重慶港（Chongqing Port），位于中國中西結合部，水路可直達長江八省二市，陸路與成渝、襄渝、渝黔、渝懷鐵路和成渝、渝黔、重慶至武漢、重慶至長沙等高速公路相連，是長江上游最大的內河主樞紐港，現為全國內河主要港口。重慶港的經濟腹地主要包括重慶市轄9區12縣及四川、云南、貴州三省。重慶港系國家一類口岸，主要從事港口裝卸、客貨運輸、水陸中轉、倉儲服務、物流配送、酒店旅游等多種綜合性經營服務。2016年全區港口吞吐量共計完成2765.94萬噸。

涪陵港有5000噸級泊位20個，年設計通過能力3000萬噸，其中集裝箱150萬標箱、件雜貨150萬噸、散貨2000萬噸。2016年該區港口吞吐量共計完成2765.94萬噸，同比增長10.33%。其中危化品完成360.09萬噸，占總量的13.1%，集裝箱完成3.6萬標箱。從該區港口吞吐量完成情況分析，大宗貨物主要為煤炭制品、金屬礦石、礦建材料、化肥，共計完成1764萬噸，占完成總量63.8%。

新生港是忠縣規劃新建的大規模腹地吞吐港和區域水陸交匯樞紐，是忠縣充分利用自身區位優勢形成核心競爭力，特別是融入長江經濟帶，打造沿江立體交通走廊重要節點，服務國家“一帶一路”戰略的關鍵舉措。新生港是常年深水良港，是三峽庫區回水高水位全年都能到達的最西端，是支撐長江上游航運中心的重要交通節點，也是承接“疆煤入渝”鐵水聯運的重要口岸。新生港吞吐規模一期不低于1200萬噸/年。

果園港位于重慶市兩江新區核心區域，是我國最大的內河水、鐵、公聯運樞紐港，采用的也是通常海港才有的直立式碼頭，占地共4平方公里，分為港前作業區和后港物流園區一期工程于2008年4月開工，2個散貨泊位已于2010年12月建成并投入運行，形成吞吐能力200萬噸。如今，果園港是國家發改委、交通部、市政府重點規劃建設的第三代現代化內河港區，總投資超過100億元，是長江上游航運中心建設的又一標志性工程，于2013年12月5日開港。

寸灘港區地處長江上游，位于重慶市江北區寸灘鎮，重慶朝天門下游約6公里的長江北岸。與重慶市內環高速公路、海爾一級公路及金渝大道相連，連接成渝、渝黔、渝遂、渝鄰、渝宜等多條高速公路，緊鄰渝懷鐵路唐家沱鐵路貨運站，距重慶空港約10公里，背靠北部新區、高新技術產業開發區、經濟技術開發區、港城工業園區和海爾工業園。目前,寸灘港區已建成集裝箱泊位5個,去年集裝箱吞吐量達到55萬標箱,貨源輻射到貴州、四川和陜西等地。

萬州港地處長江中上游結合部，三峽庫區腹心地帶，素有 “ 渝東門戶 ” 之稱，重慶直轄后為渝東和三峽庫區最大的港口。港口現有區域面積 27.01 平方公里，其中陸域 0.44 平方公里，水域 26.57 平方公里。萬州港下轄忠縣、西沱（含石寶寨）、云陽、奉節、巫山等五個縣級港站。港口地理位置適中，是渝東、川東北、湘鄂、陜南、黔北等西南地區重要的物資出海通道，是長江十大港口之一，被國家列為長江干線重點建設的五大多用途港口之一。