云門寺其實是個總稱,包括云門主寺及多個副寺,后來主寺日漸衰落各副寺就別立為寺了,如顯圣寺、雍熙寺、壽圣寺等。在當時的這幾個主要別立的寺院在加上云門寺本身被當地稱為“一山四寺”、“一主四副”或云“一本而四名”。但在當地信眾的觀念中通常把這些寺院視其為云門一寺。另外在其不遠還有很多的寺院、庵堂。至宋,云門析為廣孝、顯圣、雍熙、普濟、明覺、云門六寺。明萬歷《會稽志》卷十六載:“今云門有寺六:廣孝,恩昱諸公所居也;上庵曰廣福;看經院曰顯圣;悶興懺院早雍熙;西曰普濟;南曰明覺,各有勝地。”足見當時的盛況。