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大報恩寺(si)位(wei)于(yu)南京中(zhong)華門外(wai)雨花(hua)(hua)(hua)路東側秦(qin)(qin)淮(huai)河畔長干里(li)，范(fan)圍(wei)東起今(jin)晨光機器廠(chang)，西至雨花(hua)(hua)(hua)路，南達雨花(hua)(hua)(hua)臺，北(bei)抵秦(qin)(qin)淮(huai)河邊，周圍(wei)9里(li)13步。
大(da)(da)報恩(en)寺坐東(dong)向西、規模宏大(da)(da)，全寺整體(ti)建筑分為南(nan)北兩大(da)(da)部(bu)分，寺廟主(zhu)體(ti)部(bu)分（山門，佛殿(dian)(dian)、琉璃(li)塔等）居北半(ban)部(bu)，附(fu)屬部(bu)分（僧房、禪堂、藏經殿(dian)(dian)等）居南(nan)半(ban)部(bu)，南(nan)北兩部(bu)分之(zhi)間由圍墻隔開。
大(da)(da)報(bao)(bao)恩(en)寺(si)北半部(bu)主體建筑(zhu)中(zhong)軸線布局排列有(you)序：山(shan)門(men)（金剛殿(dian)(dian)(dian)）—香水河橋—天王殿(dian)(dian)(dian)—大(da)(da)雄寶殿(dian)(dian)(dian)—琉(liu)璃塔一(yi)(yi)觀(guan)音殿(dian)(dian)(dian)一(yi)(yi)法堂(tang)。香水河橋的(de)(de)南(nan)北兩側各置御碑亭一(yi)(yi)座(zuo)，分別護于“御制大(da)(da)報(bao)(bao)恩(en)寺(si)左碑”和“御制大(da)(da)報(bao)(bao)恩(en)寺(si)右碑”。觀(guan)音殿(dian)(dian)(dian)的(de)(de)兩側有(you)祖(zu)師(shi)殿(dian)(dian)(dian)和伽藍殿(dian)(dian)(dian)，觀(guan)音殿(dian)(dian)(dian)后南(nan)北有(you)畫(hua)廓118間。在祖(zu)師(shi)殿(dian)(dian)(dian)前有(you)鐘(zhong)樓(lou)(lou)一(yi)(yi)座(zuo)，而(er)與之對稱(cheng)的(de)(de)伽藍殿(dian)(dian)(dian)前卻無鼓樓(lou)(lou)，按中(zhong)國(guo)寺(si)廟傳統的(de)(de)“晨鐘(zhong)暮鼓”及建筑(zhu)式樣(yang)，大(da)(da)報(bao)(bao)恩(en)寺(si)內(nei)設鐘(zhong)樓(lou)(lou)而(er)不設鼓樓(lou)(lou)現象輕為(wei)少見。結合大(da)(da)報(bao)(bao)恩(en)寺(si)塔“九(jiu)級(ji)內(nei)外，篝燈(deng)一(yi)(yi)百(bai)四十有(you)六”，“—日夜費油六十四斤四兩零(ling)”，使之“晝夜長明”來看(kan)，大(da)(da)報(bao)(bao)恩(en)寺(si)設鐘(zhong)不設鼓當有(you)一(yi)(yi)定寓意。各殿(dian)(dian)(dian)的(de)(de)尺寸(cun)，《金陵梵剎志》收(shou)錄詳備。
大(da)報恩寺(si)山門朝西，建(jian)筑(zhu)(zhu)布局總體(ti)上(shang)可分為南(nan)、北(bei)兩大(da)部分。寺(si)廟中重要的宗教性建(jian)筑(zhu)(zhu)皆(jie)分布于北(bei)區；而為寺(si)院配套的附(fu)屬建(jian)筑(zhu)(zhu)皆(jie)位于南(nan)區，兩者之(zhi)間以院墻相(xiang)隔。大(da)報恩寺(si)北(bei)區的建(jian)筑(zhu)(zhu)排列極為有(you)序。沿(yan)著中軸線(xian)依次設(she)置山門（金剛殿）—香水河橋—天王殿—大(da)殿—琉璃塔—觀音殿—法堂等(deng)(deng)核心建(jian)筑(zhu)(zhu)；在(zai)中軸線(xian)兩側還根據需(xu)要設(she)置了(le)御碑(bei)亭、鐘樓、祖師殿、伽(jia)藍殿等(deng)(deng)建(jian)筑(zhu)(zhu)。
大(da)報恩(en)寺(si)以(yi)佛殿(dian)(dian)(dian)（即大(da)雄寶(bao)殿(dian)(dian)(dian)，又(you)稱碽(gong)妃殿(dian)(dian)(dian)）、天王(wang)殿(dian)(dian)(dian)、寶(bao)塔為(wei)主體，包括金剛殿(dian)(dian)(dian)、左(zuo)(zuo)右碑亭、天王(wang)殿(dian)(dian)(dian)、大(da)殿(dian)(dian)(dian)、佛殿(dian)(dian)(dian)、大(da)禪(chan)(chan)殿(dian)(dian)(dian)、后禪(chan)(chan)殿(dian)(dian)(dian)、左(zuo)(zuo)右觀(guan)音殿(dian)(dian)(dian)、法堂、祖師堂、無(wu)梁(liang)殿(dian)(dian)(dian)、伽藍(lan)殿(dian)(dian)(dian)、藏(zang)經(jing)(jing)前殿(dian)(dian)(dian)、藏(zang)經(jing)(jing)殿(dian)(dian)(dian)、左(zuo)(zuo)右貯經(jing)(jing)廊、輪藏(zang)殿(dian)(dian)(dian)、禪(chan)(chan)堂、韋馱殿(dian)(dian)(dian)、經(jing)(jing)房(fang)、東西(xi)方丈、三(san)藏(zang)殿(dian)(dian)(dian)、鐘(zhong)樓(lou)等，僧院一百(bai)四十(shi)八房(fang)，東西(xi)畫廊廊房(fang)一百(bai)一十(shi)八間，經(jing)(jing)房(fang)三(san)十(shi)八間，規模(mo)極(ji)其宏大(da)。
大(da)報恩寺及其琉璃(li)寶(bao)塔(ta)(ta)(ta)(ta)的建(jian)筑(zhu)極(ji)其精(jing)美(mei)(mei)，集明(ming)代以前中(zhong)國建(jian)筑(zhu)藝術精(jing)華于一(yi)身，下墻(qiang)、石(shi)壇及欄(lan)桿，都用(yong)漢(han)白玉石(shi)砌成(cheng)，雕鏤得(de)非(fei)常別致。大(da)殿非(fei)禮(li)部祠祭，終年封閉。明(ming)初詔(zhao)刻大(da)藏，別置藏經殿，貯南藏經板全部。門框飾有獅(shi)子、白象、飛(fei)羊等佛(fo)教題材的五(wu)色琉璃(li)磚。剎頂鑲嵌金(jin)銀珠寶(bao)。角梁下懸掛風鈴152個(ge)，日夜作響，聲聞數(shu)里。自建(jian)成(cheng)之日起就點燃長明(ming)塔(ta)(ta)(ta)(ta)燈140盞，每天耗油64斤，金(jin)碧輝煌，晝夜通明(ming)。塔(ta)(ta)(ta)(ta)內壁(bi)布滿佛(fo)龕。該塔(ta)(ta)(ta)(ta)是金(jin)陵四(si)十八景之一(yi)，明(ming)清時(shi)代，一(yi)些(xie)歐洲(zhou)商(shang)人、游客和傳(chuan)教士來到南京(jing)，稱之為(wei)“南京(jing)瓷塔(ta)(ta)(ta)(ta)”，將它與羅馬(ma)斗獸(shou)場、亞歷山(shan)大(da)地(di)下陵墓、比薩斜塔(ta)(ta)(ta)(ta)相媲美(mei)(mei)，稱之為(wei)中(zhong)古世(shi)界七(qi)大(da)奇觀之一(yi)，是當(dang)時(shi)中(zhong)國的象征。
香水河橋(qiao)為石拱(gong)橋(qiao)，橋(qiao)面總(zong)寬745厘(li)米，通厚(hou)65厘(li)米，七層，砌筑于石板橋(qiao)底(di)上。
在香水河(he)橋和天王殿之間，沿著中軸線，發現了以(yi)長方形青(qing)石板鋪砌的主干道(dao)。路面寬255厘(li)米，殘(can)長23.75米，厚(hou)16－20厘(li)米。
天王殿為(wei)帶有前廊與月臺(tai)的五(wu)開間、三進深(shen)的大型建筑，整體呈“雙凸字形”。它座(zuo)落于夯土臺(tai)基之(zhi)上。
大報恩寺大殿俗稱碩妃殿，其中供奉(feng)有碩妃的碑位，每年(nian)由(you)禮部按時祭祀(si)，除此(ci)之(zhi)外(wai)終(zhong)年(nian)封閉(bi)，不許人進入。
大殿位于北區正中心的(de)位置。底部設置大型夯土臺基，殘存的(de)高(gao)度(du)約為5.2米(mi)(mi)。外圍(wei)圍(wei)繞一(yi)(yi)周寬度(du)約為1.2米(mi)(mi)的(de)基槽。殿內共(gong)發現(xian)兩(liang)排(pai)6個(ge)大型石柱礎。據文獻記載，該殿“高(gao)七(qi)(qi)丈(zhang)一(yi)(yi)尺(chi)(chi)(chi)五(wu)寸、深十一(yi)(yi)丈(zhang)四尺(chi)(chi)(chi)三寸、長(chang)十六丈(zhang)七(qi)(qi)尺(chi)(chi)(chi)五(wu)寸”，按照現(xian)代尺(chi)(chi)(chi)寸換(huan)算(suan)就是高(gao)22.67米(mi)(mi)、深36.23米(mi)(mi)、長(chang)53.1米(mi)(mi)，其長(chang)寬數(shu)據與我(wo)們此次發掘的(de)實際狀(zhuang)況(kuang)基本吻合。
塔基位(wei)于(yu)大(da)殿之(zhi)后，與大(da)殿皆位(wei)于(yu)大(da)報恩寺遺址北區的(de)中軸線上，距(ju)離(li)大(da)殿東側基槽12米。平(ping)面呈(cheng)正(zheng)八(ba)邊形，最大(da)對徑約為(wei)25米。從外至內分為(wei)五層結構，中心部為(wei)地(di)宮，圓形地(di)宮直徑2.2米。地(di)宮未遭盜掘，保存較好。
觀音殿位(wei)于塔(ta)基(ji)東側，為夯土臺(tai)基(ji)式建筑。為三(san)開間(jian)三(san)進深的(de)高臺(tai)式建筑。
法(fa)堂位(wei)于北區(qu)中軸線最(zui)東端(duan)，為(wei)夯土臺(tai)基(ji)式建(jian)筑。為(wei)一三進深的建(jian)筑。
御(yu)碑亭(ting)基址共兩(liang)座(zuo)，分處(chu)中軸線南(nan)北(bei)兩(liang)側(ce)，南(nan)部為永(yong)樂所立(li)御(yu)碑。北(bei)部為宣德(de)年(nian)間所立(li)御(yu)碑。
位于大殿后的(de)大報恩(en)寺(si)琉(liu)璃塔建造于永樂十年(nian)（1412年(nian)），宣(xuan)德三年(nian)（1428年(nian)）竣工，九層八面(mian)，高達(da)78.2米，甚至(zhi)數(shu)十里(li)外長江上也可望見。塔身白瓷貼面(mian)，拱門琉(liu)璃門券。底層建有(you)回廊（即宋代的(de)“副階周匝”）。塔室為方形，塔檐、斗拱、平坐(zuo)、欄(lan)桿飾有(you)獅子、白象、飛(fei)羊(yang)等佛教題(ti)材的(de)五(wu)色(se)琉(liu)璃磚(zhuan)。由(you)于各層傳遞，所(suo)以使用的(de)磚(zhuan)瓦(wa)尺寸不一。
建(jian)造大報恩寺(si)花了17年時間，而同時期(qi)工程量(liang)數倍于它的(de)北京紫禁城，用時不過3年半。大報恩寺(si)工程如此費(fei)時，主要因為琉(liu)璃塔的(de)建(jian)設難度極(ji)大，不得不屢屢延(yan)期(qi)。據后人估算，僅修(xiu)建(jian)琉(liu)璃塔一(yi)項所耗用的(de)錢(qian)糧，折合白銀就高達248萬余兩。
明(ming)成祖朱棣(di)給(gei)琉璃(li)塔(ta)御(yu)賜(si)了(le)“第一塔(ta)”的(de)塔(ta)名，其(qi)特點可(ke)以歸納為“三絕(jue)”：
第一絕：巨構殊(shu)形(xing)，高(gao)聳云(yun)日。琉璃(li)塔為八邊形(xing)，共(gong)9層(ceng)，通高(gao)78.02米(mi)，相當于26層(ceng)樓房(fang)的(de)高(gao)度。
琉璃(li)塔頂部是用純金制(zhi)成的(de)(de)寶珠，直徑約為4米，據說重達2000余兩，每層(ceng)(ceng)的(de)(de)檐(yan)角(jiao)下都(dou)懸掛銅(tong)制(zhi)的(de)(de)風(feng)鈴，從(cong)上至(zhi)下共152只，即使在輕(qing)輕(qing)的(de)(de)微(wei)風(feng)之(zhi)中，清脆的(de)(de)鈴聲(sheng)也可聲(sheng)聞(wen)數(shu)里。9層(ceng)(ceng)內外共設篝燈146盞，每盞芯粗1寸左右(you)。
第二絕：通體琉(liu)璃(li)，獨步(bu)古今。琉(liu)璃(li)塔(ta)的(de)主體為磚砌，除了塔(ta)頂有一(yi)根(gen)“管心木”之外(wai)，整(zheng)個建筑當中(zhong)“不施寸木”。其內、外(wai)表層全部用各種(zhong)造(zao)型、各種(zhong)顏色的(de)琉(liu)璃(li)構件榫合(he)而成。這種(zhong)獨特的(de)裝(zhuang)飾藝術讓(rang)琉(liu)璃(li)塔(ta)贏得(de)了“中(zhong)國之大古董，永樂之大窯(yao)器”的(de)美譽。
琉(liu)(liu)璃(li)(li)(li)(li)塔(ta)所(suo)用(yong)的(de)(de)各(ge)種琉(liu)(liu)璃(li)(li)(li)(li)構(gou)件(jian)幾(ji)乎(hu)每件(jian)的(de)(de)形狀、尺寸、顏色和(he)(he)紋飾都(dou)(dou)有差異(yi)，因(yin)而制(zhi)作和(he)(he)燒制(zhi)極(ji)為不易(yi)。這是(shi)琉(liu)(liu)璃(li)(li)(li)(li)塔(ta)建設時(shi)間長達17年的(de)(de)重要原因(yin)。據史(shi)書記(ji)載，建造(zao)此塔(ta)燒制(zhi)的(de)(de)琉(liu)(liu)璃(li)(li)(li)(li)瓦(wa)、琉(liu)(liu)璃(li)(li)(li)(li)構(gou)件(jian)和(he)(he)白(bai)瓷(ci)磚(zhuan)，都(dou)(dou)是(shi)一式(shi)三份，建塔(ta)用(yong)去一份，其余兩份編號(hao)(hao)埋入地下，以(yi)備有缺損時(shi)，上(shang)報工部(bu)，照號(hao)(hao)配件(jian)修補。建國(guo)以(yi)后，南京的(de)(de)窯崗(gang)村、眼(yan)香廟(miao)一帶，先后出土過大量的(de)(de)與琉(liu)(liu)璃(li)(li)(li)(li)塔(ta)有關(guan)的(de)(de)琉(liu)(liu)璃(li)(li)(li)(li)構(gou)件(jian)，背后大都(dou)(dou)有墨書的(de)(de)編號(hao)(hao)和(he)(he)標記(ji)，證明了(le)歷史(shi)記(ji)載的(de)(de)可(ke)靠。
第三絕：長(chang)夜深沉，佛燈永明(ming)。每當暮色來臨之(zhi)時，琉璃塔上(shang)就會(hui)點燃144盞如火炬般明(ming)亮的(de)油燈，徹夜不(bu)熄(xi)。無論是(shi)(shi)月(yue)落星稀的(de)傍晚，還是(shi)(shi)風雨如注的(de)黑夜，無論是(shi)(shi)在鐘山腳下的(de)叢(cong)林(lin)之(zhi)中，還是(shi)(shi)大(da)江之(zhi)上(shang)的(de)漁舟之(zhi)內，人們都能夠看見這座高塔上(shang)永不(bu)熄(xi)滅的(de)燈光(guang)。
九層琉璃(li)塔(ta)(ta)的(de)(de)(de)每一(yi)面墻壁(bi)之(zhi)上，都有2扇窗(chuang)戶(hu)，共計144扇。這些(xie)窗(chuang)戶(hu)全部用磨制得極薄(bo)的(de)(de)(de)蚌(bang)殼(ke)進(jin)行封(feng)閉，144盞油(you)(you)燈(deng)就(jiu)分別(bie)安(an)置(zhi)在(zai)窗(chuang)戶(hu)之(zhi)內。這些(xie)蚌(bang)殼(ke)制成的(de)(de)(de)窗(chuang)罩名(ming)叫“明瓦”，是平板玻璃(li)引進(jin)之(zhi)前(qian)中(zhong)國較(jiao)好(hao)的(de)(de)(de)建筑(zhu)采光(guang)材(cai)料。自宣德三年(nian)琉璃(li)塔(ta)(ta)建成之(zhi)日起，大報(bao)恩寺就(jiu)安(an)排(pai)了(le)100名(ming)僧人輪流(liu)值班(ban)，負責給(gei)油(you)(you)燈(deng)添油(you)(you)、剪芯，擦拭(shi)明瓦，確保夜夜塔(ta)(ta)燈(deng)通明。在(zai)琉璃(li)塔(ta)(ta)旁(pang)邊，建造了(le)一(yi)座(zuo)油(you)(you)庫，用于儲存燃燈(deng)所(suo)需的(de)(de)(de)燈(deng)油(you)(you)。根據一(yi)份(fen)明代(dai)官員向皇帝提交的(de)(de)(de)賬單記載，琉璃(li)塔(ta)(ta)上每盞油(you)(you)燈(deng)每夜所(suo)需的(de)(de)(de)燈(deng)油(you)(you)為六兩四錢，整個琉璃(li)塔(ta)(ta)每月(yue)所(suo)耗用的(de)(de)(de)燈(deng)油(you)(you)總(zong)量為1530斤。
地(di)宮(gong)為圓形豎井式，從(cong)原始山體中(zhong)垂(chui)直(zhi)下(xia)挖而成(cheng)。地(di)宮(gong)之內(nei)(nei)，從(cong)上至(zhi)下(xia)以(yi)一(yi)(yi)(yi)層石(shi)(shi)塊，一(yi)(yi)(yi)層夯(hang)土(tu)的方式有規(gui)律的填充、夯(hang)筑，共(gong)(gong)39層。在距離地(di)表4.2米(mi)處，發現一(yi)(yi)(yi)塊邊(bian)長約0.9米(mi)、厚(hou)約0.25米(mi)的方形覆石(shi)(shi)，位于地(di)宮(gong)中(zhong)心(xin)。覆石(shi)(shi)提(ti)取后(hou)，其(qi)下(xia)露(lu)出了方柱狀的石(shi)(shi)函(han)(han)。石(shi)(shi)函(han)(han)高(gao)度達1.5米(mi)，邊(bian)長0.72米(mi)，由上部(bu)蓋(gai)板、底部(bu)墊板和四(si)周(zhou)四(si)塊壁板拼(pin)合而成(cheng)。其(qi)中(zhong)北(bei)壁石(shi)(shi)板鐫刻長篇銘文(wen)，題為“金陵(ling)長干寺真(zhen)身塔(ta)(ta)藏(zang)舍利(li)石(shi)(shi)函(han)(han)記”，介紹了大(da)(da)中(zhong)祥(xiang)符(fu)四(si)年，金陵(ling)長干寺住持(chi)演化大(da)(da)師可(ke)政和守(shou)滑(hua)州助教王(wang)(wang)文(wen)等人，得到宋真(zhen)宗的允許，修建(jian)九(jiu)層寶塔(ta)(ta)之事(shi)，塔(ta)(ta)高(gao)“二百尺”，而塔(ta)(ta)內(nei)(nei)地(di)宮(gong)中(zhong)藏(zang)有“感應(ying)舍利(li)十顆，并佛頂真(zhen)骨，洎諸(zhu)圣舍利(li)，內(nei)(nei)用金棺(guan)，周(zhou)以(yi)銀槨，并七(qi)寶造成(cheng)阿育(yu)王(wang)(wang)塔(ta)(ta)，以(yi)鐵函(han)(han)安置(zhi)”。考古所見與碑文(wen)的記載完全一(yi)(yi)(yi)致。在石(shi)(shi)函(han)(han)內(nei)(nei)發現有一(yi)(yi)(yi)座鐵函(han)(han)，高(gao)1.3米(mi)、寬0.5米(mi)。鐵函(han)(han)頂部(bu)放置(zhi)大(da)(da)量的銅錢，以(yi)及水晶球(qiu)、瑪瑙珠、串珠、鎏金銀鳳等供養器物。在石(shi)(shi)函(han)(han)下(xia)，還有一(yi)(yi)(yi)個小型埋藏(zang)坑，其(qi)內(nei)(nei)出土(tu)白瓷、青瓷碗各1件(jian)，青瓷壺1件(jian)。地(di)宮(gong)從(cong)現存(cun)地(di)表開口至(zhi)埋藏(zang)坑底部(bu)共(gong)(gong)深達6.74米(mi)。
票價：80元/人
按照國(guo)家相(xiang)關規定(ding)(ding)享受(shou)(shou)免票的游(you)客，可(ke)免費入園(yuan)參(can)觀；按照國(guo)家相(xiang)關規定(ding)(ding)享受(shou)(shou)半價的游(you)客，在此期間可(ke)享受(shou)(shou)折上(shang)折的優惠。景區(qu)同時(shi)向所有游(you)客推出120元購買全年(nian)年(nian)卡(ka)的活動。
地鐵：可(ke)乘坐(zuo)(zuo)南京地鐵1號線至中華門站，沿(yan)應天大(da)街向東步(bu)行(xing)約400米至雨花路可(ke)到(dao)；或(huo)乘坐(zuo)(zuo)南京地鐵3號線至武(wu)定門站，沿(yan)養(yang)虎巷(xiang)、掃(sao)帚巷(xiang)到(dao)達。
公交：乘坐公交2路(lu)(lu)(lu)(lu)、16路(lu)(lu)(lu)(lu)、49路(lu)(lu)(lu)(lu)、63路(lu)(lu)(lu)(lu)、202路(lu)(lu)(lu)(lu)、701路(lu)(lu)(lu)(lu)、706路(lu)(lu)(lu)(lu)、Y2路(lu)(lu)(lu)(lu)、Y14路(lu)(lu)(lu)(lu)、Y20路(lu)(lu)(lu)(lu)等10條公交線(xian)路(lu)(lu)(lu)(lu)至“大報恩(en)寺(si)遺址公園（建初寺(si)）”站(zhan)(zhan)（即原“雨花路(lu)(lu)(lu)(lu)”站(zhan)(zhan)）可至。
自駕：自(zi)駕(jia)游客請將車(che)輛(liang)停(ting)(ting)在雨花路西側指定(ding)停(ting)(ting)車(che)場。
大(da)報恩(en)寺(si)是(shi)南京歷史(shi)悠久的佛教寺(si)廟(miao)(miao)，千余年間，屢廢屢建，寺(si)名(ming)亦屢屢更易，大(da)報恩(en)寺(si)塔立于南朝(chao)寺(si)廟(miao)(miao)發祥地和江南佛教中(zhong)心。
南朝四(si)百八十寺(si)(si)，多少樓(lou)臺煙雨中”，杜(du)牧這兩句詩中“四(si)百八十寺(si)(si)”的起源就(jiu)是(shi)大(da)報恩寺(si)(si)，大(da)報恩寺(si)(si)的歷(li)史從孫吳開始，歷(li)經各朝，有過長干(gan)寺(si)(si)、天禧寺(si)(si)等名字，大(da)報恩寺(si)(si)塔的前(qian)身則是(shi)阿(a)育王塔。
東吳(wu)赤(chi)烏年間(jian)（238─250年），孫(sun)(sun)權(quan)建建初寺(si)(si)及阿(a)育(yu)王塔，為(wei)江(jiang)(jiang)南塔寺(si)(si)之始，有(you)“江(jiang)(jiang)南第一寺(si)(si)”之稱，是繼洛陽白馬寺(si)(si)之后的(de)中(zhong)國第二座寺(si)(si)廟，也是中(zhong)國南方地區的(de)首(shou)座寺(si)(si)廟。經過(guo)考(kao)證，阿(a)育(yu)王塔約建于東漢獻帝(di)的(de)興平年間(jian)（194─195年），是南京古老的(de)佛(fo)塔，也是中(zhong)國較早(zao)的(de)佛(fo)塔之一。建塔者極有(you)可能(neng)是秣陵人符(fu)融，他曾任徐州刺史陶謙(qian)麾下(xia)之廣陵、下(xia)邳、彭(peng)城三郡的(de)運漕(cao)官，并以漕(cao)運所得經費(fei)建廟蓋塔。符(fu)融早(zao)見(jian)于正史的(de)中(zhong)國閣樓式(shi)佛(fo)塔的(de)創始者，后退守故里秣陵，為(wei)孫(sun)(sun)策攻滅(mie)。
東吳赤烏十年（247年）東吳大帝孫(sun)權為康居國僧人會在長干里修建建初寺和阿(a)育(yu)王(wang)塔(ta)，成為江南塔(ta)寺之始。
晉太康年(nian)(nian)間（280─289年(nian)(nian)）復建(jian)，名長干(gan)寺(si)；南朝陳為報(bao)恩寺(si)，宋(song)改天禧寺(si)，建(jian)圣感塔；元改慈(ci)恩旌(jing)忠教(jiao)寺(si)。
建(jian)(jian)德六年(nian)（578年(nian)），齊地佛門遭劫。聞率僧眾(zhong)(zhong)四十余循(xun)海(hai)路奔建(jian)(jian)康。輒遇大風波，楫折船沉。忽現巨龜，負(fu)眾(zhong)(zhong)僧出水(shui)，須臾抵建(jian)(jian)康。聞口稱南無阿彌(mi)陀佛。龜對曰：師父曾記否，吾乃海(hai)曲放生池之老龜也。聞恍然大悟。奏聞宣(xuan)帝，帝大悅(yue)，敕建(jian)(jian)報恩寺，香火祀之。
唐朝年間，“慧聞者(zhe)，齊渤海(hai)人(ren)也。幼年向佛(fo)，十二入(ru)(ru)寺，十六受戒(jie)。苦修(xiu)《大(da)智度(du)論》、《中論》，樹“一心三觀”，啟天臺(tai)之(zhi)源(yuan)。所入(ru)(ru)法(fa)(fa)門，非(fei)世(shi)可(ke)知(zhi)(zhi)。學者(zhe)仰之(zhi)，以為(wei)(wei)履(lv)地戴(dai)天，莫知(zhi)(zhi)高厚。又以憫寺所得櫬(chen)施，買海(hai)曲(qu)溪石梁(liang)為(wei)(wei)放生池(chi)，佛(fo)法(fa)(fa)廣播于江北(bei)。”
北宋端拱元(yuan)(yuan)年(nian)（988年(nian)），僧可政得唐三藏玄(xuan)奘大師頂骨舍(she)利，于長干(gan)寺(si)建(jian)塔(ta)瘞藏；宋天(tian)禧(xi)元(yuan)(yuan)年(nian)（1017年(nian)），重修后的長干(gan)寺(si)改(gai)(gai)稱天(tian)禧(xi)寺(si)，寺(si)塔(ta)易名“圣感”；元(yuan)(yuan)至元(yuan)(yuan)二十五年(nian)（1288年(nian)），詔改(gai)(gai)天(tian)禧(xi)寺(si)為“元(yuan)(yuan)興慈(ci)恩旌忠教寺(si)”，改(gai)(gai)塔(ta)名為“慈(ci)恩塔(ta)”。
明永樂(le)六年（1408年）毀于(yu)火(huo)，永樂(le)十(shi)(shi)年（1412年）明成祖朱棣敕工部(bu)于(yu)原址重(zhong)建，明成祖以紀念明太祖和馬(ma)皇后(hou)為名，命工部(bu)于(yu)此重(zhong)建大報(bao)恩(en)寺(si)及九層(ceng)琉璃(li)寶塔(ta)，按照宮闕規(gui)制，征集天下夫役(yi)工匠十(shi)(shi)萬(wan)余人，費用計錢糧銀二百五十(shi)(shi)萬(wan)兩、金錢百萬(wan)，歷時十(shi)(shi)九年始完(wan)工。“依大內(nei)圖武(wu)，造九級五色琉璃(li)塔(ta)，曰第一塔(ta)，寺(si)曰大報(bao)恩(en)寺(si)”。
大(da)報(bao)恩寺的(de)修(xiu)造，由鄭(zheng)和(he)(he)等人(ren)擔任監(jian)工官。大(da)報(bao)恩寺在永樂、宣德年間建造，正值鄭(zheng)和(he)(he)率(lv)領(ling)下西洋船隊多次遠洋海外(wai)之時，因而，鄭(zheng)和(he)(he)對這項工程(cheng)難以全力照(zhao)顧，工程(cheng)進(jin)展(zhan)緩慢，弊端展(zhan)現。為此，1428年（宣德三年），明宣宗朱瞻基特下御(yu)敕(chi)，要(yao)此時已出洋回國(guo)任南(nan)京守備的(de)鄭(zheng)和(he)(he)“即將未完(wan)處，用(yong)心(xin)提督”，限期完(wan)工。竣工以后，鄭(zheng)和(he)(he)還特其從(cong)海外(wai)帶回的(de)“五(wu)谷樹”、“婆羅樹”等奇花異(yi)木種(zhong)植在寺內。
明代初年至清(qing)代前期，大(da)報恩(en)寺琉(liu)璃寶塔作(zuo)為中(zhong)國(guo)具(ju)特色(se)的(de)標志性建筑物，被稱(cheng)為“天下第(di)一塔”，更有(you)“中(zhong)國(guo)之大(da)古董(dong)，永樂(le)之大(da)窯器”之譽(yu)，是當時中(zhong)外人士游(you)歷金陵(ling)的(de)必到之處。
嘉靖四十五年（1566年）遭(zao)雷火襲擊，天王殿(dian)，大殿(dian)、觀音殿(dian)、畫廓一百四十余間焚為灰燼；萬歷二十八年（1600年）塔心木腐(fu)朽(xiu)，塔頂傾斜，僧人洪(hong)恩(en)募(mu)捐銀(yin)數千兩(liang)使之得以(yi)重(zhong)修。
清(qing)順治(zhi)十八年以后，內府及地方均有(you)撥款修(xiu)繕記載。最后一(yi)次是1802年（清(qing)嘉慶七年）修(xiu)復竣(jun)工后，繪塔圖(tu)并附志(zhi)。
咸豐四年(nian)(nian)（1854年(nian)(nian)），大(da)(da)報恩(en)寺塔(ta)被(bei)毀，關于被(bei)毀的(de)原因有兩種說(shuo)法。一說(shuo)，清(qing)軍攻克雨(yu)花臺后，太平軍為(wei)防清(qing)軍占(zhan)據(ju)大(da)(da)報恩(en)寺對城內造成威(wei)脅，太平軍先下(xia)手為(wei)強(qiang)，遂“用(yong)(yong)火藥轟之，復挖空(kong)塔(ta)座下(xia)基地(di)，數日塔(ta)倒，寺遭焚(fen)毀”。另一說(shuo)則是1856年(nian)(nian)，正逢天京之變，北(bei)王(wang)韋昌(chang)輝因為(wei)擔(dan)心(xin)翼王(wang)石(shi)達(da)開占(zhan)領城外的(de)琉(liu)璃塔(ta)，架炮攻擊城內，派(pai)兵一面在(zai)塔(ta)下(xia)挖地(di)道引(yin)爆炸藥，一面用(yong)(yong)火炮直(zhi)接轟擊塔(ta)身(shen)，最終使琉(liu)璃塔(ta)化(hua)作一堆(dui)瓦礫，而大(da)(da)報恩(en)寺的(de)其他建筑也(ye)被(bei)由此(ci)引(yin)發的(de)大(da)(da)火全部燒(shao)毀。也(ye)有人認(ren)為(wei)是曾國藩下(xia)令炸毀的(de)。
清同治四年（1865年），江寧機器制造局(ju)就大報恩(en)寺遺址坡下菜地造住(zhu)房十(shi)二(er)間(jian)，工(gong)作間(jian)八十(shi)余間(jian)，廊(lang)五十(shi)余間(jian)，寺院遺址漸(jian)被(bei)蠶食瓜分。
1958年，在眼香廟、芙(fu)蓉山、窯(yao)崗村一帶出(chu)土的大批(pi)琉璃構件(jian)上多帶有墨書的字號標記。構件(jian)現(xian)分藏于中國國家博物館(guan)、南京博物院和南京市博物館(guan)。
2004年后，南京(jing)市開始籌劃復建(jian)事宜，2007年，大報恩寺遺(yi)址公園(yuan)正式啟(qi)動建(jian)設。
2008年8月7日(ri)，在(zai)南京(jing)大報恩寺遺(yi)址(zhi)出(chu)土的鐵函中發現了七(qi)寶阿育王塔等一(yi)系(xi)列(lie)世(shi)界級(ji)文物與圣物，內藏“佛(fo)頂(ding)真(zhen)骨”。
2010年，大(da)報恩寺重(zhong)建工(gong)程被列為南京市2010年城市建設“十(shi)六個重(zhong)大(da)項(xiang)目”之一(yi)，同年大(da)連萬達集團董(dong)事(shi)長王健林向(xiang)該工(gong)程捐贈10億元人民幣。
2010年6月12日，南京大報(bao)恩(en)寺佛(fo)(fo)頂骨舍利(li)(li)盛世重光系列活動在棲(qi)霞(xia)寺隆(long)重舉行(xing)，佛(fo)(fo)頂骨舍利(li)(li)在棲(qi)霞(xia)寺法(fa)堂供奉的(de)一個月里，有近(jin)20萬人前(qian)往(wang)瞻禮。
2011年(nian)6月，被評為“2010年(nian)度全國(guo)十大(da)考古(gu)新發現”。
2012年4月25日，第三(san)屆(jie)世(shi)界佛(fo)教(jiao)論壇在香(xiang)港開幕，大(da)報恩寺出土的(de)佛(fo)頂(ding)骨(gu)舍(she)利從發現地南京迎請來到了香(xiang)港。
2012年(nian)11月，大報恩(en)寺作(zuo)為中國海上絲綢之路項目遺(yi)產(chan)點之一，列入中國世界(jie)文化(hua)遺(yi)產(chan)預備名單。
2013年(nian)5月，大(da)報恩寺遺址被(bei)國務院核定公布為全(quan)國重點文物保護單位。
2014年3月，大報恩寺輕(qing)質保護塔(ta)主體(ti)完工，該塔(ta)共有9層，由(you)輕(qing)鋼結構和(he)玻(bo)(bo)璃筑成，外立面由(you)玻(bo)(bo)璃幕墻組成。
2015年12月(yue)16日上午10點18分，大(da)報(bao)恩寺遺址公(gong)園(yuan)舉行開(kai)園(yuan)儀式。12月(yue)17日，大(da)報(bao)恩寺遺址公(gong)園(yuan)正式開(kai)放。
南京(jing)佛教文化之(zhi)(zhi)昌盛，在中(zhong)(zhong)國(guo)各大(da)古都中(zhong)(zhong)罕有(you)可(ke)比。南京(jing)有(you)著(zhu)二千年的(de)(de)佛教文化積淀，自古有(you)“南朝四(si)百八十寺”之(zhi)(zhi)說，在中(zhong)(zhong)國(guo)佛教發展史上具有(you)重要的(de)(de)不可(ke)替代的(de)(de)地位。當(dang)時佛教的(de)(de)十大(da)宗派在寺內(nei)都設有(you)講座，供僧(seng)徒任意選修；并雕版印刷(shua)了號(hao)稱“南藏(zang)”的(de)(de)大(da)部頭(tou)佛經六百三十七函五(wu)千余卷收藏(zang)于寺內(nei)。
長干寺(si)地(di)宮是中(zhong)國(guo)發現較深的地(di)宮，出土的鐵函(han)是中(zhong)國(guo)發現的較大瘞藏舍利鐵函(han)，鐵函(han)中(zhong)七寶(bao)阿育王塔(ta)是中(zhong)國(guo)發現的較大的實物塔(ta)。當(dang)年(nian)陜(shan)西法(fa)門寺(si)出土了4枚(mei)舍利，一下就成(cheng)了佛(fo)(fo)(fo)(fo)教圣(sheng)地(di)，如(ru)今南(nan)京出土了佛(fo)(fo)(fo)(fo)頂真骨，其影響可(ke)想(xiang)而(er)知。原中(zhong)國(guo)佛(fo)(fo)(fo)(fo)教協會會長趙樸初先(xian)生曾(ceng)稱南(nan)京是“佛(fo)(fo)(fo)(fo)教學術的中(zhong)心”，如(ru)今南(nan)京成(cheng)為南(nan)方佛(fo)(fo)(fo)(fo)教中(zhong)心的地(di)位無可(ke)非議(yi)。
經(jing)版(ban)雕(diao)刻于(yu)大(da)(da)報(bao)(bao)恩(en)(en)寺(si)并在(zai)該寺(si)長期(qi)保存(cun)、印(yin)刷流傳(chuan)的《永(yong)樂(le)南藏(zang)》，影響較大(da)(da)。自永(yong)樂(le)十八年（1420）《永(yong)樂(le)南藏(zang)》雕(diao)成以(yi)后(hou)，一直到清康熙年間(jian)，大(da)(da)報(bao)(bao)恩(en)(en)寺(si)一直承擔著中國絕(jue)(jue)大(da)(da)部(bu)分寺(si)廟的印(yin)經(jing)任(ren)務(wu)，是中國佛(fo)經(jing)流通的絕(jue)(jue)對(dui)中心。《永(yong)樂(le)南藏(zang)》到底印(yin)了多少部(bu)，已難以(yi)統計(ji)，不過，僅鄭和(he)就曾先后(hou)印(yin)造過10部(bu)《大(da)(da)藏(zang)經(jing)》，遍舍天下名(ming)剎。
大(da)(da)報(bao)恩(en)寺(si)是明清(qing)中(zhong)(zhong)國佛(fo)(fo)經(jing)(jing)流通的中(zhong)(zhong)心，漢(han)文佛(fo)(fo)教大(da)(da)藏(zang)(zang)(zang)經(jing)(jing)，是漢(han)文佛(fo)(fo)典的總集(ji)。大(da)(da)藏(zang)(zang)(zang)經(jing)(jing)的編撰、雕刻(ke)(ke)、印刷，一直被視作是至高無上、功德無量的盛(sheng)事。在明清(qing)出(chu)現的5部(bu)(bu)(bu)大(da)(da)藏(zang)(zang)(zang)經(jing)(jing)（其中(zhong)(zhong)官刻(ke)(ke)4部(bu)(bu)(bu)、民刻(ke)(ke)1部(bu)(bu)(bu)）中(zhong)(zhong)，有3部(bu)(bu)(bu)官刻(ke)(ke)與(yu)大(da)(da)報(bao)恩(en)寺(si)及(ji)其前身天禧寺(si)有關。其中(zhong)(zhong)直接相關的為《初刻(ke)(ke)南藏(zang)(zang)(zang)》（以(yi)前稱《洪武南藏(zang)(zang)(zang)》）、《永樂(le)南藏(zang)(zang)(zang)》。而在北京雕刻(ke)(ke)的《永樂(le)北藏(zang)(zang)(zang)》，不僅以(yi)《永樂(le)南藏(zang)(zang)(zang)》為范本，而且其主持者有不少是來自大(da)(da)報(bao)恩(en)寺(si)。
南(nan)京大(da)報恩寺(si)(si)作(zuo)為(wei)(wei)中國(guo)古(gu)典建(jian)筑文(wen)(wen)化(hua)的(de)典范(fan)，是(shi)中國(guo)經過考古(gu)發(fa)(fa)掘揭露(lu)面積較大(da)的(de)寺(si)(si)院遺址(zhi)，為(wei)(wei)研(yan)究明代皇家(jia)寺(si)(si)院的(de)規制(zhi)、布(bu)局提供了(le)極(ji)為(wei)(wei)重要(yao)的(de)實物資料。在塔(ta)基中發(fa)(fa)現了(le)始建(jian)于(yu)北宋大(da)中祥符年間(jian)的(de)長(chang)干寺(si)(si)地宮，出土(tu)了(le)以佛頂真骨為(wei)(wei)核心（碑(bei)文(wen)(wen)記載由印度高僧施(shi)護攜帶來華）、以七寶阿育王塔(ta)為(wei)(wei)代表的(de)一(yi)大(da)批(pi)佛教(jiao)珍貴(gui)文(wen)(wen)物，引起了(le)海內外的(de)極(ji)大(da)轟動(dong)。
這些重(zhong)大(da)發(fa)現(xian)對于(yu)(yu)研究宋(song)代佛塔地官的建造、舍利瘞藏(zang)制度，中(zhong)西(xi)佛教的傳播(bo)與交流等(deng)方面(mian)均具(ju)有重(zhong)要意義。此(ci)次發(fa)掘還在塔基(ji)周圍發(fa)現(xian)搭建“鷹架”的線索，揭(jie)示(shi)了明代寶塔的建筑(zhu)方法，對于(yu)(yu)中(zhong)國古代建筑(zhu)技術史(shi)的研究具(ju)有重(zhong)要價(jia)值。
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