2017年末，廈門全市醫療衛生機構總數1701個（不含部隊醫院），比去年增加123個。與去年同比，醫院增加4個，基層醫療衛生機構增加122個（主要是門診部增加），專業公共衛生機構減少3個（主要是計劃生育技術服務機構減少）。復旦大學中山廈門醫院建成投用，新增床位800張。北京中醫藥大學與廈門中醫院開展深度合作，成立廈門分院。深入推進醫藥衛生體制改革，“三師共管”家庭醫生簽約服務模式在全市推廣，全面實施公立醫院績效考核、薪酬制度改革等重大改革舉措。醫療救治應急指揮平臺投入運行，國家健康醫療大數據中心及產業園建設扎實推進。