新疆維吾爾自治區博物館，位于烏魯木齊市沙依巴克區西北路，距市中心2千米。博物館是省級綜合性地志博物館，也是新疆維吾爾自治區的文物和標本收藏保護、科學研究和宣傳教育機構。博物館外觀造型及內部裝飾具有維吾爾建筑風格，館內展廳面積7800平方米，共收藏歷史文物、民族文物、革命文物等5萬余件，其中，國家一級文物近400件，占全疆總數的60% 。

吐魯番博物館，位于新疆維吾爾自治區吐魯番市高昌區木納爾路1268號，是集文物收藏展陳、文化遺產保護與研究、社會科教宣傳教育等職能于一體的國有綜合類博物館。博物館占地面積17571平方米，展覽面積達4278平方米，庫房面積539.45平方米；館內珍貴文物有707件，其中一級文物120件，二級文物149件，三級文物438件。

新疆兵團軍墾博物館位于石河子市城區北三路，是國家AAAA級旅游景區。2004年，在石河子軍墾博物館的基礎上，將石河子市市級文物保護單位“軍墾第一樓”改擴建成為“新疆兵團軍墾博物館”；2008年，向全社會免費開放。2017年5月官網顯示，新疆兵團軍墾博物館總建筑面積9703平方米，收藏各類文物5000件 ，軍墾文物4000件，其中有29件軍墾文物被列為國家一級珍貴革命文物，3件被列為國家一級歷史文物資料，2件被列為二級古代文物，24件被列為三級古代文物。

哈密博物館成立于1988年，設有通史陳列室、五堡古墓出土文物與焉不拉克文化兩個專題陳列室，展出各類文物700余件。哈密博物館是一座展示哈密古代文明的綜合性博物館，它所收藏的珍貴文物及研究標本達1.2萬件，其中尤以新疆青銅時代至漢代的青銅器、彩陶器、服飾和古尸等藏品最為出色。五堡文物、焉不拉克文化都有較高的考古科研價值。1989年該館前身文管所被國家文物局、公安部評為全國文物安全保衛工作先進集體，1991年，又被國家人事部、文化部評為全國文化系統先進集體。

阿克蘇地區博物館位于新疆西部，天山南麓，塔克拉瑪干沙漠北緣。面積13.2萬平方公里，人口231萬。阿克蘇地區是新疆的文物大區之一，地上地下文物資源極為豐富。阿克蘇地區博物館成立于1994年，位于阿克蘇東大街36號，是阿克蘇地區第一個集歷史、藝術、民俗、自然為一體的綜合性博物館，體現了“龜茲文化”“多浪文化”特色，反映阿克蘇深厚歷史文化底蘊。新館建成于2008年，總投資4438萬元，由上海援建和地方財政配套的方式共同完成。

巴音郭楞蒙古自治州博物館為地方綜合性博物館，成立于1990年3月，隸屬于巴音郭楞蒙古自治州文化局。館舍建筑為磚混結構的普通樓房。共六層，博物館使用四、五層，共有面積約680平方米，其中展覽廳面積約340平方米。館舍建筑為磚混結構的普通樓房，共六層，博物館使用四、五層，共有面積約680平方米，其中展覽廳面積約340平方米。在建筑創作上，巴音郭楞蒙古自治州博物館以樓蘭佛塔為設計主體，配以蒙古金剛舍利佛塔為建筑基底，隱喻該建筑在尋覓和沉思古老的樓蘭文化，千年的歷史文明將在這里再現。

烏魯木齊文廟座落在市區前進路，自治區黨校北側，文廟是全疆唯一一處保存完整的清代風格廟宇建筑群，它靠街而立，門前楊樹成行，綠業成蔭。 烏魯木齊文廟原系上帝廟，后監修于民國十一年(1922年），主祭上帝，配享孔子。1945年改修為孔子大成殿，1979年公布為市級文物保護單位。1988-1990年國家投資百萬元落架維修，現為烏魯木齊市博物館館址。烏魯木齊市博物館于1991年9月8日首次預展開放。隸屬烏魯木齊市文化局。受自治區文化廳文物處統一管理。

三五九旅屯墾紀念館位于新疆南部阿克蘇地區的新疆生產建設兵團第一師阿拉爾市，建于2006年7月，2009年9月開館，建筑面積11000平方米。該紀念館先后被評為地區愛國主義教育基地、國家第三批紅色旅游經典景區等，是區內外游客接受革命傳統教育的紅色旅游基地和了解師市、新疆兵團及其建設成就的一個重要窗口。2016年12月，三五九旅屯墾紀念館入選《全國紅色旅游景點景區名錄》，2018年4月13日入圍“神奇西北100景”。

塔城地區博物館前身為“紅樓”，2008年3月31日正式免費開館。《按塔城地區歷史發展陳列》 分為“歷史文物陳列”、“塔城民族民俗文化陳列”、“塔城地區革命歷史文物陳列”、“塔城地區改革開放成就陳列”四部分。館內陳列展出文物有國家一級文物24件、二級文物17件、三級文物64件、民族民俗文物精品展品300余件，隆重推出“塔山古道和河曙光——塔城歷史文物陳列”，“騰飛之夢—塔城民族民俗文化陳列”，“愛國豐碑——塔城地區革命歷史文物陳列”。

和田地區博物館是一個地方綜合性博物館，主要展出內容為·新石器時代、銅器時代、早期鐵器時代的與農業、畜牧業、手工業及商業交通發展有關的文物。與列入中國版圖后和田地區范圍內的精絕、戎盧、扜彌、渠勒、于闐、皮山等國政治、經濟、文化交流有關的各種文物；于闐佛教文化重要文物；與和田本土發展的具有地方特色的紡織業、和田玉石文化、木器雕刻藝術等有關的重要文物；伊斯蘭教傳入后和近代的各種重要文物。