在(zai)西方,摩尼(ni)(ni)(ni)(ni)在(zai)世(shi)時(shi),摩尼(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)(jiao)已經傳播到敘利(li)亞(ya)、巴勒斯(si)坦和埃(ai)(ai)及。公(gong)元300年左右(you),摩尼(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)(jiao)徒在(zai)埃(ai)(ai)及已經頗(po)有(you)聲(sheng)勢,以致(zhi)于哲學家里(li)(li)(li)科普里(li)(li)(li)斯(si)的(de)亞(ya)歷山大(da)覺得(de)有(you)必要撰文與(yu)其論(lun)(lun)戰。摩尼(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)(jiao)又(you)從(cong)埃(ai)(ai)及傳播到北非和西班牙,從(cong)敘利(li)亞(ya)傳播到小亞(ya)細亞(ya),再(zai)從(cong)那(nei)里(li)(li)(li)傳播到希臘(la)、亞(ya)德里(li)(li)(li)亞(ya)海東岸、意大(da)利(li)和高盧。這些地(di)方當(dang)時(shi)均在(zai)羅馬帝(di)(di)國統治之(zhi)下,摩尼(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)(jiao)遭(zao)到政府的(de)粗暴迫害(hai)。皇(huang)帝(di)(di)戴(dai)克里(li)(li)(li)先於297年發布著名的(de)詔(zhao)書,命(ming)令非洲總督鎮壓摩尼(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)(jiao)。基督教(jiao)(jiao)當(dang)時(shi)也遭(zao)到戴(dai)克里(li)(li)(li)先的(de)迫害(hai),但是(shi)不(bu)久即取(qu)得(de)國教(jiao)(jiao)地(di)位,將摩尼(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)(jiao)視為最(zui)危險的(de)對手,不(bu)遺余力地(di)從(cong)教(jiao)(jiao)俗兩方面進(jin)行斗爭。執事馬克(Mark the Deacon)寫的(de)加(jia)沙主(zhu)教(jiao)(jiao)波菲里(li)(li)(li)(Porphyry, the Bishop of Gaza)傳中,記(ji)載(zai)了(le)375年波菲里(li)(li)(li)與(yu)摩尼(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)(jiao)女信徒、來(lai)自安條(tiao)克的(de)朱莉婭(Julia)的(de)一(yi)場辯(bian)論(lun)(lun)。圣奧(ao)古斯(si)丁(354-430)則記(ji)載(zai)了(le)他(ta)與(yu)摩尼(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)(jiao)徒福圖那(nei)圖斯(si)、費(fei)利(li)克斯(si)的(de)辯(bian)論(lun)(lun)。這些辯(bian)論(lun)(lun)正(zheng)是(shi)基督教(jiao)(jiao)與(yu)摩尼(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)(jiao)斗爭的(de)典型(xing)例子。著名的(de)希臘(la)文教(jiao)(jiao)義(yi)之(zhi)正(zheng)式聲(sheng)明說明遲(chi)至九世(shi)紀,摩尼(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)(jiao)仍(reng)然在(zai)西方活動。不(bu)過1000年以后,在(zai)西方就(jiu)不(bu)再(zai)看到關于他(ta)們(men)的(de)記(ji)載(zai)了(le)。
歐洲中(zhong)世紀出現(xian)過所謂新摩(mo)尼(ni)教,比如(ru),7世紀亞美尼(ni)亞的保(bao)羅(luo)派(pai)(Paulicians)、10世紀保(bao)加(jia)利亞的鮑(bao)格米勒(le)派(pai)(Bogomilists)、和12世紀法國(guo)南(nan)部(bu)的阿(a)爾比派(pai)(Albigensians),都有類似摩(mo)尼(ni)教之處(chu),可能曾受其影響。但是很難確定它們與摩(mo)尼(ni)教之間(jian)的直接歷(li)史聯(lian)系(xi)。
在(zai)(zai)(zai)東方(fang),薩(sa)(sa)珊王朝(chao)(chao)(chao)時(shi)(shi)期(qi)(224-651)摩(mo)(mo)(mo)尼(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)在(zai)(zai)(zai)波(bo)(bo)斯(si)本土(tu)不(bu)斷遭到(dao)血(xue)腥迫(po)害,它的(de)(de)主要(yao)力量逐(zhu)漸匯聚到(dao)中(zhong)亞烏滸水(Oxus,今阿(a)姆河)流(liu)域。粟(su)特(te)城(cheng)市薩(sa)(sa)秣建(撒(sa)馬爾(er)干(gan))和赭時(shi)(shi)(塔什干(gan))成為摩(mo)(mo)(mo)尼(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)傳播的(de)(de)重要(yao)基(ji)地(di)(di)。六世(shi)紀末,中(zhong)亞摩(mo)(mo)(mo)尼(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)團在(zai)(zai)(zai)撒(sa)特(te)-奧爾(er)米茲(zi)(Sad-Ohrmizd)領(ling)導下,與(yu)巴比(bi)倫的(de)(de)領(ling)袖分裂(lie),以(yi)電(dian)那勿(Denawars)派的(de)(de)名稱獨立。這(zhe)種分裂(lie)狀態到(dao)八世(shi)紀初(chu)才結束,中(zhong)亞重新接(jie)受巴比(bi)倫法(fa)王米爾(er)(Mihr,約710-740)的(de)(de)領(ling)導。七世(shi)紀中(zhong)葉(xie),穆斯(si)林征(zheng)服波(bo)(bo)斯(si)以(yi)后,摩(mo)(mo)(mo)尼(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)徒的(de)(de)處境(jing)有所改善,伍麥(mai)葉(xie)王朝(chao)(chao)(chao)(661-750)讓他(ta)們和平(ping)地(di)(di)活動(dong),可能(neng)根本沒有怎么注(zhu)意他(ta)們。阿(a)拔斯(si)王朝(chao)(chao)(chao)時(shi)(shi)期(qi)(750-1258),許多摩(mo)(mo)(mo)尼(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)文獻(xian)被翻譯成阿(a)拉(la)伯(bo)文,比(bi)如,伊本-穆蓋法(fa)耳(757年卒)曾把摩(mo)(mo)(mo)尼(ni)(ni)(ni)(ni)的(de)(de)幾本著作(zuo)(zuo)翻譯成阿(a)拉(la)伯(bo)文,比(bi)魯尼(ni)(ni)(ni)(ni)和奈丁(ding)(ding)就是(shi)在(zai)(zai)(zai)一(yi)些摩(mo)(mo)(mo)尼(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)著作(zuo)(zuo)阿(a)拉(la)伯(bo)文譯本的(de)(de)基(ji)礎(chu)上,撰(zhuan)寫摩(mo)(mo)(mo)尼(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)歷史的(de)(de)。同時(shi)(shi),阿(a)拔斯(si)王朝(chao)(chao)(chao)恢復了(le)薩(sa)(sa)珊王朝(chao)(chao)(chao)反摩(mo)(mo)(mo)尼(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)的(de)(de)做法(fa),譴責許多波(bo)(bo)斯(si)血(xue)統的(de)(de)翻譯者是(shi)摩(mo)(mo)(mo)尼(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)的(de)(de)同情者。在(zai)(zai)(zai)麥(mai)海迪(di)(775-785)和穆格臺迪(di)爾(er)(908-932)統治(zhi)時(shi)(shi)期(qi),設立了(le)專門處置異教(jiao)徒(主要(yao)是(shi)摩(mo)(mo)(mo)尼(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)徒)的(de)(de)機構,無情地(di)(di)對摩(mo)(mo)(mo)尼(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)徒進行迫(po)害。967年前奈丁(ding)(ding)在(zai)(zai)(zai)首都巴格達(da)親身(shen)認識三百(bai)個摩(mo)(mo)(mo)尼(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)徒,但(dan)是(shi),當他(ta)寫作(zuo)(zuo)《群書類述》時(shi)(shi),只有五個還留在(zai)(zai)(zai)首都,可見迫(po)害之(zhi)激烈。可能(neng)公元1000年左右,摩(mo)(mo)(mo)尼(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)徒在(zai)(zai)(zai)伊拉(la)克就滅絕了(le)。