自20世(shi)紀80年代(dai)中期，南華山(shan)腹地(di)的海原縣水沖寺(si)、五橋溝、靈光寺(si)林場(chang)等幾個林業單位，成為當地(di)林草植(zhi)被建設的重(zhong)點區域。
1993年(nian)10月(yue)，海原縣在(zai)南(nan)華山成立10萬畝水(shui)源涵養(yang)林基地建設指揮(hui)部。
1997年，在水(shui)源涵(han)養林基地(di)建設指揮(hui)部的(de)礎上，合并原南(nan)華(hua)山牧場，成立(li)南(nan)華(hua)山水(shui)源涵(han)養林總場。
2004年，寧(ning)夏(xia)回(hui)(hui)族自(zi)治(zhi)區(qu)(qu)九屆(jie)人(ren)大二次會議上(shang)，部(bu)分人(ren)大代表遞交了建立南(nan)(nan)華山自(zi)然保(bao)護區(qu)(qu)的(de)議案(an)，劃定(ding)南(nan)(nan)華山為(wei)省級自(zi)然保(bao)護區(qu)(qu)，2004年底，寧(ning)夏(xia)回(hui)(hui)族自(zi)治(zhi)區(qu)(qu)人(ren)民政府批準成立海原(yuan)縣南(nan)(nan)華山區(qu)(qu)級自(zi)然保(bao)護區(qu)(qu)。 ?
2014年12月(yue)5日，經國(guo)務院辦(ban)公廳批準，晉升為(wei)國(guo)家級自然保護區。
寧(ning)夏南華山(shan)國家級(ji)自(zi)然保護(hu)區位于(yu)寧(ning)夏回(hui)族自(zi)治區中(zhong)部的中(zhong)衛(wei)市海原縣(xian)，分布于(yu)縣(xian)域中(zhong)心(xin)部位。
南(nan)華山所屬區域大地(di)構(gou)造屬于較活動的(de)秦祁(qi)(qi)昆地(di)槽(cao)褶皺(zhou)(zhou)系(xi)“北(bei)(bei)祁(qi)(qi)連(lian)(lian)(lian)(lian)褶皺(zhou)(zhou)系(xi)的(de)北(bei)(bei)祁(qi)(qi)連(lian)(lian)(lian)(lian)走廊過渡帶(dai)”，按板塊(kuai)構(gou)造觀點，本區域所屬大地(di)構(gou)造位置位于秦嶺(ling)—祁(qi)(qi)連(lian)(lian)(lian)(lian)活動帶(dai)祁(qi)(qi)連(lian)(lian)(lian)(lian)—北(bei)(bei)秦嶺(ling)褶皺(zhou)(zhou)系(xi)的(de)北(bei)(bei)祁(qi)(qi)連(lian)(lian)(lian)(lian)加里東褶皺(zhou)(zhou)帶(dai)南(nan)華山斷褶帶(dai)。
南華山出露地(di)層由老到新包括中(zhong)元古(gu)界(jie)長(chang)城系(xi)(xi)(xi)(xi)南華山群(qun)（Chnh）、薊(ji)縣(xian)系(xi)(xi)(xi)(xi)園河群(qun)（Jxyh）、下古(gu)生界(jie)志留(liu)系(xi)(xi)(xi)(xi)上統(tong)旱峽組（S3h）、上古(gu)生界(jie)泥盆系(xi)(xi)(xi)(xi)中(zhong)統(tong)石峽溝(gou)組（D2s）和(he)石炭系(xi)(xi)(xi)(xi)中(zhong)統(tong)羊虎溝(gou)組（C2y）、中(zhong)生界(jie)白堊(e)系(xi)(xi)(xi)(xi)下統(tong)六盤山群(qun)（K1l）、新生界(jie)古(gu)近系(xi)(xi)(xi)(xi)始新統(tong)寺口子組（E2s）和(he)漸新統(tong)清(qing)水營組（E2q）、新生界(jie)新近系(xi)(xi)(xi)(xi)中(zhong)新統(tong)紅柳(liu)溝(gou)組（N1h）和(he)第(di)四系(xi)(xi)(xi)(xi)沖、洪積(ji)物及黃(huang)土沉積(ji)。
南(nan)華(hua)山(shan)(shan)地區出露了(le)早古生代(dai)中(zhong)酸(suan)性巖漿巖，分布在山(shan)(shan)體西(xi)(xi)北(bei)(bei)、北(bei)(bei)東側和西(xi)(xi)側。南(nan)華(hua)山(shan)(shan)地區出露的花崗(gang)閃長(chang)巖體，受南(nan)西(xi)(xi)華(hua)山(shan)(shan)深大斷(duan)裂控(kong)制(zhi)，呈北(bei)(bei)西(xi)(xi)-南(nan)東向(xiang)展(zhan)布，構成(cheng)(cheng)巖漿巖帶(dai)。分別沿南(nan)華(hua)山(shan)(shan)南(nan)、北(bei)(bei)斷(duan)裂帶(dai)侵入(ru)于元古界地層中(zhong)，呈巖株、巖瘤(liu)狀(zhuang)產出，屬(shu)淺成(cheng)(cheng)侵入(ru)體。
南(nan)華(hua)山(shan)地區位于(yu)寧夏南(nan)部向北(bei)東突(tu)出的弧(hu)(hu)形(xing)構造體系之中，屬于(yu)該體系年代新，晚新生代以來持續上(shang)升(sheng)，構成西(xi)華(hua)山(shan)—南(nan)華(hua)山(shan)弧(hu)(hu)形(xing)構造山(shan)地。
南(nan)華山(shan)(shan)地(di)(di)(di)區(qu)出露(lu)老的(de)地(di)(di)(di)層為(wei)中(zhong)(zhong)元古(gu)(gu)(gu)界長城(cheng)系南(nan)華山(shan)(shan)群（Chnh），為(wei)一套綠片巖(yan)(yan)-云母片巖(yan)(yan)-大理巖(yan)(yan)巖(yan)(yan)石組合，原(yuan)巖(yan)(yan)為(wei)海底火山(shan)(shan)巖(yan)(yan)和(he)優地(di)(di)(di)槽型(xing)海相(xiang)沉(chen)積(ji)，表明在(zai)中(zhong)(zhong)元古(gu)(gu)(gu)代(dai)早期(qi)發(fa)生(sheng)強烈(lie)(lie)的(de)拉(la)張(zhang)和(he)裂陷(xian)(xian)，中(zhong)(zhong)元古(gu)(gu)(gu)代(dai)末期(qi)，在(zai)五(wu)臺(tai)運(yun)動作(zuo)用(yong)下(xia)，轉變為(wei)擠(ji)壓體(ti)系，經過北祁(qi)連洋(yang)殼向南(nan)側西寧—蘭州微板塊下(xia)俯(fu)沖(chong)，海槽封閉，褶(zhe)皺隆起。早古(gu)(gu)(gu)生(sheng)代(dai)再度(du)強烈(lie)(lie)拗陷(xian)(xian)，早古(gu)(gu)(gu)生(sheng)代(dai)后期(qi)強烈(lie)(lie)的(de)加(jia)里(li)東運(yun)動使北祁(qi)連海槽前寒(han)武紀地(di)(di)(di)層褶(zhe)皺抬升(sheng)，并伴有中(zhong)(zhong)酸性巖(yan)(yan)漿巖(yan)(yan)體(ti)侵入。經剝蝕后，在(zai)山(shan)(shan)前低地(di)(di)(di)堆積(ji)了(le)(le)泥(ni)盆(pen)系陸相(xiang)紅色(se)碎(sui)屑巖(yan)(yan)，經過夷(yi)平和(he)沉(chen)降又(you)接(jie)受了(le)(le)石炭系的(de)深灰色(se)泥(ni)巖(yan)(yan)夾砂(sha)巖(yan)(yan)和(he)薄煤層沉(chen)積(ji)。二疊(die)紀早期(qi)本區(qu)基本上脫離了(le)(le)海洋(yang)環境(jing)發(fa)育陸相(xiang)沉(chen)積(ji)。印(yin)支(zhi)、燕山(shan)(shan)運(yun)動使該(gai)地(di)(di)(di)區(qu)多次發(fa)生(sheng)褶(zhe)皺與(yu)沖(chong)斷，進(jin)而(er)控制了(le)(le)中(zhong)(zhong)、新生(sheng)代(dai)山(shan)(shan)間斷陷(xian)(xian)盆(pen)地(di)(di)(di)的(de)發(fa)生(sheng)與(yu)發(fa)展。山(shan)(shan)體(ti)進(jin)一步抬升(sheng)，在(zai)山(shan)(shan)前前緣盆(pen)地(di)(di)(di)內發(fa)育了(le)(le)白堊紀和(he)第三紀沉(chen)積(ji)。?
南(nan)(nan)華山(shan)(shan)(shan)(shan)是寧夏南(nan)(nan)部六盤山(shan)(shan)(shan)(shan)、月(yue)亮(liang)山(shan)(shan)(shan)(shan)、南(nan)(nan)華山(shan)(shan)(shan)(shan)、西(xi)華山(shan)(shan)(shan)(shan)弧形(xing)山(shan)(shan)(shan)(shan)地(di)的(de)一(yi)部分，為(wei)侵蝕構造中山(shan)(shan)(shan)(shan)山(shan)(shan)(shan)(shan)地(di)地(di)貌。山(shan)(shan)(shan)(shan)體呈西(xi)北(bei)—東南(nan)(nan)走向，山(shan)(shan)(shan)(shan)體內部沖溝切割(ge)強(qiang)烈，斷層巖壁較為(wei)發育(yu)；溝系呈放射狀，羽狀展布；山(shan)(shan)(shan)(shan)脊(ji)呈尖棱狀、魚脊(ji)狀、齒狀，有(you)的(de)經風化剝蝕成渾圓狀。高(gao)峰馬萬山(shan)(shan)(shan)(shan)2954.6米，平(ping)均海(hai)拔(ba)2600米左右，溝口海(hai)拔(ba)一(yi)般北(bei)麓2000米，南(nan)(nan)麓2200米，相對(dui)高(gao)差700～900米左右。
南(nan)華(hua)(hua)(hua)山(shan)地區地貌形(xing)成與(yu)演(yan)化明顯(xian)受(shou)地質(zhi)構(gou)(gou)(gou)造(zao)和(he)巖層(ceng)控制。南(nan)華(hua)(hua)(hua)山(shan)—西(xi)華(hua)(hua)(hua)山(shan)深大斷(duan)裂(lie)從元古代開始一直影響本區的(de)構(gou)(gou)(gou)造(zao)和(he)沉(chen)積。南(nan)華(hua)(hua)(hua)山(shan)山(shan)體(ti)(ti)(ti)自二疊紀(ji)早(zao)期(qi)脫離了(le)海洋環境后(hou)，長(chang)時(shi)期(qi)處于(yu)隆(long)升(sheng)剝蝕(shi)狀態，只是在(zai)山(shan)前前緣盆地內發育了(le)白堊紀(ji)和(he)第三紀(ji)沉(chen)積。中新世(shi)(shi)(shi)(shi)時(shi)，曾(ceng)先后(hou)發生(sheng)過兩次(ci)構(gou)(gou)(gou)造(zao)變形(xing)，造(zao)成了(le)山(shan)體(ti)(ti)(ti)隆(long)升(sheng)和(he)紅柳溝組(zu)與(yu)清水(shui)營(ying)組(zu)之間的(de)角度不整合。上新世(shi)(shi)(shi)(shi)末期(qi)—更新世(shi)(shi)(shi)(shi)以(yi)來新構(gou)(gou)(gou)造(zao)運動(dong)活(huo)躍(yue)，構(gou)(gou)(gou)造(zao)變形(xing)在(zai)本區較中新世(shi)(shi)(shi)(shi)兩次(ci)構(gou)(gou)(gou)造(zao)變形(xing)更加強烈，南(nan)、西(xi)華(hua)(hua)(hua)山(shan)北麓斷(duan)裂(lie)強烈活(huo)動(dong)，山(shan)體(ti)(ti)(ti)進一步隆(long)升(sheng)，盆地進一步斷(duan)陷(xian)(xian)，第四(si)紀(ji)地層(ceng)被錯斷(duan)，形(xing)成山(shan)邊(bian)斷(duan)陷(xian)(xian)，引起(qi)水(shui)系、山(shan)脊(ji)和(he)階地的(de)變化。
寧夏(xia)南(nan)華(hua)山(shan)(shan)國家級自然(ran)保護區屬北溫(wen)(wen)帶(dai)大陸性季風(feng)氣(qi)(qi)候，氣(qi)(qi)溫(wen)(wen)由山(shan)(shan)麓向山(shan)(shan)頂逐漸降低。南(nan)華(hua)山(shan)(shan)冷(leng)月(yue)在1月(yue)份(fen)，月(yue)平(ping)(ping)均(jun)氣(qi)(qi)溫(wen)(wen)為(wei)-9.8℃，熱月(yue)在7月(yue)，月(yue)平(ping)(ping)均(jun)氣(qi)(qi)溫(wen)(wen)為(wei)10.9℃，全(quan)年(nian)平(ping)(ping)均(jun)氣(qi)(qi)溫(wen)(wen)為(wei)0.8℃，年(nian)較(jiao)差 20.7℃。平(ping)(ping)均(jun)年(nian)降雨(yu)量為(wei) 495.5毫(hao)米，降雨(yu)主要分布在植(zhi)物生長季的(de)5～9月(yue)份(fen)，占(zhan)全(quan)年(nian)降雨(yu)量的(de)77.15%。
寧夏南(nan)華山(shan)(shan)國家級自然保護區(qu)水(shui)(shui)(shui)(shui)文(wen)特(te)點是山(shan)(shan)間河谷及山(shan)(shan)洪溝較多，但地表徑(jing)流不大，多為間歇河，季節性變化大，遇到暴雨即發洪水(shui)(shui)(shui)(shui)，雨后基(ji)本干(gan)涸(he)，部分(fen)降水(shui)(shui)(shui)(shui)滲(shen)入地下(xia)，以泉水(shui)(shui)(shui)(shui)的(de)形式溢出；地下(xia)水(shui)(shui)(shui)(shui)受地質構造的(de)影(ying)響，而大氣(qi)降水(shui)(shui)(shui)(shui)是地下(xia)水(shui)(shui)(shui)(shui)的(de)重要補給來源。南(nan)華山(shan)(shan)山(shan)(shan)體內部沖溝切割強烈，溝谷水(shui)(shui)(shui)(shui)系呈放(fang)射狀、羽狀展布，分(fen)別(bie)屬于(yu)清(qing)水(shui)(shui)(shui)(shui)河水(shui)(shui)(shui)(shui)系二級流域的(de)西河流域和莧麻(ma)(ma)河流域。南(nan)華山(shan)(shan)有大小沖溝約(yue)35條，分(fen)別(bie)匯入西河、莧麻(ma)(ma)河。
寧夏南華山國家(jia)級自(zi)然保(bao)護區內(nei)林草(cao)茂密(mi)，植被覆蓋度高，有利于涵養水(shui)(shui)(shui)源，降水(shui)(shui)(shui)滲入地(di)下，在(zai)山麓以泉(quan)眼(yan)的形(xing)成溢出(chu)地(di)表，是(shi)周圍(wei)鄉（鎮）人畜飲(yin)水(shui)(shui)(shui)的重要(yao)水(shui)(shui)(shui)源。
寧(ning)夏南華山(shan)國(guo)家級自然保護區由(you)于不同的(de)海拔高度，陰坡(po)和陽坡(po)，所(suo)接受的(de)陽光不同、降水和相(xiang)對(dui)濕度的(de)不同、植(zhi)被類型的(de)不同，形(xing)成以垂直地帶性土(tu)壤(rang)灰褐土(tu)和山(shan)麓為基帶土(tu)壤(rang)黑壚土(tu)為主的(de)土(tu)類。
灰(hui)褐(he)(he)土一般分布在海(hai)(hai)拔(ba)(ba)2000～2955米之間，其(qi)下部(bu)與(yu)水平地帶性(xing)土壤黑壚(lu)土銜接(jie)，成土母質為紅(hong)色(se)、紫紅(hong)色(se)和雜(za)色(se)砂巖、灰(hui)綠色(se)云母片巖的(de)風化物，土壤有(you)機(ji)質含(han)量(liang)高，黑色(se)腐殖質層較(jiao)厚，有(you)輕度淋(lin)溶現象發生(sheng)，剖面中下部(bu)質地較(jiao)表層土黏，有(you)石灰(hui)淀積。分為暗灰(hui)褐(he)(he)土：主要分布在海(hai)(hai)拔(ba)(ba)2600米以(yi)上的(de)山脊和陰坡中上部(bu)比較(jiao)平緩處(chu)；石灰(hui)性(xing)灰(hui)褐(he)(he)土：大部(bu)分位于海(hai)(hai)拔(ba)(ba)2600米以(yi)下的(de)陰坡及山谷兩旁。
黑壚(lu)土(tu)類是南華山的基帶土(tu)壤，一般分(fen)布在海拔2000米(mi)以(yi)下的山麓或低(di)山丘陵區，成土(tu)母質(zhi)(zhi)多為第四(si)紀黃(huang)土(tu)。顯著(zhu)的特征是剖面中有(you)比(bi)(bi)較深厚(hou)、暗灰色(se)的有(you)機質(zhi)(zhi)層和(he)明顯的石灰質(zhi)(zhi)假菌絲體(ti)，整(zheng)個(ge)剖面質(zhi)(zhi)地比(bi)(bi)較均一，土(tu)壤比(bi)(bi)較肥沃。
寧(ning)夏南(nan)華山國家級自然保護區(qu)地域范圍分別與(yu)海(hai)城鎮(zhen)、史店(dian)鄉(xiang)(xiang)、曹洼鄉(xiang)(xiang)、紅羊鄉(xiang)(xiang)、樹臺鄉(xiang)(xiang)和西(xi)安(an)鎮(zhen)接(jie)壤。其地理坐標為東(dong)經105°31′-105°44′，北(bei)緯(wei)36°20′-36°33′，呈西(xi)北(bei)-東(dong)南(nan)走向，南(nan)北(bei)寬19.2千米(mi)，東(dong)西(xi)長26.4千米(mi)，總(zong)面積20100.5公(gong)頃。
按照自然(ran)(ran)保(bao)(bao)護(hu)區(qu)(qu)功能區(qu)(qu)劃(hua)要求，寧夏南華山(shan)(shan)國(guo)家級自然(ran)(ran)保(bao)(bao)護(hu)區(qu)(qu)被(bei)區(qu)(qu)劃(hua)為(wei)實驗區(qu)(qu)、緩(huan)沖(chong)區(qu)(qu)和核(he)心區(qu)(qu)三個功能區(qu)(qu)。其中，核(he)心區(qu)(qu)6182.1公(gong)頃(qing)，緩(huan)沖(chong)區(qu)(qu)5235.3公(gong)頃(qing)，實驗區(qu)(qu)8683.1公(gong)頃(qing)。東南以亂堆子、洼里、老虎崾峴、柳(liu)樹(shu)灣、莧麻灣、石塘(tang)為(wei)界，西部以種田溝(gou)、水擔(dan)溝(gou)，新莊子、崾峴、陽屲(wa)、王坡、龔灣為(wei)界，北(bei)部以菜園、野(ye)狐坡、刺兒溝(gou)、小山(shan)(shan)、山(shan)(shan)門、蘆子溝(gou)、油房院為(wei)界。四至(zhi)界限(xian)以標牌、宣傳(chuan)欄(lan)、巡護(hu)道路及鐵絲圍欄(lan)為(wei)明(ming)顯標志(zhi)。
寧夏南華山(shan)國家級(ji)自然保護區(qu)的主要保護對象為山(shan)地(di)森林生(sheng)態系統(tong)和山(shan)地(di)草原與草甸(dian)生(sheng)態系統(tong)。
截至(zhi)2013年，寧夏南華(hua)山國家級自然保護區(qu)共有(you)野生維管植物(wu)(wu)(wu)(wu) 426 種(zhong)(zhong)(zhong)（包括種(zhong)(zhong)(zhong)以下單位），隸屬58科(ke)，203屬。其(qi)中(zhong)蕨(jue)類植物(wu)(wu)(wu)(wu)2科(ke)2屬4種(zhong)(zhong)(zhong)；裸子(zi)植物(wu)(wu)(wu)(wu)2科(ke)5屬6種(zhong)(zhong)(zhong)；被(bei)子(zi)植物(wu)(wu)(wu)(wu)54科(ke)196屬416種(zhong)(zhong)(zhong)。保護區(qu)近一半的(de)植物(wu)(wu)(wu)(wu)種(zhong)(zhong)(zhong)都有(you)程度不(bu)同、類型(xing)不(bu)同的(de)資(zi)源價值，多屬于資(zi)源植物(wu)(wu)(wu)(wu)。其(qi)中(zhong)有(you)藥用(yong)植物(wu)(wu)(wu)(wu)60余(yu)種(zhong)(zhong)(zhong)，如(ru)黃(huang)芪、升麻(ma)、黨參、天(tian)仙子(zi)、補血草(cao)等(deng)；有(you)油料植物(wu)(wu)(wu)(wu)十(shi)余(yu)種(zhong)(zhong)(zhong)，如(ru)山杏、風花菜(cai)、虎(hu)榛子(zi)等(deng)；有(you)飼(si)草(cao)植物(wu)(wu)(wu)(wu)20余(yu)種(zhong)(zhong)(zhong)，如(ru)大(da)針茅、長芒草(cao)、短花針茅等(deng)；有(you)園(yuan)林綠化與材(cai)用(yong)經濟植物(wu)(wu)(wu)(wu)30余(yu)種(zhong)(zhong)(zhong)，如(ru)華(hua)北紫(zi)丁香(xiang)、毛葉忍冬等(deng)。南華(hua)山的(de)野生植物(wu)(wu)(wu)(wu)中(zhong)還有(you)淀(dian)粉植物(wu)(wu)(wu)(wu)、纖維植物(wu)(wu)(wu)(wu)、單寧植物(wu)(wu)(wu)(wu)、花卉觀(guan)賞植物(wu)(wu)(wu)(wu)、食(shi)用(yong)果菜(cai)類、蜜源植物(wu)(wu)(wu)(wu)、芳香(xiang)植物(wu)(wu)(wu)(wu)等(deng)多種(zhong)(zhong)(zhong)用(yong)途的(de)野生植物(wu)(wu)(wu)(wu)，有(you)的(de)植物(wu)(wu)(wu)(wu)兼具多種(zhong)(zhong)(zhong)價值。有(you)國家一級重點(dian)保護植物(wu)(wu)(wu)(wu)發菜(cai)，二級重點(dian)保護植物(wu)(wu)(wu)(wu)蒙古扁桃、華(hua)北駝絨(rong)藜、短芒披堿草(cao)、中(zhong)麻(ma)黃(huang)。
寧夏在(zai)中國動物地理區(qu)(qu)劃上跨(kua)蒙新(xin)(xin)區(qu)(qu)的(de)東部(bu)草原亞(ya)區(qu)(qu)、西部(bu)荒漠亞(ya)區(qu)(qu)和(he)華(hua)(hua)北(bei)區(qu)(qu)的(de)黃土高原亞(ya)區(qu)(qu)三個亞(ya)區(qu)(qu)。寧夏南華(hua)(hua)山國家級(ji)自然保護區(qu)(qu)處(chu)在(zai)蒙新(xin)(xin)區(qu)(qu)的(de)西部(bu)荒漠亞(ya)區(qu)(qu)邊緣。從動物區(qu)(qu)系(xi)成分上來(lai)看，蒙新(xin)(xin)區(qu)(qu)成分占有(you)優勢(shi)，華(hua)(hua)北(bei)區(qu)(qu)與蒙新(xin)(xin)區(qu)(qu)物種(zhong)混(hun)雜程度大，帶有(you)明顯(xian)的(de)過渡特征(zheng)。?
截(jie)至(zhi)2013年，寧夏(xia)南華山國家級(ji)自然(ran)保護區有脊椎動物有5綱(gang)(gang)26目(mu)(mu)57科(ke)(ke)126屬173種(zhong)(zhong)(zhong)（含(han)116亞種(zhong)(zhong)(zhong)）。其中，魚綱(gang)(gang)2目(mu)(mu)3科(ke)(ke)8屬9種(zhong)(zhong)(zhong)，兩棲綱(gang)(gang)1目(mu)(mu)2科(ke)(ke)2屬3種(zhong)(zhong)(zhong)，爬行綱(gang)(gang)2目(mu)(mu)5科(ke)(ke)6屬10種(zhong)(zhong)(zhong)（含(han)1亞種(zhong)(zhong)(zhong)），鳥綱(gang)(gang)15目(mu)(mu)33科(ke)(ke)80屬115種(zhong)(zhong)(zhong)（含(han)80亞種(zhong)(zhong)(zhong)），哺(bu)乳綱(gang)(gang)6目(mu)(mu)14科(ke)(ke) 30屬36種(zhong)(zhong)(zhong)（含(han)35亞種(zhong)(zhong)(zhong)）。以(yi)鳥類(lei)占優勢，哺(bu)乳類(lei)次之(zhi)，兩棲類(lei)少。
在脊椎動(dong)物(wu)(wu)資源中(zhong)(zhong)，有(you)國家重(zhong)(zhong)點(dian)保(bao)(bao)護(hu)(hu)(hu)動(dong)物(wu)(wu)22種(zhong)(zhong)(zhong)，其(qi)(qi)中(zhong)(zhong)屬于(yu)國家Ⅰ級重(zhong)(zhong)點(dian)保(bao)(bao)護(hu)(hu)(hu)動(dong)物(wu)(wu)為(wei)金雕(diao)1種(zhong)(zhong)(zhong)，Ⅱ級重(zhong)(zhong)點(dian)保(bao)(bao)護(hu)(hu)(hu)動(dong)物(wu)(wu)21種(zhong)(zhong)(zhong)，其(qi)(qi)中(zhong)(zhong)鳥(niao)類Ⅱ級重(zhong)(zhong)點(dian)保(bao)(bao)護(hu)(hu)(hu)物(wu)(wu)種(zhong)(zhong)(zhong)17種(zhong)(zhong)(zhong)（有(you)：鳶、蒼鷹、雀鷹、松雀鷹、大天鵝(e)、草原雕(diao)、禿(tu)鷲、白尾鷂(yao)、獵隼(sun)、燕隼(sun)、紅腳隼(sun)、紅隼(sun)、雕(diao)鴞(xiao)、長耳(er)鴞(xiao)、縱紋腹(fu)小鴞(xiao)等(deng)），哺乳類Ⅱ級重(zhong)(zhong)點(dian)保(bao)(bao)護(hu)(hu)(hu)物(wu)(wu)種(zhong)(zhong)(zhong)4種(zhong)(zhong)(zhong)（荒漠貓(mao)、兔獼、豹貓(mao)、巖羊）。《瀕危野生動(dong)植(zhi)物(wu)(wu)物(wu)(wu)種(zhong)(zhong)(zhong)國際(ji)貿易(yi)公約》（CITES）規定(ding)的(de)(de)(de)種(zhong)(zhong)(zhong)類25種(zhong)(zhong)(zhong)，列入(ru)國際(ji)自然保(bao)(bao)護(hu)(hu)(hu)聯盟（IUCN）瀕危物(wu)(wu)種(zhong)(zhong)(zhong)等(deng)級動(dong)物(wu)(wu)名(ming)錄的(de)(de)(de)有(you)24種(zhong)(zhong)(zhong)，列入(ru)《中(zhong)(zhong)國瀕危動(dong)物(wu)(wu)紅皮書(shu)》動(dong)物(wu)(wu)名(ming)錄的(de)(de)(de)有(you)9種(zhong)(zhong)(zhong)，有(you)中(zhong)(zhong)日保(bao)(bao)護(hu)(hu)(hu)候鳥(niao)及(ji)其(qi)(qi)棲息(xi)環(huan)境協(xie)定(ding)規定(ding)的(de)(de)(de)保(bao)(bao)護(hu)(hu)(hu)鳥(niao)類42種(zhong)(zhong)(zhong)，有(you)中(zhong)(zhong)澳(ao)保(bao)(bao)護(hu)(hu)(hu)候鳥(niao)及(ji)其(qi)(qi)棲息(xi)環(huan)境協(xie)定(ding)規定(ding)的(de)(de)(de)保(bao)(bao)護(hu)(hu)(hu)鳥(niao)類13種(zhong)(zhong)(zhong)，列入(ru)國家保(bao)(bao)護(hu)(hu)(hu)的(de)(de)(de)有(you)益的(de)(de)(de)或者有(you)重(zhong)(zhong)要經濟、科學研究價值的(de)(de)(de)陸生野生動(dong)物(wu)(wu)名(ming)錄的(de)(de)(de)有(you)65種(zhong)(zhong)(zhong)，屬于(yu)寧(ning)夏(xia)重(zhong)(zhong)點(dian)保(bao)(bao)護(hu)(hu)(hu)動(dong)物(wu)(wu)有(you)35種(zhong)(zhong)(zhong)。
寧夏南華山國家級自(zi)然保護(hu)區有(you)昆蟲(chong)(chong)16目(mu)(mu)132科530種(zhong)(zhong)。主要由鞘翅(chi)(chi)目(mu)(mu)、鱗翅(chi)(chi)目(mu)(mu)、半(ban)翅(chi)(chi)目(mu)(mu)、雙翅(chi)(chi)目(mu)(mu)、直翅(chi)(chi)目(mu)(mu)和膜翅(chi)(chi)目(mu)(mu)種(zhong)(zhong)類組成，其(qi)中鞘翅(chi)(chi)目(mu)(mu)34科179種(zhong)(zhong)、鱗翅(chi)(chi)目(mu)(mu)26科156種(zhong)(zhong)、半(ban)翅(chi)(chi)目(mu)(mu)18科56種(zhong)(zhong)，6個目(mu)(mu)的科數(shu)為110科、占(zhan)保護(hu)區昆蟲(chong)(chong)總科數(shu)的83.33%，物(wu)種(zhong)(zhong)數(shu)為480種(zhong)(zhong)、占(zhan)保護(hu)區昆蟲(chong)(chong)總種(zhong)(zhong)類數(shu)的90.56%。
寧夏南華(hua)山國家(jia)級(ji)自然保護(hu)(hu)區管(guan)理(li)(li)(li)機構為(wei)南華(hua)山自然保護(hu)(hu)區管(guan)理(li)(li)(li)處(chu)，實行三級(ji)管(guan)理(li)(li)(li)體制，行政上直屬海原(yuan)縣人民政府領導(dao)，業務接受寧夏林(lin)業局(ju)和中衛市(shi)林(lin)業局(ju)指(zhi)導(dao)。保護(hu)(hu)區管(guan)理(li)(li)(li)處(chu)下設辦公室、科研(yan)中心、計(ji)劃財務科、管(guan)理(li)(li)(li)站(zhan)、保護(hu)(hu)點(dian)、檢查(cha)站(zhan)。
寧夏南華(hua)山國家(jia)級自然(ran)保(bao)護(hu)區功能區劃調(diao)整后，原(yuan)來設立在四橋的管(guan)理(li)機(ji)構成為核心區，管(guan)理(li)機(ji)構搬遷到縣(xian)城，由縣(xian)政府調(diao)劑辦公場(chang)地。
截至2013年，寧夏南華山國(guo)家級自然保護(hu)區有(you)管理站6個(ge)、瞭望塔2個(ge)、設(she)立解(jie)說牌2塊(kuai)(kuai)(kuai)，大(da)宣傳(chuan)牌2塊(kuai)(kuai)(kuai)，小宣傳(chuan)牌60塊(kuai)(kuai)(kuai)。在(zai)周邊設(she)立固定標準地60塊(kuai)(kuai)(kuai)。配有(you)少量計算(suan)機(ji)等(deng)辦(ban)公設(she)備，及公務車、對講機(ji)、GPS、通(tong)訊和科研設(she)備等(deng)。
巧笑倩兮 
