《看我72變》是蔡依林2003年推出的個人第五張專輯，也是蔡依林最經典專輯，收錄了《看我72變》《布拉格廣場》《說愛你》《騎士精神》等在內的11首歌曲。這張專輯帶來的不只是蔡依林形象上的改變，而且歌曲風格也呈現多樣化；憑借該專輯蔡依林在中國臺灣G-music風云榜中獲得最佳女藝人獎及最佳專輯獎。2003年8月10日，專輯《看我72變》在亞洲地區的銷量超過100萬張；2004 年3月30日，蔡依林憑借專輯《看我72變》入圍第15屆臺灣金曲獎最佳流行音樂演唱專輯與最佳國語女演唱人獎。

《呸》是蔡依林發行的第13張專輯，由黃偉文和蔡依林共同制作，收錄了《Play 我呸》《第三人稱》《電話皇后》《美杜莎》等10首歌曲，于2014年11月15日發行。《呸》的概念來自于“PLAY”的諧音，PLAY這個字包含了“劇本”和“扮演”以及“表演”等等多重涵義，正呼應著蔡依林這兩年來對人生舞臺有許多新的體驗和領悟。這張專輯跳脫一般華語專輯框架，音樂飽滿復雜且主題包羅萬象。2015年，該專輯在QQ音樂年度盛典獲得“最佳港臺國語專輯”；在第26屆臺灣金曲獎同時獲得“最佳國語專輯獎”和“演唱類最佳專輯獎”。

《Ugly Beauty》是蔡依林的第14張個人音樂專輯，位列蔡依林專輯排名前三，由吳青峰、阿信、宋念宇、剃刀蔣、陳星翰、倪子岡等擔任制作人，收錄了《怪美的》《如果我沒有傷口》《惡之必要》《玫瑰少年》等11首歌曲，于2018年12月26日發行。這張專輯是Jolin推出暌違樂壇四年的專輯，她以親自參與音樂人集體創作的方式，完成專輯的歌曲。次年，該張專輯獲得第30屆臺灣金曲獎“年度專輯”獎。

華語流行天后蔡依林最好聽的專輯《Jolin 1019》，是她的第一張國語專輯，于1999年9月10日發行。這張專輯發行首周銷量超過6萬張，當年僅在中國臺灣便賣出超過40萬張的銷量，不僅讓蔡依林登上了玫瑰唱片、五大唱片等銷量榜，更是使當年只是一個新人的蔡依林備受國內外媒體關注。可以說此張專輯打響了蔡依林在臺灣乃至大陸的知名度，當年走清純路線的蔡依林用純凈的聲音響徹整個華語樂壇。專輯中的主打歌《我知道你很難過》《上街》等更是成為萬千潮流少年少女心目中的神曲。蔡依林也憑借國語專輯《Jolin 1019》一舉獲得新加坡金曲獎“最佳新人金獎”、ChannelV“亞洲區年度最受歡迎新人”和臺灣TVBS勁碟民選大賞“最受歡迎新人”等多個獎項。

《城堡》是蔡依林2004年發行的音樂專輯，也是蔡依林加盟索尼唱片之后的第二張專輯，于2004年2月27日發行。在這張專輯中，唱片公司以“天、地、海”為企劃概念，藉由“天空的飛鳥”、“森林的白馬”及“深海的藍魚”來展現“城堡”專輯中多元曲風內容。專輯《城堡》在中國臺灣的銷量達30萬，使蔡依林二度登上中國臺灣年度唱片銷量女歌手冠軍。在這張專輯中，有不少買購網小編喜歡的歌曲，如《愛情36計》《Love Love Love》《倒帶》《檸檬草的味道》《消失的城堡》《海盜》《第一優先》等，這些歌曲都非常值得一聽。

《Don't Stop》是蔡依林的音樂專輯，由李偲菘、李偉菘、陳偉等擔任制作人，共收錄10首歌曲，于2000年4月26日發行。這張專輯是蔡依林的個人第二張音樂專輯，專輯同名曲《Don't Stop》翻唱自英國團體“S Club 7”的專輯主題歌。《Don't Stop》專輯中的蔡依林，唱快歌熱力十足，唱慢歌又足夠楚楚動人，這滿足少女歌手走紅的特質，她憑借該專輯在一眾出道歌手中殺出重圍也很正常。2001年，專輯歌曲《Don't Stop》還獲得第7屆華語榜中榜“最受歡迎歌曲獎”。

《舞娘》是蔡依林的第八張國語專輯，也是蔡依林最好的專輯之一，收錄了《舞娘》《馬德里不思議》《玩美》《唇唇欲動》《假裝》等在內的11首歌曲，于2006年5月12日發行。專輯《舞娘》在40天內全亞洲銷量突破200萬張，為蔡依林帶來的不僅僅是首度登上華語年度銷售總冠軍的位置，也讓屢次與臺灣金曲獎絕緣的蔡依林在第18屆頒獎典禮上獲得了“最佳國語女歌手”以及“最受歡迎女歌手”等多項獎項。

《MUSE》是蔡依林2012年發布的專輯，收錄了《大藝術家》《馬賽克》《我》《Dr.Jolin》等在內的11首歌曲，由此讓蔡依林開始受到一些如Snoop Lion等獨立音樂者的認可，且該張專輯于2013年被臺灣中華音樂人交流協會評選為推薦唱片；蔡依林也憑借該張專輯奪得臺灣年度女歌手銷售榜冠軍。2013年5月22日，蔡依林憑借專輯《MUSE》成功獲得第24屆臺灣金曲獎最佳國語女歌手、最佳國語專輯獎與最佳年度歌曲3項提名。

《J-GAME》又名《野蠻游戲》，是蔡依林的第七張國語專輯，也是脫離周杰倫后的首支作品，收錄了《野蠻游戲》《天空》《許愿池的希臘少女》《獨占神話》《睜一只眼 閉一只眼》等在內的11首歌曲，于2005年4月25日發行。雖然沒有了周杰倫，但是沒有影響到整張專輯質量，王力宏的加盟給專輯帶來了嘻哈的元素，蔡依林的唱功也有所進步。專輯以“Game”的概念為基點，希望傳達“創意冒險”、“勇于嘗鮮”的生活態度。專輯名稱來源于三組概念：“Jisco-Game”、“Jissing-Game”、“Jancy-Game”，以呈現專輯中三種不同的曲風。2005年，蔡依林憑借該專輯獲得新城國語力頒獎典禮亞洲歌手大獎。

在蔡依林全部專輯中，只有《特務J》是蔡依林推出以特務造型風為主題的專輯，又名《愛情任務》，收錄了《日不落》《愛無赦》《特務J》《冷暴力》等12首歌曲，于2007年發行。這張專輯的MV以“音樂電影”視覺為企劃概念，制作公司邀請到金載沅、馮德倫以及吳嘉龍分別擔任Part1任務的宿命、Part2記憶的裂痕、Part3幻覺的信仰三段故事的男主角，將專輯內的十首歌曲串連拍攝成約九十分鐘的《愛情任務三部曲音樂電影》。2008年蔡依林憑借該專輯獲得第六屆HITO流行音樂獎年度十大華語歌曲、年度女歌手兩個獎項；同年還獲得第六屆MusicRadio中國TOP排行榜年度最佳銷售女歌手、年度最佳金曲、年度全能藝人三個獎項。