區領先學科為一體的三級甲等骨科專科醫院，是國務院指定的有碩士學位授予權的骨科碩士生培養基地。建院至今先后榮獲全國百姓放心示范百佳醫院、民心醫院、自治區“公益之星”先進集體、自治區優秀黨組織、自治區巾幗建功文明崗、首府百姓放心醫院、首府十佳百姓公益醫院、全國五一巾幗標兵崗、全區三八紅旗集體、2010年—2012年“全國質量月”服務質量用戶滿意度調查患者滿意單位等榮譽稱號。