| 批復時間 | 國家自主創新示范區 | 所在省、市 |
| 2009年3月 | 中關村國家自主創新示范區 | 北京市 |
| 2009年12月 | 武漢東湖國家自主創新示范區 | 湖北省武漢市 |
| 2011年3月 | 上海張江國家自主創新示范區 | 上海市 |
| 2014年6月 | 深圳國家自主創新示范區 | 廣東省深圳市 |
| 2014年11月 | 蘇南國家自主創新示范區 | 江蘇省南京市、蘇州市、無錫市、常州市、鎮江市 |
| 2015年1月 | 長株潭國家自主創新示范區 | 湖南省長沙市、株洲市、湘潭市 |
| 2015年2月 | 天津國家自主創新示范區 | 天津市 |
| 2015年6月 | 成都國家自主創新示范區 | 四川省成都市 |
| 2015年9月 | 西安國家自主創新示范區 | 陜西省西安市 |
| 2015年9月 | 杭州國家自主創新示范區 | 浙江省杭州市 |
| 2015年9月 | 珠三角國家自主創新示范區 | 廣州、深圳、珠海、佛山、惠州、東莞、中山、江門、肇慶 |
| 2016年4月 | 鄭洛新國家自主創新示范區 | 河南省鄭州市、洛陽市、新鄉市 |
| 2016年4月 | 山東半島國家自主創新示范區 | 山東省濟南市、青島市、淄博市、濰坊市、煙臺市、威海市 |
| 2016年4月 | 沈大國家自主創新示范區 | 遼寧省沈陽市、大連市 |
| 2016年6月 | 福廈泉國家自主創新示范區 | 福建省福州市、廈門市、泉州市 |
| 2016年6月 | 合蕪蚌國家自主創新示范區 | 安徽省合肥市、蕪湖市、蚌埠市 |
| 2016年7月 | 重慶國家自主創新示范區 | 重慶市 |
| 2018年2月 | 寧波、溫州國家自主創新示范區 | 浙江省寧波市、溫州市 |
| 2018年2月 | 蘭白國家自主創新示范區 | 甘肅省蘭州市、白銀市 |
| 2018年11月 | 烏昌石國家自主創新示范區 | 新疆維吾爾自治區烏魯木齊市、昌吉市、石河子市 |
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