該(gai)研(yan)究(jiu)由中國(guo)農科院(yuan)(yuan)茶(cha)葉(xie)所和中國(guo)農科院(yuan)(yuan)深圳農業基(ji)(ji)因組(zu)研(yan)究(jiu)所主導，攜手中科院(yuan)(yuan)昆明(ming)動物研(yan)究(jiu)所及(ji)云南(nan)(nan)省(sheng)(sheng)農業科學院(yuan)(yuan)茶(cha)葉(xie)研(yan)究(jiu)所等(deng)單(dan)位進行，得到中國(guo)農業科學院(yuan)(yuan)農業科技創新(xin)(xin)工程、農業基(ji)(ji)因組(zu)協同創新(xin)(xin)項(xiang)(xiang)目(mu)、浙江省(sheng)(sheng)茶(cha)樹(shu)新(xin)(xin)品種選育(yu)重大科技專項(xiang)(xiang)、深圳市(shi)基(ji)(ji)礎研(yan)究(jiu)學科布局項(xiang)(xiang)目(mu)、國(guo)家青年(nian)拔(ba)尖人(ren)才支(zhi)持計劃和云南(nan)(nan)省(sheng)(sheng)創新(xin)(xin)研(yan)究(jiu)團隊等(deng)項(xiang)(xiang)目(mu)資助。

研(yan)究人員(yuan)先以(yi)我國著名的優良(liang)茶(cha)樹(shu)品種“龍(long)井43”為材料，克服其基(ji)因組高(gao)度(du)雜(za)合、重復(fu)序列(lie)比例高(gao)等(deng)難題，完成了“龍(long)井43”染色(se)體級別(bie)的基(ji)因組的組裝。在此基(ji)礎上，研(yan)究人員(yuan)發現了決定“龍(long)井43”發芽早、產量高(gao)以(yi)及抗逆性(xing)強等(deng)優異(yi)經濟性(xing)狀的基(ji)因“密碼”。

基于對“龍井43”進行組裝的高質量基因組，研究人員又對日本、老撾、斯里蘭卡、肯尼亞等不同國家和地區的139份有代表性的茶樹材料基因組進行了深度重測序，這是該領域迄今為(wei)止最具代(dai)表性的(de)(de)一次研(yan)究。研(yan)究描繪了栽培茶(cha)樹的(de)(de)進化歷史(shi)，成為(wei)證明‘茶(cha)樹起源于中國’的(de)(de)重要成果。

這項研究發現，茶(cha)樹野(ye)生近緣種(zhong)群是栽培的(de)中小(xiao)葉(xie)茶(cha)品種(zhong)（植物(wu)(wu)分(fen)類(lei)上多屬(shu)于茶(cha)變種(zhong)）和(he)大葉(xie)茶(cha)品種(zhong)（植物(wu)(wu)分(fen)類(lei)上多屬(shu)于阿(a)薩姆茶(cha)變種(zhong)）的(de)祖先，馴化過程中二者(zhe)的(de)選(xuan)擇方(fang)向存(cun)在(zai)差異(yi)。中國中小(xiao)葉(xie)種(zhong)茶(cha)樹中的(de)萜烯類(lei)代謝(xie)基(ji)因在(zai)芽和(he)葉(xie)中表達量較高，這意味著(zhu)其風味特(te)性更明顯、更豐富(fu)。

上述相(xiang)關研(yan)究成果(guo)已以(yi)“群體測序增強(qiang)對茶樹進化的認識”為(wei)題(ti)發表(biao)在國(guo)際著名期刊《自然通訊》上。